Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10646 LG2 47122009 47125628 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   positive regulation of cellular metabolic process, secondary metabolic process, protein phosphorylation, response to light stimulus, protein phosphorylation, positive regulation of cellular metabolic process, phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 47122050 5_prime_UTR_variant
A/T 47122183 5_prime_UTR_variant
C/A 47122268 5_prime_UTR_variant
G/C 47122319 synonymous_variant p.Val8Val
A/G 47122409 intron_variant
C/A 47122417 intron_variant
C/A 47122733 intron_variant
T/A 47122739 intron_variant
C/T 47123009 synonymous_variant p.Leu159Leu
C/T 47123092 intron_variant
A/C 47123336 intron_variant
T/A 47123517 intron_variant
A/G 47123586 intron_variant
G/A 47123750 intron_variant
G/T 47123764 missense_variant&splice_region_variant p.Gly238Val
A/C 47123765 synonymous_variant p.Gly238Gly
G/A 47123976 intron_variant
G/A 47123977 intron_variant
T/C 47123995 synonymous_variant p.Ser271Ser
A/G 47124436 intron_variant
G/A 47124469 intron_variant
C/G 47124518 intron_variant
T/A 47124577 intron_variant
A/G 47124633 downstream_gene_variant
G/T 47124878 splice_region_variant&intron_variant
A/T 47124882 downstream_gene_variant
G/A 47125072 downstream_gene_variant
T/A 47125098 downstream_gene_variant
G/A 47125338 3_prime_UTR_variant
T/C 47125363 3_prime_UTR_variant
T/A 47125466 3_prime_UTR_variant
A/T 47125488 3_prime_UTR_variant
A/T 47125494 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10646.1
MKKNLLFVFILLLHYVAAADPPASSPQLPPDLSPGEGQHHLHKKMLVAIVVATISLAVLIFGFLCFWIYHTKCPTKSKTKKVQTPGPDAERGITLAPFLSRFSSVKIVGMKESVPIVDYKQIEKTTNNFEESNILGEGGFGCVYKARLDHNLDVAVKKLHCETQHAEREFENEVKLLSKIQHPNIISLLGCSADGDTRFIVYELMQNGSLEAHLHGPTHGSALTWHMRMKIALDTARGLEYLHEHCYPAVIHRDMKSSNILLDANFNAKLSDFGLAITDGSQSKKNIKLSGTLGYVAPEYLLDGKLSDKSDVYAFGVVLLELLLGRKPVEKLAPTQCQSIVTWAMPQLTDRAKLPNIVDPVIKDTMDHKHLYQVAAVAVLCVQPEPSYRPLITDVLHSLIPLVPIELGGTLRVSQVRQHASLAVNSRL*


CDS Sequence:
>Vu_10646.1
ATGAAAAAGAACCTTCTTTTTGTGTTTATTCTTCTTCTGCATTACGTTGCTGCTGCAGACCCTCCTGCTTCCTCTCCTCAACTTCCACCTGATCTCTCTCCAGGGGAGGGGCAGCATCACCTGCACAAGAAAATGCTAGTAGCTATTGTCGTAGCCACCATTTCACTTGCTGTACTCATTTTCGGTTTCTTATGTTTCTGGATTTATCACACTAAGTGTCCAACAAAATCCAAAACCAAAAAGGTTCAAACTCCTGGTCCAGATGCAGAGAGGGGGATCACCCTTGCACCGTTTCTGAGCAGATTCAGTTCCGTCAAAATTGTTGGTATGAAGGAGTCTGTGCCGATAGTTGATTATAAGCAAATAGAAAAAACGACCAATAATTTTGAGGAAAGTAACATCTTGGGCGAGGGTGGTTTTGGATGTGTTTACAAGGCTCGGTTGGATCATAATCTGGATGTTGCAGTAAAAAAACTACACTGCGAGACTCAACATGCGGAAAGAGAATTCGAGAATGAGGTGAAATTGTTAAGCAAAATTCAGCATCCGAATATAATCTCCTTACTGGGTTGTAGCGCTGATGGTGACACGAGGTTTATTGTTTATGAGTTGATGCAAAATGGATCATTGGAAGCTCATTTACATGGACCTACTCATGGCTCGGCATTGACATGGCACATGAGGATGAAGATTGCTCTTGACACAGCAAGAGGACTAGAATATCTGCATGAGCACTGCTACCCTGCAGTGATCCACAGAGACATGAAATCTTCCAATATTCTCTTAGATGCAAACTTCAATGCCAAGCTGTCTGATTTTGGTCTTGCCATAACTGATGGGTCCCAAAGCAAGAAGAACATTAAACTATCGGGTACCTTAGGATACGTAGCACCGGAGTATCTTCTAGATGGTAAATTGAGTGATAAAAGTGATGTGTATGCTTTTGGGGTTGTGCTATTGGAGCTTCTATTAGGAAGGAAGCCAGTGGAAAAACTGGCACCGACGCAATGCCAGTCTATTGTCACATGGGCCATGCCACAGCTCACAGACAGAGCCAAGCTTCCAAACATTGTGGATCCAGTGATTAAGGACACAATGGATCATAAACACTTGTACCAGGTTGCTGCTGTAGCTGTGCTATGCGTGCAACCAGAGCCTAGCTATCGCCCTCTCATCACAGATGTTCTTCACTCACTTATCCCTCTTGTTCCCATTGAGCTCGGAGGAACACTGAGAGTTTCGCAAGTGAGGCAGCATGCCTCTCTTGCTGTGAATTCCCGTCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10646::LG2:47120009-47122009(+)
AATCTTGCAACACAAATTAGATGTGTTTGCCCATACACTAATTAAATGAGTCTAACAATATACATTAGACGTGTTTGTTTATACAAATATTATGAGTCTATTAATACACACTAGACAATTATATTCATTTTCTAATTAAATGTGTTTTGCAATACATATTACATAAGTTTGTTTATAAACATTGGATGAGTGTAACAATACACATTAGAGGAGTTTGTGCATATACTGATTAGATTAATCGAACATTAGATATTAGACTATTTTGTTGATGTACTTATCACATGAGTCTAATATAATTAATTAGACCAATATACCCATACACTATTTATATTTATAATATATTGCATAGTCAAGTTTACTCTATATTTTTTAACATATTATATTCTTTTTGTATTTTTATAAAATTTACTTTTTACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAACTTTATAAACTTATGAATATTTCTTCACATGGATTTTATTCGATCTCTAAAAATTTTTATTAAAATATATATTTATTAACATAAAAACACGTACAAAACAAACATCAATTCAAGTGGGTTTAAAACTAGTTTTGATAAAAATAACTCATAACTACTTAATTTCTAAACATTTCATAAATGCTGTTAATTTTTTTTTACTAATTATTCTTTTAGCTATTTAAAAGAAATAAAGTCACAAATTATGGTCGTCAAACTTCCCTAAACACGATGACGTAGAGGTAAATGATTTAAAAGAAAATGTAGTGTTGGTGTGGAAATTTTTTATAAATCTGAAATATTTTTCAACTAAGAGTTAACAATTGATTTGTTCGTGGTGTATTAAAATTTATGTAAGAGATAGTTGTTTTTTAATATACACTTTTAAGATAAAAAGGCTAATTAAGAAATGTAATTATTTATCAGGTATATGATACATGTCGACACGTGACCGATAAATTTAATGAAAAGTATTATTAATCATCTTACAAGATATTACGTAAAACGTTAGAAAAATTTTCACATACTATAAAAGGGACAGTTAATTCAAGGCTTCTGGTACACTTGAACCATATGATTAAGGTTAGCCAATAAAATTCTTTAATTAAAATTAAATTAATAGCATTGTGTTAATTAATAATAAAAAAATTAGAAAGTATCTTTATTCAATTTTGACATATTTAAATTTTAAATTTAATAAATATAATTATCTTATTTTATTATGTTAAATTTTTTTAACGTATTAAAATATTTTAATTATTTTAATTTGAATATCAATTTGAAATGTTTAATTTAAATATTAAAATGCTATTTAACACACAAAAAAATTAAAATATGTATATCCTTAAAAGTTTGGAATAGATTTTAATCAGAGGTCCAAATTTACATTTGAAAGATATTTAACCTGAATAATATCTATTCCCGTAAAAGAGTGGAATGAATTTATGAAAGCATAGTACCTTTTTTTTGAGAAGAAATAAAAAAGAAAATGCTTAGAAATGCAGTTATTGTTAGAAAGACAGGAAGAGAAGGACCTAACGGTGTGAATGTGTCATGTTGAGAAGATGAAACGAACCGTCTTCATCATCTCTCAACCCCATGAATGAACCTATTACTCTTTTCCTTTTCCTTTTGCATAAGCTTAGAAATTTTACACAAAATAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAAACGTTGATTCATGGTTGCAGCAGAGTAGTGCAGTTGACAAGAACAGATGCACATGCTTGTCGTGTGATTGCCGCTTCACCTCAACATTAAATTTCCTCTCCCCACTGTTCCTTCTTTTCTCTTCTGCACAGAAAGGGACACAGTATGACATTCACACTTCAATCCATGATTTCACACACAACCACACCTATTTCATCAATCTTATATTAATTTCTTTATATATATAATGTTATAAAAAAAGTATAAAAAATGAATTTTGTTATTAAAAAAACCCTATATATAATCGACATTGAATTATTTTTTGTTG


Gene Sequence:
>Vu_10646(+)
GAATTGGAGTATATTTGGTCACTTCAAAAAGAAATTCTCACATAATAATGAGTTAAGAAAGAAGAAAAGAGAGAGACAAAGAGAGATATGAAAAAAGATTCAAAAGCTGAAAGAAAAAAGAGCTATCTTTTTGGAAAACCAAAAAGCAGTTGAAACCTTGGAGATCAAGAAGAAAACAGAACACCCATTACCATTAACTTTCAAAGGTTTCACAATTCATTACACAAGGCACCCTTTATGCCTGTGCCTCCAAATATCTCTTTCTACATGCATACTTACATCAAACAATGAAAAAGAACCTTCTTTTTGTGTTTATTCTTCTTCTGCATTACGTTGCTGCTGCAGACCCTCCTGCTTCCTCTCCTCAACTTCCACCTGATCTCTCTCCAGGCACTCATTCATCTCTTTCCCATCATTGAAATTCTTAATCTTTGTTAACTAATTGGTTTTACTGATGATTCTTTTCACTTTTGGATTCTCACAACTGTTAAAGCAGGGGAGGGGCAGCATCACCTGCACAAGAAAATGCTAGTAGCTATTGTCGTAGCCACCATTTCACTTGCTGTACTCATTTTCGGTTTCTTATGTTTCTGGATTTATCACACTAAGTGTCCAACAAAATCCAAAACCAAAAAGGTTCAAACTCCTGGTCCAGGTACTTGTTTGTTTTGTAATGTTCCATTTCTCATATACCTTTTTTAAGAAAAAATCAGAACTGAATTGCCCCCTATGGTATTGTCTGAGATTACTTTCTTTTCTCTATTTGTGTTGTGCTTTTGAATGGCAAGATGCAGAGAGGGGGATCACCCTTGCACCGTTTCTGAGCAGATTCAGTTCCGTCAAAATTGTTGGTATGAAGGAGTCTGTGCCGATAGTTGATTATAAGCAAATAGAAAAAACGACCAATAATTTTGAGGAAAGTAACATCTTGGGCGAGGGTGGTTTTGGATGTGTTTACAAGGCTCGGTTGGATCATAATCTGGATGTTGCAGTAAAAAAACTACACTGCGAGACTCAACATGCGGAAAGAGAATTCGAGGTAATGATCACATATTACTTGTTCATTTGCTGGTTCTCTGTTTTCAACTTCTTGTTTCTGGTCCTTTCAATCTTGTCTTGAGTGGTGTGATGAAATTGCAGAATGAGGTGAAATTGTTAAGCAAAATTCAGCATCCGAATATAATCTCCTTACTGGGTTGTAGCGCTGATGGTGACACGAGGTTTATTGTTTATGAGTTGATGCAAAATGGATCATTGGAAGCTCATTTACATGGTAAAATACTGTATTCCATGCTTAAATGCATAGCAGAGAGGACCCGGTTTTCTTATCCAAAATCGATTAAATTTTGAAAATCGTTTATAAAATATATTTGTTTTAGAAACCAAAGATCAGAAAAGGTCAGGAAATGTTATATTTCTTCTTCTGGAGATTCAAAGGACAATAATTAGAAAACACAATCGTGTTCCTGAAGCAAACAGTCTCAGATGTGTTCAAAAGACAAAAAAAATTTAGAAGCAGGAAAACTTTTCTGAAACAGTAAACAAACAACATTCCATTCTCGTTACAAATTCTTATGATGTGATTCTTTTCCAAAATCTAATGCTGAAGGACCTACTCATGGCTCGGCATTGACATGGCACATGAGGATGAAGATTGCTCTTGACACAGCAAGGTAATGTTCCTTAAAAGAGATTTTGATCTTTCTCTTTTCTTCATTACAATTGTATTGACATTCTTCTGGTATTCTGACAGAGGACTAGAATATCTGCATGAGCACTGCTACCCTGCAGTGATCCACAGAGACATGAAATCTTCCAATATTCTCTTAGATGCAAACTTCAATGCCAAGGTAAGAAAATCATTAGATTTGCCATAAAAGTTACTTCCTTTTACCGTTTCCAATTGTTTTCATCTTTGTTGTATTCACCTAAGTTTCATATTATGTGTTGGCATCCTCGAACTTATTGGTGGTGGATTCAGCTGTCTGATTTTGGTCTTGCCATAACTGATGGGTCCCAAAGCAAGAAGAACATTAAACTATCGGGTACCTTAGGATACGTAGCACCGGAGTATCTTCTAGATGGTATGCCAACTAAACCCGTTATCATTATTATACGCCATATGCATTGGTTTGACAAGTTGGATATTTTACTATATCGTAACCCTTTAGCAAACCAGATCCAAGAAATTGTTTCTCTTAGTCCTCTTTGATTTTAAGGACGTCACGACTTTAGGGTGGATTTGAAACATATGACCTGTGTATCTTGTTCTTATCTTGGACATGTTGTCATGTACCTGCCCTGTTGAAAAGTCACATTTACTCGTTATTTAAATTGACCAAATCGACAATGTCATACAAAATGAATACACAATGAACAAATTTTTAAGTTAATACAATCACATGCTTTTGTTTCTAATCATTGGTTATAGAGCACTTTATTTTGAAGTGTATGTCTCTCGCTTTAGAAATGGAATTTATTCTTGTCTGCAAAATGGGAACACCTATAACCTTTGAGATTATTTTTTATGTCTCTAATATGTTTTTGACTGTTGAGAGGGATTTCATTTCAATTGAGGTAGATATTTTTCCTGTAGACATGGATGATTGGGTCAATATACCAGTAATATTTTAATATTATCATAGAGAAATGTCTTAGATTCATCCCAAAGCAAGTTCATGTACCAATGTGAAATTCATCCGTAGAACTAATTATTGAGGATGCTGCAATTCAATAATTTTACAGGTAAATTGAGTGATAAAAGTGATGTGTATGCTTTTGGGGTTGTGCTATTGGAGCTTCTATTAGGAAGGAAGCCAGTGGAAAAACTGGCACCGACGCAATGCCAGTCTATTGTCACATGGGTATGGGCTACTTTTCATCTCATGTACCTATAACTATGGAAAGCAGTGTAAGGTACATAACTATTTATGATTGCAGGCCATGCCACAGCTCACAGACAGAGCCAAGCTTCCAAACATTGTGGATCCAGTGATTAAGGACACAATGGATCATAAACACTTGTACCAGGTTTGTGATCCTGGAATTCAAAATTCAAAACTCGTTTCCCACAAACATTTGTACTAGGTTCTTTCCTTCACCAAACAAATGTATTTTTCTTTAACGAGTTTTGTATTTTATAGGTTGCTGCTGTAGCTGTGCTATGCGTGCAACCAGAGCCTAGCTATCGCCCTCTCATCACAGATGTTCTTCACTCACTTATCCCTCTTGTTCCCATTGAGCTCGGAGGAACACTGAGAGTTTCGCAAGTGAGGCAGCATGCCTCTCTTGCTGTGAATTCCCGTCTTTGATAGTACCTATAACAGAGAGAATGGATGCTTCCAACACATATAGTTTTACCAAATACATCAAATTACAGATAGTCCACGACAAACTACAAGAACATTAATTTGGGAAGGGTGTTTACCTTAAATAGGGGAAAAGAGCATTAGATTGTTCATAACAGATGTAAAGAAGAAATTTTTAGTTTTAGTTTCTTATGGGTAGAGATGGATTGTGTATAGACTCTGTAGAGTATTGAATTTGTATAAACTTGGATATGTTGTCTTCCATTCCATTACATAAAGAGAAAATATCACAAGCAACCTCTTAAGTCAATC