Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10181 LG2 41922798 41924190 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 41922884 stop_gained p.Lys236*
C/A 41922982 intron_variant
A/T 41923057 intron_variant
G/T 41923583 missense_variant p.Ser203Tyr
G/A 41923667 missense_variant p.Ser175Leu
G/A 41923732 synonymous_variant p.Phe153Phe
G/A 41923755 missense_variant p.Pro146Ser
C/T 41923872 missense_variant p.Ala107Thr
G/T 41923876 missense_variant p.His105Gln
C/T 41924034 missense_variant p.Ala53Thr
C/T 41924116 synonymous_variant p.Glu25Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10181.1
MSSSLSSSNSPCAACKIQRRKCTQECVFAPYFPPDNPQRFAYVHKVFGASNVAKLLNELNAAQREDAVKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISILQHRLKQLQTELHHAKKELASYIGPHAMLPPPPPPPPQPRTFSLFPFKAAPPPPHQDLFAFTDDGASASHSSHAAFNHLAVLSPTLASDHTFPHAPTHPLALPHHQHLMLSPMQSKPQTDPGNLNLQFGNPVLRVCSKLNCSEWKAKGCKEGRVRKLQKEEGKWGGRQGRGI*


CDS Sequence:
>Vu_10181.1
ATGTCCTCTTCTTTGTCGTCGTCCAATTCCCCCTGCGCCGCGTGCAAGATTCAGCGCCGGAAGTGCACGCAGGAGTGCGTCTTCGCGCCGTATTTTCCGCCGGACAACCCGCAGCGCTTTGCCTACGTGCACAAGGTCTTCGGTGCCAGCAACGTCGCAAAGCTTCTCAACGAACTCAACGCGGCGCAGCGCGAGGACGCGGTTAAGTCCCTCGCCTACGAGGCCGAGGCGCGTCTGCGGGACCCCGTCTACGGTTGCGTCGGTCTCATCTCCATCCTCCAGCACCGCCTCAAGCAGTTGCAGACCGAGCTCCACCACGCCAAGAAGGAACTCGCCTCCTACATCGGACCTCACGCCATGCTCCCTCCTCCTCCTCCGCCTCCGCCGCAACCGCGCACCTTCTCTCTCTTTCCCTTCAAAGCGGCGCCTCCTCCTCCTCATCAGGATCTTTTCGCCTTCACTGACGACGGTGCTTCCGCTTCTCACTCTTCCCACGCCGCCTTCAACCACCTCGCTGTTCTCTCGCCTACCCTCGCCTCCGATCACACCTTCCCTCACGCACCCACCCATCCTCTCGCACTTCCGCACCACCAACACCTAATGCTCTCCCCTATGCAATCCAAGCCCCAGACCGACCCTGGTAATCTTAACCTACAGTTTGGAAATCCAGTTTTAAGGGTTTGCTCAAAGCTTAATTGTTCTGAATGGAAGGCAAAAGGGTGTAAAGAAGGAAGAGTGAGAAAGTTGCAGAAAGAGGAAGGAAAGTGGGGAGGGAGACAAGGTAGGGGTATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_10181::LG2:41924190-41926190(-)
CTCTTTATTTGTATAATATAATGCGTATGTTTCTTTCTGCTTAAAAATAGTTATTATAAAAAAAGTGGAAACAGAAAACTGTTATTGTAAGAAACAGCTCTGAGTTTGATTATAATTAAAAGGAATATCTGTTCAGCCTTCTTTTTTAAATAAGTTTATCTAAATGTGTAAAAAAAATATTATTCTATATAAAATGTTTCTTAAAAAAATTAAGCCTTCATACTTAAAAATAGAGTATTTGGAGGATTAAGATTTTTGCTTTCCCTTACTCTCTCAATCAAAGATAAATTTAAATTTATTGTTGATTGAAGATAAAAATTGAGTTTTAAATCAAATTTAGAGTCTACTATTATATGCAATTGAATACACTTAAACTTTACAAACTGGTCACATCGATTTTGTAAACCTAAGTATGAGTCTGAATCAATATAATGTATTTATCTGTTATATGACTTTTCATTTATTTATTTAGCCCGAGTTGAAAATATGGTTTGGTCTATTTACATAACTTATTTTATCCAAAAAATAAATCAATTATGGTATTGAGTCTAAAACATTGTTTATGACATAAATTATGCTTAAAGTTTTTAAAACTGATATTAAAAAAAATTAAAATGTTAACAAGCAATAAATCAGTTTGTGAAAAACGGATCCTATAGAATATACATTCTCATATGATTACGTGATAAAACAAATGAAAAAAAAAACGTAATAAAAGAGGAAGAAAAATAATAACGAAAGCTTCAGTAAGAATAATAATCACTAATATTATCTGTTGAATCATGAGGCTGTTAAATTATCACTTACTCTTCCTCAAAATTACTAATTTACTCTTGAAAACTATATAATTAGTAAACATTTATAATAACTAAATTAATTCAAATAAAAGTGAACTTATGAGATTCATATCAAATTCGAATTTTATAAATTAAAAGTATACGAACAGTAAAAATATCTTTTAAATATGTTCCATATATAATAAATTTATTACATTTTACGATAATCATCTTAAAAATTATACAAACAATATGTTCTAATTAAATAATAGTGTAAAACTCTATCCATTTAATTTAAATTATATTTATTGTAAACTTTTTCTTGCACTATATAGTTAAGACATTTATATGGAATGAATTAATAATTTTTTACAACCATAAATAGTGTTGAAAACAGGTCACGGGAACCAATCACCCATAGATCCATATATTTAATAGTTTTAAAATTTCAAATTATAATTATATTATATAAAAATTACAATGAATATATATTACATAAAAAAAATATAATGTTAATAGATAAAGAGGCTGCCTAGGTTCCTCCCAGTTTGAGCCATATTTTTGTAGCAGAAGAATACGAGTATTAAAATTTGAAATTGTCAGAGTTGATTTTAATAAATAATTATAAATATATTTAGTCCTCCACAATAGACAGTATCGAGCATTGAGAGTCAAAATATGGATATCTGTACACATACCTTTTGTGATGCAATTGAAGAGCGCAATCAGGAATAAGCTTTTATTTGCATTCAATATTAAAAGCGCAGTAATTGCTCTTAGTTGACTATTGAAAACATGCTTCCAACCAAAATCACCCCATCGACACAATCAATCACATAATAAAAAAATTCTACATCAAGTTTAGGATTTAGTAAAGAATATTTCTAAAAAGAAATGACATAAAATAATAAGAAATAAATGAATTAATGAAAAAAAAGAAAATTGAAATGATAAAAAAAAAGGGGTGAAATGCGTGGCGTGGGTAGCGAGTAAGTCGGGGTGATGGGTGGTGCAGCAGCAAAACAAAATCTGAAATGGCATAATAGAGAACATCATCAACAACAACAACAACGAGAACCAACTCATGTCCTCTGACCGGGGAACTTTCTGGATCTCTCTAATAAACCTTCGGATCTTCTTCTAAGCGGTGCGTTTTGTCCACTTGCTAAATCACCACACCTAATTACTCATCACTAATTAACTCTTATTATAGTAAGGAGAATA


Gene Sequence:
>Vu_10181(-)
ATGTCCTCTTCTTTGTCGTCGTCCAATTCCCCCTGCGCCGCGTGCAAGATTCAGCGCCGGAAGTGCACGCAGGAGTGCGTCTTCGCGCCGTATTTTCCGCCGGACAACCCGCAGCGCTTTGCCTACGTGCACAAGGTCTTCGGTGCCAGCAACGTCGCAAAGCTTCTCAACGAACTCAACGCGGCGCAGCGCGAGGACGCGGTTAAGTCCCTCGCCTACGAGGCCGAGGCGCGTCTGCGGGACCCCGTCTACGGTTGCGTCGGTCTCATCTCCATCCTCCAGCACCGCCTCAAGCAGTTGCAGACCGAGCTCCACCACGCCAAGAAGGAACTCGCCTCCTACATCGGACCTCACGCCATGCTCCCTCCTCCTCCTCCGCCTCCGCCGCAACCGCGCACCTTCTCTCTCTTTCCCTTCAAAGCGGCGCCTCCTCCTCCTCATCAGGATCTTTTCGCCTTCACTGACGACGGTGCTTCCGCTTCTCACTCTTCCCACGCCGCCTTCAACCACCTCGCTGTTCTCTCGCCTACCCTCGCCTCCGATCACACCTTCCCTCACGCACCCACCCATCCTCTCGCACTTCCGCACCACCAACACCTAATGCTCTCCCCTATGCAATCCAAGCCCCAGACCGACCCTGGTAATCTTAACCTACGTACACACACACATATGCCCTCTCTTTCTGTTTGGTTATTAGATCAACACAGTAGCACTCTCTTAATTTTGAATACTTGGCATGTCTTCTAGTTAGAGTTTGGAAATCCAGTTTTAAGGGTTTGCTCAAAGGTCTTGTCTTGCGTTTGTGTCGCATTTAACGATCGTGATTTCACTTGTATATTTTGCAATCAGGGAAGTTAGCATGTGCAAGTAGAGCAAGTAGAGAATAAATCAGTAGTACTATAATAGGAATATGAAATTATGCCTTGACAGAACTAGAATCCAAAAGGGATTAGCCCAAGTTGTTTCATTGGAATTAAAAAGAGAATCTTGGTTTGTGTGCTGAGAGTGTTTTTCCTCGTTCGATTTTATTTTTCGGACTTGAGATTGTTTTGCTGCACCTAATCAAGCAAGGGTTGATATATCTTCTCTCTCACATTGAGAATATAAAACAAAACAGACACTCAAAAACAGTTTATTTTTGGTGTGTTAGACCACCAACGACATGAGTATGCATTTCTGTTATGTCCTTTTAGGTTTGAATGCTTTGTGTGTTAAAAGATTGAAATGTTGAGCGATGTGATTTGAAAGAATGAAGCCGTTCTAATGTTTATTTTGTTATCTTCTGCAGCTTAATTGTTCTGAATGGAAGGCAAAAGGGTGTAAAGAAGGAAGAGTGAGAAAGTTGCAGAAAGAGGAAGGAAAGTGGGGAGGGAGACAAGGTAGGGGTATATGA