Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10366 LG2 44168078 44171496 PREDICTED: receptor-like protein kinase HSL1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 44168516 missense_variant p.Ser147Thr
C/A 44168573 missense_variant p.Pro166Thr
G/C 44168737 synonymous_variant p.Gly220Gly
C/T 44168740 synonymous_variant p.Asn221Asn
T/A 44168954 missense_variant p.Cys293Ser
C/G 44169153 missense_variant p.Pro359Arg
T/C 44169392 missense_variant p.Ser439Pro
G/A 44169396 missense_variant p.Arg440Lys
A/T 44169428 stop_gained p.Lys451*
T/G 44170183 intron_variant
G/A 44170429 intron_variant
G/A 44170874 intron_variant
A/G 44170926 intron_variant
G/T 44171181 stop_gained p.Glu645*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10366.1
MNHHHPFITLFSTILLVSTTTTTTLSLSQVIITSTTTKNQSQFFFLMKLSLPGKYPMNWDAGKPVCSFTGVTCNTKGDVIGLDLSGWSSLTGKFPEDTCSYLPQLRVLRLGHTRFKFNVGTILNCSHLEELNMNHMSQTGTLPDFSSLKSLRILDLSYNVFTGQFPMSVFNLTNLEVLNFNENGGFNLWQLPADIDRLKHLKSMVLTTCMVHGQIPASIGNITSLIDLELSGNFLTGQIPKELGQLKNLQQLELYYNYHLVGNIPEELGNLTELVDLDMSVNKFTGSIPASVCRLPKLQVLQLYNNSLTGEIPGAIENSTALRMLSLYDNFLVGQVPKKLGQFSGMLVLDLSENKFSGPLPTEVCKGGTLEYFLVLDNMFSGEIPQSYANCMMLLRFRVSNNRLEGSIPAGLLGLPHVSIIDVSNNNLNGPIPEINGNSRNLSELFLQRNKISGVITPTISRAISLVKIDFSYNLLSGPIPSEIGNLRRLNLLMLQGNKLNSSIPGSLSSLESLNLLDLSNNLLTGSIPESLSVLLPNSINFSHNMLSGPIPPKLIKGGLVESFAGNPGLCVLPVYANSSDRNFPICPSAYKSKRINTIWIAGVSVVLIFIGSALFLKQFAYSSRATTKCDVYSFGVILMELLTGKKPVEAEFGENRNIVFWVSNKVEGKEGARPSEVFDPRLSCSFKDDMIKVLRIAIRCTYKAPTSRPTMKEVVQLLIEAEPRGSDSCKLSTKDVSNVTVVKKPYEL*


CDS Sequence:
>Vu_10366.1
ATGAACCACCATCATCCCTTCATCACCCTCTTCTCTACTATACTATTAGTTTCCACCACCACCACCACCACCCTGTCACTCTCCCAGGTTATCATCACCAGTACCACCACCAAGAACCAGTCACAGTTTTTCTTTCTCATGAAACTCTCCCTCCCCGGAAAGTACCCCATGAATTGGGACGCTGGAAAACCAGTGTGCAGCTTCACCGGAGTTACCTGCAACACCAAAGGTGACGTTATCGGCCTCGACCTTTCAGGTTGGTCATCACTTACTGGAAAGTTCCCGGAAGATACATGCTCTTACCTCCCACAGTTACGTGTTCTCCGCCTCGGCCACACCAGGTTCAAGTTCAACGTAGGCACCATCCTCAACTGTTCCCACTTGGAAGAGCTTAACATGAACCACATGTCCCAGACCGGCACGCTCCCAGATTTCTCTTCCTTGAAATCTCTGAGGATTCTCGATTTGTCCTACAACGTCTTCACAGGCCAATTCCCCATGTCAGTGTTCAACCTCACCAACCTCGAGGTGCTAAACTTCAATGAAAACGGAGGCTTCAACCTGTGGCAGTTACCCGCAGATATTGACAGGTTGAAACACCTCAAGTCCATGGTTCTCACGACGTGCATGGTGCATGGTCAAATCCCTGCGTCCATAGGGAACATAACTTCCCTCATCGATCTTGAGCTGAGTGGGAATTTCCTCACGGGACAAATTCCGAAAGAGCTTGGTCAGCTGAAGAACCTTCAACAGCTTGAGCTTTACTATAACTACCATCTCGTTGGGAACATTCCAGAGGAGTTGGGGAACCTCACGGAGCTCGTGGATTTGGATATGTCAGTGAACAAGTTTACCGGGAGCATCCCTGCGTCGGTTTGTAGGCTTCCCAAGCTTCAAGTCTTGCAGCTCTACAACAACAGCCTCACAGGTGAAATCCCAGGTGCGATCGAAAACTCAACAGCTTTAAGAATGCTGTCTCTGTACGACAACTTCCTTGTAGGACAGGTTCCCAAGAAACTGGGACAGTTCTCTGGAATGTTAGTTCTTGACTTGTCGGAGAATAAATTTTCTGGTCCGTTGCCAACCGAGGTTTGCAAGGGTGGTACGCTAGAGTACTTTCTCGTTCTGGATAACATGTTTTCTGGAGAGATACCACAGAGTTATGCGAACTGCATGATGCTGTTGAGGTTTAGAGTGAGTAACAACCGTTTGGAGGGTTCCATTCCCGCGGGACTCCTTGGTTTACCACACGTTTCAATCATTGATGTGAGTAACAATAACTTGAATGGTCCAATTCCTGAGATTAACGGGAATTCTAGAAACCTGTCTGAACTGTTCCTTCAGAGGAACAAAATTTCAGGTGTCATAACTCCCACAATATCTCGAGCCATTAGTCTGGTCAAAATAGATTTCAGTTACAACCTTCTATCTGGTCCAATCCCTTCCGAAATTGGCAACCTCAGAAGGCTCAATTTGCTTATGTTGCAAGGGAACAAGCTGAATTCTTCCATCCCTGGTTCACTCTCTTCATTAGAATCTCTCAACCTTCTTGATCTCTCCAACAATCTTTTAACTGGGAGCATCCCTGAAAGCCTCTCTGTGCTGCTACCAAACTCTATTAACTTCTCGCACAATATGCTTTCGGGTCCAATTCCTCCCAAACTGATCAAAGGAGGCTTGGTGGAAAGTTTTGCAGGGAATCCTGGTTTGTGTGTGCTACCGGTGTATGCCAACTCATCGGATCGAAACTTCCCCATATGTCCAAGTGCCTACAAGAGCAAGAGGATCAACACCATCTGGATAGCTGGGGTGTCAGTGGTTTTGATCTTTATTGGGTCTGCCTTGTTTCTCAAACAATTTGCATATTCATCAAGGGCCACCACCAAGTGCGACGTCTACAGTTTTGGGGTGATTTTGATGGAGCTGTTAACTGGGAAGAAGCCCGTGGAGGCAGAGTTTGGAGAGAACAGAAACATTGTTTTCTGGGTTTCCAACAAAGTAGAAGGCAAGGAGGGGGCAAGACCAAGTGAAGTTTTTGATCCGAGGTTATCATGTTCATTCAAGGATGACATGATCAAAGTGTTGCGGATTGCCATTCGCTGCACCTACAAAGCCCCAACAAGTAGACCAACCATGAAAGAGGTTGTTCAGCTTCTGATTGAGGCAGAGCCACGCGGTTCCGACTCTTGCAAGTTGTCAACCAAAGATGTTTCAAATGTCACCGTAGTAAAGAAACCATATGAATTATAA


Promoter Sequence:
>Vu_10366::LG2:44166078-44168078(+)
CAAATTGAATCCATGTTTGACCAACACATCACATCTACATTGGTTCAAGATCATGTCAAGTTAGATTAAAATCATGTCAAATTGATTAGGTTAATTGATGCTATGTTGGATGGATTTATTAAAATAAAAGAGAAAGAGACATAAGATGAATCCTTAATATGTGTTGATCACATATAATTATGCATTTATAAATAAAAAAAATACAAAAAGATAAGTATAAGTTGGTTACGTTTAAAACTAAATACATAATATTACAAGTAACCATATCGAATAATATCTTAACCATATCCAATAGAATTTAACATAATTGACAAAGTAAATTTAATAAAAAAATTAAATTTAAATTAATTAAAAAATATAAATCAATATAATATAATTAAAATGAATTTATATTTTAGATTCAATTTATTTTATTATATCTAGATTGATTTTAAATTGAATTTTGAAAATCAATCCATAACCCCTAGGCGAAACTCGCATGTTATAACACTAATAAGAAAAAGGACAATAATACTTTGACAACATTTTAACATCATCTACGTGTCATTCTGTGATTGGTCCAAAATTATTCCACAATCAATAATAATAATCATAAACACCAACATGAACCAATCACAGAATGACACATAGATGATGTTAAAATGTTGTCAAAAAAATGTTATCAAAGTATCACTAACCTAAGAAAAAAGAATATTATATATAATACAACAAAAGTCAACCGAAGATTATTTTACATAAATTTGATCACTTTAAGTAGGTTGTCTGTATGTATGCACTTTGATCATTTTATAAATCTATCAATTTACAATTTCTTTTATTATTTATATCAATCAAATTATTAATAAAATTTTCAATTATTTACGTTCATTTTTCATTCTCCTTCTCAATCTATACGACAACCTAATCCAATGCAATGGTTACTGTTGAAGTGATTATAAATTTTACAACTTGTGTCCAGCACGGTCAACCACAGCCAAAGTAGTCTGCTGTTAAAAAATAAAAAGCTGGGGCATGATATACATATCAATACTGGGACACACCCTCAAAAGAGCAAGAAAAATTACAATATAAAAATGTATATCAGAATAAAATAATAATATTTTAAATTGTTAAATGCTCTTATTTTGTTAGGGTGGTTAAAATATCAGCGTACTAGGAGTAAATAATTACAAAAAATATTTTTAATGACGAGAACTTGTTCTAACCTGTTTAAAGCAACTGGAGAAAAAGAAATTATAAGTTGGATGATGAGCACGAAAAATGCATTTGTTCGGTTCCATCTTTGCTTTTGTTATTGAAGTGGGATATATCTTTGTAATTGGCTAGGATTGGAATCCATAAGAAAGATGTGGATCACACCCTCTCTCTTTCTCAACAAAATTATTATTTTCTTCCAAAAGAAAGCTTAATCGCATCATACATATATATATACGCTCATTAGTATCAGATGCACTTCATTCTACATGCTCTACATTACCATAACACAAAAAGAGAATGCCTTCTTTTCTTAAAATATCATTGTCAAAGGAGTGTGCATTTTTTAAAAAGATCACACCATTATCACAACAGCATTTTACAAAAACTCTTTATCATTCGTCATCACTTATCCTTGCAAAAACTACATCTGTCTTTCTAAACTTAGATTATTTAGAGTTTCATTTATTTGTAGAATTATGAAGCAAGTGTATAATGTATGAGTGAATATATGAGGAGTAGATTGTAACAGGTGTGCTGGGATAGTATAAAGTACATATGCACTGATGTTATTCTGTGATGAGGCAGTGATAGTGGAGTATAAACGTAAAGCCTCTTTACCAAAGATGTTCACTTCTCGCAGCAGTAGTACTTGAGCAAGAACCTGCTTTTTCATCATCAAGGCTTGTCACTGCTTCCCTAAGTCATCCACTCAACCATTCCATATCTTATATACATCTCTTACACCCTTCTTCTTCCCTGCAACCATTCACAATCACCTCTTCTATTTTTTTCTTCTCTCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_10366(+)
ATGAACCACCATCATCCCTTCATCACCCTCTTCTCTACTATACTATTAGTTTCCACCACCACCACCACCACCCTGTCACTCTCCCAGGTTATCATCACCAGTACCACCACCAAGAACCAGTCACAGTTTTTCTTTCTCATGAAACTCTCCCTCCCCGGAAAGTACCCCATGAATTGGGACGCTGGAAAACCAGTGTGCAGCTTCACCGGAGTTACCTGCAACACCAAAGGTGACGTTATCGGCCTCGACCTTTCAGGTTGGTCATCACTTACTGGAAAGTTCCCGGAAGATACATGCTCTTACCTCCCACAGTTACGTGTTCTCCGCCTCGGCCACACCAGGTTCAAGTTCAACGTAGGCACCATCCTCAACTGTTCCCACTTGGAAGAGCTTAACATGAACCACATGTCCCAGACCGGCACGCTCCCAGATTTCTCTTCCTTGAAATCTCTGAGGATTCTCGATTTGTCCTACAACGTCTTCACAGGCCAATTCCCCATGTCAGTGTTCAACCTCACCAACCTCGAGGTGCTAAACTTCAATGAAAACGGAGGCTTCAACCTGTGGCAGTTACCCGCAGATATTGACAGGTTGAAACACCTCAAGTCCATGGTTCTCACGACGTGCATGGTGCATGGTCAAATCCCTGCGTCCATAGGGAACATAACTTCCCTCATCGATCTTGAGCTGAGTGGGAATTTCCTCACGGGACAAATTCCGAAAGAGCTTGGTCAGCTGAAGAACCTTCAACAGCTTGAGCTTTACTATAACTACCATCTCGTTGGGAACATTCCAGAGGAGTTGGGGAACCTCACGGAGCTCGTGGATTTGGATATGTCAGTGAACAAGTTTACCGGGAGCATCCCTGCGTCGGTTTGTAGGCTTCCCAAGCTTCAAGTCTTGCAGCTCTACAACAACAGCCTCACAGGTGAAATCCCAGGTGCGATCGAAAACTCAACAGCTTTAAGAATGCTGTCTCTGTACGACAACTTCCTTGTAGGACAGGTTCCCAAGAAACTGGGACAGTTCTCTGGAATGTTAGTTCTTGACTTGTCGGAGAATAAATTTTCTGGTCCGTTGCCAACCGAGGTTTGCAAGGGTGGTACGCTAGAGTACTTTCTCGTTCTGGATAACATGTTTTCTGGAGAGATACCACAGAGTTATGCGAACTGCATGATGCTGTTGAGGTTTAGAGTGAGTAACAACCGTTTGGAGGGTTCCATTCCCGCGGGACTCCTTGGTTTACCACACGTTTCAATCATTGATGTGAGTAACAATAACTTGAATGGTCCAATTCCTGAGATTAACGGGAATTCTAGAAACCTGTCTGAACTGTTCCTTCAGAGGAACAAAATTTCAGGTGTCATAACTCCCACAATATCTCGAGCCATTAGTCTGGTCAAAATAGATTTCAGTTACAACCTTCTATCTGGTCCAATCCCTTCCGAAATTGGCAACCTCAGAAGGCTCAATTTGCTTATGTTGCAAGGGAACAAGCTGAATTCTTCCATCCCTGGTTCACTCTCTTCATTAGAATCTCTCAACCTTCTTGATCTCTCCAACAATCTTTTAACTGGGAGCATCCCTGAAAGCCTCTCTGTGCTGCTACCAAACTCTATTAACTTCTCGCACAATATGCTTTCGGGTCCAATTCCTCCCAAACTGATCAAAGGAGGCTTGGTGGAAAGTTTTGCAGGGAATCCTGGTTTGTGTGTGCTACCGGTGTATGCCAACTCATCGGATCGAAACTTCCCCATATGTCCAAGTGCCTACAAGAGCAAGAGGATCAACACCATCTGGATAGCTGGGGTGTCAGTGGTTTTGATCTTTATTGGGTCTGCCTTGTTTCTCAAACGTAGGTGCAGCAAAGACACCGCTGCAGTGGAACATGAGGAGACACTGTCTTCATCGGTTTTCTCTTATGATGTTAAGAGCTTCCACAAGATCTCTTTCGACCAAAGGGAGATCGTTGAGTCCTTGGTGGACAAGAACATAATGGGGCATGGAGGGTCTGGGACAGTGTACAAGATTGAGTTGAAAAGTGGTGATATTGTCGCAGTGAAGAGGCTGTGGAGTCGCAAGTCCAAGGATTCGACTCCAGAGGATCGGTTGTTTGTGGACAAGGCATTGAAGGCAGAGGTGGAGACCTTAGGAAGCATAAGACACAAGAACATAGTGAAACTATACTGCTGCTTCTCCAGTTTCGAGTGCAGCTTGTTGGTTTATGAGTACATGCCAAATGGTAATCTTTGGGATTCCCTGCACAAGGGTTGGACCCTTTTGGATTGGCCTACTCGTTATAGAATTGCACTGGGAATTGCACAGGGTTTATCATACCTTCACCATGATTTGCTTCTTCCTATTATCCATCGAGACATCAAGTCAACCAATATACTGTTGGATGTTGATTACCAGCCCAGGGTTGCAGACTTTGGGATTGCCAAGGTTTTGCAAGCAAGAGGAGTGAAGGATTCCACCACAACTGTCATTGCAGGAACATATGGTTACTTAGCCCCAGGTATTTTCTCCCACAAAAGTTATTTATAGTCATCATTTAAATTCATTTGTGCAAACTACCATCATATGTTTTCTTGAATGATAGAGCAAATAGTATATGCAAAAAGGAGTTTTTGTACAGCAGAAATCATTCAATACGATAAATTTGTTGAGTTTTACAATAGCTACCACTATAGTTGAACCTAATACGATGTCTGATCAGTTAACTAAGTAACAACTTTTGCAGTGCATAAAAATTAAACTCCGTGGTAAATGATTAAGAATACATTGACTATTAGCGTGCTGCTTGGATATTCTCATGGTACTGATCTCTGAATGATGCCTTTTTACCATGTAAATAATTGAGGTGCAGATATGAATGTTAAAATATAAGTACTACTTTGTACCAAAAAAAACATAGGTGGTACGTGGGGGTTGGACAATTAGTCATGTGCTAACTTCGCTGTCATCTTTTTGGTGTTCCCAACGCTGAATATTATTTTGTGCATGTTTTTATGGCTGTCACAGAATTTGCATATTCATCAAGGGCCACCACCAAGTGCGACGTCTACAGTTTTGGGGTGATTTTGATGGAGCTGTTAACTGGGAAGAAGCCCGTGGAGGCAGAGTTTGGAGAGAACAGAAACATTGTTTTCTGGGTTTCCAACAAAGTAGAAGGCAAGGAGGGGGCAAGACCAAGTGAAGTTTTTGATCCGAGGTTATCATGTTCATTCAAGGATGACATGATCAAAGTGTTGCGGATTGCCATTCGCTGCACCTACAAAGCCCCAACAAGTAGACCAACCATGAAAGAGGTTGTTCAGCTTCTGATTGAGGCAGAGCCACGCGGTTCCGACTCTTGCAAGTTGTCAACCAAAGATGTTTCAAATGTCACCGTAGTAAAGAAACCATATGAATTATAA