Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10439 LG2 45002007 45005853 PREDICTED: protein tesmin/TSO1-like CXC 5 isoform X1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 45002076 missense_variant p.Ile24Val
G/A,* 45002371 intron_variant
G/T 45002444 intron_variant
G/T 45002478 intron_variant
C/A 45003340 missense_variant p.Gln128Lys
A/G 45003341 missense_variant p.Gln128Arg
T/C 45003477 intron_variant
G/T 45003797 intron_variant
T/C 45003861 synonymous_variant p.Asn213Asn
G/A 45003986 missense_variant p.Arg255Lys
C/A 45004575 splice_region_variant&intron_variant
T/C 45004597 intron_variant
G/T 45004598 intron_variant
C/A 45004809 intron_variant
C/T 45004837 intron_variant
T/A 45004863 intron_variant
G/A 45005056 intron_variant
C/T 45005815 missense_variant p.Ser499Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10439.1
MEQSETTSDSVPRKLARQLDFTVIHRDHPHLKLPPQSPPPHSLLPLSWHPPLHLNLQTPGQLPWLCLESQEPQEQQPWLHSLRPKLVSPVGRFPQPVQKLPVKVLQEVKSESPISQRPFNVELKDTTPKKQKQCNCKNSRCLKLYCECFAAGIYCDGCNCVNCHNNEDNEAARQEAVGITLERNPNAFRPKIASSPQEKRNSKESEAQVIGKHNKGCHCKKSGCLKKYCECFQANILCSENCKCMDCKNFEGSTERRAIFHREYSLVHIKQGTNAAVTEVVGSSGYRKYITPKRRKIHESFSGKSTADQTVNTTGQYLQETDRMTSSSSTLSYSFVSDHVNTRISGSSRSVYLSVLADVLQPQNVKNLCSLFVILSGVSAKTDAEAEGKIDRQTKAENSKASVASSAKSLQETKDGRQPVCDDHVNKAVANAVDIANYNRPLSPETLALMCDEQDNMFFGNTSADGAAYQNMIQKSLNSDGSSDAYGEQERLIMTKLLDVLRELVTLGSIKG*


CDS Sequence:
>Vu_10439.1
ATGGAACAGAGTGAAACGACGTCGGATTCAGTTCCGCGGAAATTGGCAAGGCAATTGGATTTCACAGTCATTCACAGAGATCATCCGCACCTGAAACTGCCTCCTCAATCACCACCGCCGCATTCACTTCTGCCACTATCATGGCATCCTCCCTTGCATTTAAATTTGCAGACACCGGGGCAACTGCCATGGTTATGTTTGGAATCACAGGAGCCACAGGAGCAACAGCCCTGGCTACATTCACTGCGACCGAAGCTAGTTTCGCCGGTTGGTCGATTTCCGCAGCCGGTGCAGAAACTTCCGGTTAAGGTGTTGCAAGAGGTGAAGTCAGAGTCTCCTATATCACAACGTCCATTTAATGTGGAATTAAAGGACACGACACCAAAGAAACAGAAACAATGTAACTGCAAAAATTCTAGATGCCTCAAATTGTACTGTGAGTGCTTTGCAGCTGGTATCTATTGTGATGGCTGCAACTGTGTAAATTGTCATAATAATGAGGATAATGAGGCTGCCAGACAGGAGGCAGTTGGAATAACATTGGAAAGAAACCCAAATGCTTTCAGACCAAAAATTGCCAGCAGTCCTCAAGAAAAACGAAATTCCAAGGAAAGTGAAGCTCAAGTTATAGGAAAGCACAATAAAGGATGTCACTGCAAGAAATCTGGTTGCCTTAAGAAGTATTGTGAGTGCTTCCAAGCCAATATCCTCTGCTCTGAAAATTGTAAATGCATGGACTGCAAGAATTTTGAAGGAAGTACTGAAAGAAGAGCAATTTTTCACAGAGAGTATAGTCTAGTTCACATCAAACAGGGAACTAATGCTGCTGTAACTGAAGTCGTTGGATCATCTGGCTATAGAAAATATATAACACCCAAGAGGAGAAAAATTCATGAATCGTTTTCGGGAAAGTCAACTGCGGATCAAACTGTTAACACGACAGGCCAATACCTACAGGAAACTGATCGAATGACTTCGTCATCTTCAACTCTGTCATATTCCTTTGTCTCTGACCATGTCAACACAAGAATTTCAGGGTCTTCAAGGTCTGTGTACCTGTCGGTATTGGCAGATGTCCTCCAGCCACAAAATGTGAAGAATCTCTGCTCACTTTTTGTTATTCTCTCAGGAGTATCTGCAAAGACTGATGCAGAAGCGGAAGGGAAAATAGATCGACAAACAAAAGCTGAGAACTCTAAAGCTTCTGTTGCTTCATCAGCTAAATCGTTACAGGAAACTAAAGATGGTCGCCAGCCCGTTTGTGATGATCACGTGAATAAAGCTGTGGCAAATGCAGTTGATATTGCAAATTATAATAGGCCATTGTCACCAGAAACACTGGCATTGATGTGTGATGAACAGGACAACATGTTTTTTGGAAATACTTCTGCCGATGGAGCTGCATATCAAAACATGATTCAAAAGTCATTAAATTCTGATGGAAGCTCTGATGCTTACGGAGAGCAGGAAAGACTTATAATGACCAAACTCTTGGATGTTCTTCGGGAACTCGTTACTCTTGGTAGCATAAAAGGTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_10439::LG2:45000007-45002007(+)
AATTATACATAATTTATTGTCAAAAAATTATTAAAAAAAATTAACATATCATAATTCAAAATAACAGTACACAAAGCTAAACTAGGACAATTTTCAGCATTTATGTTAAACTAACTAAGAGATGAAACTTTTCATAAATTAATAACCACACATTAAAACACCGTTATAATTAGAAAAACAAATTCTATTAATATTCTCGAAAAAAATAATATACTACCTATACTAACATTTTTTTCACGCCTTAAAACACCAGCATCACTTAAATTAGGAATTGATAACATTCTTAACTTCAATTAAAATTTGAAAAATTTAGGAATTTTTACTTAAATCATCACTTCATGAAAGATAGTAAGGCATGTTAGTTTCTTGCATACAGTGAATAACTTTTGTATGTAAAAATCTATATTAGACTTTTCATAATTAATTTTTTTTATCCAAGTGATTTCAATTCATAACTAAATATTAATGTTAAACCTTTTATAAATACAAATAAAAAGAGTTAATTAACTTAAGAAAAGCTGAAAACACAAATTACATAACATTCAAATCAAAACATAATTAAACCTTTAATTTTATAATTCTCATCGCTAATATTATTTGTTAATACTTTTTGTTATACTTATCCTCTTGTTATTAATTATCACAAATAATGAGTGATAATAAGTAACACTTGCCAAAATCATCAAAATCTTTTGGTAGGATAAACAAAGTTCAAATCCATGATATAACCTAGATTAATCTGAAATGGTGTTTGTTTTAATGTATTGAAAACTATTTTCAGCCAAGGATTAAGTCTGGTGGAAAACATGAATATTAATGAAAATTTATAAAACTCTCTTCCAAAGAAAGTTCACATTTATTATACAAGAATATTTATATTTAATGTACCAGGCTGTTTACTATAAATTTGAATTTTTTTATAGGAAAATAATTTTTGAAAATACAACGTTTTATTACTTTTTAGTAGACATTTTATATAAGTTTTAATTTCTTAAATACAATAATCTCTAGATATATAAATTATTTATATTTCTTTTACTTATATTTTTATTATAAAAGGTTAGTGGAAATGAAAATGATGATTTTCCGTAATCAGTATATATTATTCTCATTTCATTCTATTACATATTCCTCTTACTTTTAGTTTATATTTTAATGAAATATATTTTCATTTTTTCCTATAACTAAATACCTAACTATTATGTTTATAAGAAAATCAATCATTTTCTTTGAAAGATTATGAGAAAATTAATCCTGGACATAACAATCTTACAAATAGAATTCCTGGAAATTTAACATCATGCTCGTTTTAATTTGTATGTTCATAGCCATTTTAAATTTAGTTTATAATATTAGTAATGAATAATTAACAATCATAATTCCTAATGATTTAGTAAAACCATATTATTAAATTTAAGCAAAATTTTATATTATTTTGTGCCAAGAGAAAGGTAAATCAGGGTAAGTTACATGTGAGATCCATATTATTATATTTTGTTTTGGATTTCTATATTTGAATATAAAGTATGCAAGATTTACTATTCCACTCCTTGGATTCAATTAGCGCCAAAATGTATCTTCGCACTGACCAGAAAGTACCAAGTACCGTTTCTTTTTACAATCCAAGGGACACAATTCACTTCAAGCTCCCCGAGAACATCTTGATAGTTCAATCAAACATTCCAATTCAATTTTCAAAATATCGAGAGAGGGAGAAAGAGCTGTCACTCCCATAGTCTTCCTCATGACACCCTTCATCTGGCGACACCACAATAAATTCCGTTTTCGTTTCATCCGGAAAATCTCTTTCTTCTCTTACATAATTACATAATAAATGCTGTTTCATTCCTTTTGCCGTTTCTTGCCATTCGTAACGCACGAGAATTTATGGACTCTCACGCATCTCCCTTTCCCTTCAATTGACCTCGGCGAAGCCTTTTCCGTCAGCGTTGTTCAGAATAACACCATTGCCAACTGCACATCTGTTGTTCAAAAATAGA


Gene Sequence:
>Vu_10439(+)
ATGGAACAGAGTGAAACGACGTCGGATTCAGTTCCGCGGAAATTGGCAAGGCAATTGGATTTCACAGTCATTCACAGAGATCATCCGCACCTGAAACTGCCTCCTCAATCACCACCGCCGCATTCACTTCTGCCACTATCATGGCATCCTCCCTTGCATTTAAATTTGCAGACACCGGGGCAACTGCCATGGTTATGTTTGGAATCACAGGAGCCACAGGAGCAACAGCCCTGGCTACATTCACTGCGACCGAAGCTAGTTTCGCCGGTTGGTCGATTTCCGCAGCCGGTGCAGAAACTTCCGGTTAAGGTGTTGCAAGAGGTGTAAGTATTCTTATGGCTCAAAAGAAAGGAAATAGAAAACGGTAGCGTTTTGAATTTGATTAGCCCTGTGTCAACGATAAGGAATGCCCGGAGGGTGCTAAAGTGTGTCGATACGTTAAGAGTGTTGAATTGGTTTAAAATCTAGTACGATCAAGATTGTTCTTGGCTGACATGATTTGATTGATGCCTCCAAAAGTAATGATTCTTGAAAATTTTAAGTTTCATAATTAGTTTGGTCCCTATTTTCGAATAATCTTTACATTGTACTCCCTGTTCAAAGAAACTCTACTCACTTTAGTTCCCTAATACACGCATTTTAGTCTATTTTGTTTGACTGTCCGTAGTTGTTCTCTGACTAAAATGATTAGAAAATGTAAGAGTAAGGAGTAAAATGAGTTAAAAAAAGTGTACTTCCTGAGAACTAGTAGTTACTAAAATGAGTTATTTCCAGTATAGAGACCAAAACTTACAAGAGTTGTAATTAAACCGGAAAGTTATAAAGATGAGATGGCTACATAAGTACTGGACTAAAGTGTTTTTGGTGGAAAATGTAAGTAGCAATAGATTTTTTGAACTGGGAGCCTTGAATTCCTTTGTGCAATTGATAAATCATTTCAATAATAATAAATATTTGTATCCGAATGCTATGTGGGCTCATTGTTATCATTTTGAGATTGGATATAGTAATCTGAATTATGATAAAAAAGGGAAAGAGTGTAGTATACATTTTGGTAAAATAAATGTCTTAAATTTCCTACTAAACTTAATGCTGCTCTATAGAGCTAAATTAGTTGTCAAGGAAAAAGCTCCAAATATTTCATCAATCCATATAATAAGGGGTTAGAAATACTGTTTCATTTCTGTACTCACTATTAAGTTTTGCCTCACAGTAAGAACTTTTGTACTAATTTTAATTTTATTATGTTTGTGAACTTATTTGCATTCGTTCAGGAAGTCAGAGTCTCCTATATCACAACGTCCATTTAATGTGGAATTAAAGGACACGACACCAAAGAAACAGAAACAATGTAACTGCAAAAATTCTAGATGCCTCAAATTGTAAGTCCTTTTATCTGAATGAAAAACTTTTATCAAGAATACTTTATCTTATCGTCATACTACATCTGCACAATCTTGAACGTATTTTTTTCTGCTCTCTCTCTCTCTAACTGGAAAAGCCTAATTTGGCAAATGCTAGGTACTGTGAGTGCTTTGCAGCTGGTATCTATTGTGATGGCTGCAACTGTGTAAATTGTCATAATAATGAGGATAATGAGGCTGCCAGACAGGAGGCAGTTGGAATAACATTGGAAAGAAACCCAAATGCTTTCAGACCAAAAATTGCCAGCAGTCCTCAAGAAAAACGAAATTCCAAGGTTTAAAACACCTCAAATTCCCTCAAAATTCAAATTTCAAGGTTTTGTGATAGTACGTAGTGCTCTAGGTTTAGGTGATATTTTAGTTGACGTGGTGCACTTTAATGTCTTGTATGAACATAGGAAAGTGAAGCTCAAGTTATAGGAAAGCACAATAAAGGATGTCACTGCAAGAAATCTGGTTGCCTTAAGAAGTATTGTGAGTGCTTCCAAGCCAATATCCTCTGCTCTGAAAATTGTAAATGCATGGACTGCAAGAATTTTGAAGGAAGTACTGAAAGAAGAGCAATTTTTCACAGAGAGTATAGTCTAGTTCACATCAAACAGGGAACTAATGCTGCTGTAACTGAAGTCGTTGGATCATCTGGCTATAGAAAATATATAACACCCAAGAGGAGAAAAATTCATGAATCGTTTTCGGGAAAGTCAACTGCGGATCAAACTGTTAACACGACAGGCCAATACCTACAGGTGTTTTCTTCTTTGCCTTTCTCAGTCATGACAGGATTTACTGGGATCTATGTAAACAATAATGTACTAATTCTTTATGCAGCAGGTTATTATAATTGGATTGGAAAATGAAATCGTATGAATCCAACCATGCAATAGCTTTGTCTTGTAATCATAGCATCAAGTCAACAATTCAATCCTTGTTGTATTCCTTGGAACCCTTGATTTTCTTATTGTTTACTGATCAATGTCCTCTATCCTTGGACATCCAAACATAATGTAATGCTTTTTTACATTATTTTGTATTTTAATCAGGAAACTGATCGAATGACTTCGTCATCTTCAACTCTGTCATATTCCTTTGTCTCTGACCATGTCAACACAAGAATTTCAGGGTCTTCAAGGTCTGTGTACCTGTACGTGAGTTTTCTAATAATTATTTGACGAATTTATATATCTTCAAGGTCTATGTACAACTAACAATTTATTGATGCTGAAGGTCGGTATTGGCAGATGTCCTCCAGCCACAAAATGTGAAGAATCTCTGCTCACTTTTTGTTATTCTCTCAGGAGTATCTGCAAAGACTGATGCAGGTTTTGAGCAACTCATGGATGTATACTCTATTTATCATTTTCAGAATAATTTTTTTTTTCTAATGAATGGTGAATGATTTAATATTCCGAAGATTTAAATATGTACTTGTAATTAAGGGATACCTTCGGGAGAAGTGGTGTTATATGTCATGATATATTTTATTGGTTACTACAGAGAAATAGTAAGCAATTGGGAAAGTATTATGGTACCAGAACAATAGTTAACTGATGCATATCTAAAGTAATGATATTAAATTATGTTTGAATATTTGATGATCAAAGCTTTGAATTTGCAATGTCTGAAGGGAAACTATTGTGGTTTAGTAAACTTAATGAAGTTATTTTTAATTTTTTTAATGAAACTAGTGTCACACTAATAATATGACTAAGGAAGGGGGCACTGGTGAAAAAACCCTTAGAGGACCTTTCATACACAGAATACTTTCAGCAAATTTTCATTCTTTGAATTGATTAGGTTAGGCGATCAGATCATGAACACCACTAATGTTCCTGAAGTCTTTCATTTTTTGGCCACAATTGTCATCATGCAGTTGCATACCTTTGGAAATATGTATTTCAGATTCAAGGTGTACTGCTCACATTTCTGACAATAGTTGTCTTTCTGTGATGCTCTATAGCTTTCACTCTTTCCATATTTTCCTGACATGTTTTATCTGTACAAAGTTTGCATTTTAATAAATGTTTCCCAACTTTTCAGAAGCGGAAGGGAAAATAGATCGACAAACAAAAGCTGAGAACTCTAAAGCTTCTGTTGCTTCATCAGCTAAATCGTTACAGGAAACTAAAGATGGTCGCCAGCCCGTTTGTGATGATCACGTGAATAAAGCTGTGGCAAATGCAGTTGATATTGCAAATTATAATAGGCCATTGTCACCAGAAACACTGGCATTGATGTGTGATGAACAGGACAACATGTTTTTTGGAAATACTTCTGCCGATGGAGCTGCATATCAAAACATGATTCAAAAGTCATTAAATTCTGATGGAAGCTCTGATGCTTACGGAGAGCAGGAAAGACTTATAATGACCAAACTCTTGGATGTTCTTCGGGAACTCGTTACTCTTGGTAGCATAAAAGGTTAG