Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09514 LG2 24759348 24763930 probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 24759517 missense_variant p.Asp57Val
C/T 24759692 synonymous_variant p.Asn115Asn
C/A 24759701 synonymous_variant p.Thr118Thr
A/C 24760437 intron_variant
A/G 24761184 intron_variant
A/T 24761243 intron_variant
C/T 24761250 intron_variant
A/T 24761622 intron_variant
A/T 24761657 intron_variant
A/T 24761835 intron_variant
T/A 24761943 intron_variant
T/G 24762320 intron_variant
G/A 24762405 intron_variant
T/C 24762430 intron_variant
T/A 24762649 intron_variant
G/A 24763603 synonymous_variant p.Lys411Lys
A/T 24763654 missense_variant p.Arg428Ser
T/A 24763785 missense_variant p.Leu472His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09514.1
MGCVCGKFSPPSETQRRNQPVKRVLSRKGSRPRSSNVGARVKKDTQRQRVRVIVNKDSAGDAVRGGGENEKPVPKEEKNKVREDAAKESKSSKDLDSNESKNEFVDGWPKWLLDNIPTNVLAKLVPKSADSYEKLAKIGRGTYSNVYKAREKGTGKIVALKKVRFDTSDSESIKFMAREIMMLQKLDHPNVIKLKGLATSRMQYSLYLVFDFMQSDLTRIISRPGETLTEPQIKCYMQQLLCGLQHCHERGIMHRDIKASNLLIDRKGVLKIADFGLATSIEYGKPLTNRVVTLWYRAPELLLGSTDYGYSIDLWSAGCLLAEMFVGRPIMPGRTEFFRCSPLACDPSALPVVIKDEDERLQTKRSKRHRVSKRGQPSQTSKSEAESRKTQSPEQPRQDTQSTKQKNVEQQKQSQETGHSASSTSSGSRLFTNEGSTNTSLSPTFLSSGSVRKSPKTEGSPNALKNINHYNALLQASMIDIINRNEGTEVPQLPKSFSHLDYRLGPDKLSNLYTSSNKYI*


CDS Sequence:
>Vu_09514.1
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Promoter Sequence:
>Vu_09514::LG2:24757348-24759348(+)
GCTGAGGGGTGCAAAGCCCGCTGAGGGGAGGAAAACAACTCACGCACTTACCGCTGAGCGGTAGTTTACCGCTGAGCGGCACTATTTTGGGCTTGGGCCTAATTTTCTGTATATTTTAGAATAGTATATAAGCTTTAGGACGTCCTAGGGTTTGTATCTTTGGCAGAGACGAAGCAAACACTCTCTTTTCCACCCCTTGAAGGAAGATCTTGGATGCTCAGGCTACCTTCTCCTCTTTCTAGGGTTCTATCTTTCATTCTTTCATTATTATTCATCTAGTTTCACCATGAATATGGTGAACTAAACCTTGTATTGTTGTTGGGGAATCAATGTAGTCTTGTGAAACTCTCATATATGGAATTTGATTTAATGTCTTATATTAAGATATATGCTTTCTTTCATCTTTAGCTAGGGTTTTTCCTCTTTGCTTATTGCTTGCTTTGTTTAACTCATTCATTGCCATGATTATTGATTTTGTCGATACGGGAACGTACGGGGAAGTCTAGATCCGGGGAATTTCTCCCAATAGCATATTGGTTGCCTTTAAGCTCCTGCACTTTAAGAACTAATTACTAGGAATGCTAGAAATTGTATGAACTCGTAATTAAGGATAGGCCTTCTTGCAAGGTGGTTTAAAGAGTCCTTTGGGAAAACGATACTTGGTCTTACCTTGTTTTATTACTTGATACGATTCGATCACACTTGCCGATTGTTAAACAAGTTTGTGGCGCCGTTTTTCGGTGTTCATAAATTTGTCATCACATAGTTAACCTTAACACTAAATTAAATAAATCTTAAAATAAAAAAGTATTAATGTTGACTTGATTGACAATAAAATGCTTCAATTTAAAAATTAGTAATGAATAGAATTGTTTAGCTTATATACTATTTAAAAACCTTCAAAAATAAAATTAATGAATTAGTGTCCATGATTTTATTTTATAGTCGTATGCACGTATAAGATAAATATGACCCTACTACCTATTTAGTGTTTATTTTCAATTATTAACATTAACTTTTGACCGACATTAAATATGTTTTTTTGTGATTTGCTTGATTATTCTCGTCGAAAAACACTTGTAGAAGGATTGAAAACCATTTCAACCAAAAAGTAAGAACAACAAAAATAAAATACTAACCAAACAATTTATGAGATAAACGTTGATTTTGAATTTTGTTTAACATGTAAAAGTAACATAAACCAAATCTAATTAATTGGATTTGATTTAAACTTAAAAAACATAGAGATTTAAATTAAAAATGAATCCACTAAAATTAATTTAAATAATCTGTCACTATAAAGTATCTATTGGAGTGTAATTTCAAGTGCTTTTAATTATTTTATTTTTTTATATGTCAAATAAGTAGTCGATTATGTCTATTTTTAATCAGATCTTTATTTCTTTATATTTTTTTCTTATATTATAGATAGAAAAACATTTTCATAATTTTATAAATTAACTTTGATGGAAGGTTTTGTTTTCTTGATAATTGGAAGTCTGCGTCAACTAAAAATAAAATAAAATTATAATATATAACATAAAGTGAAATGTAAACCTCAATTTATATTGTGGTTGAATTAGGCTTAAATTCTTTCCCTAGTTGTATTTTTGTTTTATCCATATGGAATACGTTAACGAATAATAGGAGATGTGTAGCATAACGCCAGTGTTGTGAGGAAACAATTTCCGTGGTGCCGGTTCGTTAGTACCAACAATAGTTGTGGGTCTCATGAATAATCCAATCATTAAATTTCAAGTGTCTCGCCCAATCACCCTTGATGGACATTGCATAGTTCTCTTCACCACCCTTTCACACTGTTCTTGGAGATGCCAGCAGAGCTTAGACTCAACCTTCCCTTTAGCCTCTTCTTCTTAATCCTTTGCTGCTGTACTCATCACAAATCACACACCCCCTCTCTCTTTCTTCCGCCCTATTAATATCACTTTAGTTTCATGATATACCAGTATCACCCACTTCCTATCTGTTCCTAGCTTTCA


Gene Sequence:
>Vu_09514(+)
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