Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09837 LG2 37023057 37028217 ATPase family AAA domain-containing protein 1-B isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   reactive oxygen species metabolic process, reactive oxygen species metabolic process
Cellular Component   is active in   mitochondrial outer membrane, mitochondrial outer membrane, mitochondrial outer membrane
Cellular Component   located in   plasma membrane, mitochondrion
Molecular Function   enables   ATP hydrolysis activity
Pathway   B 09191 Unclassified: metabolism   C 99980 Enzymes with EC numbers
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 37023320 intron_variant
T/G 37023413 intron_variant
C/A 37023415 intron_variant
T/A 37023570 intron_variant
T/G 37023580 intron_variant
A/G 37023729 intron_variant
T/G 37023784 intron_variant
A/G 37023957 intron_variant
A/G 37024005 intron_variant
A/C,G 37024009 intron_variant
C/T 37024430 synonymous_variant p.Leu109Leu
A/T 37024907 intron_variant
A/G 37024931 intron_variant
C/A 37024991 intron_variant
T/C 37025257 intron_variant
T/C 37025680 intron_variant
T/A 37025794 intron_variant
G/T 37026171 intron_variant
C/T 37026213 intron_variant
T/G,* 37026609 intron_variant
T/A 37026841 intron_variant
C/A 37026851 intron_variant
T/C 37027357 upstream_gene_variant
T/C 37027396 upstream_gene_variant
A/C 37027402 upstream_gene_variant
C/T 37027467 upstream_gene_variant
C/T 37027611 upstream_gene_variant
G/T 37027817 upstream_gene_variant
T/C 37027818 upstream_gene_variant
A/C 37027822 upstream_gene_variant
A/T 37027827 upstream_gene_variant
A/G 37027903 upstream_gene_variant
C/A 37027908 upstream_gene_variant
T/C 37027927 upstream_gene_variant
T/G 37027944 upstream_gene_variant
T/A 37027952 upstream_gene_variant
C/T 37028002 missense_variant p.Pro266Ser
C/T 37028042 missense_variant p.Ser279Leu
A/T 37028052 synonymous_variant p.Thr282Thr
T/A 37028118 synonymous_variant p.Gly304Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09837.1
MGGSSETKFLQDLLLYAASAALSCLVLFAGLRHLDPNREASKKVLEHKKEIAKRLGRPLIQTNPYEDVIACDVINPDHIDVEFNSIGGLETIKQALFELVILPLKRPDLFSHGKLLGPQKGVLLYGPPGTGKTMLAKAIAKESGAVFINVRISNLMSKWFGDAQKLVAAVFSLAYKLQPAIIFIDEVDSFLGQRRTTDHEALLNMKTEFMALWDGFTTDQNARVMVLAATNRPSELDEAILRRLPQAFEIGIPDQRERTEILKAPRPLSQLDLEKAIATSQKTKVAASEYAGFSLQSPSRWSVPGDSGDSQIQAAINEFSKLVVSHMINLQPESQDP*


CDS Sequence:
>Vu_09837.1
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Promoter Sequence:
>Vu_09837::LG2:37021057-37023057(+)
ATATTCTAATATTGAATTCTATCACAATTTGAGATATTCGTTTTGCATACGAGGGATTTTTTTTTAATTCAAAACTTCATTACAAATTTATTTTAAAAAAACAAGATATTTACAATTTGGTGTCAAAAGATAATTTTAATTCACATTTTTTTTCTTAAAATTCTTTAAGATTTTTTTCGAAAACAAACATAACCAAAATTCTAAATTTCAACTGACAAATTAATTCTAATAATTTTACTTCAAGAAATTTAAAATCTAAATATTGTCATAATGTTTTCTAAAAAAATTTAAAATCGAAATATTATTATTTTTCACCTATATAGAACTATTTTATTTTTTCTTTAAATTTTCTTCAATTAGGTAATTTATTTATTCTATTTAGTTGAATCTGATTTATCTAAAAATTTAAGATTAAAAAATTAATTGAGGAGAAAGTAATCTAAATATCCACTTTTAAAAAATGAAATGAGAAACCATTAATATAGAAGAGAGAGAAAAGGCTGAACTGGAAAGAGAAAAAACTGGACAATATAGAAGAGAAGAAAAAAAGTAAGTCACATCAGTACTCTCCATTGCTGTTAATTTAACAAAGATGACCTTATTCATACAATTTTCAATTTTGATAACATAGGACAGTAAGTATTTAAGCCATTAACAAAAGAGAAAACTACTTTTTCACCCTTTATTTTAATATTTAGATCTTAAAAGCTAAAATTTTAATAATAATTTATATTGCATATTTATTATCAATAGAATAATATTCTAACGTTTAAGTTGTTCCTCTTTTGGATTGCTTACGCAAATGTGTGTTTATGCAATCATGTACTTTTCAATTTTAGAATGTATATATTCTGAATTTACATACAAATCAATATTAACATTAACTATTAATAGATTTAAAAAACAATAACTCTTATTAAATTTAATCAATACTGTGATTAAACACGCACGGATCATAAGAAAATTGTTTTCTAATTATGCTAATTATTATACTTAAAAGTACATTGCAAATATATTTAATAATTTATAAAAGTTACCAATACTTCCACATAGACTAACAAAATTTTATTTTAATTTTCAAAATCTATCTTTCCTCACAGACAATTGTTTAAAATTGCAACTTTATACAGTTTTAATATTTAATAACGAAGATTAGTTGCTGTTGCTGTGCTGGTTTAGCAGTGAAGATTCCAATTGCTGCAGCGTCTGCTTATATTTCTCAAATGTAGACACTGAGTCACAGCACAACCTATAACTCTATATTGTTACTGTCTATTTTATTTATATTTCTTCACAGGCTTCTCATAGGAGCCAAAAGACATTTTTGTGTAATTGTATATAAATATTATATATTATAACTCATGGGGTCTCATTGAATTTAACAAAGTTTAATTCAAATATAATTTACAAAAAGTATATCAACAGAAAGAAAAAGCTTTTCTAACGTGACGAAATGATTCACCTAGGAAGACCCACATTAGGCTAATTTGTTTTTGCACCCCACAATTATTAACTACACCCTCACAATAATTAAACAAAAATAAATTAGCCGTTATCGTTGCATTACATCATTGTTGCATGTGTGATATTATGGAAAAAGCTTGTTTCATAAAATCTCTAAAACATATTATCTGGAAGTCACTATTAGGGGAGGTAAAGTTGTTATTTTGAAACTTTTGGGAGGTGCGCTAAGAAATTTGGAGGTGCAGGGTGTAAAAGACTGACATTAAAAAGAAAGGTGAGCCCAACATTGCCTCGCCGAGAGATGGGCAGAGCCCACCAAGCGAGCCCTCCTTTTTCTTTTATCATCCTTAACATCAACCCCAAGCGTTGTGATTCTTGACTTTTCTTTCTTACTTTGTTTCTGTTCGAATTTGAGTTTTAAGAACCGTCGGTCATTGTTCCTCGCCACAATTACAAAAAGAGTTAAGGTAGAAGGAATTTTGATGATATTATCGTATCATAAATTGGAGTTTTGATTTTTATTGTTGAAAGAAGAA


Gene Sequence:
>Vu_09837(+)
ATGGGAGGTTCATCGGAGACGAAGTTCTTGCAGGACCTGTTGTTGTACGCTGCGAGCGCGGCGTTGAGTTGCTTGGTGTTGTTCGCGGGACTCAGACACCTCGATCCTAATCGCGAAGCTTCCAAAAAGGTTCTTGAGCACAAGAAAGAGATTGCAAAGCGTCTAGGTCGCCCCCTTATTCAGACTAACCCTTATGAGGTTTATCCGTTGTTCTATTCTTTGCGTTCCAATTTTTTATATCTCAACTTTTTCACTGCATACACCTTAGTGTTGTTTTTTTGGGAGTCATTGGATGGTAATGTGAAATTATATGGCTAGGAAGATGTTCAAGGACTTGACTATGGAGTATCACAATGTTCATGATTAAGGATTCTAACGTAGGTGTTGGGAACGTGTTTTGATATTGAACGAATATATACTTGTTCCAATCCCGTCAGTAAGTTTGTAATTTGTAAAACTGATGTGCTGAATGTCACGGTGTGCATCATTGATGTTCAATGTTGGAGGGTATTTTATTTTTTATTTTCCCCAGTGTGAATAGTTTGTAGGATCAGTATTTTGATCTTGTTATTCTCATTTTTTTAACGGTCTCATTGTTGTGATTGGTTCCTCCGAATGAATTTCTAATTATGCCTGTCTTTTTTTAGTGAATGCCTAGTTTTTAACTGTCTCATGTGTTTGTATTGGATCGTATTACCTAGGCGGTCGTATAATTATGAGTGTTTATTCGTTTGTCTGCATGTTGCTCATTTGCCTTCACGTTGCATCGTAAGTTTCTTAGGTTGGGCTTCAGACTAATTTTGATGGGTGGAATAATGTTATATCGGGTAGCTATACTCTAATTTAGAGCGAAACTGTTAGCTCTGTTTTTTCATTCTATTCGCAGAGGGATGAAGCTTGATTCTTGATGATGTGCATCATGAACTAATGTCCTGATATTATCATGTTACTTATATACCCTGTAATGGATTTCTAGAGCTATGAAATTGTACTCCTGAAAGGGATTTTTCAATGACTTAAGGATTAATCTATTATGATTTCCTAATTTTGACCAATTTATTTGTTTAATTAAGAAATTAGTTTAAACACATAAATTTATCCAAATAATCGCAAAAATGAAGGACTAGATCCATTACATATCCTATATGGATATATGGCCTTACTTCATGTTGACAGTGAAAAACTTTTGACCACAATTAACTATTATCTTTTATAAGTTTTTAATTTCTGCCCTTTATTGTTTACAGGATGTTATAGCCTGTGATGTTATAAATCCTGACCACATTGATGTGGAGTTTAATTCTATTGGGGGACTGGAAACCATCAAGCAAGCTTTGTTTGAGCTTGTTATTCTGCCTCTAAAAAGACCAGATCTGTTTTCACATGGTAAGCTTCTTGGACCACAAAAGGGGGTTCTGTTGTATGGACCACCTGGCACTGGAAAAACCATGCTTGCCAAAGCTATTGCTAAGGAGTCGGGAGCAGTTTTTATCAATGTGAGGATATCAAACCTTATGAGCAAGTGGTTTGGGGATGCCCAAAAGCTTGGTAAGTGCACTATATGGCTAATTTTGCAATGTATTGTAAAGCTTTACTCTTCTCCCTTACGTAGACTTTAGTCTCTTTAGTGTTGAATTTGTGTGATCACATGGATTATATAATTATCTTGGCTCAATAAATTAAAATATGTTCTACTCCTATGTTCCTACTTTTTCATAAGGTCCATACGATAGCCCAAAGATCCAATAATTTGTCAATAATTACTTAGAATCCACGTAGAAGCTTGACACAGTGTTGTTGAAAGAGGAGGTAGTTGTATATAAACTACCTTGGGCCTTAATTCCTAAGCAATGTCAGACTTTTGAGTGTATAGGAAAAAGACCCCCAATTGAGGTTTAATGGGTAAGAGTAGCTTAGAACTCTCCTTTTTGGCCCTATAAACAATGTCAATCATTTGATCTCAAGTCCTTTAAGATAGCATTGTTATAGTCAATCATTACAATCAAGGTATTGTTTGCTATGGACTTGATGCTTTTGTCATGGTTTTGCCCTTAAAAGGTACTTCCATGGGTCAAAAGAGGAGGGTGTTTATAAACAACCCTTAGTCTTGATTCCAAAGTGATGTGAGACTTTTGAGGTATTGGAATAACACGATTTCTGACATTTTAATTATTATTTATTTACACTTCAAAATTTCACATGTAATCTTGCAATGTGTAGAAAAATCTTTAATGTGATAGATTTTTATAGTCAAATTCAACATAGTTAGTCCTAACGACTTATTGTTTTTATGCATGAAACTTTCTGAATATCTTCTAAGGTGAAATGTTGTGCAATCTGATTTGTTTGAATTCAATTGCATGTTCATTGGTAATGTTTGCATATTATCATTAAAATCATATACATTTTTATAATGTTTGTATCCTACAAACATTAATGATTTTCATTTTTAATATAAATTTGATACTTTTTCTCCAGACTTATGTGTATATCCTAATTTTAATTCTTTGACCATTATGTGTTATACCTTGTCTTATAACTATCAGAATTTGTTTAATGTTATATCTTGTGAATGAAATAATTACATTGTTCATCCATGCCATGGAAAGTCAACGAAGGTTTATATTGGCTATTGGCTCCTAATATAACTGTGATACTTTATGGGCTTGGGACTGGCTAATGTAACAGTAGCACTTGGGCTGAATAATATACTTGTTATGGAAGGGTTTAAGAGAGATAGGCATTGGATGGTTTACAAAGTTGTTTCATGAAATGATGAGGTCTAAAATGATGATGGAGCTGGATTCGGAATAAATGAATGTTATGCTCAAAGAGATTGAGTGGAAAACTACTTTTACTCCTATCTATTTGAAGATGGAAAAGCCGCAAAAATAGGTGCTATGAAGAAGGGTATTTGAGTGGAGATTAAGTCAAGAGACTCAATTTATGGAAAACTAACATCTTTTTTGTTATCTTCCTCGATCAATACAACAGTAATATCTCTTTGTATACGATACTTTTGTATCTTGTCCTTTCTTGTATGGCTAAAACAATTTACTAAACCATAAGTGCCACTATAGCTTAAAGTAAAATTTTATCATAGTTTAGGACTTGGGAATAAGTGTTGGGATCTACAGTGCCAACAGAAAACAATTGCGCTAATAGTTAGAGCTAGACGAAGAAATATAAAATCTACTGGTCATTTGGAAAACCCATTAACAAGGATTTAGACTTAACTGATATTTCGGTATACATGATTTAAAATAGGACCGTATGGTATTGTTCTGATTTTCTGTGTTGTCTTGTGAAAGAATTATTGAAATATATGACTGATTAGGAATGCAACGTTCTTCTGAAAGAAGTTAATAAAGTAACTGATTTTTAAAACATAAAGGTTAAATCTTTCAATCACTTGAAGTTTTGGTTTGAGTAAAATGATCACCCTGGATGTTGTTACTGGTTGAGTGAAATGATTATATGATATAAGTTTGCATTTAATTTTCAATGTGCTTAATTAAGCTTTATTTCTTCTTTTTCTTTATTTAAAGCATGTTTTTTTTTGTTTTTCCTAACTGTTAATATTATGCTGCTCTGCAGTGGCTGCGGTATTTAGCCTGGCTTATAAGCTTCAGCCTGCCATCATTTTCATTGATGAAGTAGACAGTTTTTTGGGTCAACGCCGTACAACTGATCATGAGGCTTTGTTAAACATGAAAACCGAGTTTATGGCTCTGTGGGACGGATTTACTACGGATCGTAAGTTTAAACCAATTATCAGGTTATTTATTTTGTTGCATAAATATTCACAATTTTGTTAGATTTAGTTTGTAAAATAATCTTCTCAATTTATTTTTATTTGAGTAAATTTGTTGACCCATATGATTTTTTGTGTGTAGAGAATGCTCGAGTTATGGTCCTTGCAGCGACAAACCGTCCTTCAGAACTTGATGAAGCAATACTTCGGCGTCTTCCTCAAGCCTTTGAAATCGGAATTCCTGACCAAAGGGAGAGGACTGAAATATTGAAGGTTATCTTAAAGGGTGAGAGGGTTGAAGAGAACATAGAGTTTGGTCATATAGCAGGCTTGTGTGAGGGTTACACTGGTTCAGATCTATTTGATCTTTGCAAGAAAGCTGCCTATTTTCCTATTAGAGAACTGCTAGATGAAGAGAAGAAAGGAAAACGATCTCCTGTTAGTATATTTAAGTCATCTCTTTCATTTTCTTCTCTGCCTTAATTTTTCATTTTCTGGCCAACCTACTTTGAGTATGTTGATTTTATTTAAGCTTATGATGTTTGGTCTTACTGTTTTGAATGTTCTCAATTTGATTCCACTTTTTTAAAAAATGGGTTAATATAGTCTAATCTGTCAAATTGATGGTAATGATGTTGTCACACCCTTCTCTATCTCCCAAACCCTTCTTCTACATCTTCTGCTGTTACACATTCAAGAGCCACCACCACCGCTCCTCCTTCAACTTCATTTTCCTAAACTGTGTTATAGTTCCGTGTAGCATTACCATATTAACTCTCCCTCTTCTTTCATCAAAAGCCCTCTCCGTGTCCTAAACATCATCAACTCTCATTGATGTAATGTCCGTACCATCAATTTGTCAAAAAAGACCACATTGACTTGTTTTTAAAAATAATAGAACTAAATTGAGAATGTTCAAAATAGTGGAATGAAATTGAAAAAATATGATAATAGTTAGACAAATTAATATGTTCAGCCATATTTAAAGCTATTGTATATGCGCAAGGTTATATTTGAATGCCTGAGAGTGACATCTCTGGTCAATGAAAGCAATTACTTAATGTGCAAGATCAATTTATCGAGTGGTTTCATATTTTCTCTAAAGAAACTGATTAGTTTTCTTGGTGGCTTTTTCATATAATAAGAACTTCTTAAATGTATTGTTTAACTTTCTTATTTCAGGCACCTAGACCTTTGTCCCAGTTAGATTTGGAGAAGGCCATTGCCACTTCACAGAAGACAAAGG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