Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09375 LG2 22126107 22128935 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase WNK7
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 22126387 upstream_gene_variant
G/A 22126489 upstream_gene_variant
C/T 22126491 upstream_gene_variant
C/T 22126594 upstream_gene_variant
G/A 22126629 upstream_gene_variant
T/G 22126658 upstream_gene_variant
G/A 22126665 upstream_gene_variant
G/T 22126676 upstream_gene_variant
G/T 22126808 missense_variant p.Gly78Val
T/C 22126880 missense_variant p.Leu102Ser
G/T 22127088 synonymous_variant p.Gly139Gly
C/T 22127240 missense_variant p.Pro190Leu
A/T 22127904 synonymous_variant p.Pro342Pro
G/T 22127984 missense_variant p.Arg369Ile
A/G 22128135 downstream_gene_variant
A/G 22128644 missense_variant p.Arg561Gly
A/T 22128903 missense_variant p.Glu647Val
G/C 22128906 missense_variant p.Gly648Ala
C/A 22128910 synonymous_variant p.Ile649Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09375.1
MSLAGTESSEEGAGLLEPPDPNIVEIDPTNRYTRYKEVIGQGAFKTVYKAFDEINGLEVAWSQIHIDEVLQSPGGPDRLYSEVHLLKSVKHDNILTFHNSWIDDKHRTMNLITELFTSGNLRQYSKKHRRVDMKAVKGWARQILNGLNYLHSHNPPIMHRDLKCDNIFINGHRGEVKIGDLGLATLIKQTNARSVIGTPEFMAPELYDEHYNELVDIYSFGMCMLELVTSEYPYSECRNSAQIYKKVSSGIKPVALSKLKNQEVKSFIEKCLVPASQRLTAKELLMDNFLQVTGSLKNRRLPLPDIVLPKYGAYENRCLMSEGPASTRIRSISMDLGDATEQPFTTLLYNSVDSVDSPDDVLPSPCVEIRRLKEGDIFFLKGEQNDQKSVSLVLRIADQSGRARNIHFIFYINSDTAISVSSEMVEQLELAEHNVKFIAELIDLLLTTLLPDWKPCVQIDHLVACNSKSSHPSQQTRSSRDSIQIVSGGGPGLPISRRRSTDKENKDNVISDKVLSNTSISLQGDAKIDDSCSETSQTGATFDFNEKHFSTVSFMSAKSGFTDFDLHRVNSQTSLVSEFEASSEYRNFPRVESYGTMKFFNYPMNAPPSFNEAEDELRIELEMIEQQYQEAIRDLSKRRYQAITEARRRVSHKFPNFK*


CDS Sequence:
>Vu_09375.1
ATGAGTTTGGCAGGCACAGAAAGCTCAGAGGAGGGGGCAGGCCTTCTAGAGCCTCCTGATCCCAATATTGTTGAAATCGATCCTACTAATCGCTACACTAGGTATAAAGAGGTTATCGGCCAAGGAGCTTTCAAGACTGTTTACAAGGCATTTGATGAAATTAATGGACTTGAAGTTGCATGGAGCCAAATTCATATTGATGAGGTATTACAGTCACCTGGTGGCCCAGATAGGCTGTACTCAGAAGTGCATCTCTTGAAGTCAGTTAAGCACGATAACATCTTGACTTTCCATAATTCTTGGATTGATGATAAGCACAGGACTATGAACTTGATTACTGAGTTATTCACCTCAGGGAACCTCAGACAGTACAGCAAGAAACACAGGAGGGTTGACATGAAGGCTGTTAAAGGATGGGCAAGGCAAATTTTAAATGGTTTAAATTATCTTCACAGTCACAACCCACCTATTATGCATAGGGACCTGAAGTGTGATAATATATTCATCAATGGTCACCGAGGAGAAGTTAAGATTGGAGATCTAGGGTTGGCAACTCTAATCAAACAAACCAATGCCAGGAGTGTAATTGGAACCCCGGAGTTCATGGCACCTGAACTGTATGATGAACATTATAATGAATTAGTGGACATATATTCTTTTGGGATGTGCATGCTTGAGTTGGTTACGTCTGAATATCCTTACAGTGAATGTAGAAACTCAGCTCAGATATACAAGAAAGTTTCATCTGGCATTAAGCCTGTTGCTCTTTCCAAACTCAAAAATCAAGAAGTAAAATCATTTATTGAGAAATGTCTTGTCCCAGCGTCTCAAAGACTGACAGCAAAGGAGCTTTTGATGGACAATTTTCTGCAAGTGACTGGTTCATTGAAGAATCGTCGTCTACCATTACCAGATATCGTTCTCCCTAAGTATGGAGCCTATGAAAATCGTTGTCTTATGTCAGAAGGTCCTGCTAGTACGCGTATTAGATCCATTTCAATGGATCTTGGTGATGCCACCGAGCAACCATTCACCACTTTACTTTATAATTCTGTTGATTCTGTTGATTCTCCTGATGATGTTTTGCCTTCTCCATGTGTTGAGATAAGAAGGTTAAAGGAAGGTGACATTTTTTTTCTAAAAGGTGAACAGAATGATCAAAAGTCTGTGTCATTAGTTCTCCGCATAGCTGATCAAAGTGGGCGGGCAAGAAATATCCATTTCATATTCTACATCAACAGTGATACTGCAATTTCAGTTTCAAGTGAAATGGTTGAGCAACTTGAACTGGCTGAGCACAATGTTAAATTCATAGCAGAGTTGATCGATCTATTATTGACCACATTGCTTCCTGATTGGAAACCTTGTGTACAAATTGATCATTTAGTTGCTTGTAATAGTAAATCATCTCATCCAAGTCAACAAACACGAAGCTCAAGAGATTCCATCCAAATTGTGTCTGGAGGTGGTCCAGGTCTCCCAATCTCACGTAGAAGATCAACAGATAAGGAGAACAAAGATAATGTCATTTCTGACAAGGTTTTATCTAATACAAGCATTAGTCTTCAAGGAGATGCAAAGATAGACGACTCTTGTTCTGAGACGTCACAAACTGGTGCAACATTTGACTTCAACGAAAAGCATTTTTCTACAGTTTCATTCATGTCTGCTAAATCAGGATTTACAGACTTTGACTTGCACAGAGTTAATAGTCAAACCTCACTTGTATCTGAATTCGAGGCTTCGTCTGAATATAGGAATTTTCCACGTGTGGAAAGCTATGGTACCATGAAATTCTTTAATTACCCTATGAATGCTCCCCCCTCCTTCAATGAAGCTGAGGATGAGTTGAGAATAGAGTTAGAGATGATTGAACAACAATATCAAGAAGCAATTAGAGATTTATCAAAAAGAAGATATCAGGCCATCACCGAGGCTAGGAGGAGGGTATCACATAAATTTCCAAACTTTAAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_09375::LG2:22124107-22126107(+)
TCTCTTCATATGCCATTTTAATTCTTTATTAAAATGAAAAAAAAAACATATTTTAAAGTTTTAAGAGTAAAATATTAATTTACAGGTTTTAGGTGTGAAACGAAGACAAGTCTCTATAGGCACAGGTTCTAAGTCGAGAGATAAAACGGTGATCGTGGAAGATGTGACTCAGCAATATGTTTTTGATGCTTTGGATAAAGTCTCGAAGCAGTAGTGATGTTTTATTGATGAGGAGGCATCTTGCTGTTATTATTATTATAATTAATATCTGTTAGAAGAGTAATATAGTGGTAGTGTTGCAGTGAAGAGCCTTGTATTTGTTTTATTTTGGTTTTTTCCTTCATAGTGTATACTTTGACAACTTGATGGAGTGCATGTTTGGATTCAATTCAATTCTTCTATTCATTCCAATTCCATAAATGTCTGTTAGCTTCATATGTGTTTGAGTATCAGAAATGGTTTTGTTTGTGGGAAGGCTCAAGAGTTTCATTGTTTCAGAGGAAATAGAAGGGAAGGGATTAAATGACTTTTTTATGACTTTTATATTTCATTTCAAATTCAATAACTTTATTGATTTTTTAAATGCTATACATTATTAATTTATCTCTTACTATTCATTTCGGGCACCAATGTTTCTTAAACTTAACTCATAAAAACTGTTCTAAAGAGGATGGAAGTAACATGGAACGAATTAACTTCCATTTTTTTTGCACTGTAAATAATTATATCCTTTCCAAGTAAGATATTGATTTCATTGCTAGACATGAAGTCACTTTTTAAAACTTAATTAATTTTTAATAACATTTTAATAAATAACAATTTTAAATCTTATTAACAGTATAAACGATTTTTAGTTCATGTTAAAATGTCTTCATATAATTCATTTATTATCTATTACCTTATTTTTCATTAATTTGAAACAATTGTATAGAAAACTGTTTACTCTTTTTTTTTTCTATTCTTTTATTATATATATTCCTCCTATTTCTATCATTTCTTTTTTTTTTGGTTTTTCCTCTCTATACCACTTACCAATCTAAAGAAGGGACAAATGTAATTAAGTCTAGAAATACCTATGCTAAAGCACAACCAAATTCTTTCCTATTTATTCTATTCTTATTTTTTTCCCTTGCTATTCATTTCATTTCAATCCCATCAGACTTGTTTTTATTTTTTATAAGAATTAGTTAATGAGTGATACTTTTCGCTTGGTTTATTATAATGAATTTTAATGAAATCAATTTTGAAAGTTTATATTTTCATAAAAAATAAGAAAAATAATTTTCAACGATAAAATAAAGAAGACTATTTTCTAAAAAACTAAAATTCGTTGCGAAGCGTTGATGTCTTCTCGAATTGCCCATGTAGCGATGACATGTTTGACTGAAAACGTATAGAAAGCGACTATAGATGGGGAATTTATATACAGTCTGAAAAAAAAAAAGGAAGAAATATTTGTGGAGAAATAATTAGTATTACTATATGTGAATAACAATAGGAGAAGAGAATGATGATGGAGAAGAGCAGAGGAGTATTTGTTGGTGGGAGAAGGATAAAGCACAAATAGGGGTTGTATTTGAAACTAGTGTCTTGCAAATTAATTTTGGCTGTTTTTAGTTAGAGAGAGAAAGGGAAGAGATAGGTGTTTGTGTTGGAAGACAAAGTTGTGGCATGCGATTTATTGACACAATTTCATCCTATATGCATTTGGGTTTCATTCTCGTTTCCCCCTCTATTTCTTTGCATTTGGGTTTCATTCTCTCTCTGATGTCCTTTTCTCTCTCTAAATTCTATGGAATTCCTCCGGAGAGGCTAAGCTTAGATGATCCTGTTCTAAGGTACATTTTATTAATTCCTTTATTCACCAAAAAACATATGCATTCATTTCTTTATCTGATTGCCTTCAACTAACTTATATCTATAATATTTGGGTTTTTCAACTTTTTACCAAAAAACTTGTCATTAATTATTTTGATTCCAACTATTTGAAGCAGTATAGA


Gene Sequence:
>Vu_09375(+)
ATGAGTTTGGCAGGCACAGAAAGCTCAGAGGAGGGGGCAGGCCTTCTAGAGCCTCCTGATCCCAATATTGTTGAAATCGATCCTACTAATCGCTACACTAGGGTATGAAATGGAATTATGTGATTTTTTTCTTACTTCCTCCCAAGAAAAAATTAGCAATGGATTAATTTCAATTTAGCAATTGTTTTTTCTGTATTCATAACAGTATAAAGAGGTTATCGGCCAAGGAGCTTTCAAGACTGTGTATCCTTTATTTTAAGATCTTATCAATGTGTCTTTTTTATTATAGTTCGGTTCTTATAGTAGCACTTCACTAGTAATCTAATTCCTTCGCTTTAAGGCTTAATGTTTTTTGTCTGTAAAATTGAAAGACATATTGAATGCCCTGCTCAATCTAGAACATAATGCATGAAATTTTCCATTAGGATCGGTCTAATGGGGCATGATTGGGTAGTTCACATAAGGTTCTAAATTCAAACCTTAGCACCATTGTACACACATAAATAGTGCATGACATTCTTTGGGTCTAATTTTTATGTTAAGAATTTTATTTTTTTAGTGAAATTTATGTCGATATGCAAACTTTTCCTTTATTTATGATTAATTAGTTACAAGGCATTTGATGAAATTAATGGACTTGAAGTTGCATGGAGCCAAATTCATATTGATGAGGTATTACAGTCACCTGGTGGCCCAGATAGGCTGTACTCAGAAGTGCATCTCTTGAAGTCAGTTAAGCACGATAACATCTTGACTTTCCATAATTCTTGGATTGATGATAAGCACAGGACTATGAACTTGATTACTGAGTTATTCACCTCAGGGAACCTCAGACAGTGTGTTCACTACCCTTTATAAATGCTTTTCATTTGATTCTTTTCCTTTTTGAATGACATCAACCTTTTGGTTAGTGGATTTGATGTATGATTTAGGTACAGCAAGAAACACAGGAGGGTTGACATGAAGGCTGTTAAAGGATGGGCAAGGCAAATTTTAAATGGTTTAAATTATCTTCACAGTCACAACCCACCTATTATGCATAGGGACCTGAAGTGTGATAATATATTCATCAATGGTCACCGAGGAGAAGTTAAGATTGGAGATCTAGGGTTGGCAACTCTAATCAAACAAACCAATGCCAGGAGTGTAATTGGTATGCTCTTCTGTTTTGTTGCATTTTCTTTTTTTGTAAATTTTCCATCCTTTCTATGATTATAAATAATCAATAATTTATTTGATTTCTACTCCAATTATATTTACAAATATGTAATCCTAGTAGGAACCCCGGAGTTCATGGCACCTGAACTGTATGATGAACATTATAATGAATTAGTGGACATATATTCTTTTGGGATGTGCATGCTTGAGTTGGTTACGTCTGAATATCCTTACAGTGAATGTAGAAACTCAGCTCAGATATACAAGAAAGTTTCATCTGTGCGTATTCTTATTGACAATGTACTTTTTCTTTAAGCAATTACTGGGATCCATGGTCATATATTATTTGATATTGCAGGGCATTAAGCCTGTTGCTCTTTCCAAACTCAAAAATCAAGAAGTAAAATCATTTATTGAGAAATGTCTTGTCCCAGCGTCTCAAAGACTGACAGCAAAGGAGCTTTTGATGGACAATTTTCTGCAAGTGACTGGTTCATTGAAGAATCGTCGTCTACCATTACCAGATATCGTTCTCCCTAAGTATGGAGCCTATGAAAATCGTTGTCTTATGTCAGAAGGTCCTGCTAGTACGCGTATTAGATCCATTTCAATGGATCTTGGTGATGCCACCGAGCAACCATTCACCACTTTACTTTATAATTCTGTTGATTCTGTTGATTCTCCTGATGATGTTTTGCCTTCTCCATGTGTTGAGATAAGAAGGTTAAAGGAAGGTGACATTTTTTTTCTAAAAGGTGAACAGAATGATCAAAAGTCTGTGTCATTAGTTCTCCGCATAGCTGATCAAAGTGGTTAGTTTAACTTACAGTTCTCTTAATAAGCATGTTTGGGATTTTTTGGTTGAAAGTTAAGTTATCTGGAAAAAAAAATGCAGGGCGGGCAAGAAATATCCATTTCATATTCTACATCAACAGTGATACTGCAATTTCAGTTTCAAGTGAAATGGTTGAGCAACTTGAACTGGCTGAGCACAATGTTAAATTCATAGCAGAGTTGATCGATCTATTATTGACCACATTGCTTCCTGATTGGAAACCTTGTGTACAAATTGATCATTTAGTTGCTTGTAATAGTAAATCATCTCATCCAAGTCAACAAACACGAAGCTCAAGAGATTCCATCCAAATTGTGTCTGGAGGTGGTCCAGGTCTCCCAATCTCACGTAGAAGATCAACAGATAAGGAGAACAAAGATAATGTCATTTCTGACAAGGTTTTATCTAATACAAGCATTAGTCTTCAAGGAGATGCAAAGATAGACGACTCTTGTTCTGAGACGTCACAAACTGGTGCAACATTTGACTTCAACGAAAAGCATTTTTCTACAGTTTCATTCATGTCTGCTAAATCAGGATTTACAGACTTTGACTTGCACAGAGTTAATAGTCAAACCTCACTTGTATCTGAATTCGAGGCTTCGTCTGAATATAGGAATTTTCCACGTGTGGAAAGCTATGGTACCATGAAATTCTTTAATTACCCTATGAATGCTCCCCCCTCCTTCAATGAAGCTGAGGATGAGTTGAGAATAGAGTTAGAGATGATTGAACAACAATATCAAGAAGCAATTAGAGATTTATCAAAAAGAAGATATCAGGCCATCACCGAGGCTAGGAGGAGGGTATCACATAAATTTCCAAACTTTAAATAA