Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10652 LG2 47207147 47211812 PREDICTED: two-component response regulator ARR12
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 47207235 5_prime_UTR_variant
A/C 47207299 5_prime_UTR_variant
G/A 47207319 5_prime_UTR_variant
G/T 47207491 intron_variant
T/C 47207642 intron_variant
G/C 47207777 intron_variant
C/T 47208182 synonymous_variant p.Leu84Leu
G/T 47208520 intron_variant
A/T 47208849 missense_variant p.Lys178Asn
G/T 47208855 missense_variant p.Lys180Asn
T/C 47209003 splice_region_variant&intron_variant
G/A 47209503 synonymous_variant p.Gly277Gly
A/G 47210132 missense_variant p.Lys487Arg
C/G 47210134 missense_variant p.Pro488Ala
C/G 47210135 missense_variant p.Pro488Arg
A/G 47210383 missense_variant p.Thr571Ala
T/A 47210394 missense_variant p.Asn574Lys
G/T 47210412 synonymous_variant p.Ala580Ala
T/C 47210562 synonymous_variant p.Ser630Ser
T/C 47210984 downstream_gene_variant
T/C 47210998 downstream_gene_variant
T/C 47211140 downstream_gene_variant
G/T 47211265 missense_variant&splice_region_variant p.Glu653Asp
C/T 47211508 3_prime_UTR_variant
A/G 47211604 3_prime_UTR_variant
C/T,* 47211709 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10652.1
MTVEKRMSDSGEEFPVGMRVLAVDDDPICLMVLENLLRKCQYHVTTTNQAITALSLLREHKDKFDLVISDVHMPDMDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSANGDTKLVMKGISHGACDYLLKPVRMEELKNIWQHVIRRKKFDSKEKNKTSNLDKPTSDSGNGHGSSGAVNSDQNEKLTKKRKDQDEDEDEEQENDHDNDDPSTQKKPRVVWSVELHRKFVAAVNQLGIDKAVPKKILDLMNVEKLTRENVASHLQKYRLYLKRISCVANQQANMVAALGGADPSYLRMSSVNGVGHLQTLTGSGQLHNNGFRSFPPGGIINRLNTPAGLNVHGFPSGVLQLSQSQNLNNTNDHLKFRSAITPVNQNGVQGMPLSVQNNKSLISVQNLTSVFNAKTNFPISNKLPDPRPKITSVSRTSDVGISNNGLMLEPCPQSTQGSVRIETLSSVASQHSEFSLPLLDQGRYNDSWTSAVQPSVIQTNSYPPSECFKPTNVPPPDNMATIPLQGGNLTGPSITSLSRQSHDSMTDMHSEGLTLTNRPGNISSNVPFQGWDDRNHDATHHSNNMFASINSLTPVNGAAVPAGHAAANSASHRNLDFNFCDPLQMKHDGFVELTEEISSKQHQGNILNQQKSQHSHFSSNLGSLEDLVSSMMKQEKDRLKLLDENLFCDNYPGGLSM*


CDS Sequence:
>Vu_10652.1
ATGACTGTGGAGAAGAGAATGAGTGATTCCGGCGAAGAGTTTCCCGTCGGAATGCGTGTGCTCGCCGTCGATGATGACCCCATCTGCCTCATGGTTTTGGAAAACCTCCTCCGGAAATGTCAATATCATGTAACTACGACAAATCAAGCAATAACAGCGTTGTCGCTTTTGAGAGAACACAAAGACAAGTTTGACCTGGTAATCAGTGATGTGCATATGCCAGACATGGATGGATTTAAGCTGCTTGAGCTAGTGGGACTTGAGATGGACCTTCCCGTCATAATGTTGTCTGCAAATGGTGATACGAAGCTGGTGATGAAAGGGATTTCTCATGGAGCCTGTGATTATCTGCTGAAACCCGTGAGAATGGAGGAGCTCAAGAACATCTGGCAGCATGTAATCAGAAGGAAGAAGTTTGACTCAAAAGAGAAGAACAAAACGAGCAACTTAGACAAACCCACTTCTGATAGTGGCAATGGACATGGATCATCAGGAGCTGTAAATTCAGATCAAAATGAGAAGCTGACTAAGAAACGGAAGGATCAAGATGAAGATGAAGATGAGGAACAGGAGAATGATCATGACAATGATGACCCGTCAACCCAGAAGAAACCTCGGGTGGTTTGGTCTGTGGAACTGCACCGCAAGTTTGTTGCTGCTGTTAATCAGCTAGGCATTGACAAGGCTGTACCTAAAAAAATTCTTGATTTGATGAATGTTGAAAAGCTTACTAGGGAGAATGTGGCGAGCCATCTCCAGAAGTATAGGCTTTATCTGAAAAGAATTAGTTGCGTGGCTAACCAACAGGCTAATATGGTGGCGGCCTTAGGGGGTGCAGATCCATCCTATCTGAGAATGAGTTCTGTGAATGGGGTTGGACATTTACAAACATTGACTGGTTCTGGGCAGCTTCATAACAATGGTTTTAGATCCTTTCCACCTGGTGGGATAATTAATAGGTTGAACACTCCTGCTGGTTTGAATGTGCACGGATTTCCTTCTGGAGTTCTTCAGTTGAGTCAGTCACAAAATTTAAACAACACTAATGATCATCTGAAGTTCCGGTCAGCCATCACTCCTGTTAATCAGAATGGTGTTCAGGGAATGCCATTGTCTGTTCAAAACAATAAGAGTCTCATTTCTGTTCAAAATTTGACCTCCGTTTTTAATGCCAAAACAAATTTTCCCATCTCAAATAAACTCCCAGATCCAAGACCAAAAATAACATCTGTCTCTCGCACTTCAGATGTAGGTATCTCAAACAATGGCTTGATGTTGGAACCATGCCCTCAAAGCACACAAGGGAGTGTAAGGATTGAAACTTTATCTTCAGTGGCCTCTCAACATTCAGAATTTTCTTTGCCTTTGCTGGATCAAGGTAGGTATAATGATAGTTGGACAAGTGCTGTGCAGCCATCTGTGATCCAGACAAACTCTTACCCTCCAAGTGAATGTTTTAAACCGACAAATGTACCTCCTCCAGATAACATGGCTACTATACCCCTGCAAGGTGGGAATCTGACTGGTCCATCCATCACTTCACTGTCCAGGCAATCCCATGATTCAATGACCGATATGCATTCTGAAGGGTTGACTTTAACTAACAGACCTGGGAATATAAGCAGTAATGTACCGTTTCAAGGGTGGGATGACCGAAATCACGATGCTACTCATCATTCGAATAATATGTTTGCATCAATAAACTCACTGACTCCAGTCAATGGTGCTGCTGTTCCAGCGGGCCATGCAGCAGCAAACTCAGCCTCACATAGAAATTTGGACTTTAACTTTTGTGATCCCTTACAAATGAAGCATGATGGTTTTGTGGAATTAACTGAAGAGATCTCATCTAAGCAACATCAGGGGAATATCCTGAACCAGCAGAAGTCTCAACATAGTCATTTTTCTAGTAATCTTGGTTCATTGGAGGACTTGGTCAGTTCAATGATGAAACAGGAGAAAGACAGGCTGAAATTATTGGATGAAAACCTCTTTTGCGATAATTACCCTGGTGGGTTATCTATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10652::LG2:47205147-47207147(+)
AAATATACTATGATAAAAAAATTATATATTAAAAGAAATCATGAAGTAAAATCTGTATTAATACTTTTAAATACATAACACTAATGAAATAACAAATAAAATATTTACTCATTCAACATATAAATAGTACTACACAACAATAAAATATTAAAAAATATAATGTAAATTGTAAATTAGGACTTCCCATCCTCAGCTTTGAATCGTAATTTGTTCATTACGCTTGACTCACTTATGGAGACTAAGAATTGCATGCCAACTTCAATCCGACTCCATTGTCATCCCTATTAAATATTATATTTTATACTTCTCCATTAATGCAACGACTAACCGTACAAAATACTCTTAATTCAATTAGTTTAATCAAAATTAAATGTTTAACTTTGAATTTGCACCTTTAATTTTGAATGAATGATTTTGGGAAGACAATTTTGATTTTTGTATTGATGAAAAGTGATTGGTTGGACCAAAATGCAGATCATGTAGAAGAAGATCCGATGGAGGAAATTATGGACAAAAAATGTCTTCTTGACTCTGATTATTCTCTTAACAGAATTCTAATAATTTTATAATCAAAGAAAGAAGAGGAAACTACATGCATTAAGCTCAGATAATCTTTGTTTATTTGCTGTGTGGAGTCTTCAAAACCATCTTTAAATGCGATGAATTTCATTATCAAGCATTTTAAGAACTTTATTATCCATAAAAAAAATAAAATTCTGCTTTCACATATACTTGAATAACACAAATTTAATGAATTAATTAAATATAAAGATAAATCTACAATATATGAAAGTAAATACAAAACTTGCACTACAAACTAATTTTATAATATTAAATTTAAAGTTTACTTAATACCACCATCATTCAAAATCTACATTTGTTTGTTGAATATATTCTAATATTTAATTTATCATAATATTTAATTTTGCACTAGTGATAAAAGTATGTTATTAATATGGTGGCAGTAAACTCTAAATGAAAACAAAAAATCCAGTTTTATAGATTAAAATGTAATTGGTATAGAAATTTCATTAAAAATACTCTGTTAGATTCTTCGAAAATAAATCATATGTTAAGTGAAGATAATTACATATATTCCAAAATAAAATATTTTAGACGATATATATTAGCTATTTTTTTTCAAGATAAATAATTCATCCTGGCATCATACTTGTTGCTTTTTTTATGATTTGTTTTAGAAATAATGAAGGAGAATTGACTGTGAACTTTCATTCGAACTCTCATTTTTGTTTACAATTATTCTTATTTTTATTATATATTAAAAAAATAAGTTGAAAATTGTAAGAAATGAGTAATATTAATATAAATTTATAGTGAAAAGCCAAAAAAGACAGTTTCTATCCCAGCACCGTCCAACGTCCAATGAATGAGAAAATATATTCTGATTGGATTCGGTTCTCTTTCGAGCGCGTGCGGAAGACGCGCATGTTTTTCTCACAAATCTTAAGATTTGGCTTCACTACAAGATTGTGATTAAGACCACTGCAATAATTTTATTTAAGAAAAAATGAGTACTGTTTATAAAGAACTTTGAAGAGAATCATTCTAAAATTTTAGAGATAAAAAAACATATACAATATTAAAAAAAAAAAATATAAGAGACAAGATTAAGATTTGAAGACAACTTTTTTAGACTCTTTAATAAATTTTGATGAGTTGGTATATGAGGTTTGAGTAAAAGCCAATTTAGTAAAATATGATAATTTATGACTTATAGATAATAAATTGATAAAGCCCAATCTTGTTAAATTTTTTTAAAAGTAGAAAGAGTTAATTAATTAAAAAAGCATATGAGATTAACATAAAAAAAAGTGGAGCATGTTTAATAATATAAATTAATGATATATTTAGGTCTATAGAAGTTTGGATTGTGAATAGGAACACACAATAATAGTTTCTCTCTCTTTCTCAATCACTTTCTCCTTCCACTGTTGCACGCTGACACCCACATAAGCACAAAAAGACACCAACTTTTTCGC


Gene Sequence:
>Vu_10652(+)
CTCCTTCCTTGCATTTATTGTTCTTTTCAATTATTCATTCACATTGTCCTCACAAATTACTATTTATTCCCCCACCAAAAAAAGTCTTTTTTTTTTTCAATTGTTTTCTGTGTCTTCTGTTTCATAGCTTCTATCTGGGTTTTGGTTTCTGAACCACGAGCACAGAAGTGGTGTTTGTGAAGTTTGGAGAAGAAAATGACTGTGGAGAAGAGAATGAGTGATTCCGGCGAAGAGTTTCCCGTCGGAATGCGTGTGCTCGCCGTCGATGATGACCCCATCTGCCTCATGGTTTTGGAAAACCTCCTCCGGAAATGTCAATATCATGGTTTGAATCTTCTACTGTTGCTTTTACTTACTCTTATTCATGATTTAGGGTTTTGGTTTGTGCTTTGTTCTTTCTTTTAGATTTTTGTGTTCTGTTTTAGATTCTTTTGTTCGTGGTAGTTAATATGGATATACTTTTACTAATAAAATTGTTTATAGAGAATACTACAGTGAACTCCAACTTCCTTAATTGTTGCAGAGGAAGCTTTTGTTGTAGGTTATATTATAGGCTACATATTTGTTTTACTGCTTGTTGTGCCTTGATTTCGATGCAGGATCTCATTATTTCTTTGGCATGAGTATTTTGTAGCGTGTTTGGTTTCATATTTGGGACATGATTTTCCAGGTCTTGGATGTGATTTTAGAAGCTAATAATTGTAGCTTCCCCACCCTAAACGTGATTTTCAGAATCTAATATTTATAGGCTTATAGCTTCCACATCCCTAACGTGATTCTTCCATCTTTAACAAAATTCCAAATATGCACTTTGATGAACATTAGTTTTGTAACTGTCTATCCTGCGGATGTGTGTGCAATGTGCCTCTTTACTCTTTCAGAATGATATTTATTTTGGTTATGGATGGGGTTGCAGTAACTACGACAAATCAAGCAATAACAGCGTTGTCGCTTTTGAGAGAACACAAAGACAAGTTTGACCTGGTAATCAGTGATGTGCATATGCCAGACATGGATGGATTTAAGCTGCTTGAGCTAGTGGGACTTGAGATGGACCTTCCCGTCATAAGTGAGTGAGAGGATGTTGTATGCTTATATCTGATCTTGGTACCTATGTTCACCATTTCTTCATTTTAACTATCATTATTTCACCATTTCTAACTTGATTAACAATTATTGATATAGTTATTAATCAAGTTAGAAATTTAAGGTATTTAGATGTCAAATAATGAGTTTTCTAACTTTTCCTTTTAAAAAAAAATCATCTGTACTATGTTTTTGTATAAATAGTCCAGTCCTGCAATAGAACTTTTTAAGTTTCATAGTTGGCTTTTGATAAATGTGAAAATGTGAAGAGTCAATAATGTTATGTAGGAAGGCTATTTTGAGTTATTTGCGCAGCTTCAATGAGTATTTGGTGAACCTTTGGTGTTATAAAATGTTTTATTCCAGTGTTGTCTGCAAATGGTGATACGAAGCTGGTGATGAAAGGGATTTCTCATGGAGCCTGTGATTATCTGCTGAAACCCGTGAGAATGGAGGAGCTCAAGAACATCTGGCAGCATGTAATCAGAAGGAAGAAGTTTGACTCAAAAGAGAAGAACAAAACGAGCAACTTAGACAAACCCACTTCTGATAGTGGCAATGGACATGGATCATCAGGAGCTGTAAATTCAGATCAAAATGAGAAGCTGACTAAGAAACGGAAGGATCAAGATGAAGATGAAGATGAGGAACAGGAGAATGATCATGACAATGATGACCCGTCAACCCAGAAGAAACCTCGGGTGGTTTGGTCTGTGGAACTGCACCGCAAGTTTGTTGCTGCTGTTAATCAGCTAGGCATTGACAGTATGTTATTCACTCTTTTACAGGATAAGACAACTGTTATAACTTCTATCAAATTTTTGATGAGCTTATTCAAATTGTTCTCATTATTTTTGTTATTTTCATGATGCTTTTTGATATCTGGTTAGATTCAATTAAACGTTCAGAACATATATATGTTGTTAATTATTCTGAAGACTTTCTTAACACTCTTCCTTATTTTTAAGTGACACCTGGGATTGTAAGGTCACAATTATTCAAAATTTATGCCATTGATATTGTTGTTTTGCTGGCAGAGGCTGTACCTAAAAAAATTCTTGATTTGATGAATGTTGAAAAGCTTACTAGGGAGAATGTGGCGAGCCATCTCCAGGCATTTTTCTAGTCCTTTGTGTTTTAATTTACTGTAACATAACTTTCCATTCACTGAATGTTTCTTCTGTATGAAATGGCTGCAGAAGTATAGGCTTTATCTGAAAAGAATTAGTTGCGTGGCTAACCAACAGGCTAATATGGTGGCGGCCTTAGGGGGTGCAGATCCATCCTATCTGAGAATGAGTTCTGTGAATGGGGTTGGACATTTACAAACATTGACTGGTTCTGGGCAGCTTCATAACAATGGTTTTAGATCCTTTCCACCTGGTGGGATAATTAATAGGTTGAACACTCCTGCTGGTTTGAATGTGCACGGATTTCCTTCTGGAGTTCTTCAGTTGAGTCAGTCACAAAATTTAAACAACACTAATGATCATCTGAAGTTCCGGTCAGCCATCACTCCTGTTAATCAGAATGGTGTTCAGGGAATGCCATTGTCTGTTCAAAACAATAAGAGTCTCATTTCTGTTCAAAATTTGACCTCCGTTTTTAATGCCAAAACAAATTTTCCCATCTCAAATAAACTCCCAGATCCAAGACCAAAAATAACATCTGTCTCTCGCACTTCAGATGTAGGTATCTCAAACAATGGCTTGATGTTGGAACCATGCCCTCAAAGCACACAAGGGAGTGTAAGGATTGAAACTTTATCTTCAGTGGCCTCTCAACATTCAGAATTTTCTTTGCCTTTGCTGGATCAAGGTAGGTATAATGATAGTTGGACAAGTGCTGTGCAGCCATCTGTGATCCAGACAAACTCTTACCCTCCAAGTGAATGTTTTAAACCGACAAATGTACCTCCTCCAGATAACATGGCTACTATACCCCTGCAAGGTGGGAATCTGACTGGTCCATCCATCACTTCACTGTCCAGGCAATCCCATGATTCAATGACCGATATGCATTCTGAAGGGTTGACTTTAACTAACAGACCTGGGAATATAAGCAGTAATGTACCGTTTCAAGGGTGGGATGACCGAAATCACGATGCTACTCATCATTCGAATAATATGTTTGCATCAATAAACTCACTGACTCCAGTCAATGGTGCTGCTGTTCCAGCGGGCCATGCAGCAGCAAACTCAGCCTCACATAGAAATTTGGACTTTAACTTTTGTGATCCCTTACAAATGAAGCATGATGGTTTTGTGGAATTAACTGAAGAGATCTCATCTAAGCAACATCAGGGGAATATCCTGAACCAGCAGAAGTCTCAACATAGTCATTTTTCTAGTAATCTTGGTTCATTGGAGGACTTGGTCAGTTCAATGATGAAACAGGTAATATCATTTATGAATATACGGGGTTTTTCCAAAAATGTTTCTGTATTATTTTTAATCATGTTGACTACACGAAGTGGTCTCATGCTTAAGTGCTTTAAAGTTACTATTTAAAAATCTATCGGTTTTGTATTTCATGTAGATGCAATCACTGCATAATATATGCGAATCTTTTTTATTAAACTGATACCATCCCCACCAATCATAATTTTCACTCCCCGGTCACATATTTCCTGTACGTCATTCTCCTTGGATTATATAATGTTTAAGCATTGTTATACTTGTCCTGCACACTGCAAAGGGCTTGAACAGTTACATTATAAGCATTTGGTGAAATTCTGCTTTTCCCGTATGATAAAATTTATGGGCTACATATATATTTCGTTAGTGTTCATTGTGTTAAGTCTGCCAAATAAGAGCAACTACCACCATCCTTTTAACTCTCGCATTGGCTAAATCCATCTTATTTGTCTATCCTGGATTGGTTAAATAACTTGTCTAGAGAATATTATATCCTGTTATTTTAGCATTTATGATCTAGTATTTTAGTATTTATTGATCATTGTTTTATCTTGCATTTGTCTTCAATATTTCCCTCCCAAACTCATTCAGTGCCAATGTTCATGCCATGCAGGAGAAAGACAGGCTGAAATTATTGGATGAAAACCTCTTTTGCGATAATTACCCTGGTGGGTTATCTATGTGATAGAAGATTTGCCAGCACATACCAACATATGCTTCCATGTTGATGAGTTTTATAGTTTTCATTGTGTTTAACCACTTTTGTCTTCCTGTAGTTTACTGTAGAGTTTAGCTTGTCCAGGTTACTTTGTACTGAGCAAAGTTCTCTAGGTTCTAAGGGCTTTCTAATTTTATACACATGCATTGTTGTCCCAGTCTTTGGGTCCAGCAATGCGTTATCAAGTTATTAATCACTTTGTTTGATCTCCGTTTACATGTTGGCCTGCAAATTGGACCTTTATCTTCATTCATCAGTCATGCTTTGCAGTGATAAGAGACAGACACGGGCCAGGTGGAACTCACTAGACAAATGAGTACCCACTTGAACCCTGAGTGTTTCTCACACCTTTCTAGACTGATCAGGAAATGCAACTTTGTTAAGTGTAAGTGATTACGATGATGAATGACAATAAACACCACCCCTCCTTGGAAATGTTGTCTTT