Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08941 LG2 12711602 12712718 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 12711976 upstream_gene_variant
T/A 12711978 upstream_gene_variant
C/A 12711979 upstream_gene_variant
G/A 12711982 upstream_gene_variant
C/T 12711983 upstream_gene_variant
C/A 12711986 upstream_gene_variant
C/G,T 12712054 stop_gained p.Gln98*
C/T 12712058 missense_variant p.Thr99Ile
G/A 12712592 missense_variant p.Arg277Gln
C/G 12712621 missense_variant p.Pro287Ala
C/T 12712622 missense_variant p.Pro287Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08941.1
MVRSPCEKVNVKRGVWATEEDTKKLAFGSKHGSGNWTSVPRKTRLKRCGKSCRLRWSNCLRNDLKHDNFTTQEEDLIIKLHAAIGSRWSIIAQQLPGRTDNDVKIYWNTKLKKKLSEMGIDPVTHKPFSKLIADYGNIGGCQKPSTRIGSINKDFKSAMMLKSEPHQTMPQGSTNINDQETTRNNFLFNRAHGDNLSMDFENEMISGSVLGEDRLSKTSSPSTPSTCSTSAFSWNDFLLLEDDFTPLDYQETDTLVSKENVVTIQSWNSKEVKSQHASGSSDFQFSSSSHTSFIEAMLDQENEMFLSFPHLMEEPSNLS*


CDS Sequence:
>Vu_08941.1
ATGGTGAGGTCTCCCTGTGAAAAAGTCAATGTCAAAAGGGGTGTGTGGGCCACAGAAGAAGACACAAAGAAGCTTGCATTTGGTTCCAAGCATGGATCTGGTAACTGGACTTCTGTCCCCAGGAAAACAAGGCTCAAGAGGTGTGGAAAGAGTTGTAGGCTTAGATGGAGTAACTGCCTTAGGAATGATCTTAAGCACGACAATTTCACAACCCAAGAAGAAGATCTAATCATTAAGCTTCACGCAGCCATAGGTAGCAGGTGGTCTATAATAGCCCAACAGCTTCCTGGGAGAACAGACAATGATGTAAAGATCTACTGGAACACAAAGCTGAAAAAGAAACTCTCTGAAATGGGGATTGATCCTGTTACCCACAAGCCCTTTTCTAAACTCATTGCTGACTATGGAAACATCGGGGGTTGCCAGAAACCAAGTACCAGAATAGGGTCTATCAATAAAGACTTCAAGAGCGCAATGATGCTAAAATCAGAACCCCATCAAACCATGCCACAAGGATCTACAAATATAAATGACCAAGAAACCACTAGAAACAACTTTTTATTCAACAGAGCTCATGGTGATAATCTCTCAATGGACTTTGAGAATGAGATGATCTCAGGATCTGTGTTAGGGGAAGATCGTTTGTCAAAAACTTCATCCCCTTCTACTCCTTCTACTTGTTCCACTTCAGCTTTTAGTTGGAATGACTTCCTTCTTCTAGAAGATGATTTTACACCACTTGACTACCAGGAAACAGACACCCTGGTTTCAAAGGAGAATGTGGTGACCATACAGAGTTGGAATAGCAAAGAGGTGAAGTCACAGCATGCCTCGGGTAGTAGTGACTTCCAATTTTCATCATCCTCTCACACTTCATTCATAGAAGCCATGCTTGATCAAGAAAATGAAATGTTTCTGAGTTTTCCACACCTTATGGAGGAACCATCCAACTTGAGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_08941::LG2:12709602-12711602(+)
ATTAATTAAAATTTTGTAGTGAAGTAAAACTTTCATTGACTTTACTTTTAACTATCCTTAATAAAGTGTTTTGTGGATTGGATTTTCTTTTACTCTTTTTAATTTGATGACCCTTAAAAAAACTTATTTAAAGATCTATTAGAATTAACTTCACAATCAAATTCACAACTTTATAATTTACTATACATTCTTAACAAAGCGTTTGTTGGTCATAATACAACAATCTCAAACTATTGTTGTAGTAGACTATTAGAAATTGTGACAATAGAAAAAAATTTGTTGGGACAAAGATAGAGAAATAAGAAAATAAGAAGTGGAAATTAGTGATGATATACTTTGAATTGAAATTTTGAAAATCAAATCTATTTCTAGATTTTTAATATTTCAAAAGCTTAGTATTAACGATCAACCAATCATATTCATTTAACTATTGATTTGAGGAATATTAATGTTTACTTTAAGAATTTCAAAAACCTAAAATTAATCTTTTATATTTTTCATTATTAGAAAAAATGAAGGCAGACAGATGTATGTGTTCTCAATCTTTTAGTAAGCAGATTACTTTTTGTAAGTGTTTAAATATTAACTGTTTATTAGTCTACACATTTTACTACCTATTTTACCTTTATCAACATAAAATATTTTATTATTTTTCCTTTTGAAATTGAAATAGTTATTGATAATAAAAACCATTTGCACAATAAAAGAATTAATTATAATAAAATTATAAAACTTGTTTATTTTTATAATTATTTTTGTAGAAATTATCTTATATTTTAATACTATTTTTTTATTTCAGTAATTAAAAATTATTTTATAATTTAATAATATATTTTATTTAAAGAATTATTGATTTGAAAATATTTTTTTTATAATAAAGAAAAAGTGGACAGCACCTGTGTTTCCAATCATAATAATAATAAAAAAAAGTAATAATAAGTAAGTAGATTATTTCTCTTGCATATTTAATTTTAGCCATTTATCCTATGTTCAAAAGCACTATGATAGACAATGCTGCCCCCTTCTGTATTTATAGTAGCTTTATACTTTGAACTCAAACTCTTCTTCATTAGGATTCCTAGTTTTTTTACACTAGTTAATCTCTAATAAACAATGAACAAAAGAGACTCGGACATTATCTCAACGTAATCTAATTAATCTAATTGATCTAATTGAATTCTCAACCAAATTTAAATCAATCTACACTTTGAAGAAAACAATTTTATCTTATATATCAACCTTTGATATGTAGTCCATCTTTCAAAAACCTAAAGTCAACCATCATCCAAACATATTCATTTATAAATATTAATATTTATTTGAACTATCGGTTGCATTCATTTAAATCATAATCTAATTTTAAACTATAAGGAATTTGAAAACCTAAAATTAAGAATAAAACCAAATAGTATCCTTATCTAAGGTCCTTGAATGCTGAAACTATTTCAACTAATAATTTGAAAAGCATTAATATTTGTTTAGTTGTATAACATTCTCATGCTTGGATTGATTTAAATTAAAGATTGGTTACACATCACTCGGAATACAGTTGGAAAGTTGTATTAATTCTATCAATATAATTAGTTGAATACTCTCATAAAACTTGTATCAACCATAATTTAATCAAGTTGAACCAAATAATTCACCGGATTCAAACCTGATCTTAAAAATGCATTCGGTACAAGCATGTAAGTAATATTGTTGTGCTGCAAAGTGGTGTTCTTTATTTCATCTCTCTTCTGAAGTTTGTTGTGAATGATAACAATCATCATGCAAATTAAGTTTAATTCATAACAATGTTTCATGCATTCCTTGCCTCCATAGTTGTGTTACCTTTAAACCCATCTCCTCCATTCTCTCTTTCCTCGCAAAGAGTGTTTGCAGAACACAGTTATTTGAAGCTGCACGACACATCTCTCAATCTCTATTTCCTTCTCTTATGTCATTTTCTTTTTTCTTTCATATGCTTTTTTAAAACCCTTGGATCATAATAAAAGACA


Gene Sequence:
>Vu_08941(+)
ATGGTGAGGTCTCCCTGTGAAAAAGTCAATGTCAAAAGGGGTGTGTGGGCCACAGAAGAAGACACAAAGAAGCTTGCATTTGGTTCCAAGCATGGATCTGGTAACTGGACTTCTGTCCCCAGGAAAACAAGTTAGACAACTTTATTTTTTAAACTTCCAAAGCTCAATTTTTGCACTTCCTTACTTAAAGTTTTGCATTTGGGGACATCATTTCAGGGCTCAAGAGGTGTGGAAAGAGTTGTAGGCTTAGATGGAGTAACTGCCTTAGGAATGATCTTAAGCACGACAATTTCACAACCCAAGAAGAAGATCTAATCATTAAGCTTCACGCAGCCATAGGTAGCAGGTGAATATTGTGGCCTAATTCTTCAACTGCTCTTGCTTCTCTGCTTTTTTTTCTGAATCATTTTGTGACAGGTGGTCTATAATAGCCCAACAGCTTCCTGGGAGAACAGACAATGATGTAAAGATCTACTGGAACACAAAGCTGAAAAAGAAACTCTCTGAAATGGGGATTGATCCTGTTACCCACAAGCCCTTTTCTAAACTCATTGCTGACTATGGAAACATCGGGGGTTGCCAGAAACCAAGTACCAGAATAGGGTCTATCAATAAAGACTTCAAGAGCGCAATGATGCTAAAATCAGAACCCCATCAAACCATGCCACAAGGATCTACAAATATAAATGACCAAGAAACCACTAGAAACAACTTTTTATTCAACAGAGCTCATGGTGATAATCTCTCAATGGACTTTGAGAATGAGATGATCTCAGGATCTGTGTTAGGGGAAGATCGTTTGTCAAAAACTTCATCCCCTTCTACTCCTTCTACTTGTTCCACTTCAGCTTTTAGTTGGAATGACTTCCTTCTTCTAGAAGATGATTTTACACCACTTGACTACCAGGAAACAGACACCCTGGTTTCAAAGGAGAATGTGGTGACCATACAGAGTTGGAATAGCAAAGAGGTGAAGTCACAGCATGCCTCGGGTAGTAGTGACTTCCAATTTTCATCATCCTCTCACACTTCATTCATAGAAGCCATGCTTGATCAAGAAAATGAAATGTTTCTGAGTTTTCCACACCTTATGGAGGAACCATCCAACTTGAGTTAA