Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09690 LG2 33811930 33815134 PREDICTED: transcription factor RF2b
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 33812190 3_prime_UTR_variant
A/G 33812197 3_prime_UTR_variant
C/A 33812220 3_prime_UTR_variant
T/A 33812320 3_prime_UTR_variant
G/A 33812395 3_prime_UTR_variant
G/A 33812396 3_prime_UTR_variant
C/T 33812501 3_prime_UTR_variant
C/T 33812586 synonymous_variant p.Gly264Gly
G/T 33812627 missense_variant p.Pro251Thr
G/A 33812656 missense_variant p.Ser241Phe
G/C 33812716 missense_variant p.Thr221Ser
A/C 33812805 synonymous_variant p.Ala191Ala
G/A 33812866 missense_variant&splice_region_variant p.Ala171Val
T/G 33812916 intron_variant
C/A 33813009 intron_variant
C/A 33813251 intron_variant
G/A 33813393 intron_variant
G/A 33813461 intron_variant
T/C 33813466 intron_variant
G/A 33813597 intron_variant
A/G 33813654 intron_variant
C/T 33813723 intron_variant
C/T 33813741 intron_variant
A/G 33813751 intron_variant
G/A 33814106 intron_variant
G/A 33814123 intron_variant
T/C 33814193 intron_variant
A/G 33814206 intron_variant
A/C 33814207 intron_variant
A/T 33814305 intron_variant
G/T 33814420 intron_variant
A/G 33814668 splice_region_variant&intron_variant
C/T 33814708 missense_variant p.Ala86Thr
T/A 33814731 missense_variant p.Lys78Met
G/C 33814769 synonymous_variant p.Thr65Thr
C/T 33814820 synonymous_variant p.Pro48Pro
C/T 33814931 synonymous_variant p.Ser11Ser
C/A 33815049 5_prime_UTR_variant
C/G 33815123 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09690.1
MSFPHHRRTQSEMHFRITDDFDLEVDLSPPHFQDPTPPNQSGPKPESPPHETACSGHRRSNSADTSSSSLLEGIEAKKALSPDKLAELWTVDPKRAKRILANRQSAARSKERKACYVSELERKFQSLQTEATTLSAQLSLFQRDTTGLSSENTELKLRLQAMEQQAKLCDALNEALKKEVGRLRIATGEIAMPADNYGLGMHQLTYSQGPFFSHHSQQGQTAFQATQMPQMHSLSSNVATSNEPLFDLDIPYDMSEMLSNESIGQFQGLDIGNGVSQVLMPDYSSNFC*


CDS Sequence:
>Vu_09690.1
ATGTCGTTCCCTCACCACCGTCGAACCCAATCGGAGATGCATTTCCGGATCACCGACGACTTCGACCTCGAGGTCGATCTCTCTCCCCCGCATTTCCAAGATCCCACCCCGCCCAACCAATCCGGACCCAAACCCGAATCTCCGCCGCACGAGACCGCCTGCTCGGGTCACCGGAGGAGTAATTCCGCGGACACCTCTTCCTCCTCGCTGCTCGAAGGCATTGAGGCCAAGAAGGCCTTGTCCCCCGATAAGCTCGCCGAACTCTGGACCGTTGATCCCAAACGTGCCAAGAGGATTCTCGCTAACCGTCAATCCGCGGCGCGCTCCAAAGAGAGGAAAGCTTGTTACGTGTCGGAGCTTGAAAGGAAATTTCAATCCCTTCAAACGGAAGCAACCACTCTCTCTGCTCAATTAAGTCTTTTCCAGAGAGATACAACTGGTCTGAGTTCTGAAAATACGGAGTTGAAGCTTAGGTTACAAGCCATGGAACAACAAGCTAAGTTGTGTGATGCTCTAAATGAAGCACTGAAGAAAGAAGTCGGTAGGCTGCGGATTGCAACAGGAGAGATAGCTATGCCCGCTGATAACTATGGCTTGGGAATGCATCAGCTTACATATTCTCAAGGACCGTTCTTCTCACATCATTCACAACAAGGGCAGACTGCATTTCAGGCCACGCAAATGCCGCAGATGCATTCACTCTCATCTAATGTGGCTACTTCCAATGAGCCTCTGTTTGATCTAGACATTCCCTATGATATGTCCGAAATGTTGTCGAATGAATCTATCGGGCAGTTTCAGGGGCTGGACATAGGCAACGGGGTTTCTCAGGTTCTGATGCCAGATTATTCCTCCAATTTCTGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_09690::LG2:33815134-33817134(-)
TCCAGGTAAAACCCTTTCGTCAACCAAAAGGCTGAAGATAAAGACCAAGAGGTAAATCGCTCTCGTCAACAAGGAAATTTTGATGGCGATGAACGAATCACAGGTATTCAGCTTCTCCAATTTTCGGCCAGTCGGCCTCACAGGTGCTCGGCCAGTTAACCTCACAGGTATTCGACCATTCGGTCTCAGGTATTTGGCCATTCGGCCCCTTCTGCTCAGCATTCTACGACCTCAGTTGAAGAAAACCGTTCGGTCATTTACAAGCAACGACTAAAAGCAACCTCCCTAAAACTCACAAGTCCTATAGTTAATCATGACTAAAGTCGAACGCTTAACTAGGACTTAGGGGGCATATGTATTGTACCTAGTAGAGACCAAACGATCATCCACTCAGCACTGTTCGGTCACCACTATGACCAATCAAGGCAAACGGCTCTATTAATGCTGGGCCATAATTAGGCCAGCGCTTATTTTATTATTGGGCCAAAAGTCCAGTAGACGGTTAAAATAACCAAAGATATTTGATTAGAGATATTGATAAAGCCGTTGATGAATAACTAACCGAATCTTCAAGTAAGTTTGTTATTATTTGGTCTATGAAACACTTTTAAATACAATGACAGGGCCAAAAGCCAGGTAGGTTCAACTGAGACTCCACTACGTTCTACTTACGTCCGATTAGGACTTAAATACTAAACCGTGTTAAACAGTTCATTAAACCGCTCCTAACATGAGCGACGAAGTGCCTTTTGCAGATACCTCCCCCTCCTGGTCAAGAAGACAACGGTGCGATCCAGACTGACAACGAGCGGTTCAAACGATCCAAACTTTCAGAAACAAGAAAGACACGTCTGAAAGGTTAGTCTCTCGGTCCTACACAAATCCCTACTGAAACACATAGTAAATATATTTATGCTCTCAAATATATATTTATGAGCTGAATACAAAACCTTATTTATAAATATATTTTTAATTTTTAATTTTTACATCAAGTTAGAATTCGTTTTAATTGTAAATTTTAATATAATTTATTTCTAAAGAAAATTAATATAATCATTTTAATTTAATTATGTTAAATTTTGTTGATTTGTTAAACGCTTTCTAAATAAATGTCAAATAGTATAAATAATTTAAATATATAAAACAATTTAAAAAGAAAACTAATCTAATTGACTATATTAATTATTTTAAAATTTAAAGACTATTAAAATTTTAAAGAGAGAAAAATTTTAATTTTATATTAAAATTCAGAAATTAAAAACATATTTAACTAACTAAAATATTTAATTTAAAGATAAAAACAATCAAATAGTATATAGTTGATAAAACTAATAATTTTGAGATATAACTTTACATTTAATATTCCCTTTAAAATGTTATATATCTAAACTATATTTTAATAAAACATGGTTATTAGATTATTAACGTTGGAGCATAAATTGTAATTAATGTTAATTATCACTCAACTATTTCTTTAAAATAAATGGGACTTATTCTGCAATGAGCATAATCATATAACAGTTGATTAGTGGATATCTGCATGATTACTTACCTAGTAACAAATACTTTATCTACATGATTTAACCTTCGAAAACTACACGATGTTTCGAAATTTGTATTTAAGACTTTAGAAACTACTTGCATTATTTAAATATCCAACTTTGTACGATCACAAATGAAATTTAATTCTTTTATTCAACTTGTTCAAGAAATCATCTGTTGCTTAATCATTTCCTCTTTCTCAAATGTGAACCCATTGATCAACCTAACAACATAATTTACCCACTCGAGCCACCGAATATAGATAGAAAATTAAGGAGAGATTAAAAATAAAAATGTCAAATAATTATAGATAAAAACTTATTTAATTAATTTATTTATTTATCGCGGGCATAGTTAATGGGAGGTATGAGGAAGAAACGCCAACAGCGGGACATGAAAAAATAGCTGAAATAAACAGATGAAAAGAAGATCATGATGAGGGCATTTTCTGATTCATT


Gene Sequence:
>Vu_09690(-)
ACAGTTAAGAAGAAAAAAAAGCCTAAACGACGACGTTTGGAATCCCCTCCGTAGGCAGAGACCGCGTTAGTGAGAGCCCAAAGGGGAGGGAAACGGACCAGTGACCGGTTAATACCCATCGGATCCGAACATACCGACAACCCGGTCACTATCACCCCTCCCCCCGAAACGATGTCGTTCCCTCACCACCGTCGAACCCAATCGGAGATGCATTTCCGGATCACCGACGACTTCGACCTCGAGGTCGATCTCTCTCCCCCGCATTTCCAAGATCCCACCCCGCCCAACCAATCCGGACCCAAACCCGAATCTCCGCCGCACGAGACCGCCTGCTCGGGTCACCGGAGGAGTAATTCCGCGGACACCTCTTCCTCCTCGCTGCTCGAAGGCATTGAGGCCAAGAAGGCCTTGTCCCCCGATAAGCTCGCCGAACTCTGGACCGTTGATCCCAAACGTGCCAAGAGGTTCCTTTCTCTCTTTCACATTGTGATATCGTTGCGATTTCAATTCCTGGTTTCAATTGTCACTTTCTTGCGTTGTGACTGAAGGGGATGGGGCATGTGATGCAGGATTCTCGCTAACCGTCAATCCGCGGCGCGCTCCAAAGAGAGGAAAGCTTGTTACGTGTCGGAGCTTGAAAGGAAATTTCAATCCCTTCAAACGGAAGCAACCACTCTCTCTGCTCAATTAAGTCTTTTCCAGGTTCCTCTACTTCAATTTTAAATCTGCATTGCTTCATTCATAAGTAACCACGTTGAGTAAATCCTCTTACCTGGATTATCTCCAATTTAGGGTGTGTTTGTTTGGGGATATAGCTCAGTTAAAACACTTACTCGATACAGTTCAATTCATATTTGCTATGGTTAAGTTTAAAATTTCGTTTTGGAATGCACTGTATGGTCACATCATCGTATTCATCAACATGACTTGACATTACCTGAATTTTCTTTTTGGAACCTTATTGAAAAAACAATACACTTATCGAGCATATAAAATAAACTTTTAAGTATGCGTATGGAAAACATCTACTGAGAGATGTCAGAACCTTAAATGAATCTCAGTGTATCGAAAAATTAGTCCTTCGTTTCCAGTTGGAAATACCTAGATTCAGCTAAAAGGTACAGTTGACCAAAGATAAAAAATCTTATTTTGATAAGCTCAACCATGAAGCTTACTGAAATAAGTTAAAAGGAAACTATGATACTCTTAACTATTTTCATAAGCTCAGATAAGATTTCCCTAAGTTCTTCAAAGCAATACATGTTCTTTTTGGTTGTCCTTGTGTTTTACAGCCAGAACTTATTGTATTTTAAGATATGAATGTGGTTATGCGTAGAAGTAACTCTTACGTATTTTCATGAGAAGTGTTTTTATACACAGGCATTCGTATATCGCACAGTCAACAAGTAATGCTTTAAATATTAGACTCCCTTACTTTAAAGTCGGGGAGGGAGAATCAATGCATATGATTACTGATAACTGTGTCATAAGAAATGCTAGTGGCGCTCTCTCCCCATGCACCCCAGTGAAATTCATGCGGGATCAATGAAATGTTGAAAAGTGTGCATTTAGCATTCTTCTTGTGTTATTTATTATTCCAGTATCCCACATTTAGTTGCATCCATGACACATAACTCACATTCGCATCTACACAGTAGTCAGCTAGTCACACCCAGTTCTATCCCTTCGTGCGGTAATTCATTGTCTCTGTGACATGATGATCAGGTGATATGATAGGATTCCTTTCCTGTTGGATTTGCTTTATTTGCTCTGTTAAATTTTGAGTAGGCTGCTTTCTCAATGTCAGGCACGAATAGTAACTTACCCCATGTTTGGTGATTTTGTCTTCGTTTATTAATTTGCTTTTGTTTCCTTTATTGAACGTTGTTTCAAATTCATTAAACTCAATACATTTTAGGGTGGCTTCATGTTATGCTACCTGAGACTAGTTCTTTCTTAAACATCTTTTTCAGAGAGATACAACTGGTCTGAGTTCTGAAAATACGGAGTTGAAGCTTAGGTTACAAGCCATGGAACAACAAGCTAAGTTGTGTGATGGTACGTTTCTTCCATAGGAAAGCTGTCCTGTTTCCACTTGCTACTCGCTAGTTACACGTTTATATTTGAAATGTGTTACATATATCTTGGTTATCTTTGATATACCACTATTAGTGTTTCTGTTATGTTAAACGTTCAGCTAATGTATTGTTATTTATAAATAATATTCACGACTTCAACCCCTGCCTCCAAAAATTGTAAAATGCACAGCTCTAAATGAAGCACTGAAGAAAGAAGTCGGTAGGCTGCGGATTGCAACAGGAGAGATAGCTATGCCCGCTGATAACTATGGCTTGGGAATGCATCAGCTTACATATTCTCAAGGACCGTTCTTCTCACATCATTCACAACAAGGGCAGACTGCATTTCAGGCCACGCAAATGCCGCAGATGCATTCACTCTCATCTAATGTGGCTACTTCCAATGAGCCTCTGTTTGATCTAGACATTCCCTATGATATGTCCGAAATGTTGTCGAATGAATCTATCGGGCAGTTTCAGGGGCTGGACATAGGCAACGGGGTTTCTCAGGTTCTGATGCCAGATTATTCCTCCAATTTCTGTTAATAAAAATCAGCAATGCCTTTTGGTTCAAAATTGACTGACCAACATGTCACCAGCCTTTTTATTGGAGTGGTCATAGACTGGCTTGAGTGGGATCTAAAGGTATTAATTTATTTTCCTTTTAATTTTTAATTTTTTATTTATTATGTGTTTGGGTTAGTTTATCTTCAAAAATAATCACCCTAGAATGAAAAACGTAATTGTTTTCTAAAGTAAGTTAAAACAATAAATATCAGTGTTGCCTCCCCATTCCAATTAGGCTCAATTTATAGAGATCAAAATTCTGACCTTTTGTTTTCAAGTTATATGGTTCATTTTAGTCTCTTTTTTTTACATTAATTTGTTTATGGGAAAATTTGTATTTACTTGCACCTTCCTGACAACAAACTTCTGTGTGTACACGTTTTTGCGCATAGCAGAGAGTGGGTGTTTGTGAGAGTTTTCATTTTCTACCATGTTGCAGAAAGAACCATTTGTCATAAATTTTAATTGGGACTATTCATACATACGGACATGGTATGCCTTGGATGGACCATCTTGTTTATATTTTTGTGGAAACATAAGTTAGACATGTTTTGTTGGTT