Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08958 LG2 12901098 12905197 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 12901186 intron_variant
C/T 12901754 intron_variant
T/A 12902042 intron_variant
T/C 12902115 intron_variant
C/T 12902343 intron_variant
A/G 12902417 intron_variant
C/A 12902988 missense_variant p.Ser147Tyr
C/T 12903066 intron_variant
C/G 12903248 intron_variant
T/C 12903465 intron_variant
G/A 12903545 intron_variant
C/T 12903733 intron_variant
A/T 12903800 intron_variant
A/G 12904075 intron_variant
C/G 12904112 intron_variant
G/A 12904190 intron_variant
G/A 12904196 intron_variant
C/A 12904198 intron_variant
A/G 12904201 intron_variant
C/T 12904208 intron_variant
T/A 12904217 intron_variant
A/T 12904312 intron_variant
G/A 12904408 intron_variant
A/G 12904431 intron_variant
C/T 12904432 intron_variant
C/G 12904439 intron_variant
C/T 12904664 missense_variant p.Ser216Phe
A/G 12904825 missense_variant p.Met270Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08958.1
MSTSSTHHTYSRKQKSLGLFFLRLYNRDGVRLIGLDDAASRLGVERRRIYDIVNVLESVGVLARKAKNQYTWKGFSAIPEALQELKEDGLKENPGSFDDSNDSAKVSDDEDEEETSPIVNTESQNDKEIPDSTALGLSSKNENRREKSLALLTQNFVKLFICSSIEMISLDEAAKLLLGNANTSIMRTKVRRLYDIANVLSSMNLIEKVIFSSVHFKFPLRILEKQCFTFSPFKVGSAAFCIQLNYSSLKMSLLWMQTHTTNTRKPAFRWLGWRGKAWSESVDLAHNSNFNEPGKRKFGTDITNTSFKRSKTDFLLDGHTCKMQNQQENISYRVQLDRSNFEKDAKQTSKGYQFGPFAPAYVPKVGTSENNSGNQVHDWDSLAQVHRPQYQNQGI*


CDS Sequence:
>Vu_08958.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08958::LG2:12899098-12901098(+)
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Gene Sequence:
>Vu_08958(+)
ATGTCTACCTCCTCAACCCACCACACCTATAGCCGAAAGCAGAAATCACTCGGCTTATTGTGTACCAAGTCTCTTTCTCACTCTTACTATCAATTGCTTCTATCCAATTCAATTTCATCCTTTACTTCTCACGCGCTTCTTCATCTTGCAGTTTTCTCAGGCTTTACAACAGAGATGGCGTCCGCTTAATTGGTCTCGATGACGCCGCATCGCGATTAGGTGTTGAGAGACGCCGGATCTACGACATCGTCAATGTCCTAGAGAGCGTCGGGGTTTGTATTCGATCGCTTACAAGGTTTTGTGCTTGCTTTATGTTTTCTTGTTTTTTTTTTAAATTCTTGGTTTTTATATTTCAGGTGCTGGCCAGAAAAGCTAAGAATCAGTATACCTGGAAAGGCTTTTCTGCGATTCCCGAGGCTTTGCAAGAACTCAAGGTTGTTTTTCTTCCGAAATTAAATGACTGTGTTGGACTATTGGCGTTTAAGATTTGATGTTTATTTTAGGTTTTTGTAGGAAGATGGTTTGAAAGAGAATCCTGGATCTTTTGATGACTCCAATGACAGCGCGAAAGTGAGAGAACTGCCTTTGGTGTTTTCATTTTACGATTTTATTTCGTAGTTTTGGGGTTAATGACTAATTTAGTGTCGAATTGTTGTCAATGGTTTAGGTGTCTGATGATGAGGATGAGGAGGAAACTTCTCCCATTGTCAATACTGAAAGTCAGAATGACAAGGAAATTCCTGATTCCACCGCTCTTGGTCTATCCTCTAAGAATGGTATTTTTATTATTTTTTTCTTTTTGCTTCCGAATATTTTGCTGATTTAAAAATCATTGGCTGCGTTGGTTTTTAATTTTCACTTCAATAAATATGTTATAAATATTTATTTGCCATTGTGAATGTTATTGTGAAAAATACATGTCTGTGGCATGTTGTCTCAGGAAGTAGATGCTGCAAGGTTTAATAAGCAACTGCACCCTGTTCACTTAGTTATCGTACCTTTCTGGTTTTCATGCAATCTTTCCCCCTCAATTTATATATTAAAACTGTTAAACATTGAAATCAGAAGAATGACTGAGATCGATCCACTTTTTCCAAAGCTATAGTGGGTCAGCAAGCTGATAAGTGACCAATCATATGACTGTCAGAGTAGAAATACCCAATTTGAGTTTTTTTAAAGAAAAATAACAGAAGAGGTATTGAACAGAGAAAATAGGTGATTATTTTGTGACGTTCGACATGGGAGCTGAGGAGATTTCTTAACATTATTGTTGGTTATTAGTAAGGTTTTTCTCTTACAAATAAAAATAATTGCCAAAAATTTTTAATATACTGCCTCATTTTTATGAACAGAAATGGATTCCAAGGTCGAATCGTGCGTGTTTGGTTTCATGTTGATTTCTTCAGAATCACGTTAATCAGTTAATGTGATTTTAGGTACATGTTTACATGTTTAGTTTCACATTAAGGATTTAATTGAGCTTAAAATTAATTCTGAGTCGTATCAAATTTACGTAGTTTTTGTGTTTGATAAAAAAGTTATATTGAATTTTATTAAAAGTTTTTTGGATGCAAAAATCCAAGCATAAATCATATCACTTGAATATTAATTTTAACCAACATTTTGCCAACATTCTTTCAAATAAACACGTAATTCAATCCCTAAATAGGAGACTACGTTATTTGCGTAGCTGTTTTATTTGTTGATGGCAAGGATGCTTTACCACTTATAATATACCTTCAATCTTTATCATAATCGTGTGGACTTTAAACGGGTGTGGTTTGGTGACGCAATTTAGATAGTATGTTATTGGTATTTATTTTCTTTGAAATATGAAACCTAAAGGTTGTTGTGGTATTTGCCATTGCAGAAAACAGAAGGGAAAAATCTCTGGCATTGCTTACTCAGAATTTTGTTAAGCTTTTTATCTGCTCTAGCGTGAGTGTCGCTAATTTATCGAATTTTTCTCGGATATTCTAACTTTATAACATATTAATATATGTTGACATTTTTAACAACATACTTTTCAGATCGAAATGATCTCCCTTGACGAAGCTGCAAAGCTGTTGCTTGGAAATGCTAATACATCAATAATGAGGAGTAAGTGATACTAAACTCTGGTATGGCTTGGTAAATATCTTAATTAAGCACTCGTATAACAAAGTGCTTCTAATACAGGTATTAATGTGTAAACTATTTTTATGTGTACGAGGGCTGTCAATACACTTTCTAACACATTCTATTATTGGTTAAAATTTGTTTGAACTACAAAGCATGTATAAGACTTATTAGAAAAAAGTGAGACAAAATTTAGTTATGTTTAGTAAGTTTCAGTTAATAGAAACGAGTGTGTTTAGATGTGCGTCTTAGAGAATGGTGCTAGTTTTTTTCTTATATATAGATAGCAAATCATTTTCATGAGTTATTTTGAAAAATTTATTAAAATAGGTCAAAGACTGTTCATGGACAGATCATAAGTTAATCTTATAAGTTTTCTATTGTTGGAGAATCTAAGATTAATAATTGATACAATTTAATTGTATCATAAATGAATCTCTTAAGTTATTATCGTTGTTACGGTTCAACAATTTATATTTTTTCTCCTAGTTTCGTGAAAAATATTAAAAAGTTACGCCAGTTTAAATTTTTAAATGAAAAGGAATTGAAAAAACACTTGTAAACTTATCTTATTTTGTTATTTCACTACTTTATTTGCCACTCACTCATTCAATGCCAGTAATCCATACAGTTATTTAGTCGTTTTGTTTCCATTCTTCTAAACTAAGGTTATCATAATAGTTATTTTATATGACTTTCCAGTTAAACAATATATATCTAATAGTGTTATTTTATATGACTTTCCAGTTAAAGAGTTTCTGTAGAAAAAAATTGTTAATAGTATTTTATATGCGTATCTACATATATATGTATATCTAAATTGTCTATAAATGAATATAAATGGATATGATAAAAATAAATTTTTTGATCATTATATGCAATTCAATTAAGATACGCTATATAAGTATGATTTCTTTGATTTTAGAAGAAACAGATTTTGAAACTAGATAAGTTGAAATAAAAAGATTCTAGAGGGTCTTGTCTAATTTAATCCATTTGTTTACTTTTATTCATAAATATTTATTTTCGTTTTTATTGTATTACGTATATACTACACTAAAAATGAAAATTATTGTTTTCTGCTTAAATTGTATTTATTTTTAATTGAAATTGTTTACATTGAAAACTATATGTTATCTGTATGATATATTAAAGTAATATTTCAGTCTTTTAAAAAATAGCTTGACGACTCGTTATTTGAATCCCGATTTGATTACCTATTTCTCAAACACTTACCTAATTGTTTGTCGTAAGATGTAAACTCTTCCATTTACACCCTTATGCTTGTTCATCATGGTTTGACAAAGAAAGAATTTAACTTTCTGAGTTTTTATTTGTATGATACTGGCCTTTCAGCTAAAGTCAGACGCCTATATGATATTGCAAATGTGTTATCCTCCATGAACCTAATCGAGAAGGTGATATTCTCCTCGGTGCACTTCAAATTTCCTCTTAGAATCTTAGAAAAGCAGTGTTTTACTTTTTCACCATTTAAAGTTGGCTCTGCAGCTTTCTGTATCCAACTGAATTACAGTAGTCTTAAGATGAGTTTGCTATGGATGCAGACCCATACAACAAATACAAGAAAACCAGCATTTAGATGGTTGGGATGGAGAGGTAAAGCATGGAGTGAATCAGTTGACTTAGCTCACAATTCAAATTTCAACGAGCCAGGGAAAAGAAAGTTTGGAACTGACATCACAAACACAAGTTTTAAAAGGAGCAAAACTGATTTTCTCTTGGATGGCCACACCTGTAAAATGCAAAATCAACAAGAAAATATCAGTTACAGAGTACAGCTCGACAGAAGCAACTTTGAAAAAGATGCAAAACAAACTTCAAAGGGCTATCAGTTTGGTCCTTTCGCTCCAGCTTATGTGCCCAAAGTCGGAACCTCTGAAAATAATAGCGGGAATCAGGTGCATGACTGGGACAGCCTCGCACAGGTTCATCGTCCTCAGTATCAAAACCAAGGTATCTAG