Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09657 LG2 32978895 32983841 calcium-dependent protein kinase SK5
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 32978902 3_prime_UTR_variant
T/A 32978904 3_prime_UTR_variant
G/A 32979133 synonymous_variant p.Gly469Gly
T/A 32979674 synonymous_variant p.Thr352Thr
A/T 32979678 missense_variant p.Ile351Lys
T/C 32979679 missense_variant p.Ile351Val
C/T 32979818 downstream_gene_variant
A/T 32980043 downstream_gene_variant
T/A 32980235 downstream_gene_variant
T/A 32980449 downstream_gene_variant
G/A 32980640 downstream_gene_variant
A/C 32980645 downstream_gene_variant
C/A 32980722 downstream_gene_variant
G/A 32980879 downstream_gene_variant
A/T 32980960 downstream_gene_variant
A/T 32981729 splice_region_variant&intron_variant
C/T 32981730 splice_region_variant&intron_variant
C/G 32981813 downstream_gene_variant
G/A 32981942 missense_variant p.Ser251Phe
T/A 32982433 downstream_gene_variant
T/A 32982443 downstream_gene_variant
T/A 32982510 downstream_gene_variant
T/A 32982566 downstream_gene_variant
C/A 32982573 downstream_gene_variant
T/G 32982595 downstream_gene_variant
G/A 32982853 downstream_gene_variant
C/G 32982892 downstream_gene_variant
A/*,T 32982897 downstream_gene_variant
A/T 32982906 downstream_gene_variant
G/T 32983102 downstream_gene_variant
G/A 32983311 synonymous_variant p.Ala131Ala
T/A 32983336 missense_variant p.Lys123Met
C/T 32983527 synonymous_variant p.Lys59Lys
C/A 32983817 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09657.1
MSKSQAGSGGGAPKTAWVLPYRTENLREVYTLGRKLGQGQFGTTFLCTHNATGRTFACKSIPKRKLLCKEDYDDVWREIQIMHHLSEHPNVVRIHGTYEDTSSVHLVMELCEGGELFDRIVQKGHYSERQAANLIKTILEVVEACHSLGVMHRDLKPENFLFDTVEEDAKLKTTDFGLSVFYKPGETFCDVVGSPYYVAPEVLRKHYGPESDVWSAGVILYILLSGVPPFWAETEQGIFRQILLGRLDFQSEPWPSISDSAKDLIRKMLDRNPKTRLTAHKVLCHPWIVDDNLAPDKPLDSAVLSRLKQFSAMNKLKKMALRVIAERLSEEEIGGLKELFKMIDADNSGTITFDELKEGLKRVGSDLMESEIKDLMDAADIDNSGTLDYGEFIAATVHLNKLEREENLVSAFSYFDKDGSGYITIDEIQQACKDFGLEDVHIDEIVKEIDQDNDGQIDYGEFAAMMRKGNGGIGRRTMRSTLNFRDALGIIGHGSDD*


CDS Sequence:
>Vu_09657.1
ATGTCGAAGTCTCAGGCGGGCAGTGGCGGGGGCGCACCGAAGACTGCGTGGGTGCTGCCGTACCGAACAGAGAACCTGAGGGAGGTGTACACACTGGGGCGGAAGCTGGGTCAGGGGCAATTCGGCACGACCTTTCTCTGCACGCACAACGCCACTGGTCGCACCTTCGCCTGCAAGTCAATCCCCAAGCGGAAGCTTCTGTGCAAGGAGGACTACGACGACGTTTGGAGGGAGATTCAGATAATGCACCATCTCTCCGAACACCCTAACGTGGTGAGGATCCACGGCACCTACGAGGACACCTCCTCCGTCCACCTCGTCATGGAGCTCTGCGAGGGAGGCGAGCTCTTCGACAGGATCGTTCAGAAGGGCCACTACAGTGAGCGCCAGGCCGCCAACCTCATCAAGACCATTCTTGAGGTTGTCGAGGCTTGTCACTCCCTTGGAGTCATGCACAGGGACCTCAAGCCCGAGAACTTTCTCTTCGACACTGTTGAGGAAGATGCCAAGCTTAAAACCACCGATTTTGGCCTCTCTGTCTTTTATAAGCCAGGTGAGACCTTCTGTGACGTTGTTGGAAGCCCGTACTATGTTGCCCCAGAGGTGCTGCGTAAGCATTATGGACCTGAATCAGATGTTTGGAGTGCTGGTGTTATTTTGTACATCTTATTAAGTGGGGTGCCACCATTTTGGGCTGAAACTGAGCAGGGGATTTTCCGACAGATTTTACTAGGAAGACTTGATTTCCAGTCCGAGCCATGGCCCAGCATTTCAGACAGTGCCAAGGATCTTATTCGAAAAATGCTTGATCGGAATCCAAAAACAAGGCTTACAGCTCACAAAGTACTCTGTCACCCATGGATTGTTGATGACAACCTTGCACCAGATAAACCTCTTGATTCTGCTGTTTTATCACGCCTAAAGCAGTTCTCTGCAATGAACAAACTTAAAAAGATGGCTTTACGTGTTATTGCGGAGAGGCTCTCTGAGGAAGAAATTGGTGGTCTGAAGGAGTTATTTAAGATGATCGATGCAGATAATAGTGGAACTATAACATTTGATGAGCTAAAAGAAGGGTTAAAGCGGGTGGGATCTGATCTAATGGAGTCTGAAATCAAGGATCTAATGGATGCAGCAGATATTGATAACAGTGGGACACTTGACTATGGTGAATTCATTGCTGCTACGGTTCACTTGAATAAGTTGGAGAGGGAGGAAAATCTGGTGTCAGCTTTCTCCTATTTTGACAAAGATGGAAGTGGTTACATAACCATTGATGAGATACAACAGGCTTGTAAGGATTTCGGTTTGGAGGATGTCCATATTGATGAAATTGTCAAAGAAATTGATCAAGACAACGATGGACAGATAGATTATGGGGAATTTGCTGCCATGATGAGAAAGGGCAATGGAGGAATCGGCAGGCGAACCATGAGGAGCACCCTCAACTTCAGAGATGCTCTGGGAATTATAGGACATGGGTCTGATGATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_09657::LG2:32983841-32985841(-)
ACATGTAACCACTTTATTAAATGTTTAAATATTACACATTTTTTTACTTAATCTCCATTTTATTCTTAAATAAATAAATCATAATAAAATAAAGTAAGAGATCCATGCTATCTAACAGAACAAACAAGAAGACAAAAAATGTATTAGTAAAAGAAGATTAACCAAAAAGTATAAGATAACATTACTTTTTATAAAAAGACATAAAAGTTATAATTGTAAAATAAATAATTTAAAATACACCGACTTGTAATTTAGACTTTCGTCTTCTTTCAGTTAGCATGTGACCATTACATATTGCATGTAATTTCACAATCTTTGGACTGTTTTTTTTCCTCAAATTTTGAATTTTATTATCTTTTATACATGACATATTTTTAAATTTTATCACATGAACCCTTTTCATGTTTTTAGATTTCAAACATTCATACATATTAACTAATTTGAAATTGTATAAAAATATATCACTATGAAAATTTTTCCTGTTTTAATACTTGAACAGTATGAGATAAATCAATATCAACTTCAAGATCAAAAATATTTTATATTATAATATAAACGAGTTGAGTCTTAGGGAAATATTGCCAATGGAAAAAACAAAATTAGAAAAAGAAATTGTAATTAATTTTTAGCAATAAGTGTCATGTATTCTCATTGAAATAATAGAAAATAAAGTTTGATTGTAAATTATTTGGTCAAAGAGAAGAAAAATGTAATATTTATAATGGCTCAATCAATTTTACATTACATTAATGAAAACACATACTATGTATTTAATTTTTTTATTATAAATAATTAATTTAGTTTTAGAAAATAATTAAATTTAAATAAATAATTACATAAAAGAATAAAATAAAAATTTTAATTTAAAAAGGTTTAAATTGTTTACTTAAAGATAAAAAGAATAAGATAATTATTTTAATTTTAAAAACAATTACTTAAGAAAGTAAAATTAAAAAAAAAACTGTGTACACCAGATAAGTATATTAACCAGACTTCTTTTTACATAATCTTATTTCAGTTTAAAAGTATTAGAATGAAAATAAATATTCTCATGTGTTTTTTGAAATATATTTCCAGATATATGTATTACCAGAAAAAAGAAGTACATTAATAAATAAGGAGTGAATTTCCTATCTTATATTTCAAGAACATTGTCTATGACAATAACTTATTTTAATTGCTTTTACTTTTAATTAGTTAAGTTTTATATATTTTAAGAAATCAGTAAAATACTTATCCAACAATTGAAAGTATTATTTCAAAATATAATACTGAGAAAGCAAAATTATACCTAATTTTATTTTGCTGAAATGTAACTAGTTAATTGTAGTGTGCCCGGAAGTCTGTAGTAATTTCTTAACAACTTAGTACATGAATTACTCTCAAACATAATGTTTTTTTGGAGAGTTGACATGATATTCTGACGGACTTTAAGTATTTATTAAAATCAACAAACTAAATAAATATAATAAATAAATATAAGTTAAGTATATTTTTAATTTTTAAATTAATAAAAAATTAAAATTTATTTTATTTTAAATTTTAATATAATTTAAGTTTTAAATTTTAAAAATGAATGAATATAAATCTTTTAATTTAACTGCTTAAAAAAATTATATATTAATATTTAAACTGTTTATATTATTTAGCATAATTTATGCCAATAAAAAATACAATTTAATACATTAAAAAATTTAACGTTTTTAAATTAAGAAAACTATATCTATCATTAAATTTTAAAAAAAGATATATCAAAATTTAAAATAAAAAATAATTCTAATTTCATGTATAAATTAAAAAAATTAAAAACATATTTAATTCATAAATAAATAATAAAAATTTCTTGAAAAAATAGTTAACAACTGTTCTAGAATAAAAACAGTTTTTCTTACAATTATTTATAATTTAAATTTAAATTTAATTTTGCAAGAGCTTAAAGTTGGTGAGTTGTGACATCGAAAGGTAGTATAAAAAGAGGAGAGTGGCGTGTCTTAGGTGGT


Gene Sequence:
>Vu_09657(-)
AAGACTTAAAGTCTCTCACACAAAGCACTTTGTTTATTTATTTATTTATTTGTTTTCAATTTTTACGGGGTCTTCCTTTCTTTGCTGGTTTCCCTTTATCTGACTCAGAGCCGCATAGAGAAAGAGAGAGTGTTGGCAATGTCGAAGTCTCAGGCGGGCAGTGGCGGGGGCGCACCGAAGACTGCGTGGGTGCTGCCGTACCGAACAGAGAACCTGAGGGAGGTGTACACACTGGGGCGGAAGCTGGGTCAGGGGCAATTCGGCACGACCTTTCTCTGCACGCACAACGCCACTGGTCGCACCTTCGCCTGCAAGTCAATCCCCAAGCGGAAGCTTCTGTGCAAGGAGGACTACGACGACGTTTGGAGGGAGATTCAGATAATGCACCATCTCTCCGAACACCCTAACGTGGTGAGGATCCACGGCACCTACGAGGACACCTCCTCCGTCCACCTCGTCATGGAGCTCTGCGAGGGAGGCGAGCTCTTCGACAGGATCGTTCAGAAGGGCCACTACAGTGAGCGCCAGGCCGCCAACCTCATCAAGACCATTCTTGAGGTTGTCGAGGCTTGTCACTCCCTTGGAGTCATGCACAGGGACCTCAAGCCCGAGAACTTTCTCTTCGACACTGTTGAGGAAGATGCCAAGCTTAAAACCACCGATTTTGGCCTCTCTGTCTTTTATAAGCCAGGTTTGCTTCCGATCTATTTCATTCATCATTCTCCTGTCGTCCTCACTGCGATCTGACTATAGTTCTGAATGCGATCGATTCGAGGTTAGTTATTGCTGGTGGGGTCCTGTTTAAGGATGAATGTGAATGCGTTCATTTTGATCAGGTACTGAAATCGTTTTGCGCGTTAACAGTAGCTCCGCTTCTAACCTCAATCAGCACTTTAACAAAAATTCTTGCTTCTGGTTTTCATTATTTTTTCTTATCTTTCCCTTGATTGATGCTTAGTCATTGTTTGTTTAATTTGGATAGATCGATCTATTTCCGCCGGCTTGTTGCTGCTTCGAAGCAGAAATACAGAATCATATTTTAGAATGCTTCATAGTAGCTGATTCTGGCTTGGTGTTTTCTTAGTGCTTTTATATGAAAAATATGCTATGAAGTCGAGCCTCTTGGCCTAGTGGTTGCTGAGATTTTCATTTAATGGTTTTATAAGCCTATTTTTTGTTACTCCTTTTCTGTAAAAGCAGCAGTTGTTGGTTTGAGCAGCAATTAATGAAGTTTCACTAATTTTACAAATCTGATTCCAAGTGGATGAGTTGACAAATTCACGTCATCTTAGATACAGATATAGTTTAATACCAAAATACAAAATGTGATGAATTCTATTTTTGTCTCGTAGATTGAATTGAAATCACGATCTTCATGTTTCGGGACATATATAAAAAAGTGATTTTTATTTTTATGGTTTTTATTGGGTTCAACGGAGATGAAGCCAGAAAGGCAATAGGGTGTATATAACGAACCAGCAATCCATAAATGGTTTAGTTATTAGTTGATACATATGACTGATGTATGATTTAATACGGTATCTATAACACAATCACTACCAGATAATCTGGAATCCCTTCCATATTGTGGATGGTTAACACAATGATGTACTTTTCAGGTGAGACCTTCTGTGACGTTGTTGGAAGCCCGTACTATGTTGCCCCAGAGGTGCTGCGTAAGCATTATGGACCTGAATCAGATGTTTGGAGTGCTGGTGTTATTTTGTACATCTTATTAAGTGGGGTGCCACCATTTTGGGCTGGTAGTTACATGTCACCTTCACCTTAAATTATCAATTGTTTTCATCGTTACTGATACTTCTCTGCCATTTTTGTCATTTTCAGAAACTGAGCAGGGGATTTTCCGACAGATTTTACTAGGAAGACTTGATTTCCAGTCCGAGCCATGGCCCAGCATTTCAGACAGTGCCAAGGATCTTATTCGAAAAATGCTTGATCGGAATCCAAAAACAAGGCTTACAGCTCACAAAGTACTCTGTGAGTCTATTCAACATCTTTTATATTGAGGAAGCAACCAGCATGATTTTTATGAATATTTGCACAATTTTGGGAAAGGAGTTCAAACTTGTAACACTTGTTGTGTGGTTTCTGTGTCAGGTCACCCATGGATTGTTGATGACAACCTTGCACCAGATAAACCTCTTGATTCTGCTGTTTTATCACGCCTAAAGCAGTTCTCTGCAATGAACAAACTTAAAAAGATGGCTTTACGTGTAAGGCTGTAAACCATTTTAGTTGGGCGTAATGATTTCTGTGTGCTGAGTGCTGACCATTTAAAAACAATTTAATCTCTTATGAATACCCTGTTTTGTCTTCTTTTAGAATGGATTGTTAATTATATCAATTTTTGGTAGAAATTAGGTTAATTATAATTTCTTTTAACTTTTAATTTTAAAAAATCACTCGTTTAAGTTTTTAATTTACTACTTAAAATTCATAATATCATGACTCCTTGATCGTGGGAATGGATATTTTCATTTGCAATGTGAAGTATAATGAGATCTTGGCAGTGGACCATTTTATCATTGTTATGATTGAAGATGAATTTTACTAACGTATATTTCTAAATTGATTATATCAGTACTATGAGATTATAATATTATGAATAGTTAAAGATAGTGTAATACTTTTGGAGTTACTATAGTGTAATTTGATCATTTTCTACACGTGTAGATATATTTAGTAAGAGTGGTATTTTAATAAGAGTGAAAGAAATAAGTAAAGAGAAAAATACAATTTAATGTTATGTGATTACTTAGAAAAATGCTATGATTATTTTTATAATAAATAATTCTCATATGTTTTTTAATTTTGATAGTTTATAATATAACAATCAATAGTTATTTTTCGTTTTGTAATTTGAACTTCATTTTTTTATTCTTTTTGGTTCTGGGCTTTTGGTACAATAAGAGATATCTTATGCAAAGTAATGTAGTGCAGCCAGTGTCATAATAAGAACTTATTATTGTCTGTACATTATTTATCTTAATTTTTTTTTTGCACTTTATATTGTATGAGTTGTTATTATTTTATTTTTCGGTACAACATTGGTATAATAAATCTCTTTAATTTATACTTCTTTTTTATTTAGTCGGCTTGTTCGTCGAATGGAAAGAAGAATTCGATAGAAAAACATTTATAATATAAACATTTATAAACACTGGTATGAGTGTGTTTTTGCCTGCAGGAATGCCACCTGTTTCGATAGGCATTAGATTCTCTCAAAGAATCACTGGACATCTGTTTGAACCAAAAGTTTTTGAATCTTTATCCCCATAGGGAACATTACAAATTTTGAATTTGAAGAATTTTTTACAGTGAATAATATGATAAATGGCTTTTTATATGTCCACGTTGTACTGTTGTTAAAAACACATTAAATAAAGATTAACTCTTGCTCAGGCTCTTAACCAACCTTATAACCAAAGCAAGAACAAGGGCTTATACATACATTAGAACCAGGAACCGATATACTGGGTGGAGGCCATTGTCTTTTATCAGCAGCTGTCATCAGTTAGATGAATTTCATTGATATGAAGTCTGATTTTTTCTTTTATTTTCTGTTAGTTTTGGTTCTCTGTTATGAACTCCATTATCCTATACGTGTGTTCGATATAACCAAAGACATTCTCAACTTGACAGTTGTATTGTTTTTCATGCATTAACCTTAAAATTGGAAGATGTGGCTTGCAGGGTTTCAGTTCTGAAGGAACGTGACCTTGTTTTACATTTGGCATGATTATTATCCAAAACTGTTTCTTTACGTCCGTTTTTTTCTGATCTTTTTTTATCAATGTCAATATTTTATGTTGTGCTTTAGTTGAATTGTCATAAATAAACACAAATGAATTGCTGTCACTTTCTTCCCAGCCTTGGGCCATAGTTGTGTTGCTTAGTTTGAGTATTAAATCTTTTTCAAGTTTTTCAGCTTTGACTTAATGGCTTGATTTTCTAATTCTATCAGAAACTCTTCTTGAATGGGGAGTTGAAATCCATTTCCTAGTATTCCATGTCAAATCCTAATACCGTGATATTTACAATTTTGTATGCTTTAAAGGTTATTGCGGAGAGGCTCTCTGAGGAAGAAATTGGTGGTCTGAAGGAGTTATTTAAGATGATCGATGCAGATAATAGTGGAACTATAACATTTGATGAGCTAAAAGAAGGGTTAAAGCGGGTGGGATCTGATCTAATGGAGTCTGAAATCAAGGATCTAATGGATGCAGTAAGTCCATTTGCTTTTGTTATCTGTGCTGTTTTGCCTTGAATGTTTAACTGTTGAACGAGATGTATGATCTTGCACGTTACAGGCAGATATTGATAACAGTGGGACACTTGACTATGGTGAATTCATTGCTGCTACGGTTCACTTGAATAAGTTGGAGAGGGAGGAAAATCTGGTGTCAGCTTTCTCCTATTTTGACAAAGATGGAAGTGGTTACATAACCATTGATGAGATACAACAGGCTTGTAAGGATTTCGGTTTGGAGGATGTCCATATTGATGAAATTGTCAAAGAAATTGATCAAGACAACGTAAGTATACGTTTTTTTTTCCTGCTATCTAGCGGTTGTTTGTAGTTGTCATAAGTTTCTTCAACACTACCTGTTCTTTGGGTTAATGGAAGATATGTTGTGCAGGATGGACAGATAGATTATGGGGAATTTGCTGCCATGATGAGAAAGGGCAATGGAGGAATCGGCAGGCGAACCATGAGGAGCACCCTCAACTTCAGAGATGCTCTGGGAATTATAGGACATGGGTCTGATGATTAAATAATTGTACCTTAAAATAATTATTTGGTGATGAAATTTTGAACAAGAAAAACTTTGGTGAGTATGGACAACTTGAGTAGCCTGACCAAAACTTGCATTTATGAATAGACCCATGGTTAAAAAATAACCTTCGGTACATGTATAGTTTTAG