Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10497 LG2 45548411 45553049 PREDICTED: U-box domain-containing protein 52-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 45549409 downstream_gene_variant
T/A 45549525 downstream_gene_variant
C/A 45549661 missense_variant p.Gln159Lys
A/T 45549971 splice_region_variant&intron_variant
T/C 45551553 downstream_gene_variant
T/C 45551555 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10497.1
MWLPKHRSDKKDGVSGLVAVAIDKKKESQSALKWAVDNLLTRSATVILIHVKLLAPTLSPSPSLFAPRISSFLGDDTSVVSKEHEGQNRSVFLPYRVFCTRKDIQCKDVLLEDSEVPRAIIEYASQTGVEHLVLGSSAKTSFLKRFKVSDIPGEIAKGAPDFCTVYVIAKGKIQTMRSATRPAPAIFSNQVCQINNGRSNLSEPNVYSSRSIREQETYSFDAGSQYDETFRSPFTRKRYNGRQYGDTPNLDTDISFVSSGRRSTERLIPSLNLDTGISNSRLSYSSDIDANFSFESASYRRKSTEMGSPLELSSFSFESDKQSSCSSQTADDMEAEMRRLKLELKQTMKMYNTACKEALTAQQKAVELQRWKMEEERRLEEARLAEEAALAIAEKEKAKSKAAIEAAEAQKRIAELEAQKRLSAEMKALKESEEKRKVLESLVNVDVRYRKYTIEEIEEATNFFSESLKIGEGGYGPVFKCLLDHTPVAVKVLRPDAQQGRSQFQREVEVLSCIRHPHMVLLLGACPEYGCLVYEYMANGSLEDRLFRQGNTPPLPWQLRFKIAAEIGTGLLFLHQTKPEPLVHRDLKPANILLDRNFVSKISDVGLARLVPPSVADSVTQYHMTSAAGTFCYIDPEYQQTGMLGVKSDIYSLGIIFLQILTAKSPMGLTHHVARAIEKGTLSEMLDPSLSDWPQEEALTFAKLGVQCAELRRRDRPDLGKVVLPELDRLRNLAEDTDLISALGNPTNMPRDRHVSAVLEGDCPPFPNPVSGEIRANNSVTF*


CDS Sequence:
>Vu_10497.1
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Promoter Sequence:
>Vu_10497::LG2:45546411-45548411(+)
GGATGTCAAGCATGAACATGTGCTGAAATTGGATATGGCCAAAGCATATGTATGTGATTCCTGTAGAAAGCAAGGGAAGTTCTGGACATTTTCTTGTGATGTTTGTGACTATGACCTGCATCCAAGTTGTCTAGAAAAGGCCAACTAGAACTACAGCTTATAGAGCATAGAAAAACGTAAGTTTGGAACAATTATGGTTGTTTCTGTCGTGATGGAAAGAATGTTGTAATACCTAAGAAATTTGAACACTGAATATATTTTCATTCTTATCAGTACGTTGACAAAACCTGCCATTTGAAATTAAGAGTGATTTAAATCAGATTAGTTTTGTAAGTAAGATAAAGTTCTGAATAGAATTACTAAGTTTAAGAAAGTGTGGGCAACTGTTTACAGAATGTACTGCTTTTACTTGCAGGTTGTCTGTATCATGATTTTGATACAACTTTATACATACCCTGTTGGTGAAAAACAAATGTAAAAATAATCAAATATTCTGTTCAATACTCCAACTCTTAATTTTTATTTATGACTTTTAATATGATAATAATGACTGTAATTATTCATCAATATAATATATATTAACATAATTATAAGTTATAGGTTATTTTTATATGTATTTTTTTTACGTCCCTTTTGTATTTAAATATATAATCAATGTAAAACACATAATTCAATACTTTTTTTTTATCTTCTTGGAAGTGAAAATGTGTGCAGGTATTCAAGTTAATTAGAATGTATTCAAAGTGTTGATGACTCATACAGTTAGTTATTCATACAAAGATGTCAATATGCTTTTTGTGTAATCCACTCCAAGGAAAAAAAATCAGGTTAAACAACCATATTATCAATATAATTTAAACTTTTTTCTTATTTTTAATTATATCAAATAGGATTTAATTCATTTTCATTTTTTTTCTAATTTTTCTCATGTTTTGGTTCTTATTAAAATCTATTTTATTTTAGTCACTGATATTATGTTTCAGTTCTTACTAAAGCACAACTTTTTTTATATAGATCTCTTTTCCATCAGAAAGTTTTCATCTTAGTCTGATATTTAAGAAATATCAGGATCTATTGTCAATCAAAAAGGCATGGCATGTCATCATTTAGAGGGACAAGGATTAAAATAAAAATATAAAAACTAAAAATTATTAAAGTTTGAATAAAATAATAGACATGAATTGAGAACATTAAGCAATGTAGAGTTATATTTTACTTTATAAAAGTAATAGTAAGAGGACAAAACTAACAAATAAAAATATATAAACATAGTGAATCTAGATCAAATAACTTTATATTTGTAATTTCTTTACTGATTTAAATAAACTAAATCCACCATAGTGAAACATTAATGATAAAATTTAGATGTCAGTTTACGTTTTTTATAACCATTTAATTCCCTTCTGTGTTTGTACGATGACATTAAAATATGATTAATGGGAGCTGTTACTGACTATATATGATTTAGTAAGCAGATTTCATTCCCAAAAGGACGAAGTCAAAGTTAACCCGCAAATTTTGGTCATTCTTTGATGGGATAAACAACATCACAGAATAGAACAATGTGTGTGGTTCTTACATCTTAGAAAAAGAAGCCTAAAATAGTTAAATAAATCCCAGATTGGCTGCTACAGACATACAAGGGATCGGTTAGTTATTACTATTCTTTTTGTCGTTTAAGGTTTTGAACATCAAAAGAGAATCAGGAACAACAATCTAACAAAGTAAACGAATTAAACAAATTCCTCAAGTCCTATGTTATTCAGGAGTATCATGTGATCCTATATATTTTTCATCAAAGCAAGTCGAGGAATTTCTGGGTGCAACTTAACCAAACCAACCACAGATTAGGAAACATCATCAAAAGGCTTAAAAGGAAGGATCTTTAGATGATGCCTTTGAAAGGAAGAGAAGAAAATACATTTTGGCCTTGAGGGTCCCTTTAGTTTGGTATTTGGCTGATTGAAGGAGCAGAATAAGATTGCAGTGAAAGAAAGTAA


Gene Sequence:
>Vu_10497(+)
ATGTGGTTGCCAAAGCATCGATCAGATAAAAAGGATGGTGTGAGTGGATTAGTAGCAGTGGCAATTGATAAAAAGAAAGAGAGCCAATCTGCACTCAAATGGGCAGTTGACAATCTCCTCACCAGAAGTGCAACAGTAATTCTCATCCATGTCAAGCTTCTCGCACCAACCCTCTCTCCATCACCTTCTCTTTTCGCCCCTAGTAAGTACCCTACAATGGAATTGCCATTGCTATTAACCATAGCTTCAAACATCATTGTCTCTGCACAACATTTCTGCATGTTCAGTGATTGGTTTTTGTTGAGTAAATTTTGGAAAAACAGATTTTCTTCTTCACTGGTAAATAATCTAGTACATAGCACAATTTATTTCAATTTGAATGAGTTTTATGACAGTTAATGTCACTTTTTTTTCATAAAAGTAAAATTAAACAGATCTCAATTTCTATTATGAATTTATGGAAGTTTAGAGTAACGTGTGAAATACACACACATATATGTGTGTGTGCAAAGGAAAGTTTTTCAGCAGCAATGGGAACAATGGCGACATGATTGATTCCTCGTTTGGTTTATTACCTTGGCAGGGATAAGTTCTTTCCTGGGTGATGATACTTCAGTGGTAAGCAAAGAACACGAAGGCCAAAACAGAAGTGTTTTCCTCCCATATCGTGTCTTCTGTACAAGAAAAGATGTGAGTTGTTTTTCCTTTCAAGATGAATGTTTCTGGAAATGAAAGCAGCTATCTTGCTGATGGTGTTCATCTTAGAATTCTTATAATCTCTTTTGTTTTGTTTCTTGGTGTGGTGTGGTGGATGGGCCATAGATTCAATGCAAGGATGTCCTACTAGAAGATTCAGAAGTACCCAGAGCTATAATTGAATATGCTTCTCAGACAGGAGTTGAGCATCTGGTTCTTGGCTCTTCAGCAAAAACTAGTTTTCTCAAGTATGCTACTTTCTAACTCACGTTGTCATCTTGCAAATTTTACATCAAGTTTCTCGTCATCTTCCTTTCATTCAGATAAAACACGATATAGTCAAAATGCAGAGTTTGGAAATGTGATTACAATTGCTTAAGACTTATCCTGTCTAGCTTAGAGTCACTTGCCCTTATGATTACGTATTGTTAAAATAGAAACCTGAATCTCTCGCTTGGATGTGTCAGTATGTATTCGATTTCTTAAAGAATGTTTTTTTCTCATCAGAAGATTCAAGGTGTCAGATATTCCAGGAGAAATTGCAAAAGGGGCGCCAGATTTCTGTACTGTCTATGTTATTGCGAAAGGAAAGATTCAAACTATGCGATCTGCTACTCGTCCTGCACCTGCCATTTTCTCTAACCAGGTCTGTCAAATTAACAATGGCAGGTCAAACCTTTCAGAGCCAAATGTGTACTCATCTCGAAGCATAAGAGGTTAGATTCATCCTTTCAAGAACCACACATCTATGTCCCTAAACATATTGTGAAATGTGCTGCTCACTGAAAAAGTTGGTTTCTATCAGAGCAAGAAACGTATTCCTTTGATGCTGGATCACAGTATGATGAAACATTCAGGTCAGTGACATTACATAATACATACTACTTAGCATTTGTTTTAGCATATGAAGACTAAATCTATTGGAAACAGGTCACCATTTACTAGGAAACGTTACAATGGCAGACAATATGGAGACACTCCCAATTTAGATACGGACATATCCTTTGTAAGCTCTGGAAGGAGAAGCACAGAACGTTTGATCCCTTCATTGAACTTAGATACAGGAATATCCAACAGTCGGCTATCATATAGCTCAGACATAGATGCAAACTTCAGCTTTGAGTCAGCGTCTTATCGAAGGAAGTCTACGGAAATGGGCTCTCCTCTTGAATTATCATCATTCTCATTTGAGAGTGATAAGCAATCATCTTGTTCGTCACAAACAGCGGTAAGGAAAGTTCGCAGTGCTGTAGAGATCTGTTTGGTCTGAGAAAACAGTTTTCTTATGTTTTATTACTTACTAAAAAGAATCTCATCTTGTTTTCACTTTGTTTAGTTAAAACTGGATTTTTGTTTTTATTCTGTAAGTCTTTGAAAATGGAAAAACAGGTAAAGTAAGTAGTATCTTTGTAGTTATTTACAAAGCCAGATTCTCATAGCAAAGGTATCCTGCATTTGTATTTTTTGGCTTGCTTGAACATGTTATAACAGTTCCTGCACTGATAAGGAGTTGAAGAGAATTCCATAGCTTAGGCCCATTTTTGTAAAAAAGAATAAGATTTTTTAAATTGTTGAAGTTGTGGCAATTGTAGGATGACATGGAAGCTGAAATGAGAAGATTGAAGTTGGAGCTGAAGCAGACCATGAAAATGTATAACACGGCTTGTAAAGAAGCACTCACAGCACAACAGAAGGTGTGAATATATATTGTGTATATATATATATATATATGGTTTGTGTTTAGAATTTATTTTTCATGCACTGGTTATCACAACATTAACCAATTAGAAATCACTTGATGTATACAGTCTTACTAGAACATGAGAATCTATGGATGAATGACAGTGTAAAAAATCTTTACATGAGTACTTTTGAATTATATAATTGTGTTTTTCCCTGGAAAAGTTCAATAATGTGTGATTAATGGCATGCATGGTTGACAGGCAGTGGAACTTCAGCGGTGGAAAATGGAGGAAGAGAGGAGATTGGAAGAAGCGAGGCTGGCTGAGGAAGCAGCACTGGCAATTGCAGAAAAGGAGAAAGCCAAGTCTAAAGCAGCCATTGAGGCTGCCGAAGCACAAAAAAGGATTGCAGAACTGGAGGCACAGAAGAGACTCAGTGCAGAAATGAAAGCACTTAAAGAATCAGAAGAGAAAAGAAAAGTGCTTGAATCTTTGGTAAATGTAGATGTCAGGTATAGAAAATACACTATTGAGGAGATTGAAGAAGCAACAAATTTTTTTTCTGAATCCCTTAAAATTGGAGAAGGAGGATATGGTCCTGTTTTCAAGTGCCTTTTGGATCACACCCCTGTTGCAGTCAAGGTTCTACGCCCTGATGCACAACAAGGAAGATCACAGTTTCAGCGAGAGGTAAACAAGCATAGAAACAAAACACTACATTTGAACACAACAAATTCAACTCAATGATCAGAGATTTTGCTTTCTTTAGGTTTTACTTGGTTTCAGAAAATGTTCTATATTTTCATTTTTGTTTTTGCAAGACATCTTTGTTTTCAACTTTCAAAGATTTGCATACAGTGTAAAACTTTTAAGCTAACAAACAATCAAAATCATCCTCTATTTGACTTGTAACTCATTCCTTACAAAATTCAATCATCAAACAAGGCAATTTATGAGTGGATGAAAGTTTTGTTTTATCGATAATGTTACTTGTTAGTATTTGTTAGTAGGGAGAGTTAATCGACAACCTTTTCCACTTTTCTTCCAAACCTGTCAAACCAGTCTTATATTTTCCAAGTATTAGTAGCAAGAGTTGAAACCACAACCTCTCTCACTTTCCTTTCCAATTTTACCACTAAGTCAATCTTATATCTCCTGGATTACAGGTTAAACTATACATATTTTTGTTATTATATGTGAAAACAAAGCTATTTCTTAAACCATGTAATGCACATTACAGGTTGAGGTATTGAGCTGCATACGGCATCCACACATGGTTCTACTCCTAGGAGCATGTCCAGAATATGGATGTCTAGTGTATGAGTATATGGCAAATGGTAGCTTGGAAGATCGCCTCTTTCGACAAGGCAACACTCCCCCACTGCCTTGGCAGCTAAGATTCAAGATAGCAGCTGAGATTGGCACAGGCTTGCTGTTCCTGCACCAGACAAAACCAGAACCTCTGGTGCACAGGGACTTGAAACCAGCCAACATCTTGCTTGACAGAAACTTTGTGTCCAAAATCAGTGATGTAGGTTTGGCCAGGCTAGTTCCACCATCTGTGGCAGACTCTGTCACGCAGTATCACATGACATCCGCAGCCGGAACCTTCTGCTACATAGATCCTGAATACCAGCAGACAGGAATGTTAGGAGTGAAATCAGACATATACTCCCTTGGGATAATCTTTTTACAAATTTTAACAGCAAAATCACCTATGGGTTTGACCCATCATGTTGCAAGGGCCATTGAGAAAGGAACTTTATCTGAGATGTTGGATCCATCACTCTCTGATTGGCCACAAGAGGAGGCCTTGACGTTTGCCAAGTTGGGAGTGCAGTGTGCTGAATTAAGGCGCAGAGACAGACCTGATCTTGGCAAGGTTGTCCTACCAGAACTCGACAGACTCAGAAACCTTGCTGAAGATACTGACCTTATTTCAGCTTTGGGTAACCCTACGAATATGCCCCGAGACAGACATGTTTCAGCTGTACTGGTAAGTTTCTCTGTTTTTATCATACAAGTAAGTTAATACTAAAACAAAGCACACATAAAAACTAAGTTGTTGAACTCATAATTAACCAAGAATCAAGAATGTGAAATGGGAAAGTTACCTCTTCTTGTGAAGAGGATGTTACGTATGCATCATGCTAACATGAAAAGTTGTGCCTGCTTTTTTATTTTGCCAGGAAGGAGATTGTCCTCCATTTCCTAACCCTGTCTCAGGGGAAATTAGAGCTAACAATTCAGTGACTTTCTGA