Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10301 LG2 43484285 43493804 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108329969
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   negative regulation of cellular metabolic process, negative regulation of cellular metabolic process
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 43484472 5_prime_UTR_variant
A/T 43484478 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 43484487 5_prime_UTR_variant
C/T 43484491 5_prime_UTR_variant
T/G,A 43484492 5_prime_UTR_variant
C/G,* 43484497 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 43484566 missense_variant p.Phe10Ser
C/T 43484569 missense_variant p.Thr11Met
T/C 43484616 intron_variant
G/C 43484705 missense_variant p.Ser25Thr
G/A 43485106 intron_variant
C/T 43485214 intron_variant
T/C 43485317 intron_variant
C/T 43485484 intron_variant
C/A 43485608 intron_variant
A/G 43485801 intron_variant
T/A 43485807 intron_variant
T/A 43485854 intron_variant
C/T 43485855 intron_variant
G/A 43485907 intron_variant
T/C 43486300 intron_variant
G/T 43486472 intron_variant
G/A 43486813 intron_variant
A/C 43486992 intron_variant
T/C 43487413 synonymous_variant p.Asn233Asn
T/A 43487548 intron_variant
A/G 43487757 intron_variant
G/T 43487948 intron_variant
T/C 43488309 intron_variant
A/G 43488344 intron_variant
A/T 43488412 intron_variant
T/A 43489170 intron_variant
T/A 43489198 intron_variant
C/A 43489200 intron_variant
C/T 43489201 intron_variant
T/C 43489268 intron_variant
G/A 43489290 intron_variant
G/T 43490392 downstream_gene_variant
C/A 43490398 downstream_gene_variant
C/T 43490406 downstream_gene_variant
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G/T 43490604 downstream_gene_variant
G/A 43490637 downstream_gene_variant
A/T 43490741 downstream_gene_variant
G/T 43490756 downstream_gene_variant
A/G 43490759 downstream_gene_variant
C/T 43490773 downstream_gene_variant
G/A 43490802 downstream_gene_variant
G/A 43490814 downstream_gene_variant
C/G 43490824 downstream_gene_variant
A/G 43490879 downstream_gene_variant
G/T 43490894 downstream_gene_variant
C/A 43490937 downstream_gene_variant
T/A 43490958 downstream_gene_variant
G/A 43490963 downstream_gene_variant
G/T 43490964 downstream_gene_variant
A/G 43490970 downstream_gene_variant
C/A 43490981 downstream_gene_variant
T/C 43491061 downstream_gene_variant
A/T 43491107 downstream_gene_variant
G/T 43491113 downstream_gene_variant
T/C 43491148 downstream_gene_variant
G/A 43491153 downstream_gene_variant
T/C 43491180 downstream_gene_variant
C/G 43491199 downstream_gene_variant
T/C 43491208 downstream_gene_variant
A/G 43491211 downstream_gene_variant
G/A 43491212 downstream_gene_variant
T/C 43491235 downstream_gene_variant
T/A 43491263 downstream_gene_variant
T/A 43491272 downstream_gene_variant
G/A 43491281 downstream_gene_variant
T/C 43491290 downstream_gene_variant
G/T 43491300 downstream_gene_variant
G/A 43491337 downstream_gene_variant
T/G 43491372 downstream_gene_variant
T/C 43491559 downstream_gene_variant
G/T 43491703 downstream_gene_variant
G/T 43491926 downstream_gene_variant
A/T 43491962 downstream_gene_variant
G/A 43492029 downstream_gene_variant
T/C 43492064 downstream_gene_variant
G/C 43492978 missense_variant p.Val391Leu
T/C 43493018 missense_variant p.Leu404Ser
A/G 43493022 synonymous_variant p.Ala405Ala
T/C 43493043 synonymous_variant p.Asn412Asn
T/C 43493049 synonymous_variant p.Pro414Pro
A/G 43493769 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10301.1
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CDS Sequence:
>Vu_10301.1
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Promoter Sequence:
>Vu_10301::LG2:43482285-43484285(+)
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Gene Sequence:
>Vu_10301(+)
ATTCTTGTTCTGTCTTCTTTTCCACCTCTTAATTTCTTACTATCTGTCTCCATGATTCCAGTCAAGAAGGGAATAATCTCTATAAGTATTCAATCAGTCGACACAGTTTCTCAATCTCCATTTTTTCTCAACACACTTCTTCTTCTTCCGTCAATCTCTCTGCAATTCCCTTCTGTTTCATCTATTTGTTGTTAGGGATTTTTTTTCTTTCTCTCTTTTTGTTTTTTTTTCCTGCTCCGACTAAGACACGGCAATGTCGGAGAAGAAGACCAGAGTGTCTTTTACGGAAAAAGATGCTGTCGCGCTGATGCAGAGGTATCTATTTATTTATTTAAGGTTGTTTATAATTTTGTTTGTAATTTTGTGTTGCGACTTCAAAGAGTTCAAACGATTTGGGCTTTTTGTGCAGGTACGACCCAAGTACAGTGTTTATCTTACTTCAAGAAGTTGCGCATTACGCTAAGCCAAAGATTGATTGGAGCGAGTTGGTGAAGAAAAGCGCAACTGGGATTTCTAATGTTAGGGAATATCAAATGCTGTGGCGGCATTTGGCCTACCGGCATTCTTTGCCGGAAAATTTTGAAGTTGGGGCTGAACCTCTGGTCAGTACAATACTCTTGAAATTTCTTTGATATGCTAATTTGTTGTTAAGGTGAAATATCTTTTGCAAATTAGTTTTAGGGTACGTTTGAAATAACTTGTTTACAACTTATTGGAACTTATCTTACAACATAGACCAGCTTCGGTTGATAGGGATGGCGAGTGGTGAGTTGGGGAGAGACCACGAGGCTTAACCAAAGTGCTTGAGTTGGACTCAACCTGGTTGGGATGTCCACCTATTTGGTGTCTGTCAAACCCTAAGGGAGATTAGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTTTGACGAGGAGATACTTCTTGGCAATGAAAAGAAAAGCCTTGCCACATAGACTTTTTGTAGAATGGATGGTTTGGTAGAGCTTATAAAATGTCCATGATAACTCTTGAAAATAGCTATAGTTTCTATGAAAACAGTTAACTGTTCTCCCTCTTTTAAGTATAGAAACAACTTATACGTAAGTGCGTACATGATAAATATTTAGGAACTTTCTAAAAGAACCAAGATAACAATGTAAATTGAATTAATCTTCTCCCCGTAGCATATTTCTTATGCATGAGTTAATTTTAACCTGTGAAAAACTCATCTCATTTTGTCTTCTATGTTTATCCAAATATAGTTCTATTCAATAAGCCCTTAATGAAGCTAAGCTATTTTCCCAAACAAGTATCCAGATGTATATCCCAAATTGTACTGAGATGTATATTCATCTCAGTACATTTTTATGCATTTATTCATGGATACTTTGCTGGTCATTTATTTGGATATTTCAAAAGGGTTTTTGGTCATGTGTCAGCATCGAAATTCCTTATGACTGTTTTATGGTTATTTTAGCAGTCTGATGATTCTAGTTGGTGCTAAATAAGGAAGAATGAAGTTTGGTTACTTCATAATATACAAGTGCAAGATCATTGTGTTTATGATTTTGAAGTCCTGAATGCAACCAAGTTTTATAGGGTCTCTTACTTTTGGCCTTATAGACGTGTGTCCAAATTCATATAGCCAATATTCGAGTACATGAAAAATTAAGGTAGAAGGTACTGGCTTAATTTTAATTCATAAATATTACCATTAGTTCCTTTATGGATCAAATTGACAAACATTTAATCAGATGACTGATAATGACTAAATAGTCACTCAACTAATGATTATATTAGTGGAGTATCCTTTATTATTCAAATTTCTATCCCAGATTAGTTTTTCACAACATGCTGTATTACCATTTTTCACTGGATTTTTCTTAGGTTTTTGGATTAGTGTTAGATATGTTCATACTTATTTGGAGTCTCATTTCCAGGATGATGACAGTGACTTAGAGTGTGAGCTAGAAGAATTACCTCCTGTTAGTGTGGAATCTGCATCAGAGGCGGCTGCATGTGTGAAGGTACATGTCCTTGCCCTAGTTATTACACATTTTATCTCAATATCTTATGCTTTGGATAGTTGTATAATTATTGTTTGTTAAATAGATTTATCAACAACATATTAACACATGGATCTTGTGCCTTATGCCACTGGGTAAGGATATGGCTAGAATCACAAGTGTAAATTTTACTAATTTCATTCTGATTGTAGGGGAGATTTCTACTTAGAATATAACAAAAAGAATTTTATGAGATTAGTAAATACATGATTGCAAGTTAGCTTGGCTTTACTTGACGACTGACTATAAGAATAATAATATTGTGGTTGTGAATGGTTGGCAGTAAAGTCCCACTAATACCAGCAAATAAGTGTGGTAAAGTGAGAATGAATATACAAAAAAAAAAACACGTGATTAGGAATGGAATGTACATGAGAGGAAGTTGACGTAGCACCTATAAAGAAGATGATAGAAACTCCCCAAAGGTGGTTAGGTCATGTGAGAAGACCAGTGGAGTCTGCATTGAGAAAACTAGAACTAGTTAAAGCTTTTTTGACTAAAATTTGATTGGGGAAGACCTAAAAATCTATTGGAGGGAAACAATAAAAAGCCTTTAAATTTTATTGAAAATTTGATATTTGGTAGAATTCAATGATGTTGATTGATCTAAGTCGACAATACCATGTAGTGAAGAATAATTGAGTTCTCTTTACAGTTCCATTATTTAAACTTTAAATTGTGTTTTTTCTTGATATTCAATTTTGAACGGTCTGTTTTTGGGAATTGTTTATTCATCAGGTAATGATTGCTTCTCGCACACTCAGTGACTCTGCCCCTAGTAGCTCAACAATCGAGGCTCCATTGACTATAAATGTTCCAGTTTGCCATTCATCTGCAACACTTATTGAAAGTTCACAACCCTCTAATTTGATGCAAGGGACAAACATTGTTTTTCCAGTCACTGTTCAGAGACAAACATTGCCAACACACCCTGTACCACCAACAGATGGTATTGAATCTAAGGGATTAGTTGGTGGTAATTTGGCGTCCAAAAGAAAACGGAAAACATGGTCAGAGGAAGAGGACATACAACTACGAGCTGCTGTTCAGAGATGGGGCGAAGGGAATTGGGCAACCATGGCAAAAGGAGACAATTTTCCTATTAAGAGAAGTCCTACACAGTTAGCACAGGTGGTTTTCAAATCATAAAACTTTATAAACCTGTTCTCTTAGTAATTATGTGAATATTTCATTGGAAGTTCGTATAAGACAGACCAAGATTCATTGTATGAATGATATCATTACATTTGAAAATTGGTCTTATTTTTTCGTAAAATCCAAAATTAACATCTTAAAGTTATTGTTGGATTCTTGGGATTTTAGGGGGGTTAATCTCGTGCTTGTGCTTGTTCTGTGACGGGTTCATTAAAAGTTCATCCTCTATTGTGGACTATTTCAAAACACTCAATTTATTAAACCGTAAATATTTATTAAAAATAATTTTTTTACATTAGCTAGTTGAGATCCCACATCGACAAAAAAATATAACCAATATTGTCCTTATAAGGCTTGGGTAACTCTCATATTGCAAGCTAGTTTTATGGAGCTAAGTTTTAATCCCAATTTTAATATTGTATTAAAACCCATCTTAGATGTGTTGTTGAACTGCCCCCATTTATCTGTGCTGCAGTTTTGGGTTTGAGGGATTTGTTGAGATTCCACATCGAGTGGAGATATATCATATACGATCAATGCTGTCCCTTTTAGGCTTAGGCAGTCCTCACATTATTAGTTAGTTTTTGGGATTGAGTTATGTCCTAAGCTTAAGTTCTGATTTCTTATCAATGTCTGTCTTAAATCCATTAATGGGTCACCCATATCTGTACACACAAAAGATGTCAATTCCCAGGCATAAGGGATGTTATTGGAGCACTTGCATATTTCCACACTCTAGATGTTTAATCAGGTATGTGAGAGAATGTTTGATTGTAGTATAATACTTATGGAACTGAGTCTATTTTTATTTGCTGTCCTCTATTCAGGTAACATGTCTTTTATGACCTTGTTTTCCTAGGTTCAAATCCCATTAATGAATTTTTTCATGTCCAACTCTATCAAGAACTTCTCATTTGTGATATTTTTAGTCGTGATGGATGAATCTATGCATCCTTTTGTTTACTGATTATTTTTGTGAATATTAGTGTCATTGATAACTCATCCAGTCCCTTTCACCTTTACTGTTTATTTGCTTTATATTCTATATATCAGGATGGGTTATCCTAAAACTTGCTGAAATGGACCATTTTACTTTGTATCTTTTTTAATACTCATGTGATTTAAACACCGTACCATTTTACCCTTTTTGTTATTTACTTTTTGTTTTATTTAATTCTCATGGGTTAATCTACAATTGTTTGCAGAGGTGGAGCATTTTACGAAAGAAAGATGGCACTGTCAATTCTGGAACCATATCAACCAGCTCACAATATACTACTGCTGAACAACTGGCAACCCGACACTCTTTATCTTTAGCCCTTGATATGCCATTCAAAAAGTTAACTGCTCCTGGAGTGTCAGATCCTGGTAATTGTACTGGACCTTTTTCTGTTTATTTTTATTTATCTTCATATTAATTAAGTTCGGATTTTCTATGCTTGTCCATTGATTTTGCTCCATTTTACCTCCTATTTTCTCCATCCATTTGTTTGGATGTGAGAAGTAGGGAGGAAAGAAATAAGAGAGAAGAGAAAAAGTGTGTTTGGTATTTTAAGTTGTTTGGGTTAGAGAATAAGAAGAAACAAATTAACTGCTCTTTCTCCCTTTATTTGGTTAGATCGAAAGGAAAGAATAAAGAAAATATGCTCATATCAAATAACATTTTTACCTTTACGCTAAACATAAAATCAAAATTTTGACATTTTGGTCTTTATATCAAATTCTCCCCTCTTCTCACCTTTTTCTCTGTAAATTGGAGCTCGATTTCTTTGCTATCTGCACAACGTTTTTCTTTTTTTTCTTCGTCTCTTTCTTTGTCTCTTCACTGTTCCAAATGTGATAACATTTTCTTGGGAAGTGTCTTCTGTTCCTAACCCAGTTCTTCCTCTCCTAAATCATTGGTTCCAAACAAATTGTAAATCCTGAACTGAATCTCAAAGTTCTACAACTCTCAAATCAATTTTAGGTGATTCTCAAATTTATTTAGGATGACTCTCATTGATGATTGTGGACATTTTTAGTGCCTAATCAAAGAAACACTAGTTAATTATGCACTTTCCGTGGGACTGATTATAGTTCCCGGTTTCATGTTGTCTACTGTGATTATGAATATTATTTGCAAGTGTGGTTTGAAATGTTTATGATCTTTCAGATGAATGGTAAGATGCAAATGTGATTTGAAATGTTTGTTTTATAACCTAAAAGACCACGAATTTAATTAATGTATTGCCTGTGTCACTTCTCCCCCTAAAAGTATGTCTATTTTTAGATTATCTAGCACTATTTAATACAACGAAGCAATTTTGTAATATAAAAGTACAAATTCAGAGTGACATTGAATTAGTGCATTGCTATCAATCACCATTTTGTTGGTGGACTTCTTACATTTCATGGCAGGAGTGGGATAGCCAAATAGCTTGAGTATGACTTTGTTGGCGTACAAATTCACCAATTCAATGGATATGTGTCTTGCCTTCTATAATTTTATTATACTTTCAATGGTCATCGCAGGCTTCCCGTGTTTATAGATATAATATCTCTATGCCATCAATGCTATCTTCCTTCTAGCATAGTGAGAGATTTAGAGTTAGGAAGTTGTTGATATATGCTAGTTTGTTGGGCTGAGATAGAGAGGAATTAAGGCAAATTGTCTATAAATAAGAGGGAAGGTTGAAGAGGGGATTGTCTTGTCATATAGGGTTTAGGACGCATAGACACTCAAAGTTCTGCTAGTCAGGCATTATATGCAGGAGAACTCCCTTGTTCTTTTCTTTCTAACTAGTACCGGTACTGGTTTTTGAAGATGATTCCAACATTTGATGGAAAAGAGGCTTATTGGTGGTTTGAGCAATGATTTTGAAGCAAATAGTGCATATGAAGAAGAGAAACTATCAAAGCAAGTGAAAACTCTTCCATAGGTCATGCTCTCAGCCTGGTGGCTAACTTGGAGATGGCACTATGTGAGGGCAGCCTGGTGGACATTTGTGAAACTGCTGATCAAAATATACTAACTGAAGTATGATTTTGGTCATAAGAATTGGGAGCAAAGATAACGAATCTTGGGTGGAAGAAAGCATAACAGGATAAATGTTTGGAGAGAACTTGTTAGGGTATAAGGGAGAGGTAATGAGAAGGAGAAGAAAGGTAGGAGGGAAGTGACGCCGTACGGTATTGATCGTAAAGGCCGAACGGTGGCAGACATGTAGAGGTAAGGCCGGACGGTGGACAAGGAGAATGGTCAGACCGAACGGTGGATAAGGGGGAGCAACCAGGCCGAACGGTGGGAGGCAGGGAGCGACCAGGCCGAACGGTAGAAGGAAGAGAGCAAGCTGACCGAACAGTAGAAAGGACGGAGCAGGAGGGCCGAACGGTTGGGGGCAGAGGAGAAGCATCCTAACTGACACAACAGTTAGGATGAGCGGGAAATTAATTAGAGTATAAGGTCGTATCTCAGGATATTATTCCGTATAAGTTAAATATAGTATATAAGGATAAAAATATTCATATCAAATAATTATAATAAATAGGATTATTCGCATCAGATAATTATAATAAATAGGAGTAATTTCTATTATTCATTACCTTTTTGGGAAGGAATTAATTAGTATTAATAAAGGGGAAGCCTAGGGTAGAAGGTATGCTTTTGAGAATTGAGTTTTGTAAAGGAGGTTATGTTCCAGGATAATTGACGAGGTTATGCTCCCAATTATTGGTTGACTGAAGGACGTTATGCTTCCAGTTATTATTTACTTGTGTTTACCTAGTTATTACCCGCAATAAAAGAGATTCTTTCATCCATTATCATTCGTTTATTGTTCCATTACGTGTGTGAGAGTGTGAAAGGTTGTATTTGGCTAATTTACGTACTCAGGTACGTAACAGAACTAGCAAGAAAAAATAATATAAGAATGTTACAAGAATTAGGAGAAAGTAGAAATCCAGCAAAGACAACTCATTGCCATTCTGGACCAAAAATCTGAAAATAGAAGCAGAAATGAAGTTCTTGGGATAAAGAATCATGGTGGCAGAAATGAGTCTGATGGGTTGTTGTGGGGTTGCTAAGAGGATTGGGAGAAGACCTATGGTTGACACAGAGGAAAGCAAGGAGCATCATGTTGGGGAAAACATCCCTTTAATGAACCACAAACAGAAACAAATCTAGACATCAAGTAGAATCAGGCGGTGCAGGAAAAACATTCAGGAAACAAAAGAAACTGAGAACAACCACCGTTTTGCTAATGGCAAGAACAAAATTTTCTATCAATCCTGTGAGAAGTGTTGTGAATCTGCAGAAAAGAGATGACTGAGAATAAGAGAAACATTTATAGAGAATATGGGGGAAGAAACTGATGGCCAAATAGCCAGATGGAGAAGCAACATGAAAGGAAAACAGAGGAAAATATGCAGGTTGCCACTGTGATGACCACCTTTTGGGTTGCAGATGGAAAAACAGGTAATAAAATGGAAGTGAGGATTGAGAAGGAAACCAATCCAATGGGTGGAACGATGGGGAGTAGAAAATGTTTGCGGTCCTAGAAGTCAGCGAACCACAACCGCTGGAACTTCTAGACCTGGTTTCTCCAAAGGAGATGGATGTTTTATTTAGTAGTTGATACAATCCTCTATAGGATTCAATCCAAAAAACTCAAGGATAATCATGGAAATGACCCATTATAGTTTCAATCATCAAGAAAAGAAACAAGAAACAATAGTTGAAATGGAAAAACATGGAAAGATTAGTGTTTGACTTAACTAAAAAACAATGTTGATGTTGAAGAAGGAAATCTTGACTAACAATGACAGAAAAATAACGTAACATTGAAATTTTAGTGTCTTTTAAAATTTACTTCTTTAACAACATATTTTGTCTTTAAGCTTTTCAAATTTCCCTATTCAAGCACTATATTTTATTTAGAATGTTCAAGGAATATATTGAGAATATTCTAGAACACTTTCAGTGAAAAATTGTAACCCCAATGTATTTTTAAATGAAATTTTCACAAAATAAGTTTTGTATGGTCTAAACTATTCTCTTCAATCTCTAATTTGTTTTGATAATTCTTTCCATTCTCACATTAGTAGTTCTCCTTGTTTTATTAAGTTTATTACTTGCACATCACTTGTAAGACTGATCAATCTTCTAATAATTTTATTTTTAGTTTATTGTTCTAATAATGTTATTTTTCAATCTTATGCAAGGTATTTGAATAACCTATTTTTATATGGTTGCAGTTAAGACATCCACATCAGTTAAAAATCAAGTGCAGATTAGAAATACTGTGGAGAAGGTTGCCACTAGTTTTGTACCACCTCAACAGCCATCTCGGCAAGCTTCTTTGTTGGGATCTGATTCTCATTCTCATGTAAAACCCAAACTAGTAGACGAAAAACTAATCTCGAAGGGTAATATAATTTCAAATCCTGTGTTAAAATCTACCACAGCTGCTCCTGGGACACGAATTGATTCACCTTCAAATACTATATCACATGTTAAAATTGCTCCAGTAAAACACAACGTAGACACCAAGCCTGCAGTAAGCTCTTTGGCAAAACCATCCGTTTCTACCAATATGCCTTCTGATCCAAAGGTTCATTTACATTATAAATTGCAAATCTCTTGCATTATGCAATAATTTGACAAATTGAATATTCACTCACTTTATTTATATTGTTTCAACAGAACAAACCGACTACTTCTTTGACTGATAAAGTTCCATTGGAGCAAGATGCTAATTCCACTAAAGACGATACCAGCTCCAGACCGAAAGATCAAACACCAGAAAACGAAGCTCCTAAAGTTACTATTGACAGCCAGGTCAATAGCAACTTAGAGAAGGGAAGATTAGATATAGGTCAAGCGAAGATTGTGCCTGTTAGTAGTGGAGAGGAAAGTTTGAAAGATAAAGCAAGTCCAGTCACAAATGAAAAACAACCAAGTGTTACTAAAGCAAATGCAGCGGTGTCCGAAAACCAAGGAACTGTTAAGAATGCTACTGAGAATAGCAACCTTGACAAAGGAAACCTAACTTCTAATCAAGACAAGAAAACTTCAATCAATGAAAGTTCAAACAATCAAAACATAAATGACAAACATGTAAATTTGCCAGTACAAGATGAAGGCAGCCAAAGTGACAAGGTGGTAAAACTGATGGAGAATGTTGAGTGATTAATTTGTGAAAATGAGTAGTTTTTTTAGATTGAATTCTAAAGTTTTGATGAAATTTAAGTTATTTTAGGAATTTGTACCACATTAGTGTACTGTAATATTTTTTAAGAAAAAATTGCCTAGTGGTAAATATATGTTGACGACCTGCAAATTTTCATGATTTTC