Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09995 LG2 39216497 39220518 probable serine/threonine-protein kinase PBL6
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 39216505 missense_variant p.Asn602Asp
A/G 39216699 intron_variant
T/A 39216714 intron_variant
C/T 39216725 intron_variant
G/T 39216767 intron_variant
T/A 39216851 splice_region_variant&intron_variant
A/T 39216968 missense_variant p.Ile542Asn
T/C 39216973 synonymous_variant p.Glu540Glu
G/C 39217055 intron_variant
T/G 39217155 missense_variant p.Asn522His
A/C 39217296 intron_variant
G/C 39217297 intron_variant
G/T 39217298 intron_variant
C/G 39217534 intron_variant
T/A 39217809 splice_region_variant&intron_variant
G/A,T 39218549 downstream_gene_variant
T/G 39218812 downstream_gene_variant
T/A 39218866 downstream_gene_variant
A/G 39218953 downstream_gene_variant
G/A 39218995 downstream_gene_variant
T/A 39218996 downstream_gene_variant
T/G 39219157 downstream_gene_variant
C/G 39219163 downstream_gene_variant
C/T 39219195 downstream_gene_variant
C/T 39219227 downstream_gene_variant
G/T 39219259 missense_variant p.Leu245Ile
G/A 39219564 missense_variant p.Thr143Ile
G/T 39219964 downstream_gene_variant
C/T 39220045 missense_variant p.Arg97Lys
T/A 39220104 synonymous_variant p.Gly77Gly
A/T 39220396 missense_variant p.His41Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09995.1
MESPPTPSYVVVACDATRDRTENEIKLVADHVRARGSFLSHGDKLLVLCVLHKVSHPMGYQTLACPESFAGTNFRTMEEEVKKKVDTYASELLSCYEDFESEGATIEIKVTAGFPIKQVVLQEITNYNASWIILDRHLRRDLRYHLNKLPCKVALVKDDLSLEIWKSHNTHDTKITATKFVFSLSKFVSLSDCHCIEDIEHSIVSSKSYPHSIVASDTSSMIRRYTKQSSVNRSRDYSSVSEFGSSSKQERSGISIKGEYRYLTSSQIDHKPNQSDFLPKHSDAPLLCTGCGTRTELSISDSMKFNYSDIQLATNDFSKDNLLGEGGYGHVYKGVLKDGQQIAAKVRKEESSQGFSEFHSEVYVLSFARHKNIVMLLGYCCKERKNILIYEYICNKSLHWHLFENNAAVLEWHQRYAIAIGIAKGLRFLHEECRGGPIIHRDMRPSNILLTHDIVPMLGDFGLAKWKTDNETPQTRIMGTLGYLAPEYAEDGIVSEGTDVYSYGIILLQLISGRQVGNSNNPEQQQSLRQWAEPMIEKLALHELIDTRLSESYDTYELYLMAKAAYFCVQRKPEMRPSMGEVVRLLEGESSHFHSLEDQFVPNFNG*


CDS Sequence:
>Vu_09995.1
ATGGAAAGCCCTCCTACTCCTTCTTACGTCGTGGTTGCATGTGATGCCACAAGGGACCGCACTGAAAACGAGATCAAACTCGTTGCTGATCATGTCCGGGCCAGGGGTTCCTTTCTCTCTCATGGTGACAAGCTGCTTGTGCTTTGTGTGTTGCACAAAGTGTCTCACCCCATGGGGTACCAGACATTAGCATGTCCCGAGTCATTTGCTGGAACCAACTTTCGTACAATGGAGGAAGAAGTCAAAAAGAAAGTTGATACGTATGCTAGTGAGCTTTTATCATGTTATGAAGATTTTGAAAGTGAAGGGGCTACTATTGAAATTAAAGTCACGGCAGGATTTCCAATTAAACAAGTTGTTTTACAGGAGATTACAAACTATAATGCATCGTGGATAATACTTGACAGACATCTTCGGCGCGACCTGAGATACCACCTTAACAAGTTGCCATGTAAGGTTGCATTGGTTAAAGACGACTTGTCTCTGGAAATTTGGAAATCTCATAATACACATGACACAAAGATCACAGCAACAAAGTTTGTATTTTCTTTATCAAAGTTTGTGTCGCTATCAGATTGTCATTGTATCGAAGACATTGAGCACTCAATTGTCTCTTCCAAAAGCTATCCCCATTCTATAGTTGCTTCCGATACCAGTAGTATGATTAGGAGATATACGAAGCAGTCAAGTGTTAACAGGTCGCGCGATTACAGTTCCGTATCAGAATTTGGATCCTCTTCTAAGCAAGAAAGATCAGGCATAAGCATTAAAGGAGAATATAGGTATCTCACCAGTTCTCAGATTGACCATAAGCCAAACCAAAGTGACTTTCTGCCAAAACATTCAGACGCACCGCTTCTTTGTACTGGCTGTGGGACAAGAACTGAGTTATCTATCTCAGACTCAATGAAGTTCAACTACTCTGACATACAACTTGCAACAAATGACTTTTCAAAGGACAACTTATTAGGTGAAGGTGGCTACGGTCACGTATACAAGGGCGTGCTTAAAGATGGACAGCAAATTGCGGCAAAGGTAAGGAAAGAAGAAAGTTCACAAGGATTTTCTGAATTTCATTCTGAGGTCTACGTCTTAAGTTTTGCGCGACACAAGAATATAGTGATGCTGTTGGGTTATTGTTGCAAAGAAAGGAAAAACATCCTCATTTATGAATATATTTGCAACAAGTCTCTCCATTGGCATTTATTTGAAAATAATGCAGCAGTTCTTGAGTGGCACCAGAGGTATGCTATTGCCATTGGGATTGCTAAGGGATTGCGTTTTCTACACGAGGAATGCCGTGGTGGTCCTATTATTCATCGGGACATGCGACCAAGCAATATACTTCTCACCCACGATATTGTTCCCATGCTAGGTGACTTTGGCCTTGCTAAATGGAAGACTGATAATGAAACTCCTCAAACAAGGATAATGGGCACATTAGGATACCTTGCTCCTGAGTATGCTGAAGACGGTATTGTTTCTGAGGGAACAGATGTGTACTCTTATGGGATTATCCTGTTACAATTGATATCAGGACGCCAGGTGGGCAATTCCAACAATCCAGAACAACAACAATCTCTCCGACAATGGGCTGAGCCAATGATAGAGAAGTTGGCGTTACATGAACTGATTGACACTCGTCTATCGGAATCATATGACACCTATGAACTGTACCTCATGGCCAAAGCAGCATACTTCTGTGTGCAAAGGAAGCCTGAGATGCGTCCCTCAATGGGAGAGGTTGTGCGACTTCTCGAGGGAGAAAGTAGCCACTTCCACTCTTTGGAAGATCAATTTGTACCTAATTTTAACGGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_09995::LG2:39220518-39222518(-)
TTTGTTTAATGCATGACGGTTGATGTGGTTTCTATTTTAATATATTTTGTTTAATTTGGTTTTTTTTAAGGGTTAAATATGTTTGTAGTCCCGTTTGTGGTTTTCGTCCATATTTCAAAGTAAGGTATAATTTGGTCCTCATTCTTAATTTGGTTTTTTTTAACGGAGTTTAAAAGGGTAATGGATGATATACCATGTGTTAATTTGATATTTTTTTTTAATTTTTAAAATTATTATTATTTTTTTTATTATTATTTTTATTTTAAAAATATTATCTAAATGTCAAGTTAATATTGTGTCATGTAGCAATGTCATATGTCAAGTCAATGTCACGTGTTTCGTCAATATTAGTTTCAGTATATTGTATTTTATTCAGTTATAATTTTTGCTAATTTTCTTTAATTTAACTTCTATTTTTGGCTTTATGTATTGATATTTTTAAAAAAATTTGGAGTGAATATGTTGATAGTTTTTTAGTTTTTAATCATGTTTGGAGGGAGCTTGTTAAAGACTTTGGTTGGAAAATAATTCTTCTTTAGTACATTATGATTTTTGAATCTGGTTCTTTGGAGTTTTAGAAGAAAATGATGTTCAAGTTTCACATTTTTTTTTGTGTGAAGAAAAATCATTGTGTCAAGTTAATTTAACCTTCATTCACATAGAACAACATAAATGGTTTAATGTTTTAACTCTATACATTTTTTTTCATAATTATAATTTATATATGTATGGTGAAATAGTATGATTCTCATGTTTGTATTATTTTATTTTATTTTTTCTTATTATTAAATTTTGATGTGATAACAAATGATTAACATAAGATGTCAAAATTCATATTATTGACTAACATGACCTTATTTGAAAAATAAATTAGAAAAATATAAAAAAAATAAAAAATGTTAAATATTATTACTGTTATATTTTATTAATGAAAAATATTATCAAAAACATAAACTTGGTCTTTTTTATTGGGAAAATGATTCTTGTAAACTAAGTTTATCAACACTACTATACACCTAAAGAAAATAAAAAGATATATTTATAGAAAGGAAAAATATACGTGAACACCTCTTAATTTTCTTATTACTTTCTAACACTTATTAAAAAAATAATATTTATACTTTTTTAAGTTAATTCATCTTAAATTATTTTCTATTTTAAATAAAAGTATTATTTTATTGGTATTTGGAAGGGTGTTGAATAAGAAATGACTTAATTGATAATTTAGTTATTATATGATTTACTTTAATTCTTATATTTTTTTATTTAATTAAATTCAAATATATTTTAAATAAAATTAATATATTTTTTCAATTAAATAGATATTTTAAATTTTGATACGTGACAAATATACAATATTTCTATATTTATAGAATATACATGAAAAAAAGAGAAAGAAATTAAGAAAAAAACTAGTATACAATATATATACATAAAATCCAGGTAAAAGTCTATCATTGCTCTTTTAATTTGATTGATACTCCTTTATGCATGTTGGTTTTCTGAAAGAAACGAATGCTGATTGCGTCAACGCTGAGAAGAGAGGAATATGGAATAATAGTTTAAGCTGAGAAATAACATATTCAAATAGTTTATAAGTGAAGAGAGTGGAGAATCTAGAATCTTGAAAAGCATGTCCAAGCAAACAGTAACCAAAAACTGTCTTCAAGTTCCTCGTACTCTTCCCCATGTTGGCACTGTCCAAGGCGGCATAGCATCCTTCCATTCATCTCTCTCCCCGAATATGCTCAAGCATATTATCTTGGTATTGTCTCAACCTCCACAGCCAGAGAAAACATGACTGGTGGCGCTGCTTTGGACTGACAAGGCATGAGAATGCTTCTGTCTTGATTGGACGATCGTTTCTTCTATTCAACATATCACCATATTATGTGCTTTTCTGCATCACCACATTTCGTGTCAACAACGTTCAAGCTTTAACACCAATCATCACAAGACGTGCAGTGCTGCTAATTAGGGAATAGAATAATAATTTGAGT


Gene Sequence:
>Vu_09995(-)
ATGGAAAGCCCTCCTACTCCTTCTTACGTCGTGGTTGCATGTGATGCCACAAGGGACCGCACTGAAAACGAGATCAAACTCGTTGCTGATCATGTCCGGGCCAGGGGTTCCTTTCTCTCTCATGGTGACAAGCTGCTTGTGCTTTGTGTGTTGCACAAAGTGTCTCACCCCAGTAAGTGTTAATATTGCAGTTCTTTAATCTGTTTGAGAAAGAGAAATGAATCTACCAATGCGTTGAGAATATTATCTCTTCAATCATTTGTTGATCTGCATCAGTTTGTATGCATATAGATTGTTCCTTCAATTTTCTGATTGCTCATTGCATGACTTGTTTTCCTCCTTTTGGATTAATAGTGGGGTACCAGACATTAGCATGTCCCGAGTCATTTGCTGGAACCAACTTTCGTACAATGGAGGAAGAAGTCAAAAAGAAAGTTGATACGTATGCTAGTGAGCTTTTATCATGTTATGAAGATTTTGAAAGTGAAGGGGTACATTGTTTAAGTTCTAGAGAGCTTCCAAAGTACTCTTAACAAATGCATGCTATAACTCTGCAATTAGAACAATGCTCCCAACTACTAACTATAAGTTGATGTGCAGGCTACTATTGAAATTAAAGTCACGGCAGGATTTCCAATTAAACAAGTTGTTTTACAGGAGATTACAAACTATAATGCATCGTGGATAATACTTGACAGGTATTATTATCTCTCAGATTGTGAATAACCATTATCTCTTGCATTTGACTGATCGATGATTTCCATTAGTCGATGAGGATATTATCCAATAAATTTGTCCTCTATGGCAATAGGCGTAGCTAGTAGTGCATATGTTTGCATTTGAAACTTTGTTAAGAAAATCATCACTTTAATTAGTTTCCTGCTTATTTTCTTCTGATGGTTTTCAACTTTATTGGGTGAATTCCAACAGACATCTTCGGCGCGACCTGAGATACCACCTTAACAAGTTGCCATGTAAGGTTGCATTGGTTAAAGACGACTTGTCTCTGGAAATTTGGAAATCTCATAATACACATGACACAAAGATCACAGCAACAAAGTTTGTATTTTCTTTATCAAAGTTTGTGTCGCTATCAGATTGTCATTGTATCGAAGACATTGAGCACTCAATTGTCTCTTCCAAAAGCTATCCCCATTCTATAGTTGCTTCCGATACCAGTAGTATGATTAGGAGATATACGAAGCAGTCAAGTGTTAACAGGTCGCGCGATTACAGTTCCGTATCAGAATTTGGATCCTCTTCTAAGCAAGAAAGATCAGGTGATCAGGAAGCCTGTTTAATTGTTTTTAAGCCTGTCTTACAGGTTTTAGGAATTACGCATGTAAGCTTTTCTTGCAATGATATGGAATCATTGTGTTTTTAAATGAGCATTTATCACTGGCTCTCTGGAAAATATCATCATAAAATTCTTTCTGAAAGTCTTTTTTTAAGCATGATTATCACTCCTCGTGGAATATTTTAATATGCTATTTGGTTGCCAGGGGTGGTGTGGAATGGAAAGACATAAGTTATTCACATTATCTCTATCCTAAAACTTAGAGTTATGAATTTACGGGTCTTTTTTTTATGATACTTAAGTTTCTCACTTTTACTTAACATCATACTTAGGCTCACAGTTAAATTTTTAGACAAATGTAGATTTCATTCTCTTGCTGAGAAGAAGATAGAATGATGAATAGTAAGTTAATTGCATCTCATACTCCTAAACTGGAGGGAGAAAATAAGAACTGTTTTTAATTGAGATTGTTTCAGCTTATATCAGATTAAATGTCAATGCAGTTTATGATTTCCTGTAAATTGGGAAGAAAGCTGCCTTTGTAATTAGTTGTGGACTAATCGTTCTTATTTTTGTAGCTTAAGTATGATTACCTTTTGTTTTGTTGAATAGAAACTTATTTGTTTATAACTAAGTTATTATTGGTACAGAGTATTTCACCAATTTGTTAATCTAGAAGATTTGAACCTAAAACCTTATTTATGAGAACAGATTCCAATACCAAACTAATCAACTTGTTGGTTTTGTGTATTTAAGTTCGTTTTACCATTTTAAAACGCGTACAAAAGTTGAATATAGAAGAGATCGATGTTTTTGCAGGTTAACATCCATTGTTTTTCCTATCGCATTTTGTAATAAATAGGAGTTTTAACTTTGATGCAGGCATAAGCATTAAAGGAGAATATAGGTATCTCACCAGTTCTCAGATTGACCATAAGCCAAACCAAAGTGACTTTCTGCCAAAACATTCAGACGCACCGCTTCTTTGTACTGGCTGTGGGACAAGAACTGAGTTATCTATCTCAGACTCAATGAAGTTCAACTACTCTGACATACAACTTGCAACAAATGACTTTTCAAAGGACAACTTATTAGGTGAAGGTGGCTACGGTCACGTATACAAGGGCGTGCTTAAAGATGGACAGCAAATTGCGGCAAAGGTAAGGAAAGAAGAAAGTTCACAAGGATTTTCTGAATTTCATTCTGAGGTCTACGTCTTAAGTTTTGCGCGACACAAGAATATAGTGATGCTGTTGGGTTATTGTTGCAAAGAAAGGAAAAACATCCTCATTTATGAATATATTTGCAACAAGTCTCTCCATTGGCATTTATTTGGTAAGTTGGCTATAGTTTATTTACTCTCTGAGTCTCAATATACCCAATGAGGTTTAACTTTTATGAATACATTTCTGAAGAAAATAATGCAGCAGTTCTTGAGTGGCACCAGAGGTATGCTATTGCCATTGGGATTGCTAAGGGATTGCGTTTTCTACACGAGGAATGCCGTGGTGGTCCTATTATTCATCGGGACATGCGACCAAGCAATATACTTCTCACCCACGATATTGTTCCCATGGTAAGGTATCATATAACAATATAAGTTTCATGGATATACAGTGTATAAAATGTTTTGGTTTCACAACATTTACATAACTAGGAAATTCCATATCTTATCATTCTCTGAGAGGCTTCTTTTCTGTCTTCGCATTAAAGTGGCATGTTGACTATAAATGGTTTGATGGCAGCTGTGTGTGCTTTGAATTAAGTGGTGTGTTGATTATAAGTGCAGCTAGGTGACTTTGGCCTTGCTAAATGGAAGACTGATAATGAAACTCCTCAAACAAGGATAATGGGCACATTAGGGTGAGAATTTTTGTTTGCTATAACTACCTTAAATTCCGAACATAAAAACTAAAACAAACACCTTGTTTGTTACTGTAGATACCTTGCTCCTGAGTATGCTGAAGACGGTATTGTTTCTGAGGGAACAGATGTGTACTCTTATGGGATTATCCTGTTACAATTGATATCAGGACGCCAGGTGGGCAATTCCAACAATCCAGAACAACAACAATCTCTCCGACAATGGGTATCTTTGATTGTTTACCTCTTTAACCATTGAAAGAAACTTTACTTGTTGTTTGCAATATCTAGCAATATCAACATCAATCTGACTGACCTTGATAAATAATGTTACGTGTGCAAAACATTAGGCTGAGCCAATGATAGAGAAGTTGGCGTTACATGAACTGATTGACACTCGTCTATCGGAATCATATGACACCTATGAACTGTACCTCATGGCCAAAGCAGCATACTTCTGTGTGCAAAGGAAGCCTGAGATGCGTCCCTCAATGGGAGAGGTACCTAATTTAACCTAATTGCTTTCACCATTTTTTAATTGAGTTAAATATTTTTTAGTTTTGATGTAAAATTGAAATTGGTATCTCTTTTCACATTTATTTTATGAATTTGAGAACTAAAATTTATCTAATTGATTTGAAACAAATTCCATTTTCTTATTAAGTTTAACCTTTATTTTTATTTAGAACATGAACATGACAAGAGACGAAGGCTCTTTCTAATATCTTGCATATTTTGTGTAATCGGTGCAGATTATTACAATTAATGTTAGCTTTTTGTTCAGGTTGTGCGACTTCTCGAGGGAGAAAGTAGCCACTTCCACTCTTTGGAAGATCAATTTGTACCTAATTTTAACGGCTAA