Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09424 LG2 22919519 22919857 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 22919551 stop_gained p.Gln103*
C/T 22919559 missense_variant p.Ser100Asn
T/A 22919576 synonymous_variant p.Ala94Ala
C/T 22919582 synonymous_variant p.Ala92Ala
G/A 22919586 missense_variant p.Ser91Phe
C/T 22919609 synonymous_variant p.Val83Val
C/T 22919611 missense_variant p.Val83Met
G/A 22919724 missense_variant p.Pro45Leu
T/C 22919755 missense_variant p.Arg35Gly
T/C 22919779 missense_variant p.Arg27Gly
G/A 22919780 synonymous_variant p.Phe26Phe
C/G 22919785 missense_variant p.Ala25Pro
A/T 22919789 synonymous_variant p.Val23Val
C/G 22919799 missense_variant p.Ser20Thr
A/G 22919842 missense_variant p.Tyr6His
T/C 22919854 missense_variant p.Arg2Gly
T/C 22919857 start_lost p.Met1?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09424.1
MRTMGYLAPELTRTGKPTTSSDVYAFRVLLEVVCRRRPIEVKALPEELVLVDWVWERWRMGAPLAVVDPRLGGAFDEVEVLVVIKVGLYCSAEAPEKRPSMRQVVRYLEREV*


CDS Sequence:
>Vu_09424.1
ATGAGAACGATGGGGTACCTTGCACCTGAACTCACACGAACGGGGAAACCCACCACCAGTTCTGATGTTTACGCTTTCAGAGTGTTGTTGGAGGTGGTGTGCAGGAGGAGGCCCATTGAGGTGAAGGCATTGCCGGAGGAGCTGGTGCTGGTGGACTGGGTCTGGGAGCGGTGGCGCATGGGGGCGCCGCTGGCGGTGGTGGACCCCAGGTTGGGTGGGGCGTTTGATGAGGTGGAAGTTTTGGTAGTGATTAAAGTGGGGTTGTACTGTTCCGCGGAGGCACCAGAGAAGAGGCCCAGCATGAGGCAGGTGGTGAGGTATTTGGAGAGGGAGGTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_09424::LG2:22919857-22921857(-)
TTCTTATTTTGAGGTGAATGTGGTTACTGTGTTGTCCAATTCTTTATCTTGTGGATGTTTCTCCAAAAAATTACTTATATAATAAATGTTTTGATAGGTTATGAAAGGATTCTTCATATTTTATATGGATTATTCATATTTTGTATTAAAATTTTATTTTAATAAAACAATAAAAGTGGATTTCACTTTATGAAAATATAAAATTAAAATGTATGATGAGGTGAGTAAATATTTGTCTAAAATTAAAAAATATATATATATCAATGCTATTTTATTACAGATATAAAAAAAATATTTATATCAATATTAAAACTTAGAGAGAGCTGTAAGCCTTATTTGTGATAAGTACCTTTCTCCTAATTTAAACCACTTCCTTAATAAACAAGCATAATATTTGTGTGCATCAAAATTGATTTGAAATACTACAAAGTACAGTTCATTAATGAGGAATAGCTAAAATAACTGTTATTTAATATCAGCCCAATTAATTATTACAATTTTATATTCAGTTATTCACACAAACATAATAAATGAAGGAAGTAAAAAGCTGAGTGTGTCCAAAATTGAGAAAAAGGTTTCCTCAAGTAAATAAAAATGTTAATTATGATGGTAACCAAAAATTAAATTAAATAAATGTGATGAGATTCAAGAATTTGATAATGGCTAACACGTTATAGTATTTACTAAAAATTACAAATGGTATGAAAAAATATTTAAATAAATTTAGAGTTTTGTGTGCTTTAACCTCGAGCTAATCAAATGTAAATGTAAATTGTTCTTTCTTTACTGTCCATGTTTATAGTTATTTAATTTTCGAGTAAATTGAGAATGTTTAGGATAAAAAGTACAATCTAGAAAATTAAGACTATGTAAGATCTCAAAGCTATCAATTAACTTAGTGGAGAAATATTTGATAAAGTCGACAACTATTAGAAAAAAATAAAATTTTCAAAGTATACTCTTGTACATGATATTTATGTAATTAATCAAATAATAATAAATATTTAAAATTAATTATCATATTTAAACAACAACTAATTTATAATTAATGACAATTTGAGTAATTCTTATTATTTATGCAAGCAAATATTCATTAAAAAAATATAAGTAGATATCCACTCCAATATATTCACAAGATACACTACTTATTTATTATTTGTTGAATACACAAAACCCGATGAAGACAATCATTAAGGTTGTGTTAAGGGTGTGTTCAGGTGATTTGTGAGAGATGATTTGGGTGAGAGTAATTGAATGGATTTATGGAGATTTGAGAGTAATATTTTTGTTGTTTTTTTGAGTAGATTTGGAGGTAATTGAGAGTGGATTTGAAAGTAAAGTTTGCGAGAATTAGTGTAGGATTTGATTGATGTGACAAATTTAAAAATTTTGTTTAATTGGTAAAAATTAAAAATTACCAAAATGCCCTTAGTTATTAAAGTAATATAAAATGATTATTGTTAATGTTATATTTATTTGTAAAAATGTTTATAAAGAGTAAAAAATTAAAAATAATTATTAAAATTAATTTTTAAAATATAAAAAATTTATAATTTAGAGATTTTTCATAAAAATGTTTTAATTTTTCATATTAATCCTCGATAATTTGGAGGGAAGAAATCTTCTTATATGAAAATGTTATATTTCAAACCTATTCCTATAATTATTACTATTTTTATTTCTGAATACTGCATATTGATGTTTACTATGTTTGGTTTAATACCCAGTTTTGTCCCCAGTTTGGTTCGGAAATCTCAATTTAGTCCCTCGTTAGAAAAGTAATTGTAATGGATCCTTACTTGTACATTTGTGAGTCAAGTTAGTCCTTTCCGTTAAATATAAGCAAACGGCGTTAATGGGATGATGATGTGGCAATAGTTAGTGGTTAGGTGTCAAAACGCGATAGTGTACGTGCTTACGTGGTGTTGAATTAGAGAAGTTTAGGTTTTATTAGAAATTGAGTTTATTTTAATTGGGGATAAATTGGCAGCTGAACTCAT


Gene Sequence:
>Vu_09424(-)
ATGAGAACGATGGGGTACCTTGCACCTGAACTCACACGAACGGGGAAACCCACCACCAGTTCTGATGTTTACGCTTTCAGAGTGTTGTTGGAGGTGGTGTGCAGGAGGAGGCCCATTGAGGTGAAGGCATTGCCGGAGGAGCTGGTGCTGGTGGACTGGGTCTGGGAGCGGTGGCGCATGGGGGCGCCGCTGGCGGTGGTGGACCCCAGGTTGGGTGGGGCGTTTGATGAGGTGGAAGTTTTGGTAGTGATTAAAGTGGGGTTGTACTGTTCCGCGGAGGCACCAGAGAAGAGGCCCAGCATGAGGCAGGTGGTGAGGTATTTGGAGAGGGAGGTGTAA