Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10160 LG2 41661452 41668937 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 41662243 intron_variant
A/T 41662244 intron_variant
G/A 41662316 intron_variant
C/A 41662415 missense_variant p.Gly574Val
C/T 41662416 missense_variant p.Gly574Ser
A/C 41662601 missense_variant p.Phe512Cys
T/C 41662606 synonymous_variant p.Ala510Ala
T/C 41662751 3_prime_UTR_variant
T/A 41663038 3_prime_UTR_variant
T/C 41663379 intron_variant
G/T 41664501 intron_variant
A/C 41664625 intron_variant
C/T 41664755 intron_variant
T/A 41665042 missense_variant p.Glu375Asp
C/A 41665047 missense_variant&splice_region_variant p.Asp374Tyr
A/T 41665327 intron_variant
G/T 41665440 intron_variant
G/C 41665443 intron_variant
G/A 41665574 intron_variant
T/A 41665681 intron_variant
C/T 41665786 missense_variant&splice_region_variant p.Asp325Asn
T/C 41666680 intron_variant
C/T 41666687 intron_variant
T/A 41666931 intron_variant
T/A 41666989 intron_variant
T/G 41667394 intron_variant
A/T 41667395 intron_variant
T/G 41667677 synonymous_variant p.Gly321Gly
G/C 41667690 missense_variant p.Thr317Ser
C/T 41668306 missense_variant p.Glu112Lys
A/G 41668491 missense_variant p.Leu50Pro
G/A 41668492 missense_variant p.Leu50Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10160.2
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>Vu_10160.1
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>Vu_10160.3
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CDS Sequence:
>Vu_10160.2
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>Vu_10160.1
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>Vu_10160.3
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Promoter Sequence:
>Vu_10160::LG2:41668937-41670937(-)
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Gene Sequence:
>Vu_10160(-)
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