Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08990 LG2 13320332 13321621 PREDICTED: polygalacturonase inhibitor-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 13320469 3_prime_UTR_variant
G/T 13320489 missense_variant p.Pro370Gln
A/C,G 13320593 missense_variant p.Phe335Leu
T/C 13320689 synonymous_variant p.Lys303Lys
G/C 13320775 missense_variant p.Leu275Val
G/A 13320891 missense_variant p.Pro236Leu
C/T 13321057 missense_variant p.Ala181Thr
G/A 13321319 synonymous_variant p.Asp93Asp
T/G 13321400 synonymous_variant p.Pro66Pro
C/T 13321415 synonymous_variant p.Ser61Ser
G/A 13321437 missense_variant p.Ser54Phe
C/G 13321442 synonymous_variant p.Val52Val
A/C 13321559 synonymous_variant p.Val13Val
A/T 13321567 missense_variant p.Ser11Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08990.1
MKCHLPCTVASLVKMRGTRSVSMYFRNTTTCDFTFTSKMRSLLMLLGLCVLVLSPFPVALSERCHPQDKKVLLRFKKELNNPYFLASWDPKEDCCDWYCVKCDDRNNRIYTIFLRSDEPDPNVTGQIPPSVGDLPYLQGLSFHNLPNLVGPIQPTIAKLHKLTGIFFSNTGISGPIPEFLAQIKTLQYIELSSNRLSGPIPSSLSQLPNLISLQLDRNKLTGRIPASFGSFKKPGPDLILSHNQLSGPIPASLGNLDPDRIDLSRNNLVGDASFLFGSKKKTRVLDLSRNAFSFDLSRLTFPKETLTWLDISHNNIYGSIPMALTKVRYFQQLNFSFNPGLKGQIPQGGGLQTFDKYSYFHTNLCGSPLPPCTK*


CDS Sequence:
>Vu_08990.1
ATGAAATGTCACTTGCCCTGCACCGTCGCCTCCTTGGTTAAAATGAGAGGAACGAGAAGCGTGTCGATGTACTTCCGGAACACAACAACTTGTGACTTCACATTCACAAGCAAAATGCGAAGCCTGTTAATGTTATTGGGACTATGCGTCCTAGTGTTGTCCCCTTTTCCAGTTGCATTATCGGAGCGGTGCCACCCACAGGACAAGAAGGTGCTCCTCCGCTTCAAAAAGGAACTCAACAACCCTTACTTCTTAGCTTCCTGGGACCCAAAAGAGGACTGCTGTGACTGGTACTGTGTCAAGTGTGACGACAGAAATAACCGTATCTACACAATATTTCTAAGATCCGATGAGCCAGACCCCAATGTCACCGGCCAAATACCACCCTCTGTCGGTGACCTCCCTTACCTCCAGGGCCTCAGCTTCCACAACCTCCCCAACCTAGTCGGCCCAATTCAGCCCACCATCGCCAAACTCCACAAACTAACCGGTATCTTTTTCTCCAATACTGGTATCTCAGGCCCAATACCTGAATTTCTGGCCCAGATTAAGACCCTCCAGTATATCGAACTTTCCTCTAACAGACTCTCGGGCCCCATTCCCAGCTCTCTTTCCCAACTGCCTAATCTCATCTCTCTACAGCTGGACAGGAACAAATTGACGGGCCGAATCCCGGCCTCTTTTGGATCCTTCAAGAAGCCCGGGCCAGATCTCATCCTCTCTCACAACCAACTTTCCGGGCCCATTCCCGCTTCCTTGGGCAACCTAGACCCAGACAGGATAGACTTGTCAAGGAACAACTTGGTAGGCGATGCTTCATTTCTTTTCGGGAGCAAGAAAAAGACTCGGGTACTTGACCTTTCCAGGAACGCCTTCTCCTTTGATCTGTCTCGTTTGACGTTTCCCAAAGAAACCTTAACTTGGTTGGATATCAGTCACAATAATATCTATGGCAGCATTCCAATGGCGTTGACGAAAGTGCGATATTTCCAGCAATTGAACTTTAGTTTTAATCCTGGCTTGAAGGGTCAAATACCGCAGGGTGGGGGATTGCAAACATTCGATAAATATTCATATTTTCACACTAACTTGTGTGGCTCTCCACTTCCGCCCTGCACCAAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_08990::LG2:13321621-13323621(-)
ACCGAAACATTAAACCTTAAATATATTAGAGTCATTATTTATCTGGTTAAAATTAGAGAGTGGTTTGTCAATATTAAAATTTATGATTAAGAAGATAATTGTGACAAAAAGTTATTGTATATATATATAATAATACAATGATTTGATGAGAGATTGAATTTAAATTATAAAAATATGAAATATCATTGATAGTAATTATAAAATGGGTTATGGTCTACATTTGTAGAAAATATAGTTTCTCTTCATCCCTATCATAAGAGAAAACAAAATCATTATTTGAGGTCCTATAATTTGGAATATCACATACTTATTGTTATTAATATCATTATCTACATCACTCAGAATGACAAATTGAGGTATGCTTCTGCATTCTATTTCATCATGAATTAGTATATGAGTTCATTAAGAATTAACATATATGATTGTACTATGAATTTTTTATCTATATATAAATAAAATTACTTGGTTAGACACAATTATTTTTTGACAGAAAATTCTCCTAATTATTATTAAGAGCAATCATACTCGATTCATGTGTGACTTTTGAAAATATTGAAATTTGGATTTCTTACGAATATACATATAATGCGGCTTAAAATTGGCGGTTTCAAAATTCATGATAAAAATTATTTTGGAAGTTTTTATCTTTTTTATTTTATTGTCACTTTTCTTTGAATTTGGTACATCAACCTGTAAAATTTGGAAACATAGAATTAAACGAGTTAGTTGAATCAAGAAGTCACCAAAGTGACCTCTCTTGAGTAGATTGTTCATAAGAATGTTAAATGTTTGTGTTTTTGTTTATCCATATGAGTATTGATCGATCCAAAGGAAGATTTATACTTGAGCAAATTGCATATACACATGTGATGTAAACTTGTGATAATTGTGACGTTTTGCTTCTCAATAATAAATCAATCTAAAGATAGATTTGTTGTTTGACATGTTTTATTATCAATGTTTGATCATTACAATACCATATTCCTAACAAATAATATTATTGTCCAAATATTTGATATTAATGGTGCATTAGTTAAGTATCTTGACATTGGTTATATTATTATTTGAATGTATTGTTGATTGAATTTTGTTTATGATGCGAGCATAACTACATTATTTATTTTGTTTTCAATTAAGTAACTATTGTTTCAATATCTACTAATCTGAATTTGATTTAGATTCTCAATGGAACAAATATTAAAGATTGAAAAGAGAACAAAGACTTTAATACGTCTGAATACAAAAAAAGTTATGAGACATGTGATCACTCAAATCACATAAGTTTTATGATCATTAAACACAACATTTCTAAAAAATTAAGGATAATATCTCTAAGAAGATAACAAGTACTAAATATTTTATTGTTAAAATTGAAAAGCAGTTTGCAAGAAGGCGGTAAGGCAAAAACAAATACTCTTATTTAGAGCTTGATTTCCTTGAATATAAAAGAATATTTTGATACATTAGGGATTAATACTGGTATAAGTATATACAAATAGTATGATATATGTACTGTCCTTCTAACACACGAATATAAAAATATTCATGTCCGTTACATTAGGATGTCTATTTATAATTTTTTATTTTAGTTTGTACACCTGCAATATAATATGTGTAAAAATAGATTAAAATATCATTTTCGTTTTTCTTTTACTTACATAGGTAAAGTAGTTTGAATTGGATCCCTATGTATCATTTTAAAATTGCGTTATGTATATTTCTAAAGAGTTTTGTAGAAAATTATAACGACAATTTAAATTTTAAATTGTGAACCGTTAGAAACAACGTCATCCTATAACACTTATTAAAGAAGATACTGCTGCCGGAATTGTCCTTTTATTAAATAATGAATAGTAATTGTGTTTTAAAGCGGCTTTGTCTTTTACCTTTTTTTGCCGAGTATCTGTCAGAGTGAATAGAGAAAAGCTGTAAATAACGGGTACTGTTTGGCTAGGCAACCCCACATTGGTGATTTTGACGTGTGATGGCCATCAGCATCG


Gene Sequence:
>Vu_08990(-)
GATACTATTTCCAATGTGGAAAACATGAAATGTCACTTGCCCTGCACCGTCGCCTCCTTGGTTAAAATGAGAGGAACGAGAAGCGTGTCGATGTACTTCCGGAACACAACAACTTGTGACTTCACATTCACAAGCAAAATGCGAAGCCTGTTAATGTTATTGGGACTATGCGTCCTAGTGTTGTCCCCTTTTCCAGTTGCATTATCGGAGCGGTGCCACCCACAGGACAAGAAGGTGCTCCTCCGCTTCAAAAAGGAACTCAACAACCCTTACTTCTTAGCTTCCTGGGACCCAAAAGAGGACTGCTGTGACTGGTACTGTGTCAAGTGTGACGACAGAAATAACCGTATCTACACAATATTTCTAAGATCCGATGAGCCAGACCCCAATGTCACCGGCCAAATACCACCCTCTGTCGGTGACCTCCCTTACCTCCAGGGCCTCAGCTTCCACAACCTCCCCAACCTAGTCGGCCCAATTCAGCCCACCATCGCCAAACTCCACAAACTAACCGGTATCTTTTTCTCCAATACTGGTATCTCAGGCCCAATACCTGAATTTCTGGCCCAGATTAAGACCCTCCAGTATATCGAACTTTCCTCTAACAGACTCTCGGGCCCCATTCCCAGCTCTCTTTCCCAACTGCCTAATCTCATCTCTCTACAGCTGGACAGGAACAAATTGACGGGCCGAATCCCGGCCTCTTTTGGATCCTTCAAGAAGCCCGGGCCAGATCTCATCCTCTCTCACAACCAACTTTCCGGGCCCATTCCCGCTTCCTTGGGCAACCTAGACCCAGACAGGATAGACTTGTCAAGGAACAACTTGGTAGGCGATGCTTCATTTCTTTTCGGGAGCAAGAAAAAGACTCGGGTACTTGACCTTTCCAGGAACGCCTTCTCCTTTGATCTGTCTCGTTTGACGTTTCCCAAAGAAACCTTAACTTGGTTGGATATCAGTCACAATAATATCTATGGCAGCATTCCAATGGCGTTGACGAAAGTGCGATATTTCCAGCAATTGAACTTTAGTTTTAATCCTGGCTTGAAGGGTCAAATACCGCAGGGTGGGGGATTGCAAACATTCGATAAATATTCATATTTTCACACTAACTTGTGTGGCTCTCCACTTCCGCCCTGCACCAAATAGATTAACAGATTACTTCCACTTTCAATACCCACTAAGTTGTGTGTCTTTCTATTTCCGCCCTGCGCCACTAAGATTATGTAAGGGGTTCGTTTCAGTGTTGAGAAATTAAAGTATGTTTCTCGTAGTAATTTTATTCGTCTC