Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09244 LG2 18584638 18587348 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 51
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 18584688 5_prime_UTR_variant
A/T 18584697 5_prime_UTR_variant
C/G 18584829 missense_variant p.Gln44Glu
G/T 18584831 missense_variant p.Gln44His
T/A 18584834 stop_gained p.Cys45*
C/A 18584932 missense_variant p.Thr78Asn
A/G 18584950 splice_region_variant&intron_variant
G/C 18585269 downstream_gene_variant
A/T 18585297 downstream_gene_variant
A/C,* 18585725 downstream_gene_variant
A/T,* 18585727 downstream_gene_variant
A/T 18585869 downstream_gene_variant
A/G 18585932 downstream_gene_variant
T/A 18586050 downstream_gene_variant
C/A 18586052 downstream_gene_variant
T/A 18586071 downstream_gene_variant
G/C 18586177 downstream_gene_variant
C/T 18586212 downstream_gene_variant
G/T 18586261 downstream_gene_variant
G/A 18586263 downstream_gene_variant
C/T 18586398 downstream_gene_variant
A/G 18586482 downstream_gene_variant
C/T 18586648 downstream_gene_variant
T/C,* 18586723 downstream_gene_variant
G/T 18586751 downstream_gene_variant
T/C 18586800 downstream_gene_variant
G/T 18586827 downstream_gene_variant
G/A 18587283 3_prime_UTR_variant
A/G 18587292 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09244.1
MEQYFGNPNFCHSAVVNMAASPASEFKISDYLILEDVADYHHEQCWSLSTETESSEKANSSDASHGFGDATSSTTTTTNNNNIKCKNKGIKQKKAEVSQSITFRTRSQLEIMDDGYKWRKYGKKTVKNNSNPRNYYKCSGAGCSVKKRVERDRNDSNYVLTTYVGVHNHHTPSSYYTQMPLLHSDDWNLLPSATQNS*


CDS Sequence:
>Vu_09244.1
ATGGAACAGTATTTTGGAAACCCTAATTTCTGTCACTCTGCCGTGGTCAACATGGCAGCATCTCCAGCCTCTGAGTTCAAGATATCTGATTATCTTATATTGGAAGATGTTGCTGATTATCATCATGAACAGTGTTGGTCACTGAGCACTGAAACTGAATCATCGGAGAAAGCAAACTCTAGCGATGCCAGTCATGGATTTGGTGATGCAACCTCCTCCACCACCACCACCACCAACAACAACAACATAAAGTGCAAAAATAAAGGGATTAAGCAAAAGAAGGCAGAAGTGAGTCAAAGCATCACGTTTAGAACCAGATCGCAGCTCGAGATCATGGATGATGGATATAAATGGAGGAAATACGGAAAGAAGACAGTGAAGAACAATTCCAACCCAAGGAACTACTACAAGTGTTCAGGTGCAGGATGCAGTGTGAAGAAAAGGGTGGAAAGAGACCGAAATGACTCAAACTATGTTCTAACAACGTACGTAGGTGTCCACAATCACCACACCCCGTCTTCCTATTACACCCAAATGCCTTTGTTGCATTCTGATGATTGGAACCTTCTCCCTTCTGCAACTCAAAACTCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_09244::LG2:18582638-18584638(+)
GAAATTCTAAACCATTAGTCAACTATTAATACTTCTTTTGATTAATAATTTTATTTTGATAACTTGATTTTTAAAAAAGAAATATTTAAATGAAATTTATTAGTAATTATTAGAGGAGAGAATAATGGAGTTAGATATCATAATACTCAACAGGTGAGTAAGTATATAATTGTGTCTTATACCAAAAATGTCCATTTAATATTTAGTAGAAATTTTATCGTGCAAATATTCTTAAATAAGAATTCTTTTTCTCATGCTTATCTATAAATATACATAGAGGATACATCATTTTAGTGTCTTTTTTTGTTTTTTGTTTTAATTTTATCTTCATAATAATTACCTTTTAAATTTAAATAATTATTCATAATAAAAAAATAATTTTCAGTTTTATCATTTTAGTAACTACTTTTTTTAATCCAAATAATTATTCATTATAAATAAAAGAATTAATAACTCTTTTATAATTTTAGTAATTACTTTTTCAAATTTAAATACTCATAATAAAAAATTATTTATACTTATTAACTCAAATAATTATTCATTATAAATAAAAGAATTATTTAATTTTTTATTATTTTAATAACTACAATTTCAAATTTAAATAATCATTAAAAAAATATTTATATAATATTTTTTATTTTAATAACTAAAATTTATTTTATTTATAACAATTATTGTTTGCAAAGTTTTCATCATTGAATTAACAATTATTGTTTGCAAAGTTTTCGAAATATTTGTGTTGTAAATACAATTTGTCATCTTTTTCTTTGCATATAAACAACCTATTTATGTTTTCTCATCATTTTCTAGTATTTAAGCCAAACTAAAATAAAACAAAATTATACATAATTTGCAATAATTATCCAAAATCGTTCATATTGTGGTAGTTATGTATGCTAAAGCCATGTTTTACAATAGTTATCATATACGTCAACATCTCTTTCAAGCTATCTTTAAATTTTGTCTTCTTGATGTGCTTTCTTAAAGGCTTGATTGATCATTCTTGGATCCTTCTTTTTTATTTATTTAATTTGATATCCTCTTCTATTTCTCTATACTCTCAACAATTCCCTCTCCCAATGCATGTAATATTACATGTATCATTTCCCAAATTCCATAATATTAGTGCTTCATCATGCTCATTTATTAAGCAATTGTAAGTATCAGCATGAACAACTCATCTCAAATTCAACTTTGTTGTTGTCTTGATCGGTAGCCATTTGATTGTCTACCTTCGTGATTATTCTTTTGAATTTTACTTAACTCAGAATTTATATCTTCAGAGTTGTGATTAGCTTTGTATGTCTCCCATTCTCTATTTCATCTTCTTAATGTGATTGCCGCTTTTTTAATTGTTAAACCTAGCTAATTCACTTTCAACATTTTTCTCCATCCGATGTAAGTTGGCTTCTCATTGCACTTAGTACATTAGATTGATTAAAAGAAAATAATTTGATTTAGATCAGTATGATCTTGAAATATGTTTAGATTTTTGGCGCTTAACACGGAAATCAGAGGCAAATATCATGTTGGGTGGAGTGATTAAGTTCCCATCGATAAACAGGGACGACCCATCATCAATGGACAGCTACTACATATTTATTCAAAAATTAAAAAAAAAAAATTGAATATATATACATGGACATAACGCCACCACACTAGCTATGCATACATCTATCGTCTTAAAAAAGCAATAACATGGTATCATATTGTGTTATTTTCACGGTCCCATTTATACCTATTCTGCAAGATTAAAGTGGTAGGGAACCCCTACTTGCTAGCTCCTACGTCATCACCCTGACATCATCTTCATCTGTCTTATCTTGACTCCCTCTGTGAGCAAGTTCGCAGCATCCTCCAAGGTGTTTCGAAGTATCTTCAAATATCAAGTATATTAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAGAAAGATTAAACACTTATTCCCTTATATTTATTTTATATTTTTTATTACTATATATTATATATATCCAGTGACGGTGTGTTTTG


Gene Sequence:
>Vu_09244(+)
GGTTCCAGCCCTGGTAAAAGGCCAAAGACTCTTGGGTCTCTGCAACATATCACCACACCACCATGGAACAGTATTTTGGAAACCCTAATTTCTGTCACTCTGCCGTGGTCAACATGGCAGCATCTCCAGCCTCTGAGTTCAAGATATCTGATTATCTTATATTGGAAGATGTTGCTGATTATCATCATGAACAGTGTTGGTCACTGAGCACTGAAACTGAATCATCGGAGAAAGCAAACTCTAGCGATGCCAGTCATGGATTTGGTGATGCAACCTCCTCCACCACCACCACCACCAACAACAACAACATGTAAGTGTTTTTTTCTTGATTTATGTTGTTTTTTTCGTTAAACAAGAAAATGTATATGGTGTATATTCTATGCTATTTCGTGTGTGTAAATATTATTAATTAATGTTGCCGGGATTCAACGTTAATATGACAGAAAGTGCAAAAATAAAGGGATTAAGCAAAAGAAGGCAGAAGTGAGTCAAAGCATCACGTTTAGAACCAGATCGCAGCTCGAGATCATGGATGATGGATATAAATGGAGGAAATACGGAAAGAAGACAGTGAAGAACAATTCCAACCCAAGGTAATTACTCATAACTATTAATTTCACAGATTATATGAGAAAACAACTCTCTTTATAAAAACAAGAAAAACCCTTTTCACAAAAGAATTGGAATCGATTTAAGATACTGGTAATCGAGGATTTTATTTTCTATACTCTGAGACAAATTAAAGAAACACATAGATTAAAGGAACAGTAGCAATAAAAGGAACCTGATGTAACATAGTTAACTCGATGTCCATTGGTTCGTTTGACTTCGCTTCCTGCATCATGAATATCACATAATGCATGCAAATTTTATGTGTTTGAATAGCTTTGAAGGATTACGTTAGGATCTAAGTTGGTGTATTTAGAAGCACATGTGAAATAATTAAAGAAATCAAGATGGTGTAGACATGAATGGAGAGGAAGTGAGGGAATCATGTCAACCATGCACTGTAAAATAGGATAAGATATTGGGCCCGATACCTAGCTAGAAAGATAGAGATGAAAGTGGTGGCGGCTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGATATATAGTGATTAAAAGAGGGGGACAAGGACTAGTCCTGGGCCTTAATCATATATGATTGGAGTGTTATCAATGGTGAAGCATTATGTGGGGATCTGCTTGATTAATAAAAGTAACATGCTTTGCAGTGAGATTAGGACAGCTAAGTAAGCATTCTTTCTTTATGAACACTGCACTGATGCGCCTGTGAAACCGTACATGACGTAGTTTTGCTAAATTATTTGCACTTTTCTTACTTAGTTTTAGTTTGCTCGTGTGCTGGTTTTAGCCTAGGGGAAGAAGAACGAATGGTAGTTAAAAACACAAAAATGTTTACTAATTAATTTCATGTACGGAAACTCTTCAAATATTTTGGAAAGTGTTTGTTTCACCTTAAAAAATATTTTTATGTAATGCCATGACACTTTTTTACCTTCATTTAACACATGTTACAGAGGTAAAATAGTGTAAATTTTTGTATTGTTTATACACTTAACTCATAATATTTTAATAGTTTAATAATATTTATTAATATTTTAAGTTAAAGAATAAAATAAAAAATTGATTAAAATACTAACATTCTATATTGTTAAGTGATTTTTCTCTTCATAACTTTTTGAGATATTACCACTCAATATTTTGAAGGATGCAAACTCCACCCCAAGATGAAATTTTGTGAATGAAATATGTTATCAATTATATCTAATATATGTACTTTTTAGGAAAATATGCATTTTGGAAAATTCAACATCAGAAAGTTGAGTATGGAATAAGAACATATTTACAAATATTTTGTAGTAAATTTTTGGATCAAATTTGATGTTATGATTCTTAGATTCATTTATATTTCATCTCTATCGAATTTTTCTAGTGAATTTATTTTTTTAAAGACTTAATAGTGATATTGGACTTGATAATTTGCACTACTAACCCGTTCAAATTGAGGAAAACATAGGCCGGTTAGGAATTTAAGTATATGAGTTAAACAATTTATTTGATAAGAATATTCAATAAATTTTAAAATAAAAATAGGCAATAAAAATGATTGAATATAATTGGCTCTTTATATGTATATGGAGTAATTATTTTGTGTTTAAAATTTGTTAAAGTAGTTTGAGTTAATAGATAATTTATTGTGGTTTTGAAAGAATTGATGATGAGAGTGCAGGAACTACTACAAGTGTTCAGGTGCAGGATGCAGTGTGAAGAAAAGGGTGGAAAGAGACCGAAATGACTCAAACTATGTTCTAACAACGTACGTAGGTGTCCACAATCACCACACCCCGTCTTCCTATTACACCCAAATGCCTTTGTTGCATTCTGATGATTGGAACCTTCTCCCTTCTGCAACTCAAAACTCATAGCTCCTCATTACATATAGTTAATCATAGTTATTGTGTAATTAACTATCTCTTTCTCCATACCACCCTTCTATTTTGAACTTTAATTATGTAAACCTCTATTATGATGACCACTTTGGCTAGCATGTGTTATGTATTAATTAGTACAAATACAATCTAACATATTTTGAATAAGATGTTACATTATGTTAG