Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09874 LG2 37619569 37620901 PREDICTED: protein RKD4
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   embryo development ending in seed dormancy, embryo development ending in seed dormancy, embryo development ending in seed dormancy, embryo development ending in seed dormancy, embryo development ending in seed dormancy
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 37620501 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09874.1
MEFASEHDFPNFETIPHTFSSCFFSAQLYPTDKTMEVSLSPLEGFSGHDWTQQLPYSSKQLCLNEFPDLENLDLDFSLPPLGEDLEEVDQKPLNIIVVPEEGNSGREKGFGDALLAIENGSAICVKKEEVQNIEQMAVPSTSSGSKKKKPCALEFEEIKKHFDVPINEAAKQMNVGLTMLKRRCRELNIMRWPHRKLKSLQLLIENVKELGLADEVPMLEKHKRLLEKLPGLELCAKAKKLRQACFKANYKRRRFMGMTLQA*


CDS Sequence:
>Vu_09874.1
ATGGAATTTGCCTCCGAACATGATTTCCCCAATTTTGAAACCATTCCTCATACCTTCAGCTCATGCTTTTTCTCTGCTCAACTATACCCCACAGACAAAACGATGGAGGTTTCGCTTTCACCATTAGAGGGTTTTTCCGGTCACGATTGGACACAGCAGTTGCCGTATTCAAGTAAGCAACTTTGTTTGAATGAGTTCCCAGATTTGGAAAACCTGGACCTCGATTTTAGCCTCCCACCGCTGGGTGAAGATTTGGAGGAGGTGGACCAGAAGCCCTTGAACATTATTGTTGTTCCCGAAGAGGGTAATAGCGGTCGCGAGAAGGGTTTTGGGGATGCTTTATTGGCGATTGAAAATGGGTCTGCGATTTGTGTGAAGAAAGAGGAGGTGCAGAATATCGAGCAGATGGCAGTGCCTAGTACTAGTAGTGGCAGTAAGAAGAAGAAGCCATGTGCTTTGGAATTTGAGGAGATAAAGAAGCATTTTGATGTTCCCATTAATGAAGCTGCGAAGCAAATGAATGTGGGGTTAACCATGTTGAAGAGAAGGTGCAGGGAGCTTAACATCATGAGGTGGCCCCATAGAAAACTCAAGAGCTTGCAATTACTCATCGAGAATGTTAAGGAATTGGGTTTGGCAGACGAGGTTCCCATGTTGGAGAAGCATAAAAGGTTGTTGGAAAAATTACCAGGACTGGAATTATGTGCAAAAGCCAAGAAGCTGAGGCAAGCTTGTTTCAAAGCTAATTACAAGAGGAGAAGGTTTATGGGTATGACACTCCAAGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_09874::LG2:37617569-37619569(+)
TACTCCTTTAATTCCATTTTATGTTATGTTAAAGGTTTTCTTAGTATTAAAAACAATAATAAGTTATCCAGTGAATATATTTTTTACTAAAATATTCTTACCTGTTTTTCTATTTTATTTTTTATACATCTTTCGCATTAAAATAAACCATGATTACATATCTCTACCGACTCATCTATCTGGATATGATTTTATGAATAATTAAGATACTAAATACTGTTGCTTTAAATGAACTAATATTGTTGAACACTATATTTCTCTCTTGTTATATAACTAAGTATACTAATTTATGTTGTTCTCTGCATTTATATATATACTAAATATTGTTATATTAATGGTATATTAAATTTTTTAATAAGTTTTAAAATATTAAAATCAGTATTCACTAATTTATTTTGAAGACAACATAGAGATAATATTAAAAGCTCAGCGGAAAATGACATTTTAATAATTTATATTAGTCTTAATGTTCAAATGACAATTCATTTAAAATATATAAGAAAACTTAAATAACTTGAATATCCATTTTATTTATTATACTAAGTTAAGAAAGCTTGTTTATCAACCTGTCACTAAATTAAGTGAACATGTTGAGATTTTGAGTTTAGCCTGATCTGTTTTAATTAAGACAAAAATTGAAAAAATAACTGAGAATTAATTTTTTTATTACATGTTTTGAAGTATAAATATGTTCTATTATTATAATTCAAATCATAAACAGTTAAGTTGTAACTATTAATAATAATTAAATAATTTAATATATAAATAATAATTTTTAATTTATTGATCTCAAAATATTAATTAATTATTTAAAGACTTAAAATATTATTATAATTAAATATATTTAAAAAAATATATATTTATTTTAAAATTATAGAATAAAAAATTAAAATTAAAAGGAAAAAAACTGACAAGGTGATGAAGTGGACCAAAAGTTATTCCAAATTTCGAAATTTGTTGAAATTTTTGAAAATAACCTTAAATGAATTTTGAAATTTATTGAATAAAAAATTCAACACATTTGTTAAAAGATTTTTTTTAACAGATTTCAAAACCATTGAAATTTTGTTCGAAAGCTTCGATAAAATTCAAAATTCATTGAAGAAGGATATTTTTAAAATACGATGATGAAGAAAGAAATATGAGGTGATATAAGAAGAAACACTATATTTGGTGTGTAAAAATACATTAAGAAAATTTCATACACCAATGTGTTAGAAATAAATTCGTTTAAAAGATGAAAATATCATTTTTAAACTTAAAATATTAAGATCTTTAAAGCAATGTGAAACTTGTAATTGACATCAAATTCTTTTTAATTTGTATTTTTTTTTCTCACCCTTCTATACCCAAAGTCAGTGGAAGAATATGGTCACTGCACCACACAACTTTTTTTTTTATGCGTATGCGCTTGGTTTTGTTTTATTTTATTTTATAATAGTTTCCATGCGTTACTTTAGAAACAGCTATGAACATAGCATCATTTCCTAAAACACTAAACGATGACAAAACACGTATGGAAAAACACGCTTTTACAACTCCTCATACACGTACAGACAAAACAACAATCACAAATCTCCCCACCACTAACATTCTTACTTCCATTACATGATAACAAATATGCCTTTCTTTGTTTTTTTTCTTGCTAATTAATTATCAATTTCTTAAGAAGATTATCACTAACGAGATTATTAATTTGTGATTAAAATGAGATAAGCATGCAGATGTAAGATATGAGTGAGATTGGATGAATAAATGTGGTTGTGATGACTTGTTTAATTAGTAATTAAGGTTAATGCAAATTCAAATGAATATGAATATGATTATGATGTATCTAAAGTACGTTCAATGTCTTTAAAATTGAACGGAAGTTGGTCTGAAAATTGTAACCCCCTCTTTTCCCAAACCACACATTACCTCACATTTATAAATACTGTCTTTTTTCCGCATTCTCCTTAGTCTCTCCAAACCCATTCGCATTCTCCTCTTTCTCTCCGATA


Gene Sequence:
>Vu_09874(+)
ATGGAATTTGCCTCCGAACATGATTTCCCCAATTTTGAAACCATTCCTCATACCTTCAGCTCATGCTTTTTCTCTGCTCAACTATACCCCACAGACAAGTAAGCTACTCTTTCTTCACTGTCTTTTGCTTAGTATTATTCCTATGGAACAGTTTCTCGTGACTTTCGAGGTTGATTGCAACTTTCTTTCTTTTATTTTGTCTTATACGATAAACAGTACTATATTGTTTTTTTTTGTTCGTGTGTCTGGATGAGTGGTATTTTAATGGTGTGTGTGACTTCAGAACGATGGAGGTTTCGCTTTCACCATTAGAGGGTTTTTCCGGTCACGATTGGACACAGCAGTTGCCGTATTCAAGTAAGCAACTTTGTTTGAATGAGTTCCCAGATTTGGAAAACCTGGACCTCGATTTTAGCCTCCCACCGCTGGGTGAAGATTTGGAGGAGGTGGACCAGAAGCCCTTGAACATTATTGTTGTTCCCGAAGAGGGTAATAGCGGTCGCGAGAAGGGTTTTGGGGATGCTTTATTGGCGATTGAAAATGGGTCTGCGATTTGTGTGAAGAAAGAGGAGGTGCAGAATATCGAGCAGATGGCAGTGCCTAGTACTAGTAGTGGCAGTAAGAAGAAGAAGCCATGTGCTTTGGAATTTGAGGAGATAAAGAAGCATTTTGATGTTCCCATTAATGAAGCTGCGAAGCAAATGAATGTGGGGTTAACCATGTTGAAGAGAAGGTGCAGGGAGCTTAACATCATGAGGTGGCCCCATAGAAAACTCAAGAGCTTGCAATTACTCATCGAGAATGTTAAGGTAATGTACCCAGACATGCTTGTCATGTCCTATGTATGAGTATATCTCTTAACATTTAATGAGCATCGACTGAAACAACATTCTCTTTTTATTACCTTATTTCCCGTGTCTTAATTACTCAACCAGTAAATTATTTTGCTTTTATATATTCGCTGAGAAATCCTGAGTTTACAATTGTAGCAGTTGGACCCCACGCGGAATCATAATTAAGAACTTTGTAGTTTGTACTGTTTTGCAATAGTTTGTGCCCCATAAAAGGGCAGTGAAGGTGACAAGAAAACCAACGTGAAAACTCATTAACCACTGATTTTATTACTTTTCTGTGGTCAATGGTTGAAAGTGGTTGGTATGTGGTGCAGGAATTGGGTTTGGCAGACGAGGTTCCCATGTTGGAGAAGCATAAAAGGTTGTTGGAAAAATTACCAGGACTGGAATTATGTGCAAAAGCCAAGAAGCTGAGGCAAGCTTGTTTCAAAGCTAATTACAAGAGGAGAAGGTTTATGGGTATGACACTCCAAGCTTGA