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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10148 LG2 41487887 41491499 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09143 Cell growth and death   C 04110 Cell cycle [PATH:ko04110]
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 41488225 missense_variant p.Gln59Glu
A/T 41488227 missense_variant p.Gln59His
C/T 41488235 missense_variant p.Ala62Val
G/A,* 41488690 missense_variant p.Val188Ile
A/T 41489826 missense_variant p.Asp492Val
T/G 41489879 splice_region_variant&intron_variant
T/C 41489887 intron_variant
A/T 41489890 intron_variant
C/A 41489895 intron_variant
A/G 41489964 intron_variant
G/A 41489969 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10148.2
MDGKPNPDSSSPDFLRHVQAALKRHRPLGSMQSNSIRPRRTLLPQRKLSNTPSDPTNSQEQASSNVSLNTVVPSQNLDVQKKDQFSVHTNSTAQEMEWVEGNQIEASSSSSLLGCNQKGDVQQAGFDASLRCDSGVSSVLPKRSVVTQDHLQQFSSFLSQPATHSSVLGPSCATTTSVHSTSAPMLNSTTRYSHSHLDGGSNVTAEPFGEVNANPRPVTEGVVKSVNVFQKETNRMLVDRGAEAEVPASDLGIGDAELVSKESSRSTEQQGGVLKESGNSKYTWDDGKGKEAVDVATIQPQVLPPTSTTTCSDVKLESSRVEKREKIGSSKGASAPRKRTYDPDLFFKVNGKLYQRLGKIGSGGSSEVHKVISSDCRIFALKKIKLKGRDYATAFGFCQEIEYLNRLKGKDNIIQLIDYEVTDKALLEEVMKGSLSNRDGRVKDDGCIYMVLEYGEIDLAHMLSQKWKELDGSHRTIDENWLRFYWQQILLAVNTIHEERIVHSDLKPANFLLVKGSLKLIDFGIAKAIMNDTTNIQRDSQVGTLSYMSPEAFMCNETDANGNIIKCGRSSDIWSLGCILYQMVYGRTPFSDYKTFWAKFKVITDPHHEITYEPVSNPWLLDLMMRCLTWDRNQRWRIPQLLEHPFLVPPVPSHPSMPQDNNSCKLLQHISETCTYDPEVSELCSQLQRLLSDSVDKTTHSLNSRDQQLKLLSQMSDMCIQLHERLRNTGNK*

>Vu_10148.3
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>Vu_10148.1
MDGKPNPDSSSPDFLRHVQAALKRHRPLGSMQSNSIRPRRTLLPQRKLSNTPSDPTNSQEQASSNVSLNTVVPSQNLDVQKKDQFSVHTNSTAQDAKATNELENLSSHMGSLGFAEMEWVEGNQIEASSSSSLLGCNQKGDVQQAGFDASLRCDSGVSSVLPKRSVVTQDHLQQFSSFLSQPATHSSVLGPSCATTTSVHSTSAPMLNSTTRYSHSHLDGGSNVTAEPFGEVNANPRPVTEGVVKSVNVFQKETNRMLVDRGAEAEVPASDLGIGDAELVSKESSRSTEQQGGVLKESGNSKYTWDDGKGKEAVDVATIQPQVLPPTSTTTCSDVKLESSRVEKREKIGSSKGASAPRKRTYDPDLFFKVNGKLYQRLGKIGSGGSSEVHKVISSDCRIFALKKIKLKGRDYATAFGFCQEIEYLNRLKGKDNIIQLIDYEVTDKALLEEVMKGSLSNRDGRVKDDGCIYMVLEYGEIDLAHMLSQKWKELDGSHRTIDENWLRFYWQQILLAVNTIHEERIVHSDLKPANFLLVKGSLKLIDFGIAKAIMNDTTNIQRDSQVGTLSYMSPEAFMCNETDANGNIIKCGRSSDIWSLGCILYQMVYGRTPFSDYKTFWAKFKVITDPHHEITYEPVSNPWLLDLMMRCLTWDRNQRWRIPQLLEHPFLVPPVPSHPSMPQDNNSCKLLQHISETCTYDPEVSELCSQLQRLLSDSVDKTTHSLNSRDQQLKLLSQMSDMCIQLHERLRNTGNK*


CDS Sequence:
>Vu_10148.2
ATGGATGGGAAGCCTAATCCGGATTCCTCCTCCCCGGACTTCCTCCGCCACGTTCAAGCCGCCTTGAAACGACACCGACCACTCGGTTCAATGCAGTCCAATAGCATAAGGCCAAGGCGCACGCTACTTCCACAACGAAAGCTATCTAACACACCCTCCGACCCCACCAATTCTCAAGAACAAGCTTCTTCCAATGTCTCACTCAACACCGTCGTCCCTTCCCAAAACCTAGACGTTCAGAAGAAAGATCAATTTTCAGTTCACACAAATTCTACTGCGCAGGAAATGGAGTGGGTTGAAGGCAACCAAATTGAAGCATCGTCGTCATCATCATTGCTAGGATGCAACCAGAAGGGGGATGTTCAGCAGGCTGGCTTTGACGCGAGTTTGAGATGTGATAGTGGAGTGAGTTCCGTGTTGCCAAAGAGAAGTGTGGTTACTCAGGATCATTTGCAGCAATTCAGTAGCTTTTTGAGTCAGCCAGCTACCCACTCTTCGGTTTTGGGACCTTCATGTGCTACAACAACCTCAGTTCATTCAACTTCGGCGCCTATGCTAAATTCAACAACACGATATTCTCATTCGCATCTAGACGGTGGCTCAAATGTGACTGCTGAGCCTTTTGGGGAGGTTAATGCTAATCCTCGTCCTGTAACTGAAGGGGTTGTGAAATCAGTAAATGTTTTCCAAAAGGAAACCAACAGAATGTTGGTGGATCGGGGAGCAGAAGCTGAAGTGCCGGCCTCTGATCTTGGTATTGGTGATGCAGAATTGGTGTCTAAGGAGAGCAGTCGATCTACGGAGCAACAAGGGGGGGTTTTGAAAGAATCTGGCAATTCTAAATATACTTGGGATGATGGTAAAGGGAAAGAGGCTGTGGATGTTGCCACTATACAACCGCAGGTACTACCTCCCACATCCACAACCACATGTTCAGATGTGAAGTTGGAGTCTTCTAGGGTAGAAAAGCGAGAGAAGATTGGAAGTAGTAAAGGTGCATCAGCTCCCCGTAAGAGGACTTATGACCCTGATTTGTTTTTTAAAGTTAATGGAAAGCTTTACCAACGTCTTGGCAAGATAGGTAGTGGTGGAAGCAGTGAGGTACACAAAGTGATTTCATCGGACTGTAGGATATTTGCCCTTAAAAAGATCAAGCTCAAGGGTCGTGATTATGCTACTGCATTTGGGTTTTGTCAAGAGATCGAGTATCTCAATAGGCTGAAAGGAAAGGATAACATCATACAGCTCATAGATTATGAGGTGACAGACAAGGCATTGCTTGAGGAAGTTATGAAAGGCTCTTTAAGTAATAGAGATGGCCGGGTCAAGGATGATGGATGTATATACATGGTCCTTGAATATGGAGAAATTGATTTGGCTCACATGTTGTCTCAGAAGTGGAAGGAACTGGATGGGAGCCACCGGACCATAGATGAGAACTGGCTTCGATTTTATTGGCAGCAAATTCTTCTAGCTGTCAACACTATTCATGAGGAACGTATTGTGCACTCAGACTTGAAGCCAGCTAACTTCCTTCTTGTCAAAGGTTCCCTAAAACTAATTGATTTTGGTATAGCCAAAGCAATAATGAATGACACAACCAACATCCAACGGGATTCACAGGTGGGTACACTTAGTTACATGTCTCCAGAGGCATTTATGTGTAATGAGACTGATGCGAACGGAAACATCATAAAGTGTGGCCGGTCATCAGATATATGGTCCCTGGGTTGCATCCTTTATCAAATGGTATATGGGAGAACGCCTTTTTCTGATTACAAGACATTTTGGGCCAAATTCAAGGTCATAACAGATCCACATCATGAAATTACATATGAACCAGTTTCAAACCCATGGCTTTTGGATCTTATGATGAGGTGTTTAACATGGGACCGCAATCAAAGGTGGAGAATACCTCAGCTACTGGAACATCCTTTTCTTGTTCCACCTGTACCATCTCATCCATCTATGCCCCAAGATAATAATAGCTGTAAATTGCTACAACATATTTCTGAAACTTGTACATATGACCCAGAGGTATCTGAACTGTGTAGTCAGCTCCAACGGCTTCTAAGTGATTCAGTCGACAAAACAACTCACTCACTAAATTCACGAGATCAACAACTAAAACTGCTGTCCCAAATGTCAGATATGTGTATTCAGCTGCATGAACGTTTGAGAAATACTGGAAACAAGTAG

>Vu_10148.3
ATGGGTTCGCTTGGATTCGCAGAAATGGAGTGGGTTGAAGGCAACCAAATTGAAGCATCGTCGTCATCATCATTGCTAGGATGCAACCAGAAGGGGGATGTTCAGCAGGCTGGCTTTGACGCGAGTTTGAGATGTGATAGTGGAGTGAGTTCCGTGTTGCCAAAGAGAAGTGTGGTTACTCAGGATCATTTGCAGCAATTCAGTAGCTTTTTGAGTCAGCCAGCTACCCACTCTTCGGTTTTGGGACCTTCATGTGCTACAACAACCTCAGTTCATTCAACTTCGGCGCCTATGCTAAATTCAACAACACGATATTCTCATTCGCATCTAGACGGTGGCTCAAATGTGACTGCTGAGCCTTTTGGGGAGGTTAATGCTAATCCTCGTCCTGTAACTGAAGGGGTTGTGAAATCAGTAAATGTTTTCCAAAAGGAAACCAACAGAATGTTGGTGGATCGGGGAGCAGAAGCTGAAGTGCCGGCCTCTGATCTTGGTATTGGTGATGCAGAATTGGTGTCTAAGGAGAGCAGTCGATCTACGGAGCAACAAGGGGGGGTTTTGAAAGAATCTGGCAATTCTAAATATACTTGGGATGATGGTAAAGGGAAAGAGGCTGTGGATGTTGCCACTATACAACCGCAGGTACTACCTCCCACATCCACAACCACATGTTCAGATGTGAAGTTGGAGTCTTCTAGGGTAGAAAAGCGAGAGAAGATTGGAAGTAGTAAAGGTGCATCAGCTCCCCGTAAGAGGACTTATGACCCTGATTTGTTTTTTAAAGTTAATGGAAAGCTTTACCAACGTCTTGGCAAGATAGGTAGTGGTGGAAGCAGTGAGGTACACAAAGTGATTTCATCGGACTGTAGGATATTTGCCCTTAAAAAGATCAAGCTCAAGGGTCGTGATTATGCTACTGCATTTGGGTTTTGTCAAGAGATCGAGTATCTCAATAGGCTGAAAGGAAAGGATAACATCATACAGCTCATAGATTATGAGGTGACAGACAAGGCATTGCTTGAGGAAGTTATGAAAGGCTCTTTAAGTAATAGAGATGGCCGGGTCAAGGATGATGGATGTATATACATGGTCCTTGAATATGGAGAAATTGATTTGGCTCACATGTTGTCTCAGAAGTGGAAGGAACTGGATGGGAGCCACCGGACCATAGATGAGAACTGGCTTCGATTTTATTGGCAGCAAATTCTTCTAGCTGTCAACACTATTCATGAGGAACGTATTGTGCACTCAGACTTGAAGCCAGCTAACTTCCTTCTTGTCAAAGGTTCCCTAAAACTAATTGATTTTGGTATAGCCAAAGCAATAATGAATGACACAACCAACATCCAACGGGATTCACAGGTGGGTACACTTAGTTACATGTCTCCAGAGGCATTTATGTGTAATGAGACTGATGCGAACGGAAACATCATAAAGTGTGGCCGGTCATCAGATATATGGTCCCTGGGTTGCATCCTTTATCAAATGGTATATGGGAGAACGCCTTTTTCTGATTACAAGACATTTTGGGCCAAATTCAAGGTCATAACAGATCCACATCATGAAATTACATATGAACCAGTTTCAAACCCATGGCTTTTGGATCTTATGATGAGGTGTTTAACATGGGACCGCAATCAAAGGTGGAGAATACCTCAGCTACTGGAACATCCTTTTCTTGTTCCACCTGTACCATCTCATCCATCTATGCCCCAAGATAATAATAGCTGTAAATTGCTACAACATATTTCTGAAACTTGTACATATGACCCAGAGGTATCTGAACTGTGTAGTCAGCTCCAACGGCTTCTAAGTGATTCAGTCGACAAAACAACTCACTCACTAAATTCACGAGATCAACAACTAAAACTGCTGTCCCAAATGTCAGATATGTGTATTCAGCTGCATGAACGTTTGAGAAATACTGGAAACAAGTAG

>Vu_10148.1
ATGGATGGGAAGCCTAATCCGGATTCCTCCTCCCCGGACTTCCTCCGCCACGTTCAAGCCGCCTTGAAACGACACCGACCACTCGGTTCAATGCAGTCCAATAGCATAAGGCCAAGGCGCACGCTACTTCCACAACGAAAGCTATCTAACACACCCTCCGACCCCACCAATTCTCAAGAACAAGCTTCTTCCAATGTCTCACTCAACACCGTCGTCCCTTCCCAAAACCTAGACGTTCAGAAGAAAGATCAATTTTCAGTTCACACAAATTCTACTGCGCAGGATGCTAAAGCCACCAATGAGTTGGAGAATTTATCGTCTCACATGGGTTCGCTTGGATTCGCAGAAATGGAGTGGGTTGAAGGCAACCAAATTGAAGCATCGTCGTCATCATCATTGCTAGGATGCAACCAGAAGGGGGATGTTCAGCAGGCTGGCTTTGACGCGAGTTTGAGATGTGATAGTGGAGTGAGTTCCGTGTTGCCAAAGAGAAGTGTGGTTACTCAGGATCATTTGCAGCAATTCAGTAGCTTTTTGAGTCAGCCAGCTACCCACTCTTCGGTTTTGGGACCTTCATGTGCTACAACAACCTCAGTTCATTCAACTTCGGCGCCTATGCTAAATTCAACAACACGATATTCTCATTCGCATCTAGACGGTGGCTCAAATGTGACTGCTGAGCCTTTTGGGGAGGTTAATGCTAATCCTCGTCCTGTAACTGAAGGGGTTGTGAAATCAGTAAATGTTTTCCAAAAGGAAACCAACAGAATGTTGGTGGATCGGGGAGCAGAAGCTGAAGTGCCGGCCTCTGATCTTGGTATTGGTGATGCAGAATTGGTGTCTAAGGAGAGCAGTCGATCTACGGAGCAACAAGGGGGGGTTTTGAAAGAATCTGGCAATTCTAAATATACTTGGGATGATGGTAAAGGGAAAGAGGCTGTGGATGTTGCCACTATACAACCGCAGGTACTACCTCCCACATCCACAACCACATGTTCAGATGTGAAGTTGGAGTCTTCTAGGGTAGAAAAGCGAGAGAAGATTGGAAGTAGTAAAGGTGCATCAGCTCCCCGTAAGAGGACTTATGACCCTGATTTGTTTTTTAAAGTTAATGGAAAGCTTTACCAACGTCTTGGCAAGATAGGTAGTGGTGGAAGCAGTGAGGTACACAAAGTGATTTCATCGGACTGTAGGATATTTGCCCTTAAAAAGATCAAGCTCAAGGGTCGTGATTATGCTACTGCATTTGGGTTTTGTCAAGAGATCGAGTATCTCAATAGGCTGAAAGGAAAGGATAACATCATACAGCTCATAGATTATGAGGTGACAGACAAGGCATTGCTTGAGGAAGTTATGAAAGGCTCTTTAAGTAATAGAGATGGCCGGGTCAAGGATGATGGATGTATATACATGGTCCTTGAATATGGAGAAATTGATTTGGCTCACATGTTGTCTCAGAAGTGGAAGGAACTGGATGGGAGCCACCGGACCATAGATGAGAACTGGCTTCGATTTTATTGGCAGCAAATTCTTCTAGCTGTCAACACTATTCATGAGGAACGTATTGTGCACTCAGACTTGAAGCCAGCTAACTTCCTTCTTGTCAAAGGTTCCCTAAAACTAATTGATTTTGGTATAGCCAAAGCAATAATGAATGACACAACCAACATCCAACGGGATTCACAGGTGGGTACACTTAGTTACATGTCTCCAGAGGCATTTATGTGTAATGAGACTGATGCGAACGGAAACATCATAAAGTGTGGCCGGTCATCAGATATATGGTCCCTGGGTTGCATCCTTTATCAAATGGTATATGGGAGAACGCCTTTTTCTGATTACAAGACATTTTGGGCCAAATTCAAGGTCATAACAGATCCACATCATGAAATTACATATGAACCAGTTTCAAACCCATGGCTTTTGGATCTTATGATGAGGTGTTTAACATGGGACCGCAATCAAAGGTGGAGAATACCTCAGCTACTGGAACATCCTTTTCTTGTTCCACCTGTACCATCTCATCCATCTATGCCCCAAGATAATAATAGCTGTAAATTGCTACAACATATTTCTGAAACTTGTACATATGACCCAGAGGTATCTGAACTGTGTAGTCAGCTCCAACGGCTTCTAAGTGATTCAGTCGACAAAACAACTCACTCACTAAATTCACGAGATCAACAACTAAAACTGCTGTCCCAAATGTCAGATATGTGTATTCAGCTGCATGAACGTTTGAGAAATACTGGAAACAAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_10148::LG2:41485887-41487887(+)
ATATGCATTTTAAAAGGTTTGTTATGAAAATCATATTCCAAAAATTTCAGACAACTTCTACCAACAAATTTTTGTAATATGTAATTCGAAAAATCATATAACAGATGATAAAAAGGGACATTTTGAAAATTTGGAAAGTGCACGAAGAAATTGTGAGAGTGCAGGAAGTAAAACTTCTGTTCGGAGAGACCATTGTCCAATAAATCTGATATTAAAGTTCAGATTGTTTTATTTTATACGTTTCATTATGCACTTTCAAAATTTTATATTTAACCTTCTAATATCTCAGCACCTCCAACTTTTTTAAAAAATTTACTTTTTAACTTTAATAAAAATATTTTTATTTTATTCTTTTTCTTATTAAAAACACTTTAACAAATATTTTTTCTCTTTTTTACTAAAGTCACTCTACATCACCTTAATAATAATTTAATTTAATTTAAAATTTAAATATTATTTAATATAATTTTATATTTTAATATTTATCAAAATATGATTTATATTATAATAATAGTTATATTAGAAAATAAAAATAAAATAATTAAAATAAAAATAATAATAAAAATAAAAAAAATGAAATAATAATAATAATAATATAAAATTTGTTTTGATATGTTAAAATATATTAAAATATTAAAATAAATTAAACAATTATTAAATTTTAAATAGATATATGTTTTAAATATGTTAACGGTTTTGTTTTTTAAATTAAATTAAAATAGATATATTCTATTAAAATATTAAATTAAATAATTATTAAAATTAAATAAAAAACAAAATTTTAAGAAGATTTTTAATCGGATATCCATATCCGTAAAATACATTATCGGATTTCTATATGCAATTGACAAATTTTAATTTTTTTTTATTTTAATTTTAATAGTTATTTAATTTAATTTAATATTTTAATATAATATAATATATTTAAATATTTTTAATGTGATTTTAAACACTATTTTCATTTTCATTATTATTACTTTTATTTTAGTTATTTTTACTTTTACTTTTTTTAAAAAAAATTATAAAATATATATCAAATTTTAATAATTATTAAATTATAAAAATATAATAAATAATATTATTATTTTTAATTAAATTAAATATTTTTTAAATTTTAAATAAAAAAAAACGTTAGCATATTTAAAATTTTTGTTTTTATATAAAATTTAATAATTGTTTAATTTATTTTAATATTTTAATATTTTAATATAATTTAACATATTAAATCAAAATTTATATTATTATTATTTCATTTTTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTATTATTATTTTAATTTTTTAATTTTCATTTTTTAATATAAGTATTATTATAATATAAATCATATTTTGATAATTATTAAAATATAAAATTATATTAAATAATATTTAAAATTTTAAATTAAATTAAATTAAATTATTATTAATGTGCTGAAGGGACTTTAGTATTTAGTATAAAAGAGAAGAAAATAAAAATATTTTTATTAAAGTTAAAAAATAAATCTTTTGAAAAAGTTAGAGGTGCAAGTTGAGATGTTAGAAGGTTAAAAATGAAATTTTTAGAGTTACAGAATGAGATGTTGGAGGTGTAGGATGAAGTGTTAGGAGAAGAGGAGGGCGAAGTAGGTGTTGGCGGGGTCGTCAAGGAGGGCAGGCACATGGCGGAGATGGAGGTGTAGGTTGAGATGTTAGAAGGTTAAAAATGAAATTTTTGGGTGTACAGGATGAGATGTTGGAGGTGTAGGATGAGAGAGTAGAGAGCGACGGAGTGCTAGGAGAGGAGGACAAAGTAGGTGTTGGCGGGGTCGTCAAGGAGAACAGTGGCGAGGAGGCGGCATGGAAGTGTAGGTTGAGATGTTAGGAGGATAAAAATAGAATTTTTGGAGGCACAGTATGAAACACTTCGAACACAATGATTGGGCTTTGAGCAGGCCCGACTTTAGATGGTTAGTAACAAACCCAAAGGAACGCTGTTTTAGCAGGCCCATGGAAGAGAAGGAGGAGCG


Gene Sequence:
>Vu_10148(+)
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