Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10603 LG2 46647323 46648007 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor SHINE 2-like
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SNP Position Effect Amino acid change
T/A 46647392 stop_lost p.Ter177Leuext*?
A/C 46647396 stop_lost p.Ter176Gluext*?
C/T 46647397 stop_retained_variant p.Ter175Ter
A/T 46647676 synonymous_variant p.Leu82Leu
C/T 46647697 synonymous_variant p.Pro75Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10603.1
MVQAKKFRGVRQRQWGSWVSEIRHPLLKRRVWLGTFETAEAAARAYDQAAILMNGQNAKTNFPKNQAQPDATTSTAPSAASASASDHDNAFLSPKALSELLSTKLRKYCKDPAPSLTCLRLDADNSHIGVWQKGAGPHSGSNWVMRVELGKKQTQSESAWSPSSSANDTAGNNGVVVVEEEEEEDRLALQMIEELLNWN*


CDS Sequence:
>Vu_10603.1
ATGGTACAAGCCAAGAAGTTCAGAGGAGTCAGGCAACGCCAGTGGGGCTCCTGGGTGTCAGAAATTCGCCATCCTTTACTGAAGAGAAGGGTCTGGCTAGGCACGTTTGAGACAGCTGAGGCTGCTGCAAGGGCTTATGATCAAGCAGCCATTTTGATGAATGGCCAGAATGCCAAGACTAACTTCCCCAAGAACCAGGCTCAGCCTGATGCCACCACTTCCACCGCCCCTTCTGCTGCTTCTGCTTCTGCTTCTGATCATGACAACGCTTTCTTATCTCCCAAAGCTCTTTCAGAACTCCTCAGCACTAAGCTCAGAAAGTACTGCAAAGACCCTGCTCCTTCTCTCACTTGTCTCAGGCTCGATGCCGATAACTCCCACATTGGAGTCTGGCAGAAAGGTGCAGGACCACATTCTGGCTCCAATTGGGTCATGAGGGTGGAGCTTGGGAAGAAGCAGACACAGAGTGAATCAGCATGGTCGCCCAGCAGTAGTGCTAATGACACTGCTGGAAACAATGGAGTAGTAGTAGTAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGATAGACTCGCTTTGCAGATGATCGAGGAGCTACTCAATTGGAACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_10603::LG2:46648007-46650007(-)
CTATAGACAAGACTAAATCATTTATCATTTTGAAAAATAAATTATTGCTGTAGGCAAATAATGTACCTAGAAATAACAAAATGGATTGGATATATTAAATTGAGAATGTTTCAGTAATTTGTTATTCTCTCTCTAACTTGCATGTCCATCATTTTATTTTATTAAAAAAATATTTATTTTTTAAATACTTAGGTTTAGAGTTCCTAATACATGATATTTTGTTTTTAAAAAAATTAAAAACTATACATGTATTATTGTTATTAATATATTATGTGTTCGTACAATGTGGAGATGTACAACTAGATTTTTATGTTTATTATATTTTTAACATGTTTTCTCATATTTTTTGTTGGAACCTTTTAGTTTTGATCTAATCGATATAAGTTTTTCACCCTCGTTCGACCTCTTTTTATTTATTTGGTTGATTTGTCTTTGATGTTTAAGTTAACAAGAAGTAAAAAACAATAAATACAATAATAATCGAATAATAAGATGTCATATATCATGAAGAAAATATCTTTTTATAGTATTTTATGGGTCTCTTAATTACATGGACCTAGGTTGGGTAGATGTGTCTAGGTTTAGAGTTTCCTAATCCTTGACACAACTCACAGTTGCTAATTAATTACTTTCATTTTTTTCTAGTGTTATAAACTGGTTTTTCGTGGCTTGATATTACTATTGTACAGGTGTGTCAAAGTCTATGTCGTCTCTATGATGATGACATATTTCAAACTCCAGCACATTATGTAAACTCTATTATTTAAGCATTTTAAAAAAATATTTAATCAATATTGACTAAGTTATTAATACATTACAAGTCATTTAATTAAATTTGTTGATTTAAATTAATTTTATAAAGCAAGAAATTTTAATTTTAATTTATATATTTTTACAAATTACAAATTACAATATATTAAGTTTGTACTCATCTAAGTATAGATCTCACCTAAATTCATATTTGGAAAAAAAAATTCTATTATCAAATTTCAAATAAATTTATCATCAATTTTGTATTGCCGAATAATACTTTACATGGATTGCGATTTAAATTGTTCCAACAATTTTTCAATAAATATATAATGTATCATATGATTTTTAATTTCCATAACTATATAACTCCTAATATTTCATACTATTGTTAATATTTTATATTACATTACTCATAATATTGTATAAATCTGTATTCCAATTAAATCTGTACAAACATTTTAAATAAAAATGCGAATAAGTAAGAGTATAATGCAGGGATAATAGGATTTTGAAATTCTCCATTACTCTTAAGGGCTGATCTGTCCATCACATGACATAATATAATAGACAAGGAAGAAGAAAACAGGGATCAGATTATCGTACTTGGGCAGCTATGAAAAATAGGAGATCATGGCTGCATTTCAGGTAGAAAAGTTTTGTAACAGATATTAGGAATTAGTTGACTCCTTGGCAAAAATATTGGTTGACGTAAGTGTGAATAAGACAATCCATGATAAAAGGTGTTAAGTTGTGGAAAATTTAAAAAAAGAATTTGATTGTGGAGAGAAAAACGAAAGATTTTCCATTAGAATTCACGTGATGAGAAAAGGGGGTTGTTTTGTGATGGTTTTGTGAGAGAGTTTGAAGATATATATGGAAGGAGTGAGCTGAAAAGGTGAAATTACAGGGTAATATTTTTTGACATTCCGTGTTGCGTGGAAAAAGGAAGTGTGGAGAAATGGAACACAGCTTGTGATGGCATAATGTTTGTGGGCAGAAGGAGGCCTACAAGGTGGTCATTAATTTGAGTTGTTAAGGAACCATGGATTTATCAAAGTTGTGCAGGTGAAACTTTTATTGCATGTGTACTGTTCACTTCAACTTTCCGTCCAATCCTCACCGACAACCCACATAAATTTCGTTAACACTCGTTAAATACTTACACTACTCTTCTTATTAATCCCTATTAATTCCCTTCACCTCTCTTCTTCTCTCTCTCACTTTCTCACGCGCCATTTAACAAAGAT


Gene Sequence:
>Vu_10603(-)
ATGGTACAAGCCAAGAAGTTCAGAGGAGTCAGGCAACGCCAGTGGGGCTCCTGGGTGTCAGAAATTCGCCATCCTTTACTGTAATCATCTCATTAATCTCCAAACCAAACCAACACAATGCTGCTTCTGTTTCTCTCTTTATTTATTTATTTCTTCTCACTGCAGGAAGAGAAGGGTCTGGCTAGGCACGTTTGAGACAGCTGAGGCTGCTGCAAGGGCTTATGATCAAGCAGCCATTTTGATGAATGGCCAGAATGCCAAGACTAACTTCCCCAAGAACCAGGCTCAGCCTGATGCCACCACTTCCACCGCCCCTTCTGCTGCTTCTGCTTCTGCTTCTGATCATGACAACGCTTTCTTATCTCCCAAAGCTCTTTCAGAACTCCTCAGCACTAAGCTCAGAAAGTACTGCAAAGACCCTGCTCCTTCTCTCACTTGTCTCAGGCTCGATGCCGATAACTCCCACATTGGAGTCTGGCAGAAAGGTGCAGGACCACATTCTGGCTCCAATTGGGTCATGAGGGTGGAGCTTGGGAAGAAGCAGACACAGAGTGAATCAGCATGGTCGCCCAGCAGTAGTGCTAATGACACTGCTGGAAACAATGGAGTAGTAGTAGTAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGATAGACTCGCTTTGCAGATGATCGAGGAGCTACTCAATTGGAACTAG