Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10453 LG2 45157811 45161845 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK1 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 45158213 intron_variant
T/C 45158276 intron_variant
A/G 45158295 intron_variant
C/A 45158311 intron_variant
T/A 45158626 missense_variant p.Asn536Ile
C/T 45158709 intron_variant
A/G 45158725 intron_variant
C/T 45159031 intron_variant
A/T 45159065 intron_variant
A/G 45159132 intron_variant
T/A 45159235 intron_variant
C/T 45159270 intron_variant
C/T 45159274 intron_variant
C/T 45159286 intron_variant
G/A 45159318 synonymous_variant p.Thr466Thr
G/C 45159345 missense_variant p.Asn457Lys
T/C 45159448 intron_variant
A/G 45159512 intron_variant
A/G 45159561 intron_variant
T/C 45159937 intron_variant
A/T 45159938 intron_variant
G/T 45159959 intron_variant
G/T 45159988 intron_variant
T/A 45160136 synonymous_variant p.Gly395Gly
G/A 45160168 intron_variant
A/C 45160225 intron_variant
T/C 45160285 intron_variant
A/T 45160488 missense_variant p.Trp340Arg
A/T 45161003 intron_variant
A/G 45161070 intron_variant
G/T 45161100 missense_variant p.Ser249Tyr
G/A 45161358 missense_variant p.Thr163Met
G/T 45161616 missense_variant p.Pro77Gln
A/T 45161646 missense_variant p.Val67Asp
G/T 45161715 missense_variant p.Pro44Gln
G/T 45161765 synonymous_variant p.Pro27Pro
T/A 45161815 missense_variant p.Thr11Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10453.1
MFAVTPYSPATTPVDVVPQPFPQPAAPAFQSSPSPSMFLTPPAPSSPSPETLFFQGLPLPPSSVTPVPLTVPALPSPSPESLTPPFVVSQSPPAPTAASQPPPFPYATAPSTTSFPPLVVAPSPPSPTASFPPALPDMPLTPEAAAVTTSTVPPPPLPPSFTTEPTLATPWSPALPLSAPEVNLPVAVDFQKASTYHVSSGLIVGLVIGAIVLVFVFSIGLVLCRNRKKTKQKNLCTGRSKESPPSIESKGSHVIQVPPNPTLPPNLKSGSFKSVSVKTIPNHAPRAAFSPGNGSFTYDEILVATNCFSESNLLGEGGFGYVYKGVLPCGKQIAVKQLKSGSQQGEREFQAEVETISRVHHKHLVELAGYCVSGAERMLVYEFVPNNTLEFHLHGEGSIFLGWTTRIKIALGSAKGLAYLHEGNPAIIHRDIKASNILLDFNFEPKVSDFGLAKVLPNDSHISHLTTRVMGTFGYVAPEYASSGKLTDKSDVYSYGVMLLELITGRPPITAAGSRNECLVDWARPLLARALQEENFDNLVDPRLQKNCDADEMVRMVTCAAACVRHSSKLRPRMSQIVGALEGVVSLTDLVGDVTPENTPEHNWSKYLDYGDNQ*


CDS Sequence:
>Vu_10453.1
ATGTTTGCAGTTACACCATATTCTCCGGCGACCACGCCGGTTGACGTCGTTCCTCAGCCGTTTCCGCAACCAGCAGCACCCGCATTCCAGTCCTCGCCGTCACCATCGATGTTTCTGACGCCTCCAGCCCCGTCCTCCCCGTCGCCGGAAACTTTATTCTTCCAAGGTTTGCCTCTACCGCCATCTTCAGTTACACCTGTTCCTCTGACGGTGCCGGCGTTGCCGTCTCCGTCGCCGGAATCTCTCACACCGCCGTTTGTAGTTTCACAATCGCCTCCGGCTCCGACCGCCGCATCGCAGCCACCGCCGTTTCCATATGCCACAGCGCCTTCAACGACGTCGTTTCCGCCGCTTGTAGTTGCGCCATCGCCTCCGTCTCCCACCGCCAGTTTTCCACCTGCATTGCCAGATATGCCTCTGACACCGGAGGCGGCGGCGGTGACGACGTCGACTGTTCCTCCACCGCCTTTACCTCCTTCATTCACGACGGAACCAACCCTGGCAACGCCGTGGAGCCCCGCCTTGCCGTTATCTGCGCCGGAAGTGAATTTGCCGGTGGCTGTGGATTTTCAGAAGGCCTCAACATACCACGTGTCAAGTGGGCTCATTGTTGGGCTTGTAATTGGGGCAATCGTTTTGGTGTTTGTTTTTAGTATTGGATTAGTTCTATGCAGGAATAGGAAGAAAACCAAACAGAAGAATCTGTGCACGGGTCGCTCTAAGGAATCACCACCCTCCATTGAATCCAAGGGATCTCATGTTATTCAAGTGCCACCAAATCCAACGCTGCCACCGAATCTCAAATCAGGTTCTTTTAAGTCAGTGTCTGTGAAAACAATTCCAAATCATGCTCCAAGGGCAGCCTTCAGTCCCGGGAATGGTAGTTTCACGTATGATGAAATATTAGTGGCCACTAATTGTTTCTCTGAGTCCAACCTTCTTGGAGAAGGTGGCTTTGGCTATGTGTACAAAGGAGTTCTCCCATGTGGAAAGCAAATTGCAGTTAAGCAACTAAAATCTGGTAGCCAACAAGGAGAGAGAGAATTTCAAGCTGAGGTTGAGACAATTAGTCGAGTGCATCATAAGCATCTTGTTGAATTGGCTGGCTACTGCGTTTCTGGGGCAGAGAGAATGCTTGTTTATGAATTTGTTCCAAATAACACATTGGAATTTCACTTGCACGGGGAGGGGAGTATCTTCTTAGGATGGACAACGAGAATTAAAATTGCCCTCGGATCTGCAAAAGGGCTGGCATATCTACATGAAGGTAATCCAGCAATTATTCACCGTGATATTAAGGCATCTAATATTCTTCTTGATTTTAATTTTGAACCCAAGGTTTCTGACTTTGGCCTGGCAAAAGTCTTACCAAACGATAGCCATATTAGTCACCTCACCACCCGAGTGATGGGAACCTTTGGATATGTGGCTCCGGAGTATGCATCAAGTGGTAAATTGACAGATAAATCAGATGTATATTCCTACGGAGTCATGCTTTTGGAACTTATAACCGGACGTCCACCAATCACTGCAGCAGGATCTAGGAATGAGTGCTTGGTTGACTGGGCTAGGCCATTGCTTGCTCGAGCACTACAAGAAGAGAATTTCGACAACCTTGTTGATCCAAGGTTGCAGAAAAACTGCGATGCTGATGAGATGGTTAGAATGGTTACATGTGCAGCTGCTTGTGTGCGCCATTCATCCAAACTTCGACCTCGTATGAGCCAAATAGTTGGAGCCTTAGAAGGAGTGGTTTCTCTTACTGATCTTGTTGGAGATGTTACACCGGAGAATACCCCAGAACACAATTGGTCAAAGTATTTAGATTATGGCGACAACCAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_10453::LG2:45161845-45163845(-)
GATATTCGCGCGGGTGCAGATTTTTTTGCCATCCCTAATCACTATGCATTAATATTCAACAAAAATATAATTACTCAATATATAATATTTTAACAGAAATTACAAATCCACATACAACTTCCCAAACCCCCTTACACCTAATAAATTTTCTACTGGTTTCTTGTTCGTATTATTATATTTGGAACTCTTATCCATTTGAAAACCATCTCATATGCAATTTTTTTTACTAAAAAATGTTAAGCAACGTTGTTCATTGTCTTAACCACTTCCAGTGCACTTCGTAAATTTTGAATGTATTTTATAATAATTTGTTTAGTTACCATTTTATATGTCAAAAAAATTTTACTTAAAAATATAAAATAACAGTTCTTTATAAGTTAAATTAATTTATACATACATTAGAAAAATAGAGAAACTAATAAAAAAGTAATACATTTATTCATGTATAAGTTAATTCTAATTTAAACAATGTTTTTTATTTTATTATTGTTATTAGTTTATAGAAAATTATCTAAATAGAACTTAGTGCATCAAATTTTAATTAACCAAGGTTTATGGACAAGTTTGTTTTGTAAGGTAATATTGCTCTTTTGTAAAATAGTTGACTGTTGTATCATATGAAAAATTGAAACAATAAATGACAGTAGTGAAATGTATATTATAATAACATGTAAATTTTAAACTACAAAACAATTCCTCTTCCATGTTATTATCATTTTTTTTATGTCATTTTGATGGTAATTTTTCATTTCCTAACTATCATCTTGTCAAAGTATGAGTATTTCAATACTCAGTTCTTTTAACTCTAATTAATTAATTGGTTATATTGTATTAGTATAATTATTTCTGGTTCAGGATATATTTTATTAGTATAATTATTTTTTTATATTTATATTATGTTTATAGTGTAAGGCGGTTTATTTTATTTTATCAATCTTACAACGGTTTTATTTATATAAAACTGTGTAAAAGAGTAATACATGTCCGGAGGAAACATTGAAATTATTAGCAATCATTTATTGATTAATTTATTAGATAGGGTTAATTTAAGTATTTATAAATATTACGACTTTACTTTAAAAAAAATTGAAATCGTGTTATATAAGACGACTTCAGTAGTGCCTTTTCTTTTAAATGAAGTTATCGTCTCTATAAATATTTCAGTTAAAAACAATTTTTTAAATGTGAATTTCAGTTGCGTAAATACAAAATAAATTTATTAATCTCATTTGTTAAATAACCATGATTTATTGATTGCTTAAAAATGTTATATGCTTTAAAAAAAAAAATTGTGAAACTGAGAGAAACTTTCTTTATTTTTAAAAAAATGTCCAAGTCAGAAATTTAAATACCTCTGCTAATAACATCGACAAATTTCCCTTTACGAGGCACATGTGACATCTTGGGACTGAAAATAAGGAATCATAGACTCTGCTGTATAATTGTCTCCATTTTTGTTCCGCCTATGTTTTTATAATATCCAAATGCAAAAAGGGCAGCTTTATGTGGCATACATCTTCTTCCCATCACTGGAGAAAACCATGATTCCTTCATTTATTTTTTTTTCAATTTCAACCACTCTTCTATGTGCCTCTTCTTTTCTATCTCACATGCTGAAAAAGGTCACTCTATGGGACCATTAATGACTTTTCGAAAAGGTCAACCACCACATGCACCTCACTCTCTACAACATAAAATTACAAATGTTTCATTATGAATTTATCCTAACAGTTGCTGAAACCATTTTTTTTTTGTATCTTATCGAAACAGAGATACAATAACACAAGTGGTTGATAGAAAAAGGTGTTAAACATAGTTGGATTGCACTAGCCATTTGTGGCTACATGCTACAGCTTATAGAGTTGCTATGTCATAATTTTCTTTTCAATTTTTTCATAGCAATTCGGCGCCCACTATAATATTCATATATGCTCTGCTTCGCTTCTTCACGTGCATGAGTTTGTCTTCACCTTCCAACTCCTACCCACTGTTATACAATC


Gene Sequence:
>Vu_10453(-)
ATGTTTGCAGTTACACCATATTCTCCGGCGACCACGCCGGTTGACGTCGTTCCTCAGCCGTTTCCGCAACCAGCAGCACCCGCATTCCAGTCCTCGCCGTCACCATCGATGTTTCTGACGCCTCCAGCCCCGTCCTCCCCGTCGCCGGAAACTTTATTCTTCCAAGGTTTGCCTCTACCGCCATCTTCAGTTACACCTGTTCCTCTGACGGTGCCGGCGTTGCCGTCTCCGTCGCCGGAATCTCTCACACCGCCGTTTGTAGTTTCACAATCGCCTCCGGCTCCGACCGCCGCATCGCAGCCACCGCCGTTTCCATATGCCACAGCGCCTTCAACGACGTCGTTTCCGCCGCTTGTAGTTGCGCCATCGCCTCCGTCTCCCACCGCCAGTTTTCCACCTGCATTGCCAGATATGCCTCTGACACCGGAGGCGGCGGCGGTGACGACGTCGACTGTTCCTCCACCGCCTTTACCTCCTTCATTCACGACGGAACCAACCCTGGCAACGCCGTGGAGCCCCGCCTTGCCGTTATCTGCGCCGGAAGTGAATTTGCCGGTGGCTGTGGATTTTCAGAAGGCCTCAACATACCACGTGTCAAGTGGGCTCATTGTTGGGCTTGTAATTGGGGCAATCGTTTTGGTGTTTGTTTTTAGTATTGGATTAGTTCTATGCAGGAATAGGAAGAAAACCAAACAGAAGAATCTGTGCACGGGTCGCTCTAAGGAATCACCACCCTCCATTGAATCCAAGGGTTAGAAAATCTTATCCCTTTTTGTTTGTTAGCTAAATCTCAGTAAAAAATTAACATCAGTTTGTTATGTACTTTCTGCCACTTAATCCATTCAAAATTTCATTTTAATAACTCATACTAACTTGTAATGCAAATTTTTATTGCATATTTAGTGATATGAAACTTCAATAATAACAAAGGAATGGTTAATTTTCCCCTAAATGTAAAGGCGTAGTTTTGTAGTTTACATGATCCCTTCTATTATATAAAAAGGTGATGGATAATAGAGTTCAATTCAATGCATTTCATGGTTTGGATAATTATTAATCTGCTTGCACACTGCATGATCTCATCATCAGGATCTCATGTTATTCAAGTGCCACCAAATCCAACGCTGCCACCGAATCTCAAATCAGGTTCTTTTAAGTCAGTGTCTGTGAAAACAATTCCAAATCATGCTCCAAGGGCAGCCTTCAGTCCCGGGAATGGTAGTTTCACGTATGATGAAATATTAGTGGCCACTAATTGTTTCTCTGAGTCCAACCTTCTTGGAGAAGGTGGCTTTGGCTATGTGTACAAAGGAGTTCTCCCATGTGGAAAGCAAATTGCAGTTAAGCAACTAAAATCTGGTAGCCAACAAGGAGAGAGAGAATTTCAAGCTGAGGTTGAGACAATTAGTCGAGTGCATCATAAGCATCTTGTTGAATTGGCTGGCTACTGCGTTTCTGGGGCAGAGAGAATGCTTGTTTATGAATTTGTTCCAAATAACACATTGGAATTTCACTTGCACGGTAAGTCTGTATTTATGGTAATCCACCGAAACTTTTTCTACTCTGTTGTTGATGGCACTGCTGGTTTCTCGTGAAAAAGTTCTGTTTTAAGTATAGTTGTTTTGTCCTGTATAGAGGACAGGTTTTTTCAATGGTTCTGTACTACGGTTGCATGGTCCTGAAGATGACATAAAATTGTACTGCAGGGGAGGGGAGTATCTTCTTAGGATGGACAACGAGAATTAAAATTGCCCTCGGATCTGCAAAAGGGCTGGCATATCTACATGAAGGTTGTGAGAATTCTTCACTTTTGAGTTAGAATCTGATTCAGGATTTTGCTGTTAACTTGTATAATTCCTTGATGTTACATACTTAAATCTTATATACGGATCCTGTGCTTATGACTTTAGGAAATGGTAATTGGTTTTTAATCGTGATCATCATGGTTACAGGTAATCCAGCAATTATTCACCGTGATATTAAGGCATCTAATATTCTTCTTGATTTTAATTTTGAACCCAAGGTAAGTCTAATCTTGTTCCCTTGATTATTATATGATAATGTTATTATTAATTTTATACGCTTTTTTATTCTTTCCTTCCGCAAAAATCTTCTGTGTCTTCTTTCCATGAAATGCAAGTCTTGAAAGGAAATATTGATAGTAAAAGGAACATTTTTTAATATAGTTGACTCCGAATGAGTCCTTCAGAAAATCAGAACGCTAAGTTAATTGGAGATTGTCCCCTCTTTTGATCACCTATGCTTCGTACTCATTGTTTAATCCTCTTTTAAAAAAAAGTCTGTTATATTTACTCTGTTTATTTTTTTTCAAATGACTTCCTAATTTTGTTCCCTGTGCATCATACAGCACATGAAGTGTTCCTATGTTAATAACTGATAATCTAAGACCTATCTTTCTCAATTACTCTAGAAACATATTTATGCTGAGCTTCTGTTTGTATTAGGTTTCTGACTTTGGCCTGGCAAAAGTCTTACCAAACGATAGCCATATTAGTCACCTCACCACCCGAGTGATGGGAACCTTTGGGTAAGGACTCTGTCCATCTTACTGCACGTATCATAGTGCATTACTTAACATTAACCTCATCGATTACTTGAAACAGAAAGTGCTGTGAATTCCTTAAAATACTTAAGTAAACATTGAATTTTTTTCTCTACTATTAAGTCAGCATCACAAAGTGAACATTGGTCATTTTAGCTCTTCAGTAAATAAGCAGCGCCCTCCTTACAAGTAACAGAAAAAAACGGTTGAAAAAAAATGTTTCTATACAGCGATCATGTGTTGCCAAAGCTGTCTATTGCATATGTCAAAATCAGCTTTTGCCAACTATAGAACTTCAAAGCCAAAAGTTTCGTTGCAGATATGTGGCTCCGGAGTATGCATCAAGTGGTAAATTGACAGATAAATCAGATGTATATTCCTACGGAGTCATGCTTTTGGAACTTATAACCGGACGTCCACCAATCACTGCAGCAGGATCTAGGAATGAGTGCTTGGTTGACTGGGTGAGTTGACTGAGTTCTTTCCAATAATATGTCTAGCGATAGTAGATGTTTTGCCAACTCAAAGTAATAGTAAATTTGAGGGACGATTTTCTTTTGATCCTGATCCTCCGTATTAAAATAACCTATGTGTGTGTGTTGGACTGCAGGCTAGGCCATTGCTTGCTCGAGCACTACAAGAAGAGAATTTCGACAACCTTGTTGATCCAAGGTTGCAGAAAAACTGCGATGCTGATGAGATGGTTAGAATGGTTACATGTGCAGCTGCTTGTGTGCGCCATTCATCCAAACTTCGACCTCGTATGAGCCAAGTAATCATCTGTTTATCATTTTCATCAGCATCACATAAGGACAGAAAGATGGAAGAACTAAGCTAATTATAACTTTTTCAGTAAATCCGTGACTAGACCAGGACAGTAATTTGAAAGAATGATGATTATAGACAGATATGCAAAAACTTAAAAGAAAATTTCTTATTAGAAAAAATCTTAGGACAATACGTACGTAGGTGAAGATTTTCGGTGAATTTAAAGGTTTACCTTAGTAATGACTAATAAAAGTTTGTATAATTGGTTAACATAGAATGTCAAAATAAAACTAATTATGATAGAAAACAACACTGAAAAACACTTAACTGTACTTAAGTTTTGTCAATACATTAAAATCTTGGTCAATCCTTTGGATTGCTTCAACCTTCCTCAATAGATACTCTCAGTTACATAATTAAATCAGTATTGATATTTCAACTTTCAATTAGGACATACAACTAGACAATTAATTCTTAATATCTAGATTTCCTTTGTTAAAATTCTCTCTAGCTCTGATAAACATGGTCTGTTTTTGTTGTGTAAGTACATATGAGACTCTGACCACTAAGTTCACAATTTGTAACAGATAGTTGGAGCCTTAGAAGGAGTGGTTTCTCTTACTGATCTTGTTGGAGATGTTACACCGGAGAATACCCCAGAACACAATTGGTCAAAGTATTTAGATTATGGCGACAACCAATAG