Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09934 LG2 38446866 38448397 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 38447031 missense_variant p.Ser50Tyr
T/C 38447167 synonymous_variant p.Ser95Ser
A/G 38447658 missense_variant p.Thr198Ala
C/A 38447783 missense_variant p.Asp239Glu
G/A 38447784 missense_variant p.Gly240Arg
C/T 38447951 synonymous_variant p.His295His
T/G 38447957 synonymous_variant p.Ser297Ser
G/C 38448305 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09934.1
MDNMDNMGDPKNIIQELLQGLELARQLQVHLHTPSSSRETRDLLIHNIISIFEKALEMVNWKGPVPAGESSQLPLAAAIRMSDSPISSSPQSEDSERDLKDQDNNAFKKRNTLPRWTKRIRVTPGMGVEGPLDDGHSWRKYGQKDILGAMYPRGYYRCTHRTVQGCMATKQVQRSDEDPTIFEINYRGNHTCTVAHSTGTSSIIPLENQEPTLNNTNQQQNILQSLEQQPNDLLLSLRDGLRVQTQNLDSTDPSFSPFRFPLSTNMENEGQVFPPHVLENFTSPYMSPATSGISHFSVSPTGVNNFGGNQNLSTFESHINDMIPAVTSAPNSAAVALEFPFDQFGFDGQNLRFGNP*


CDS Sequence:
>Vu_09934.1
ATGGACAACATGGACAACATGGGAGACCCAAAGAACATCATACAAGAACTGCTACAAGGTTTGGAGTTGGCAAGGCAGCTACAAGTGCATCTCCACACGCCTTCTTCGTCCCGCGAAACCCGTGACCTCCTCATCCACAACATCATATCCATCTTTGAAAAGGCACTTGAAATGGTAAATTGGAAAGGTCCGGTGCCTGCCGGTGAGTCATCACAACTGCCCCTGGCAGCCGCAATCCGAATGTCAGACTCACCTATCAGCAGTAGTCCCCAAAGTGAAGACTCTGAGAGAGATTTGAAGGACCAAGACAACAATGCTTTCAAGAAAAGAAACACTTTGCCCAGATGGACAAAAAGGATTCGGGTTACACCGGGAATGGGGGTGGAAGGGCCTCTTGATGATGGACATAGTTGGAGAAAGTATGGTCAGAAAGACATCCTTGGAGCCATGTACCCCAGGGGCTATTACAGATGTACCCACAGAACTGTGCAAGGTTGCATGGCAACAAAGCAAGTGCAAAGATCTGATGAGGACCCTACAATTTTTGAAATCAATTACCGAGGAAATCACACATGCACGGTGGCCCACAGCACGGGTACTTCTTCAATAATTCCACTAGAAAACCAAGAACCAACTCTGAACAACACAAATCAGCAGCAGAATATCTTGCAGAGCCTTGAGCAGCAACCAAATGATTTACTTTTGAGTCTCCGAGACGGGTTGAGAGTCCAAACACAAAACCTTGATTCCACTGACCCATCATTTTCTCCATTCCGTTTCCCTTTATCAACAAACATGGAAAACGAAGGTCAGGTTTTCCCTCCTCATGTTCTTGAAAATTTCACTTCTCCTTATATGTCACCTGCTACATCCGGAATCAGCCACTTTTCTGTGTCTCCAACTGGGGTGAACAATTTTGGAGGGAACCAAAATTTGTCAACTTTTGAGTCTCATATCAATGACATGATCCCTGCTGTTACTTCTGCTCCAAACTCAGCAGCTGTTGCTTTAGAGTTTCCTTTCGACCAGTTTGGATTTGATGGTCAGAACCTCAGATTCGGTAACCCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_09934::LG2:38444866-38446866(+)
ATTCGCACAAGAATCGCAAACCTACAAACAGAAACTGGATCGAACCATCATACTCATCGCGCATCATCAACACAGAAACGAAATCACTGAAATCGCCAATCAACCCTTCTCTCTATCGCGAAACCCATGGAACAACAGTTGTGAATCGCATTAGCCATCGCATACCACTGTGTTTTGCCCAGGGAAAAAGAAAGGCAACTAACGTCAAGGAGAAGCTGACGTTTGCATTTAAAAAATCCAACGTGGTAAACGATAGAAAGAAAAGATGTCAACACATGGCCAGACGTTAGGCACGTCAGCTTTTTTTTTTAACGCCGTTAGTTTTGGAGGACCAAAATTAAGCTTTCCTTAAGGAGGAGGACTAAAATGTATCTTACTTTAAAAGAGGGACTAAAAACAAATTCGCTTGACAGTTAAGAAACTAAAAACATATTTAACCCTATAAATTATAAATCATTTTAAATAAAAAAAATTGAAAAAGTGGAAGTCTGTGGAGATGCACGACTTCAAAAAAAGAAGTCATTGTTTTTTTATTAATTTAAATGGTTTATATTTAATATTTTTGTTAATTTAAATTTATAATAAAAAAAATTGTTATTAATTAATTATAATTTGTAAAAAAGTATACTATAATAATAAAAATTCAAAAAAATAGAAATATAAATTTTTTGAATTTTTAATTAGATAATTACAATAATTATAGTTATAAATTATTTAATTGAAATTATTTTATAAGAAATTTAATTTAATTATAAAAAATAATTAAAATCATAAAATTTATTTATTTAATAATATTAAAAAAAAATTAATTATTAATTAAATAAAATTAATAAAAGAAATTAAAAATTAAAAAGAGTAAAGATGTGTGGGGTGTACGACTTCTCTTAAGTCGTCAATCTCCTACGATTTCAAATTTTTTATATTCTTTTTATGAAAAAAAGAATGGTAATCAATTATCATGTCCTAAAATCGATTTTTAAGTGTACGATTTTACCTTTGATCACGGTGTCAGAGTGAAGTTGTATACTGAGATACAACTTCTTCCGTATGAGCTCTCACTACTTATCTATTTTTCGTAATTCAAAATTTTTTTTGCCTAACCGATAATTTATATTATAATTTTACCTAATTTCGTGCAAAAACAACTTGCAAGACAGAGATAAACAAAAACGTGCATGAGAAACGAGAGATAAATAAATAGATACAACATCAGATTGACCTAAACTAGATCGTAAGACTTTTACGCTCGCACAGTTCGCGGCATTAATTTGTACGGTTTAAGAGTGGGTCATGTCTAAATTAAATCGAATTAAATTGAAATCATTTTTGAGATGTAATTCCTATCAAATTAATTTGATTAGACGGGAAAAGAATAGTTACGTGGAGAGAATTAAATGAAAAGAATTTGGCATTGAGTAATTGTTAATTAATACATAACAGAAATTGATATCGATCTTGAATCCAGTTAAACGAGTGTACCCCATCCTGAAACAGGTCTGGAATGTTATAAATTGTAATTATAATATTAGTGAGGATTGGAACTTGAAATGTTATGATGAAAGCGAAGTGGAAGAAGGCCAACGTCACACAACCTTCCATAACAACGTTGGAAGGTACAATGGTAATGACGCGGAACAAGGTTTGAAGATTCCTAGTCTCATTCTTTTCCAACTTTATCACCCTTTTCATCACTCTGACTTTTTTCTTAGAATATATATTTTTCTAATAAAGAATTATATATGTTTTTTACTGCGTATGAAAGCGAGGGATATGGTTATTGAAGAGAAGAGGGTCTGTGCTGGAGAATGGGTCAGCAATTGGACCTCTCATGGTTACCCTTTGAACTGGTGGATTCCTTCCTATGACCAAAGACTAGTCCGAGTACACAAAATCCACTCCACTTTTCTCAGTCAAACTTTCCTTTTCCTTTCTATTTTCTGCGCTTTCCCACCCTTCAAAAATCCCATATAACTCACCTCATCGCTAACCCTTTTCTCTTA


Gene Sequence:
>Vu_09934(+)
ATGCTTTTGTTGGGTACATGGACAACATGGACAACATGGGAGACCCAAAGAACATCATACAAGAACTGCTACAAGGTTTGGAGTTGGCAAGGCAGCTACAAGTGCATCTCCACACGCCTTCTTCGTCCCGCGAAACCCGTGACCTCCTCATCCACAACATCATATCCATCTTTGAAAAGGCACTTGAAATGGTAAATTGGAAAGGTCCGGTGCCTGCCGGTGAGTCATCACAACTGCCCCTGGCAGCCGCAATCCGAATGTCAGACTCACCTATCAGCAGTAGTCCCCAAAGTGAAGACTCTGAGAGAGATTTGAAGGACCAAGACAACAATGCTTTCAAGAAAAGGTATATCTAATACCAATGCATATATATCTATCTATGCACCACCTTGCCTTTGCTTTTGTCATTTCATTGACTTCATCAACTTCTTTCCTCACAGAAACACTTTGCCCAGATGGACAAAAAGGATTCGGGTTACACCGGGAATGGGGGTGGAAGGGCCTCTTGATGATGGACATAGTTGGAGAAAGTATGGTCAGAAAGACATCCTTGGAGCCATGTACCCCAGGTAAGAGATCTTTAATATACTGTTATATATATAGTGTTGAACTAGATTTGTATGTATATATATATAACTATGTACTTTGTTCGTTTGCAGGGGCTATTACAGATGTACCCACAGAACTGTGCAAGGTTGCATGGCAACAAAGCAAGTGCAAAGATCTGATGAGGACCCTACAATTTTTGAAATCAATTACCGAGGAAATCACACATGCACGGTGGCCCACAGCACGGGTACTTCTTCAATAATTCCACTAGAAAACCAAGAACCAACTCTGAACAACACAAATCAGCAGCAGAATATCTTGCAGAGCCTTGAGCAGCAACCAAATGATTTACTTTTGAGTCTCCGAGACGGGTTGAGAGTCCAAACACAAAACCTTGATTCCACTGACCCATCATTTTCTCCATTCCGTTTCCCTTTATCAACAAACATGGAAAACGAAGGTCAGGTTTTCCCTCCTCATGTTCTTGAAAATTTCACTTCTCCTTATATGTCACCTGCTACATCCGGAATCAGCCACTTTTCTGTGTCTCCAACTGGGGTGAACAATTTTGGAGGGAACCAAAATTTGTCAACTTTTGAGTCTCATATCAATGACATGATCCCTGCTGTTACTTCTGCTCCAAACTCAGCAGCTGTTGCTTTAGAGTTTCCTTTCGACCAGTTTGGATTTGATGGTCAGAACCTCAGATTCGGTAACCCATGATTTTTCTGCCGAGTATACTCAATCAACTGAAATTGAATGAAAGTCAAAATCTATTATTTTTTTAAAATAATAGAATTAGAAGCATATGATGAAAGTGGAAAGATATCAGCAGGTGCTGTACGGTAACATTCTATAATTATATGACCCTTTTGAAAAAAAAAAGGCTTGTGTGTTTGTGTCGTAGGAATCTGCAATTCTAAAATTGCTTAGTCATTAAGAACTTTCCTTCATAATGTCAAGTTATCACAAACTCTTTTCTA