Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10730 LG2 47953437 47955141 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase STY46-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 47953608 synonymous_variant p.Glu376Glu
C/T 47953670 upstream_gene_variant
C/A 47953779 upstream_gene_variant
C/T 47954032 missense_variant p.Ala316Thr
A/G 47954255 synonymous_variant p.His241His
T/C 47954468 synonymous_variant p.Thr170Thr
G/A 47954580 upstream_gene_variant
A/T 47954699 missense_variant p.Leu120His
A/G 47954733 missense_variant p.Phe109Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10730.1
MSLSESPTTRHNLSRQSSKSKSGGCCRGFSSVRTVSSTAPTLQHHHLQQLYQKLELKVAGLEKEVQRQTELRVMYRKRMEKTQDYLKYCLQIAQENGILDLIIHSNGEFSQSPISSPRELNSTPTPSHNHPNLIPIVDQAKINGWFINPSEIRLGEKIGQGTTAEIHRGTWRGCDVAVKCMSDSFFGKNENGVVFFAQEVETLSKQRHRFVLHLMGACLDPPRHAWVVTEYLNTTLKEWLHGPGKRPKHRTTPLPPFKERVIRALEIAQAMQYLHEQKPKVIHRDLKPSNIFLDDALHVRVADFGHARFLDDDEMALTGETGTYVYMAPEVIRCEPYNEKCDVYSFGIILNELLTGNYPYIETQLGPAKIAMEVVEDELRPLVASKDDGEELEEVIDLICLCWNASPSTRPSFATITHTLKSYVERVLLISN*


CDS Sequence:
>Vu_10730.1
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Promoter Sequence:
>Vu_10730::LG2:47955141-47957141(-)
GCAGTTTGCTCTTTTAGTTGTATTTGAATAAATCACACTACAATTTATGTAGTTAGTTCCATTACAATTTAAAAAGTTTATTCTATCACGACACTGATCTTGAATATAAGTTAAAAAATTAGAACAATTTACGCTCTTTAAAATGTTAATGAGTAGTATTTTAATTATACCTGTTTTTGTGTAAAATAAATTAGCTAAACTTTAACATTATCTTTCCTCAAAACTTCATATAAGAATAAAAATGTCATTGAAAATAAAATCTTAACTAGGCGAAAAACACTTGAGACGTTATAGTACTCATTAAATTAATTAAAGTTGTGGATATTTTGCGGTTAAAGTTTTCAATATTATTTTCTCTTATTTATCTTCCTTGATGCTAAGGCTTTTGTTTTTTTAATTCCTTTTCTAGTTGTTAGTTATAGTCTTTTTGTTTTCTTTTTATTCTTAATATTGAAAGAGCCAAATTAAGAGGTATTTATTTTAAATTGTTATTAGAAAGACTTTTGATATAAAGAGGGATAGTTAGATTTATAAGATGAGAATGTTCATTGAGAATATAAATATCAATAAATTAATCTTAGTTCAATCACATAAAAACATTAACATTACTTCTAATCTAAAATTTTAAAATAATGAATTTATAAATCTTTAATGCTATTTAACTTTTTTTTTTAATTCTGCTCAATATAAAAACTTATGACTCTAATTGAAATTCTAAGTATATCTTGGCCACCACCCTTCTGCAAGAAATTTGGGATGGCCTAAAAGTAAGGTCTTCTAGAAAAAGTGATTCTTACCTATCTTTTCAACAACTCCAACAAGGATATGATAATCTTAATACACATTATATAAAGTTGAAGTCTATTTGAGAGGAATTATATGACTATAAACCCCCTCTCCACCACGGTTGTGGTGGTCTTTAGCAACTTCAAACATACACCGAATCTAAATATATGTCATGTCATTTTTTATGAATTTGCATGGTTTTTTTTCTTTCAAATTTGTGATTAAAATGTTCTCTATGATCCTCTACCTTCAATTAGTAACGTCTTTTTCCTTATTCTCACAAAAGAAACTCAATGTGAAATTATTGACCCAAATTCATCTTATTGTACTCCTTCATGTACTACAATTGTTTGTGTTATGGTATAGGTTTAATTTTTCTTTCTTTTTATCGTCATTGTTATATGAACTCCCTTACTAGGCTATTTTATAGTACACTACAGTTTTCAGTACTATTCTCCTTTCTCTTACTCAGTGATGATCTGTAATGTATATTCTCTTTAGAATAATTCATTCAGATAAAAGTTTCGGTAGGTCCAATATAGAGATAAATAATAAATAGAAATAAAGATTCAACAAAAACATATAAATTATACCTAAAAAAGGAAAAAGTGCTTAATTAACGCTAAATAATCCTTGCATGCATAACGCACTTTACATCCATAATTTATTTATTTTCTGAAAGCTTAACATTAACTACCCTCAAGAAATCTAAATCCTACATCCTAGGAAGATTGTTCTTGCCGCTTTTGACATGTTTGCTTTGGAATTAGTCGTGTGCAGACAAAATTTTGACCACGATATAGCGATTAGTTGACCTTTTGTGTGTAATATGAATCTCGTTAAACTTCAAAGTAAACTCCGCCAAAATGTCTCTCAATTGTGAGGGTCTAAATTTACACACAACATTTCCGTCTTCATACAAACCAACAAATCTGGCCAGCACAAAATCTGTCTCATTCTCAAACTACATAGTCAATTCATTTTAGGAAAAAGATAAAATGAACACTCAAAATAATCTCAACACCATTAAACAAATAAAATCAGATAAAATTGTGGTGAAGGGAAGGTTCGTGAGAAAGTCCGTCAGTTGAGCCTGCAATACAGTTAACAAGGAAAAAGGTGCATGTTTATATATGATTATAAGACACTCTTTACCACCACATTTAGTTCTCCTCGTACATTGCCTCCTCCCACACAACATTCGAACCGACAAC


Gene Sequence:
>Vu_10730(-)
ATGAGTCTAAGCGAGAGCCCAACCACTCGCCACAACCTCTCTCGCCAATCATCCAAGTCCAAGAGTGGTGGATGCTGTCGAGGCTTCAGCAGCGTTAGGACCGTCTCATCCACCGCACCAACCTTGCAACACCATCATCTTCAGCAGCTTTACCAAAAATTGGAACTAAAGGTACCTTTTTTCTCATGCAAATCGCTTCCATTGGACATTGAAGTAAAGTTATTAGCCTCCCAGTGATAGTGTGAGTTGAATCAGGTGGCAGGTTTGGAAAAAGAGGTGCAGAGGCAGACAGAACTGCGCGTTATGTATAGGAAAAGAATGGAAAAGACGCAGGATTACTTGAAATACTGTCTCCAAATCGCACAGGAAAATGGAATCTTGGACCTCATTATCCACTCCAACGGTGAATTCTCGCAATCTCCCATTTCTTCTCCACGTGAACTCAACTCCACCCCCACACCATCGCACAACCATCCCAATCTAATACCCATCGTTGATCAAGCCAAAATCAATGGATGGTTCATCAACCCCAGTGAGGTAAAACTAACTACTTTCTATCTTCCTTCTCCGTGCCTATTCAAAATTGGAATATACCTCAGTTTTACAGTGATGAACAGATTCGTCTGGGAGAAAAAATAGGGCAGGGAACCACGGCGGAGATTCACAGAGGGACATGGCGCGGATGTGATGTGGCGGTGAAGTGCATGTCAGATTCATTCTTCGGCAAAAACGAAAACGGTGTCGTGTTCTTCGCTCAGGAGGTTGAAACCCTCTCGAAACAGCGTCACCGGTTTGTGCTTCACCTCATGGGTGCGTGTCTCGACCCTCCGCGTCATGCATGGGTGGTTACCGAGTATCTGAACACCACGCTCAAGGAGTGGCTACATGGGCCGGGGAAAAGGCCCAAACACCGAACAACGCCACTCCCTCCCTTCAAAGAGAGGGTGATACGGGCCCTGGAAATAGCCCAAGCCATGCAGTACCTCCACGAACAAAAGCCCAAGGTCATTCATCGTGACTTGAAGCCCAGCAACATCTTCCTGGACGATGCGTTGCATGTGAGAGTGGCGGATTTTGGTCACGCGCGGTTCTTGGACGATGACGAAATGGCCCTCACCGGAGAAACAGGAACATACGTGTATATGGCACCGGAGGTAATTCGGTGCGAGCCCTACAATGAAAAATGTGATGTATACAGTTTTGGGATAATTCTCAACGAGTTACTTACTGGAAACTACCCTTATATAGAGACACAACTTGGTCCCGCCAAGGTAACTACACTTGTTTTTATCCTTTCTTTTATTAAGCGTGGTTTAAATTTAGTTTAATTTTTATTAAAAAATTTAAATTTTAGGTGTAAAGGAATTTAGAAATTTTGTATTACACACTTTACATTTACTATTTTACTTTTTAATTTATTTTTGTAAATATAAAAGTTAACTTTTTTTTTAATGATTAAAACATCTCTAAAGTGGTGCTTTCCAATGTTATTTTGTTGTGAAAATGTTGTTAGATTGCTATGGAAGTTGTGGAAGATGAGCTAAGGCCTTTAGTTGCATCAAAGGACGATGGTGAGGAACTGGAAGAAGTGATTGACCTAATATGCCTTTGCTGGAATGCAAGCCCATCCACTCGACCATCATTCGCAACAATTACTCATACCCTCAAATCTTATGTCGAAAGGGTCCTTCTAATTTCAAATTAA