Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10504 LG2 45613226 45615062 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 17
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T,G 45614177 downstream_gene_variant
T/C 45614248 missense_variant p.Phe219Ser
G/A 45614287 missense_variant p.Ser232Asn
C/A 45614327 downstream_gene_variant
C/T 45614333 downstream_gene_variant
A/G 45614491 missense_variant p.Arg273Gly
C/A 45614577 downstream_gene_variant
C/T 45614615 downstream_gene_variant
A/T 45614633 downstream_gene_variant
A/C 45614747 downstream_gene_variant
T/A 45614941 downstream_gene_variant
T/A 45614950 downstream_gene_variant
T/A 45615043 missense_variant&splice_region_variant p.His293Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10504.1
MAVELMSLPKMEEQKAIQEAAMEGLKGMENFIHLLSNEPSHLNTHLTQATVSNFKKLISLLNGTGHARFRRAPLPSNNQPIPPANPVTVHQPPTTFAPTHSHSLTLDFTKPNIFAATNNKSSDLEFSKETFSVSSNSSFISSAITADGSVSNGNQASSLFLTSPPPPSSSGKPPLVKKRCHDHFDDVSGSTKCHCIKRRKNRVKKTVRVPAISTKIADIPSDEFSWRKYGQKPIKGSPYPRGYYKCSTVRGCPARKHVERASDDPTMLIVTYEGEHRHSIQTALQDNISDAVVMANLNV*


CDS Sequence:
>Vu_10504.1
ATGGCGGTGGAGTTGATGAGCTTGCCGAAAATGGAGGAACAGAAGGCAATTCAAGAAGCAGCCATGGAAGGTCTCAAGGGAATGGAAAACTTCATCCATCTTCTCTCCAACGAACCCTCTCATCTCAACACTCACCTCACCCAAGCAACCGTTTCAAACTTCAAAAAGCTCATCTCTTTGCTCAACGGAACCGGCCATGCCCGTTTCCGTCGCGCGCCTCTCCCTTCAAACAACCAACCCATTCCACCGGCTAACCCGGTCACCGTCCACCAACCTCCCACCACCTTCGCCCCCACGCACTCGCACTCTCTCACTCTCGATTTCACCAAACCTAACATCTTCGCCGCCACCAACAATAAGTCCTCGGATCTCGAATTCTCAAAAGAAACCTTCAGCGTCTCCTCCAACTCCTCCTTCATCTCCTCCGCCATCACCGCCGATGGCAGCGTCTCCAACGGCAACCAAGCCTCCTCTCTCTTCCTCACCTCGCCTCCGCCGCCTTCTTCCTCCGGAAAACCGCCACTCGTCAAGAAGCGGTGCCACGACCACTTCGACGACGTCTCCGGCTCCACCAAGTGCCACTGCATTAAGAGAAGGAAGAATCGGGTGAAGAAGACGGTGAGAGTGCCGGCGATTAGTACGAAAATCGCCGATATTCCGTCGGACGAGTTCTCGTGGAGGAAGTACGGGCAGAAGCCGATCAAGGGATCACCGTACCCGAGGGGTTACTATAAGTGCAGTACGGTGAGAGGATGTCCGGCGAGGAAACACGTGGAACGTGCTTCGGACGATCCGACGATGTTGATTGTGACGTACGAGGGGGAGCACCGTCACTCCATTCAGACCGCGTTGCAGGATAACATTTCCGACGCCGTGGTCATGGCAAACCTAAATGTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10504::LG2:45611226-45613226(+)
ACAGATCATAAGGGCTTTTCTGAAAGAGATTTGCAGATTTCTTCTTCTATCTATAATATGCCAATCTCACACTCCACTATTACAAAAATTTATGTTTAAATATCTTTTCTTTTTTAATATTTTACTATTTATATACTAGTATATATTCTTATCAGAATAAAAGAATTCCTCAACAATATCATAAATTATAAAAACTAAAGTATTGTCAATATAAAATATTATGCGTTATACGTTTATCACATTATGAGTACTCATATATGTTTCAACAAATAAGTAAAGTTAGAAAAAATTCAATGGAAAATAATAAACGTTTATCCACAATTTATAAACTGTTTTCTTTTATTCTTGCATTCATTGAACGTTTATTTTTAAACAAAACTTAGAGGATAAGATTATGGTTTTATTTATAGTTTAAATAATAAAATACGGTTAAATTCTTTCCTTCGTCATACAAGCCTTTTCTCATTGAGGGATCATCAAGAGCATATTTGTTTTAAACTATAGTGACCATTTGTTGTTCAAAAGTAAATAAACAAAAAACATAAAAAATGAAATAGAATAATTGCCAAAAACTAGACAAAAAAATAAGTTATAAATAAAATCATAACCAAATGATAATGCGTAATGTATGTCAATCTTTTATTAATAATTATATTTTTAGATAAACAATTAAAATAAAAATATTAAAGTAATAAATAAAATAAAAGTAGTTAATTTAAATTTTAATGAATTTATAGCAATTTATTTTAATACACTATTATTTAAAAATATATTTTTTATTTACTATACTTTATAATGTTGTTTTAGTTTAATTTAAAATTATTTCAACTTATTAAATTTCTATTTTTAAAAATTTATTACATTAATTATTTTATAAACGTATTAATATACTCTCTTTTTTTTACTTTATCACATCTATCAAACCAACTATTATCATTTCATTGTTTCTCTTCTGTCTTTTTAAAAAAAAAAAAAACTAAACAACTTTTTTTATTGTTTTTCTCTCTTTTTCTTCTTTCCTTCTTTCTTACTCCTCTGATTTAACAAGTGTATTCATCAAAAAGTCATTAGAAAAAAAAAAACACAAATTAAGATGGAATAACAACAGGCAGCCATGCACTGTAATTTAAAGTAATACGTTCGTTTTTGGTTGGCATTTCTTTATTGGTTTTCATTTAAAGCATCTAATAAGAAATTATTAGGTAATGAAATTTTTCTTTTTTGTACGATTATATATTATTTCATAAACCAATGTAGATCAAAATATTCATTATTTATTTTTTTTACTATTTGTACAACTTGTTAAAACCGTTCGACCTAGATATTCTGGTTCTACAATTTCAGATTATTCTTATTCTGATTTTCAATATGAGAACAAAAGATTAGTCTTTCACCCAAATTTTTAATTAAAAACATTCTTATCCTGTCGTCTAACAATTTTCATACTTTTTCTTTCTTTCTTTCAACCACGTGGATCAAGGAATAAATTTCACCTTCTTTTTCTGCTGTGTTAAATTAATTCATTACAGTGGTTGTGTACAAGTTCTATTGAACCTCTATCACCCATTCATATTATATATACATTTACGCTTAATCGGTCAGAAGAATCTACATAATTTATTTTAAAATATTCATTTAAGTAATATATTATTAATTAAAATGAATATTTTTTTATAGAATTGGGTTTAATATTTAGTTTACCATCAATTGATTGAAAACAAGTAAACACATAAGTAACCTTTGTAAAAGAATCTGTAAGTTGACATTTACGTATGGTGGACGATTGAATATTCAAAGATTTATCACTTTCACAAATAAATAAAAAAATATAAATGTATTCAAAAAGAATAAATATTGTAGATTTATAATTTGTGACTTAAGGTTGTCCCCATTATATGTTGCTGTGTCTTCTTCTTCTCAACAGAACAAAGCTAAACCTTCCTCTCTTGTTCATTTTCCATTTCCATGGCGTTCTGAGTGAGACCCAGAGAGAAGATAAA


Gene Sequence:
>Vu_10504(+)
ATGGCGGTGGAGTTGATGAGCTTGCCGAAAATGGAGGAACAGAAGGCAATTCAAGAAGCAGCCATGGAAGGTCTCAAGGGAATGGAAAACTTCATCCATCTTCTCTCCAACGAACCCTCTCATCTCAACACTCACCTCACCCAAGCAACCGTTTCAAACTTCAAAAAGCTCATCTCTTTGCTCAACGGAACCGGCCATGCCCGTTTCCGTCGCGCGCCTCTCCCTTCAAACAACCAACCCATTCCACCGGCTAACCCGGTCACCGTCCACCAACCTCCCACCACCTTCGCCCCCACGCACTCGCACTCTCTCACTCTCGATTTCACCAAACCTAACATCTTCGCCGCCACCAACAATAAGTCCTCGGATCTCGAATTCTCAAAAGAAACCTTCAGCGTCTCCTCCAACTCCTCCTTCATCTCCTCCGCCATCACCGCCGATGGCAGCGTCTCCAACGGCAACCAAGCCTCCTCTCTCTTCCTCACCTCGCCTCCGCCGCCTTCTTCCTCCGGAAAACCGCCACTCGTCAAGAAGCGGTGCCACGACCACTTCGACGACGTCTCCGGCTCCACCAAGTGCCACTGCATTAAGAGAAGGTACACCCTCGTCGCACCTTAGTGTTTGACTCGGGCATGACTCGGCCAGTCTGCGTTCTAGAGTCAACGATTTCGGTAGTAGTGCAGTTAAAGGCATTCAATGGAAACAGTCACGAGGCACGCGTGACACTGACACCAAAGAGTTTTTTTTCTCTGACTTTTTGTACTCTGCCGCGTTTGCCAATCCACTTTTTTTTCGGAAATTATGTTTCACAATAAAAACAACAAAATATAACATACCAAACACTACCCGTCCCCACTTTCTCACGTTAACCACCTTCATTATTATTGTTGCCTTTGAATGTTGACCTAAGCGCCCTATGATTTTCTATTTTTAATTTTTACTAAAAAAAAAATTTCTTTCAGGAAGAATCGGGTGAAGAAGACGGTGAGAGTGCCGGCGATTAGTACGAAAATCGCCGATATTCCGTCGGACGAGTTCTCGTGGAGGAAGTACGGGCAGAAGCCGATCAAGGGATCACCGTACCCGAGGTGAGTGATGACGCGTGATCTGGCGTTGACTTTAGTCAAATGTTTGTGAACTGACGTTGATTTGTTATGCTTGGTTTGTCAGGGGTTACTATAAGTGCAGTACGGTGAGAGGATGTCCGGCGAGGAAACACGTGGAACGTGCTTCGGACGATCCGACGATGTTGATTGTGACGTACGAGGGGGAGCACCGTCACTCCATTCAGACCGCGTTGCAGGATAACATTTCCGACGCCGTGGGTTTGGTTTTTCAGTAAGGAAAATGACACTTGAACAACCATTTTTGACAACATTTAGACACGCGCACACGTGTCTAAATTTGAGTGGTCCATTTTCATTTAATTTTTCTAACTGGACCACTCAAATTTAGATACGTGTGCGCGTGTCTAAATGTTGTCAAAAATGGTTGTTCAAGTATCATTTTCCTTTCAGTAAAAATAGTAGGGTGGTGGAATTAAAAGTTTCTTTTTATAGTTGGAGAGAAAAAAAATTAATAGGAATTGAATTGGGTGGTGGGTGGAATGTAAATGTAAATCTATAATCCTTCAAATTATTAATATGCTCCTCTGCTAAATTAATTAATTTGGCATCTCTCTATTGAAAACAAGAGTTAAGTTGATTTAATATTCTTAATATCAGTTATTGCATCTAATTAAAATATTTGGATTACAGTTTTTGTATTAAAACGGTGAAAGGAACTGATTGAGTTTTCTCGATGGACACTTATAGTCATGGCAAACCTAAATGTTTGA