Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10651 LG2 47192616 47193660 PREDICTED: zinc finger protein 1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 47192635 3_prime_UTR_variant
G/A 47192723 3_prime_UTR_variant
A/C 47192739 3_prime_UTR_variant
A/G 47192811 missense_variant p.Leu261Pro
G/A 47192819 synonymous_variant p.Asp258Asp
C/T 47192919 missense_variant p.Arg225Lys
C/T 47193010 missense_variant p.Gly195Arg
C/T 47193021 missense_variant p.Gly191Glu
G/C 47193112 missense_variant p.Pro161Ala
A/G 47193146 synonymous_variant p.Ala149Ala
G/C 47193170 missense_variant p.His141Gln
G/A 47193176 synonymous_variant p.His139His
A/T 47193431 synonymous_variant p.Pro54Pro
C/T 47193460 missense_variant p.Gly45Arg
T/A 47193462 missense_variant p.Lys44Ile
T/C 47193463 missense_variant p.Lys44Glu
T/C 47193485 synonymous_variant p.Glu36Glu
T/C 47193614 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10651.1
METLSYQAPCDSLSVGVTPSSPSKPLQNPQKKLEEEEEGEKEKKGDTLLDLNVPGDDSATGCSPVLNLITCLEADLSSEDPHEPRVFSCNYCQRKFYSSQALGGHQNAHKRERSIAKKSHRSVSTMVAPATAFGIPSLHNHLPHYPTVASLPLHGAFGNKPLGIQTHCMIHRPPPLLPPHFSFNGFSNTFGHHHGWSRPLITQQPGIGKLTMESCRKTSRDKVDRLQLKSAGNEEISEYLVSGNTGLKTGQEKKKHLDLSLKL*


CDS Sequence:
>Vu_10651.1
ATGGAAACACTGAGCTACCAGGCTCCCTGTGATAGCCTTTCTGTTGGAGTGACTCCTTCAAGTCCAAGCAAACCATTGCAGAATCCACAGAAGAAACTTGAGGAAGAAGAAGAGGGAGAAAAAGAGAAAAAAGGAGATACTTTACTGGATCTAAATGTCCCTGGTGATGATTCTGCTACTGGGTGCAGTCCGGTGCTGAATCTCATCACTTGTCTGGAAGCGGATTTGTCATCAGAAGACCCCCATGAGCCAAGAGTGTTCTCTTGCAACTACTGTCAGAGGAAGTTCTACAGTTCACAAGCTCTTGGTGGACACCAAAATGCTCACAAAAGAGAAAGGTCCATAGCAAAGAAAAGTCACAGATCAGTATCAACCATGGTGGCCCCAGCAACAGCTTTTGGAATTCCCTCTCTCCACAATCACCTTCCTCACTATCCCACTGTGGCTTCTCTGCCTCTCCACGGTGCTTTTGGTAATAAACCGCTTGGAATTCAGACTCACTGCATGATTCATAGGCCTCCTCCTCTTCTTCCTCCTCACTTCTCATTCAATGGTTTTTCAAACACTTTTGGACATCATCATGGGTGGTCAAGACCCCTTATTACTCAACAACCTGGGATAGGGAAGTTAACTATGGAAAGTTGTCGCAAAACATCACGAGACAAAGTTGACAGATTACAACTCAAGTCAGCAGGTAATGAAGAAATAAGTGAATATCTGGTTAGTGGAAATACTGGTTTGAAGACTGGTCAAGAGAAAAAGAAGCACCTTGACTTGTCCCTAAAGCTCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_10651::LG2:47193660-47195660(-)
TAAATTTAAAAATATTATGAGTAATTATTTTAAAATTATCTTTGTATAAAAATTTAAATACATATCATATGTTTATATTTACGAGTAATTATCTCTATATAAAAATTAAAAATTTTATCCATAAGATTGAAACTTAAAAGATTGAATCTGAATACTCTCTTGACTCACAAGAAACGAACTAAATGTTTTTAATTATCATTAAACCTTCATTTATTATTTTTCTATGTTTAATTATTTTAATTTTAGATTAATTAACCATGTTTTTAACTGTAATTATAATATTGGTGTACTTTAAATCAAACTTTGCAACAAAAGAAGTATATGAAATTTTATAAGATGTAAACTAAGACATCAAATTTGATACGAAGTAATAATAGAAATATACCTTAATTTCATGGATATCTACTATATATAATTTATCACATCATATATGTTATAAATTTATAAACTATATTCTCTATATGTATATTAAGTGTTTATGAATCTTTTTGTCTACATGAACATTATTTGCTTTGATATATTATACTTTTGTAACAGTACAAAAGATTGTTTTGTAAGAGCAGTTATTTTAAGTTCATAATTCGATTTGGGATCGAGGTTAAGTTTTATTACATAAATTATTTTTTCTGTCTAAGTTTATATTGCAGTTTGGTCTTAATTTTTCTTTCACCATTTGATTTACTTATAAAAGACATTCTAAAATTTAAGTTAATATTTGTTTGAACAATTTGACAATAAATACATAATCAACTATCATATCTATATTTATAAAATTTCATGATAAGTTTTTAATTAGAGCTAGTCGCTTATATACCAATAACCTAATTATTCTCAATAACTAATGTTATCTGTGGTCTGACTAAACAGTTTATAAAGGTTTCGTTTCTGGCTAATAATACTCGGAGAGTATTTACAATGTCTTGTTGGATAAAAATGATAGCATGTATTGAATAATGAAGGGACGTGAATAAAAAGTAAATGTAAACCATTAACAGTGCCTAATGATGATTACCGGTTTGAAATTCCAATCATATCTTCATTACAAGCCGAATTGAATGGCGCCTTAAACAAGCAAGCACTAATTTTGTTTGCTTTTTCAAATTTCATAGAAATACGTCACACACAGTGGGCCTGGGTATGAAGTTGTGCCTTATAAGTGTCTATCCAGAAAGCAGAACAACTGAGGAAGCAGAAAAAGCCAAAGTGAAGGAAATTTTTATTTCCAAACGAGAGACGCAAAGGGACAGTTTAACAACAACTGGGGACATGTTGGCCTGATTGATGGACTTTCAAGTACGAAGGGAAGTTTGTTTGGTTACGAGTTTGGTCTCCATTACAATGTTTGGCTCTGTGTCCTATATGACATTATTAGGTTCGCTTTTGAAGCTGCGCGTGATGGCATGATAATCTTCTCCTGATCCTTGCTGCACCCAAGGGCCAACTACAAATGTTGTACCTTAATGCTGCTCTCCAACACCAACAATGATGCCACCATATGTGTCTTTACATGACCATATGACAGAGACCAGAGACTTCACTTCACAACATCTTCTAAAGGGTGAGGCTCCAAATCATCCAGCTCATGCAGATTTAAATCTTTTTTACCTAAACTACTTCAACCCAAACCAAAAGCTTTTTGCATGTGTGGGCCACCATGTAAAAGTACAATGCAAATACACAATTGCATTAGTCTCACTCTATACAGCAGGCCACATGGGTGGTGACACTGTCACTCCTGGATTTTCATTAAAAGTCAAAAATACTGTCTACAAAACTACTCTCTGCTCTATCTTTTCTATTAACTTTCTACATTCATCATCAAAATCTAATTAACTTCTCAATAAGCTGATTAACCTCTGTAATAAACCTAACCCACTGATCTGATGCTGACCTATTTAAAAATATATAATTCATTCTTTTTTCATACACTTACCTTTGACAGTAAATGATAAAAAATATAAAAAATAAAATAGGAATATGGTTTGAGCCTCCTTCAATAT


Gene Sequence:
>Vu_10651(-)
ACTGCTTTTGTCCATTTAAAGCTAGGTGTCAAGAATCATCATACTAAAATTTTATAAAGTGACCTACAATGGAAACACTGAGCTACCAGGCTCCCTGTGATAGCCTTTCTGTTGGAGTGACTCCTTCAAGTCCAAGCAAACCATTGCAGAATCCACAGAAGAAACTTGAGGAAGAAGAAGAGGGAGAAAAAGAGAAAAAAGGAGATACTTTACTGGATCTAAATGTCCCTGGTGATGATTCTGCTACTGGGTGCAGTCCGGTGCTGAATCTCATCACTTGTCTGGAAGCGGATTTGTCATCAGAAGACCCCCATGAGCCAAGAGTGTTCTCTTGCAACTACTGTCAGAGGAAGTTCTACAGTTCACAAGCTCTTGGTGGACACCAAAATGCTCACAAAAGAGAAAGGTCCATAGCAAAGAAAAGTCACAGATCAGTATCAACCATGGTGGCCCCAGCAACAGCTTTTGGAATTCCCTCTCTCCACAATCACCTTCCTCACTATCCCACTGTGGCTTCTCTGCCTCTCCACGGTGCTTTTGGTAATAAACCGCTTGGAATTCAGACTCACTGCATGATTCATAGGCCTCCTCCTCTTCTTCCTCCTCACTTCTCATTCAATGGTTTTTCAAACACTTTTGGACATCATCATGGGTGGTCAAGACCCCTTATTACTCAACAACCTGGGATAGGGAAGTTAACTATGGAAAGTTGTCGCAAAACATCACGAGACAAAGTTGACAGATTACAACTCAAGTCAGCAGGTAATGAAGAAATAAGTGAATATCTGGTTAGTGGAAATACTGGTTTGAAGACTGGTCAAGAGAAAAAGAAGCACCTTGACTTGTCCCTAAAGCTCTAAGCATCATGGAATTTAGTCCTTGATTAGAAGGTTAATGTTTTGCCAAATTTATTGTTTAACATCTTGCAATAAGATAGCGTTGTAAATTTGTTTATGAGAGGATCATGTTCTTGGAAGTTTGTTAATTCCTTTTAAGGAAGGTTTAATTTTTTGTTTTAATCTGAACATATAGGCAGTTTCTTTTC