Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10672 LG2 47436563 47440302 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 40
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 47436581 missense_variant p.Val7Leu
C/T 47436588 missense_variant p.Ala9Val
G/A 47436620 missense_variant p.Gly20Arg
A/G 47436770 intron_variant
T/G 47436785 intron_variant
T/A 47436797 intron_variant
C/T 47436876 intron_variant
G/C,* 47436931 intron_variant
A/G 47436947 intron_variant
T/G 47436992 intron_variant
C/T 47437018 intron_variant
C/A 47437044 intron_variant
T/C 47437068 intron_variant
A/G 47437187 intron_variant
G/A 47437193 intron_variant
G/A 47437212 intron_variant
A/G 47437219 intron_variant
T/C 47437221 intron_variant
A/G 47437257 intron_variant
A/T 47437268 intron_variant
A/G 47437273 intron_variant
C/A 47437287 intron_variant
T/A 47437288 intron_variant
T/A,* 47437296 intron_variant
G/T,* 47437297 intron_variant
G/C 47437317 intron_variant
T/G 47437323 intron_variant
G/T 47437329 intron_variant
C/T 47437332 intron_variant
T/C 47437360 intron_variant
A/G 47437374 intron_variant
A/G 47437387 intron_variant
T/A 47437397 intron_variant
G/A 47437404 intron_variant
T/C 47437436 intron_variant
T/C 47437456 intron_variant
G/T 47437457 intron_variant
T/G 47437459 intron_variant
C/T 47437579 intron_variant
G/A 47437627 intron_variant
T/A 47437628 intron_variant
C/T 47437683 intron_variant
A/C 47437796 intron_variant
C/A 47437815 intron_variant
T/C 47437872 intron_variant
T/C 47437955 intron_variant
A/C 47437967 intron_variant
C/G 47437983 intron_variant
G/C 47438092 upstream_gene_variant
A/T 47438136 upstream_gene_variant
T/A 47438255 upstream_gene_variant
G/T 47438327 upstream_gene_variant
A/G 47438353 upstream_gene_variant
G/A 47438385 upstream_gene_variant
T/C 47438399 upstream_gene_variant
C/G 47438420 upstream_gene_variant
T/G 47438446 upstream_gene_variant
T/A 47438447 upstream_gene_variant
C/T 47438507 upstream_gene_variant
C/A 47438645 missense_variant p.Arg53Ser
C/G 47438742 missense_variant p.Thr85Arg
G/T 47438867 splice_region_variant&intron_variant
C/G 47438924 synonymous_variant p.Thr120Thr
G/C 47439218 upstream_gene_variant
A/G 47439335 upstream_gene_variant
G/T 47439443 upstream_gene_variant
A/G 47439567 upstream_gene_variant
G/C 47439942 missense_variant p.Met153Ile
A/C 47439970 missense_variant p.Asn163His
A/C 47440131 missense_variant p.Gln216His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10672.1
MHERKAVMAQEADAFVALPGGYETMEELLEMITWAQLVEMLEAKVQHMKEQNRTLRMMVEIMSKKCQKLQLHVQEINNAESEFSTAQKASQIFVKIPPNDNSLIVKDGYEWKKYGQKKTTKDNPSPRAYYKCALAPTCPVKKKVQRSIQDKSMVVATYEGKHNHGFPFRDLFKPSSATPEASIMDNDLPMTNISNDINIDLCLCNRVPTDVTDKQQKDGGSNIKVLECVSSLLKDPNFIKPLAEAVVLSINTQSKQVGLNLSLGLPQPHLSK*


CDS Sequence:
>Vu_10672.1
ATGCATGAGCGTAAAGCTGTAATGGCTCAAGAAGCTGATGCATTTGTTGCTCTCCCTGGAGGATACGAAACCATGGAAGAGTTGTTGGAGATGATAACTTGGGCCCAACTTGTGGAAATGCTTGAAGCAAAGGTGCAACATATGAAAGAGCAGAATCGTACTCTACGAATGATGGTGGAAATTATGAGCAAGAAATGCCAGAAGCTTCAACTTCATGTTCAAGAGATCAACAATGCAGAAAGTGAGTTTTCCACAGCACAGAAGGCATCGCAAATCTTTGTTAAAATCCCCCCCAACGACAATAGTTTGATAGTAAAAGATGGTTATGAGTGGAAGAAGTATGGTCAGAAGAAGACAACCAAAGACAATCCTTCACCCAGAGCTTATTACAAGTGCGCATTGGCTCCTACATGCCCTGTCAAGAAAAAGGTGCAAAGAAGCATACAGGATAAATCTATGGTTGTTGCAACTTACGAAGGAAAGCATAACCACGGTTTTCCTTTTCGTGATTTATTCAAGCCATCATCGGCTACACCCGAAGCCTCAATAATGGATAACGATTTACCTATGACAAACATATCAAACGACATCAACATCGACCTTTGTCTATGCAATCGTGTTCCAACAGATGTAACAGATAAACAGCAAAAGGACGGTGGCAGTAACATTAAAGTTCTGGAATGTGTAAGTTCTCTGCTAAAAGATCCTAACTTCATCAAACCATTAGCTGAAGCAGTTGTTCTCTCCATCAATACCCAGAGTAAGCAAGTGGGTCTTAACCTGAGTTTGGGTCTTCCTCAACCGCATTTGTCTAAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10672::LG2:47434563-47436563(+)
ATTGTGTTAATTAATAATAACAAAATTAGAATTTATCTTTATTTCAATTTTGACATATTTAAATTTTAAAATTTTAAAATTTTAAAATTTAATAAATATAATTATCTTATTTTTATTATGTTATATTTTTTTAACGTATTAAAGTATTTTACTTATTTTAATTTGAATATTAATTTAAAATATTTAATTTAAATATTAAAATGTTATTTAACACATAAAAGTTTACAATATGCATATCCTTACAAAAATTGGAATAGATTTTAATTTGACGTCCAAATTTACATTTCAAAGATATTTAACCTTGAATAATATCTATTCCCGTAATAAAAGAGTGGGATAAATTTATGAAAGCATTAGTACTTTTTTTCAGAAGAAATAAAAAAGAAAATGCTTACAAATGTAGTCATTGTTAGAAAGACAGGAAGAGAAGGACCTAACAGTGTGAATGTGTCATGTTGAGAAGATGAAATGAACCGTCTTCATCATCTCGCAACCCCATGAATTAACTTATTACTCTTTTCCTTTTCCTTTTGCATAAGCTTAGAAATTTTACACAAAATAAAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAAACGTTGATTCATGGTTGCAGCAGAGTAGTGCAGTTGACAAGAACAGATGCACATGTTTGTCGTGTGATTGCCGCTTCACCTCAACATTAAATTTCCTCTCCCCACTGTTCCTTCTTTTCTCTTCTGCACAGAAAGCGACACAGTATGACATTCACACTTCAATCCATGATTTCACACACAAACACACTTATTTCATCAATCTTATATTAATTTCTTTATATATATAATGTTATAAAAAAATTATAAAAGAGAGTTTTGTTATTAAGAAAACCCTATATAATCGAAATTGAATTATCTTTGAAATGAATGCCAGTCTATTACCACATGCGTATGTGCTTCTTTTCATCTACCTATAACTATGGAAAGCAGTGTAAGGTACATAAATATTTATGATTGCAGGCCATGCCGCAGCTCACAGACAGAGCCAAGCTTCCAAACATTGTGGATCCAGTCATTAAGGACTGATAAGAAACCACAGGACAAGTAATAAAATAAGAGGAAAAGAGAATAAAAAAAATCACAGATCTAGGCAAAAACAGAAAGAATAAATTTACGTGGGTTTTTTCTAGTTTGATCCCTGATTTATTAGAATCTCTAATTGAGTTACTAAAAGTGTTAATTTGAGCTCTTGCCGTTAAATTTAGTTAACAGGTTAAGTTTTTGTACATGTGAGAGGTCGATGTGTAATTTTTTGAAACGTGACATGCTGATGTCGAATCCTTCGTAGTGCTAGTGATGCTCGTCCCCCACCACCAACGCAAACTCTCACGCCACTGTAAGAAGAAGTCATCGCGAGTTTTGTCAGAGCCACCGTGAAATCTCGAAACTTGTAGTGCAAAAGCTCCAAAATCACAACGTCACCATGAGCATCATCGCAAAACGAAGCTCCTAGCTTCATCTCCTTTATGGCGAAACAATTCCTCGCAACCTGCAAAACGTGAAACACAGAAAGCCCCAAATCTCTTCGCACCAAAAACCCTAAATTGCGACTTCGCTCATCTTCCAAATTAAATCCCAAATTTAGATTAGAATTGATTTTTTTACTTGCTTTTCTGCTATAGGTAATACATTATGATCTTCCCAATTCTTTAGAAATATTTGTTCATAGATCTGGACGGACAGGTCGTGCTGGTAAGTAGATCTGGGCTGTGAGGCTTATTGAGCGTGATGTGGGAAGTAGATTTACAGAGGTGATATCCTTTGTTGGCATCTTATTGAATTTTGTCTATCTTTTGCACTGGAAGATGTACCTTGTTAATTTTATCTATCTTTTGCACAGGCGGCAATATCATAATTTGATTCAAAATCCATCACCATATCCAAAGGCTACAAGCAGTGAAACAAAATAAGCTTTTTTTTTCTTCTACGACGCCTGGTTAAATTGAAGAACAGCGTGAAGTAAGAATTGTTTCAGATA


Gene Sequence:
>Vu_10672(+)
ATGCATGAGCGTAAAGCTGTAATGGCTCAAGAAGCTGATGCATTTGTTGCTCTCCCTGGAGGATACGAAACCATGGAAGAGTTGTTGGAGATGATAACTTGGGCCCAACTTGTAATTCATAAAAAACCGGTTGGTCTTGTATTCATATTTTTCAGCTACCAAGGATAGTTGTTGATAGTGCATCCATGGACACAGTTGGCATGGATGATGGCCGATTTGGCTTTTTGGAGAAGATGAAGAATTTGACTTTTCAGAAATTCATATTATTATAATTTTATAAGTTGCTAATTTCCACGTTTCAACTCTCACCATGCCACGTGTTCAAAAATTGACACATCACCCTCCCATTTGTGCAAAAACTTAACCCCGTTAACTAAATTTAACAGCAAGGGCTCAATTGACTCAAATTAGCACTTTTAAGGACTCAATTGGAGATTCTAATAAAGGGGGAAAAACCCAAGGGACAACTAAAGGGTTTAAACCATTAAATTTAATGTTCATGTTATTGTGTCCATTTATAGCTGACTGATCGGGTAATAGGCCAAATAATTGAAAAGAATCGAGTTGTTGACATGCCATGAAAACATCTCTTGACCATTTGGTTCCGACAACTATTAAACAAAAATTAAAGTGCAATTAATGTCACAATGACTACTATTAAATGATTAAGATTTGTATTAATGATCATTAAGAGATAAATTAATTAGTCAAATTCTTTTAAACTCTATAAAACTGGGTTTAATTTCGAAGTATAGATAAATATTCTGACCTGTATTCTGCAGTTCACCCACCACATATCAATCGACACATCAAAACATCACTTAAACGACATCCTCGTCCCGATTTAACAGAAACAATTCATAATCACTCTTTTAAACTTTTTATTTCACAGATGATTTTTATTTTGCAAAATAAAACTCGTCCACTTTATTTATGGGAAATGTAATTACTTAAAATTCTGTCATTTTTTACATTTTAATATATTTTAGTTTTTAAATTTAAAAAACTAATAAATGCTGTTTTTAAATCTAATCGTATTAAATATTTTTTATCTTGTTAAATACGTTTTAAAATAATATTTAAATTGTTTCTATCATTTCAATAGATTTTAATTTAAATACTAACATGAAATATGATTTAATAAATCCAAAATATAATTTTATATTTTTTTTAAAGTTCAAAAATTAAAATATATTAAATAAAAGTTATAATTTCACGTATAAGTTTATAAAAAAAATAAAAACATAGTTAACCTTAAATTAAACATGTCAATATATTATTGTAATTGAGAAAGAAACGTGTGAAATCATAGGAGGCTTGATCATCGGAGGCGCGGATAAGTTGGTCAAATTTATCTCCTACAAATAGTTTTCATTTGGTCGCATTGAGGGATTTCATTTCTCTATGTCTGTCTGCTTTTCATTATACTTTCTATTTTCGTCGCAAATTCTTTCAATTATTAGGTTGACAGTTTGTTTCACATGTCATCAATGATTCTGAAAAAATGGTTTGAATGGAATCTGGCCGTGGCCATAATTCTAACTTCAAATAATGCATTGCAATCAATAAATAGACATAAAAATAAACATAAAATTGTTCTTATGATCATCAACTCGGAAGAGGAACACGTCATGTGTTGACGCATGCATGATGAAATACGTTTTAGAAATCAGAAATAATTCTTCACAGTAATTCTATTCTATTTGTGAACACGGGGAATTTAGATCCAACTCTGCTCCATTTACATTTTTTTTCAAGGGGAAAGATTTGAGAATAATAATACCATCCCAAAAACTGAAGCATATCCACACCATATATACACGAATGAGTTGAAGTTCTTCCACACCTTTGAACATACCTGCTTATAATTGAATCTGCTTTCCTTTTTCTTCAACTTCACATTTCCATAATGGCTGAAAAGGTAGCTAAACCAGCCTTGTTCTTCCTTTGCTTACTCATGTTTTTGTATGCAATGCTTTAATTCTAAATATACATATACATTCAAATGTTTTTGTATGCAAATCTTAATTGGTTTAGGTGGAAATGCTTGAAGCAAAGGTGCAACATATGAAAGAGCAGAATCGTACTCTACGAATGATGGTGGAAATTATGAGCAAGAAATGCCAGAAGCTTCAACTTCATGTTCAAGAGATCAACAATGCAGAAAGTGAGTTTTCCACAGCACAGAAGGCATCGCAAATCTTTGTTAAAATCCCCCCCAACGACAATAGTTTGGTATGCTCATTAATTAGTTGTGTTAATGCTCAAATATATAATTGATGAAGTTTAATTCAACTGGTTTTGGATATAGATAGTAAAAGATGGTTATGAGTGGAAGAAGTATGGTCAGAAGAAGACAACCAAAGACAATCCTTCACCCAGAGCTTATTACAAGTGCGCATTGGCTCCTACATGCCCTGTCAAGAAAAAGGTATATATACATATACTACATATGTACTTTGTTTAGATAAAGAATTTGAATTTATTAAATTTTTTTTTTACTAACATATATAAACTACAATTAAATATAAATAATTATTAATAATTCAAAAATGTTAATATTAATGTTTTCTAGGTTACTAACCCTTTTTTCTATTAATATTAGTTGGTGTTAACTTCAATTATTTATATCCACAAGGTTATTTTTGTGATGTAGATTTGAGTTTATTTTGTTGGTTTTTTTATTGATATTAACTGAAAAAAAAATTCAATTGAAATTGTTAAAAAAACAGAGAGTTAATGTTGGCTAAACTATTTTCCAATTAACATAAGAAAAGAAAATCTTATTGGTTAATTATATCATTAGCATTGATGATAGAAAAATAATTAATGCACATATTAAAAAAAATCATGACAAAAAAAACTGATTTATATTCGTAAGGAGTAATCTTTTTAATATTGGTCGAGAAAGTCATAATTAATATTAATTAATATCCAATAAAAAATAATCATAGTCTACAAAATAAATTGTATAATTATATAATCAATATTCTCCGAAAAGTAAATTTCTACAATGCCTAAATTTTAGTTAAGTTCACGACGTCCGAATCAAAATCGAGTTAAAGAAGGAATAATATCATAAAGATTTTATAAATTTAAAAATACAAAAGAAAATTAAATTCTTATAGTGAAATATGAAATATATAGTTTTAAATAATTTAATTAGTTTTCTAAAATTTTAGCTAGAATTAAAAAAATTCAATTATAAAAAGCATTTCAATTTTTTTTTATAAAAATAAATTACTTAAAATTTTCTACCCAAACTAATTATAAATATTTGTTATTTTCTAAGCCAAAGTAGTGGTCTGTATAAAAATAAGCTATAGCCTTTCTGCAATGATGTGTGATAGGTGCAAAGAAGCATACAGGATAAATCTATGGTTGTTGCAACTTACGAAGGAAAGCATAACCACGGTTTTCCTTTTCGTGATTTATTCAAGCCATCATCGGCTACACCCGAAGCCTCAATAATGGATAACGATTTACCTATGACAAACATATCAAACGACATCAACATCGACCTTTGTCTATGCAATCGTGTTCCAACAGATGTAACAGATAAACAGCAAAAGGACGGTGGCAGTAACATTAAAGTTCTGGAATGTGTAAGTTCTCTGCTAAAAGATCCTAACTTCATCAAACCATTAGCTGAAGCAGTTGTTCTCTCCATCAATACCCAGAGTAAGCAAGTGGGTCTTAACCTGAGTTTGGGTCTTCCTCAACCGCATTTGTCTAAGTGA