Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08991 LG2 13328061 13329333 PREDICTED: polygalacturonase inhibitor-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 13328097 3_prime_UTR_variant
G/C 13328175 3_prime_UTR_variant
G/T 13328225 missense_variant p.Pro370Gln
T/A 13328396 missense_variant p.His313Leu
G/T 13328458 missense_variant p.Phe292Leu
A/G 13328691 synonymous_variant p.Leu215Leu
C/G 13328701 synonymous_variant p.Gly211Gly
C/A 13328702 missense_variant p.Gly211Val
C/T 13328703 missense_variant p.Gly211Arg
A/G 13328824 synonymous_variant p.Thr170Thr
G/A 13328830 synonymous_variant p.Thr168Thr
G/T 13328947 synonymous_variant p.Pro129Pro
T/G 13329079 missense_variant p.Leu85Phe
A/G 13329173 missense_variant p.Phe54Ser
T/A 13329214 synonymous_variant p.Arg40Arg
G/A 13329216 stop_gained p.Arg40*
A/G 13329269 missense_variant p.Leu22Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08991.1
MKCHLPCTVASLFKMRGTRSVLMYFRNTTTCDFTFTSKMRSLLMLLGLCVLVLFPFPVALSERCHPQDKKVLLRFKKELNNPYFLASWDPKEDCCDWYCVKCDDRNNRIYEVFLVSSFPDPNVTGQIPPSVGDLPYLEYLDFHKLPNLVGPIPTTITKLTKLKSLSITNTGLSGPIPEFLGQIKSLEYIALSFNSLSGSIPSSLSQLPNLGSLQLDRNKLTGPIPASFGSFKKPGPDLKLSHNQLSGALPRSLGNLDPDNIDLSRNNFVGDASFLFGSKKKIQVLDLSRNAFSFDLSPVTFPKKTLIWLDINHNKIYGSLPVALTKVQNLQQLNVSYNPQLKGQIPQGGELHRFDKYAFFHTKLCGSPLPPCTK*


CDS Sequence:
>Vu_08991.1
ATGAAATGTCACTTGCCCTGCACCGTCGCCTCCTTGTTTAAAATGAGAGGAACGAGAAGCGTGTTGATGTACTTCCGGAACACAACAACTTGTGACTTCACATTCACAAGCAAAATGCGAAGCCTGTTAATGTTATTGGGACTATGCGTCCTAGTGTTGTTCCCTTTTCCAGTTGCATTATCAGAGCGGTGCCACCCACAGGACAAGAAGGTGCTCCTCCGCTTCAAAAAGGAACTCAACAACCCTTACTTCTTAGCTTCCTGGGACCCAAAAGAGGATTGCTGTGACTGGTACTGTGTCAAGTGTGACGACAGAAATAACCGTATCTACGAAGTATTTCTAGTATCCTCTTTTCCAGACCCCAATGTCACTGGCCAAATACCACCCTCTGTGGGTGACCTCCCTTACCTCGAGTACCTTGACTTTCACAAGCTCCCCAACCTCGTCGGCCCAATTCCGACAACCATCACGAAACTCACCAAACTGAAATCTCTCTCTATCACCAATACTGGTCTCTCAGGCCCGATCCCTGAATTTCTGGGCCAGATTAAGAGCCTCGAGTATATCGCCCTTTCCTTTAACAGCCTCTCGGGCTCCATTCCCAGCTCACTTTCCCAGCTGCCTAATCTCGGGTCTCTACAGTTGGACAGGAACAAATTGACGGGCCCAATCCCGGCCTCTTTCGGCTCCTTCAAGAAGCCCGGGCCAGATCTCAAACTCTCTCACAACCAACTTTCCGGGGCCCTTCCCCGTTCCTTGGGCAACCTAGACCCAGACAATATAGACTTGTCAAGGAACAACTTCGTAGGCGATGCTTCATTTCTTTTCGGGAGCAAGAAAAAGATTCAGGTACTTGACCTTTCCAGGAACGCCTTCTCCTTTGATCTGTCTCCTGTGACGTTTCCCAAGAAAACCTTGATTTGGTTGGATATCAATCACAATAAGATTTATGGAAGCCTTCCAGTGGCGTTGACCAAAGTGCAAAATTTGCAGCAGTTGAACGTCAGTTATAATCCTCAGTTGAAGGGCCAAATTCCACAGGGTGGTGAATTGCATAGATTCGATAAATATGCCTTCTTTCACACTAAGTTGTGTGGCTCTCCACTTCCGCCCTGCACCAAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_08991::LG2:13329333-13331333(-)
GGTTCACATTCTTTAACCATTCACGATGAGTTAACATTATTAATGCGGTGCCAAGCTAGCATAATTATCATCTTCTACTCATTCATACTACATAATTCATTATTCAATAGTTCCATTTCAAGGGTTCACTACTTTTGCCTATCCATATTGTCCTTGTTAAGAAAATAAGTATGATTTATTCAAGTTTGTAAATGAAACAATAATAAAAGTTTGACAGATTTAACATATTATTTAACTTCGTTACTTTAAATGAAATTCATACTAGATAAAAGTATAAATGATATGCAATTATAAATAAACTAGACACATATCAATATTTTATATGCTTTAATTGTAATACTTCTTTTAATATTGTTTTGCTTTTCAATGTGCTTTAAATTATCATTTTATTTTGTGGAATGATATTTCAATGTGCATTTTGGGTGCACAATATGGATATACTAGGATGGTCAGAAGTTGTTTTGTACATATAAGGATTTAGAAAAATAACAACTAAAAGCATGTTTGAATAAGTGATTAGATCACATTTATTAATTTCTTCAAAGAAAACAAATCTTAAGTGAAACTTAATCAGTAGTGTGGATGGTGATAGAAACCCATTTAAGAAACTAAATAGATATTCATCTAAGGAACATCAACTTAAGCTAAAGTTAAAAGAGTGGAAATATAAGAAGGACTTTCAAGCTTATTATTTCTTTCCCTCAAGCCTTAAAAGATATTGGACTTCTCAAAGAGCCATGATCAAAAGCATAGAAGAAGGAGAAGGAGCTTCAAGAACACTATTTTTATGGAGGATCACATTTTAAGTCTCTTCTTTTATCTTTAATATCTTTTGTAAATATGTAAAATAGTTTATTTAGGCTTTGTATTTGACCAAGACTCTTTGTCGAGCTTTGTTTTAAGTATGATGACTTTAGTTCAAAAAACTGTGCACTGAAGTTGTCATGAGTATAAATGAATTTGATTCAATTGAAAGTCCGAACCACTTTAAAGACATCGTACAAATTGAAAGTTGTGACCATTCCTAATAATTTTCATCCAACATGTTTTACAAATACGTCATTACCAATCCTAACTGATTACTTCACATTTTTAAAATTTTATGAAATAGTTATTCTTACTCACAACCATTTTAAGTTAGAAGTTGTCACGATTCCATAAACTTATCCTTGGACTATAAATTTTAACACCTACTCCATTTTTGTAATTTAAAGAGTAAGAAACTATCCATTTTTATAATTTTTTATTTTAGTCTGCACACCTGCAATTTAATATGTGTAAAAATAGATTAAAATATCATTTTCGTTTTTCTTTTACTTACATAGGTAAAGTAGTTTGAATTGGATCCCTATATATCATTTTAAAATTGCGTAATGTATATTTCAAAATGTATAAAGAGTTTTGTAGAAAATTATAACGACAATTTAAATTTTAAAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAACTATTGGCCGTTTCTGGTTTTCGTCCCTCTTTCAAAATAAAGTACAATTTGGTCCTCATTCTTTTCGAAACGTTCGTTTTAGTCCTCGAAACTTTGGTTTTAGTCCTCATTTTGATGACAAAATATGACCAAAATTTTAACGGTGTTAGTTTTCGAGGACTAAAAGGAACGTTTTCGAGAAGAATGAGAACCAAATTATACCTTATTTTTAGAGAGGGACGAAGACAAAAAACGATCAATAGTTTAGAGACTAAAAACATATTTAACCCAATTTTAAATTGTGAACCGTTGGAAACAACGTCATCCTATAACACTTATTAAAGAAAATACTTTTGCCGGAATTGTCTTTTTATTAAATAATGAATAGTAATTGTGTTTTAAAGTGGCTTTGTCTTTTACCTTTTTTTGCCGAGTATCTGTCAGAGTGAATAGAGAAAAGCTGTAAATAACGGGTACTGTTTGGCTAGGCAACCCCACATGGGTGATTTTGACGTGTGATGGCCACCAGCATCGGATACTATTTCCCATGCGGAAAAC


Gene Sequence:
>Vu_08991(-)
ATGAAATGTCACTTGCCCTGCACCGTCGCCTCCTTGTTTAAAATGAGAGGAACGAGAAGCGTGTTGATGTACTTCCGGAACACAACAACTTGTGACTTCACATTCACAAGCAAAATGCGAAGCCTGTTAATGTTATTGGGACTATGCGTCCTAGTGTTGTTCCCTTTTCCAGTTGCATTATCAGAGCGGTGCCACCCACAGGACAAGAAGGTGCTCCTCCGCTTCAAAAAGGAACTCAACAACCCTTACTTCTTAGCTTCCTGGGACCCAAAAGAGGATTGCTGTGACTGGTACTGTGTCAAGTGTGACGACAGAAATAACCGTATCTACGAAGTATTTCTAGTATCCTCTTTTCCAGACCCCAATGTCACTGGCCAAATACCACCCTCTGTGGGTGACCTCCCTTACCTCGAGTACCTTGACTTTCACAAGCTCCCCAACCTCGTCGGCCCAATTCCGACAACCATCACGAAACTCACCAAACTGAAATCTCTCTCTATCACCAATACTGGTCTCTCAGGCCCGATCCCTGAATTTCTGGGCCAGATTAAGAGCCTCGAGTATATCGCCCTTTCCTTTAACAGCCTCTCGGGCTCCATTCCCAGCTCACTTTCCCAGCTGCCTAATCTCGGGTCTCTACAGTTGGACAGGAACAAATTGACGGGCCCAATCCCGGCCTCTTTCGGCTCCTTCAAGAAGCCCGGGCCAGATCTCAAACTCTCTCACAACCAACTTTCCGGGGCCCTTCCCCGTTCCTTGGGCAACCTAGACCCAGACAATATAGACTTGTCAAGGAACAACTTCGTAGGCGATGCTTCATTTCTTTTCGGGAGCAAGAAAAAGATTCAGGTACTTGACCTTTCCAGGAACGCCTTCTCCTTTGATCTGTCTCCTGTGACGTTTCCCAAGAAAACCTTGATTTGGTTGGATATCAATCACAATAAGATTTATGGAAGCCTTCCAGTGGCGTTGACCAAAGTGCAAAATTTGCAGCAGTTGAACGTCAGTTATAATCCTCAGTTGAAGGGCCAAATTCCACAGGGTGGTGAATTGCATAGATTCGATAAATATGCCTTCTTTCACACTAAGTTGTGTGGCTCTCCACTTCCGCCCTGCACCAAATAGATTAACTCATTCCTTCTACTTCCTTTAAAATAACCTTTCTATTTTCGCCCTCCATCTATAAGATTAAACAAGGAAATCGTTCCACTTTGAATAAAATAAGTTTTATATTTTTGCTCTCTGATTTCAAGTTTATGTATGAGCTTTTCAG