Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09470 LG2 23947949 23950599 PREDICTED: transcription factor SCREAM2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 23948125 synonymous_variant p.Thr44Thr
A/G 23948131 synonymous_variant p.Ala46Ala
C/G 23948137 synonymous_variant p.Ser48Ser
T/A 23948165 missense_variant p.Ser58Thr
T/C 23948302 synonymous_variant p.Asp103Asp
T/C 23948524 synonymous_variant p.Asp177Asp
A/G,* 23948537 missense_variant p.Thr182Ala
T/C 23948636 missense_variant p.Ser215Pro
C/T 23948649 missense_variant p.Ser219Phe
G/T 23948755 missense_variant p.Glu254Asp
G/T 23948917 missense_variant p.Lys308Asn
G/A 23949007 synonymous_variant p.Lys338Lys
A/T 23949014 stop_gained&splice_region_variant p.Lys341*
A/C 23949041 downstream_gene_variant
T/C 23949093 downstream_gene_variant
G/T 23949451 downstream_gene_variant
G/T 23949475 downstream_gene_variant
G/A 23949548 downstream_gene_variant
T/A 23949728 missense_variant p.Met467Lys
C/T 23949732 synonymous_variant p.Asp468Asp
C/T 23949989 downstream_gene_variant
T/G 23950063 downstream_gene_variant
T/G 23950164 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09470.1
MMSRMNTVGWMEEREDDDNSASWPRNKPTNTIIVTDTTPTTKPTTAASAAAFVENNTSRDDLASLCAFKPMLELDDEWYISNHHHHHNSHHHQDMTFSPTFPDSDNLLLPAVDSSSSCSPSSSVFTNLDPSSSHLHYFLPPKPPTLSSLLNPFDIPFLDPQASSSFPLLPSAHFPSDTPSQTATATAFAGFHSLEDGSSKPLFHQRSKILRPLESLPPSGAPPTLFQKRAALRKNMSAGEGSEKKRKEREEVVEDVSFDGSGLNYDSDDLTEINNNSGRVDEGSAKNGGNSSNANSSVTGLDQKGKKKGMPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIEYLKELLQRINDLHNELESTPPGSSLTPSSNFHPLTPTPPTLPSRIKEELCPSSLPSPNAQPARVEVRLREGRAVNIHMFCARKPGLLLSTMRAMDNLGLDIQQAVISCFNGFAMDIFRAEQCKEGQDVHPEQIKAVLLDSAGYSGMM*


CDS Sequence:
>Vu_09470.1
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Promoter Sequence:
>Vu_09470::LG2:23945949-23947949(+)
AAGAAATAATAAAGTTTCATCTTTCCTTCCCTACACTGTACCCACACAACTCCCTGCACCTTATTTAAGATTCTTGTCCCACTCCTTTTTCTTCTAACACATACCATTTTAATTCATTTTCTAGCATTCAATTCTTCCCCAGTTTTACACATGGATGATGTAAATACATTTACAACCTGTGGACCCAATTCCTATTCCTATTTTCTTCCCCAAATATTGCATCATCTTTCAACACCACACTCTCCTATGTAGATCAACAATCATTTCTATGCAAAACTTCACACCATCGTCAGGATAATTCCCCCATATATAAAATTCACTTTTAAAGGAAACTTAATCATTTATTGTTGGAGTTTGAGCCAACTATTAGTTAATATTCGGATATTGCATTCTAATATTTTGAAAAAAAAGAGAGAGAGGTGTTGTAGTTGCGATTGGGTAGTAACTGCGGTGACCAGAAAAAGCTTCACGAGATACTTGGGATTCTATTACATATTTTCAGCTTCCCTCTCTTAATTCTCATTACTCTTTCGTTATTGGATCTCTCCACTTTTCTACCATCTTCCTAATATTGCATCACAAATTCAAAGGCCACTGCTTTTAATTGTCAAAATCACAATTATCAATTCTATCTCAAACTCTTCTTCTCCACCTCCAACTTTTGCAATTTCTTACAAACCTTATCCACCTATTTTCTAATTTATTTACAACTAATTTGGTTAATTAGTTTGATTGCACTTCTAATTTCATTTTACCTATTAAACTTATTGTTGGCTTTTCATAGGTCATAGCCAATGCATTTATGATGTGAATCAGACACAACACACTTATCCAAATTCCATTTATGGTAACATTAAGTTAAGTACATGCATTTGAAGGAGCTTAATTAGCAACTTTTGATGCCAAAACAAAATATACATTGAAAAAGAAAGGAAACAAATTAAGCATACTACTATAGTGTTAGCTTGGAGGATTGGAGAAGTTGATTATTTTGTCCCCTAGTACCATAAGAGTTTGCTTTTGCATGCAATGACAAAACTCTTAAATTCTCGCAGTTACTCTCATCCAAACCAAGAATGCTGCTGTATAGACAAAAGCCTAGGTTTCGCACCTTCTAATCAATTCAGATTGCTCCAGAATTCTTCGTTTTTAGTTGTGTTTTGTGTTAAATAATGTTCACGTGCTCGCAGTCATGTCACACGAGCGAATAACATTATAAGTTTTTTAATGTCATATGTTTAGTGTAGACAGAGATTTTGCATTAGAGTTTCTTCAAGGTATCTGCATAATAATGGCTAAAAGTAATTCAAATGATGAGGGTAAACCACTCTTCCAAATTTATCAAACATGTTCCAACATTACTAACAATCACTTTTAATGCCCATAAGTCAGAATTAAAATTTGTATAAACTAGTTATAAAAAATATTTTAATTTTTTCAAATTTGAAATTGAGGTTAAAGTGATTTTTAGCGTAACCGAATCATTCACGTTTAGTCTTTTATATTTTTCCAAATCAATTAATGTTTTAGACACTCTCTAATTAAATTCATCTAATAATTTTGATTTAAATAATGAATAAAAAGTAATAGTTTATTTAAAAACTGAAAAGATAAATTATATTATATTTGTTGAAAAAGAAAAAAATAAAATAGTGATTGAATGAGAGGAGTGGGGAAAAGAGTTAAAAATTGGTAAGTAAGATTAATGTATATAAATAATAGGAGGAAAGAGTGAGAGAGAGAGAGCTGGAGTTGGTTTCCACGTGGAGAAGGTGCAGAAGAGAAGGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGGAGAAAAAGAGGGTTAACGTATATGTGATGATTTGTTCGCAGAGCTTCTTCTGCTGAATGTAACGTTCTTTCTCTTAAGCGAGCTATCGCAATCTCTCTCTCCAATGCCCTTTTCCTTCTGCAACCTCTTCCTTTTTTTCTCCACTCTCTTCCTTTAACTCCCTCTGCTTCTTTCTCACCTCATTTTTCTCTC


Gene Sequence:
>Vu_09470(+)
CGCAAACGCCAACGACAACCTTCCTCCTCAACCACAAAACCACCCATGATGTCCAGAATGAACACCGTTGGATGGATGGAGGAACGTGAAGACGACGACAACTCTGCTTCTTGGCCAAGAAACAAGCCCACCAACACCATCATCGTCACCGACACAACGCCCACAACAAAGCCAACAACAGCAGCATCCGCAGCTGCTTTCGTAGAAAACAACACTTCCCGCGACGATTTAGCTTCTCTCTGCGCCTTCAAGCCCATGCTGGAGCTGGACGACGAATGGTACATCAGTAATCACCACCACCACCATAACAGCCACCACCACCAAGACATGACCTTCTCCCCCACCTTCCCCGATTCCGACAACCTCCTCCTCCCCGCCGTCGACTCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCTCCTCCTCCGTCTTTACCAACCTCGACCCTTCCTCCTCCCACCTTCACTACTTCCTCCCTCCCAAACCCCCCACTCTATCGTCCCTCCTCAACCCCTTCGACATCCCCTTTCTTGACCCTCAAGCTTCCTCATCCTTCCCGCTTCTTCCCTCCGCCCATTTCCCCTCCGATACGCCTTCTCAGACCGCCACCGCCACCGCCTTCGCCGGCTTCCACAGCCTCGAAGACGGGTCCTCCAAGCCTCTGTTTCACCAGCGCTCCAAGATTCTGCGGCCCCTGGAGTCCCTGCCCCCCTCCGGGGCGCCACCCACGCTCTTTCAGAAGAGGGCGGCGCTCAGGAAGAACATGTCTGCCGGTGAAGGGAGTGAGAAGAAGAGGAAGGAGAGGGAGGAGGTGGTGGAGGATGTGAGTTTTGATGGGTCTGGGTTGAACTATGATTCCGATGATTTGACTGAGATTAATAACAACAGTGGTAGGGTGGATGAGGGTAGTGCTAAGAACGGTGGGAACAGTTCCAATGCGAACAGCAGTGTCACTGGGTTGGATCAGAAAGGGAAGAAAAAGGGAATGCCTGCTAAGAATTTGATGGCAGAACGACGGCGCAGGAAGAAGCTCAATGATAGACTCTACATGCTTAGGTCCGTTGTTCCTAAGATTAGCAAAGTAAGTTTCGGTTCTTGTCTCTAAACCTTTGTGAAATTTTCAGTTGTAGTTGCTTTTGAGCTTAGTGAATGTTAATTGTTGTTGATTTTTGGTTTGGGATGGATCTGTGGGTTCTACTCTATGACATTGTGTTGCTTTGATAGATGGACAGGGCTTCAATTCTTGGGGATGCAATAGAGTATCTTAAGGAGCTTCTGCAAAGGATCAATGATCTTCATAACGAGTTGGAGTCTACACCACCTGGTTCTTCCCTCACTCCTTCCTCCAATTTCCATCCTTTGACGCCTACTCCTCCCACACTGCCCAGTCGTATCAAAGAAGAATTGTGCCCCAGCTCATTACCAAGCCCCAATGCTCAACCTGCTAGGGTAATCTTCTTTCTTCTCCATGCTTCAACTTCCCTTTTTATTCATATACTATAGATATGGCAAGAAGTTTATTCTGTATGTTATAATAACGTGGAAGGGAAGTTTTGCTTGTTATGTGGGTGGAGCATTTTGATTGCTGTTAGTATGGTTTTATAGAAGCTTTGCTTAATTCAGTGTTTCGATTATACATAGGTTGAGGTTCGGCTACGCGAAGGAAGGGCTGTTAACATCCACATGTTTTGTGCCCGCAAGCCTGGTCTGTTGCTCTCAACCATGAGGGCTATGGATAACCTTGGATTAGACATTCAGCAGGCTGTTATTAGCTGCTTCAATGGATTTGCTATGGACATTTTTCGAGCCGAGGTAAGAATTTTAGTTCATCATTTAAGGTCAATTCCTGTTATGAACTTTTAATAAATATCCATGCTACAATGACGAGTAAACAAACTGATACTTTGTATTTCTTTTATTTGGAAATACCCTAAACTTCAATTATGATAAGGTAACCTACCATGTTAACTGTCGAGATCCATTATAAAATGCTTGTGATATTTCCACACCCATTAACGATGGCTTCGGTGTTGGAATGATATTGTAGTTTCTGCATCTTAAGAACAATATTTGCTCTGTAGTTGTCTTTAAGGTTACAGCAACTGCTCAAATAAATGGTAATTCAAATAGCTTTGTTATCCAGATATTCTTCTTAATGCTATACGAATAAAGTAGTAAAGGAAACATAGATACATTTATTGACTTAAAAACATAAAAGGCAGTAATAGTTTTTTGCTTAGTAAATAGAATTATTTATATAGAAAGTTATGAATTCTATTAAAGTGATGGCTGTTGTCTAAAGGCTACCGAACCCTCTCTTTCAGCAATGCAAAGAAGGTCAGGATGTCCATCCGGAGCAGATCAAAGCAGTTCTCTTGGATTCAGCTGGCTACAGTGGCATGATGTAACTAGTTTTGGCATGGAACAAACTAGTGACTGCCATTTCTCTGTCAATTTGGCAAGTTAATCAGTTTTTACTTTGAATGAATGGCAAGTTTTTACTTTGTAATGACCAAAATTCAAGTGTACGATACTAGCTAGCTATGGTTTTAAGTTGAGGTAGAAAAAATTTTCACATGAATTTTACCCCCGCAGCGGCAGTTACTGCCTCGTACTTTTTCGCATGTTCGTGTCCAACCCAAAGTAGATGAGACTGAGTTCAAT