Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08926 LG2 12487570 12489816 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein ATHB-16-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 12487963 synonymous_variant p.His34His
A/G 12488161 downstream_gene_variant
C/T 12488230 downstream_gene_variant
T/A 12488253 downstream_gene_variant
G/A 12488553 synonymous_variant p.Ala137Ala
C/G 12488892 downstream_gene_variant
G/T 12489127 missense_variant p.Lys182Asn
T/G 12489596 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08926.1
MVGGTVFSAASSLTTLLPNQSPPSASQPLDSIFHSSSSASSSPFLGSRSIVSFGGVQGGKGCNESFFLPYDDNGDEDTDEYFHQPEKKRRLSVDQVQFLEKSFDEENKLEPERKIRLAKELGLQPRQVAIWFQNRRARWKTKQMEKDYDSLHACYNDLKASYDDLLREKDKLQAEVAKLSEKVLEREKLEEGNFYRAETKGFQEPLQKSMIDSASEGAGSKVDISSAKSDMFDSSESPRYTDGVHSTLLETGDSSYVFEADQSDVSQDEGDNLSNTLLPHYMFPKLEDVGYTDQPHNSCHFGFPEEEDQAIWSWSY*


CDS Sequence:
>Vu_08926.1
ATGGTGGGTGGGACTGTCTTTTCCGCTGCTTCAAGTTTAACCACTTTGCTTCCCAACCAATCACCTCCTTCCGCCTCTCAGCCTCTCGATTCCATTTTCCACTCTTCTTCTTCTGCTTCTTCTTCCCCTTTTCTCGGTTCAAGATCTATAGTGAGCTTTGGAGGTGTTCAAGGGGGGAAAGGGTGCAACGAGTCGTTCTTCCTGCCTTACGATGATAATGGGGATGAGGACACGGACGAGTACTTTCATCAGCCTGAGAAAAAACGCAGGCTGTCCGTTGACCAAGTGCAGTTTCTTGAGAAGAGCTTTGATGAGGAGAATAAGCTCGAACCCGAGAGGAAGATTCGGCTAGCTAAAGAACTCGGGTTGCAGCCGCGGCAGGTGGCGATTTGGTTTCAGAACCGCCGGGCGCGGTGGAAGACGAAGCAGATGGAGAAGGATTATGATTCCCTGCACGCATGCTATAATGATCTCAAGGCCAGCTATGATGATCTTCTCAGGGAAAAGGATAAGCTCCAAGCTGAGGTAGCAAAGCTCAGTGAGAAGGTGCTCGAAAGAGAAAAACTGGAGGAGGGGAACTTTTACAGGGCTGAAACCAAGGGATTTCAGGAGCCGCTGCAGAAGTCTATGATTGATTCAGCTTCAGAGGGTGCAGGGTCCAAAGTTGACATTAGTTCAGCAAAGAGTGACATGTTTGATTCATCAGAAAGCCCACGTTACACTGATGGAGTACACTCTACTCTCCTTGAGACCGGTGACTCTTCTTATGTGTTTGAAGCTGATCAGTCTGATGTGTCACAGGATGAAGGAGATAACCTGAGCAATACCCTTTTGCCTCATTACATGTTTCCCAAACTTGAAGATGTTGGTTACACGGACCAGCCTCATAATTCATGTCATTTTGGATTTCCCGAGGAAGAAGATCAAGCCATCTGGTCTTGGTCTTACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_08926::LG2:12485570-12487570(+)
GCTTGATTTGGTTTTGGAGAACTAATTGTTCACAGAGAGAAGTAGGTACTTAGTAAACAATGATCATTTATATGTAAAGCATCCAAACCATACTATTCCGTACAGGGAAAATATGTCAACAATACTTAATGTAATAATCAGCCTGAAGAGCTGTGATGTGTTATTTGAAAGGTCAATTAATTTCCTGCTGCTCAAAATTGTATCTGCAATGATAATGAGAACTTGGTTCTGCATCATTCACATTTTAGAATGCTTCTATTCACAGTGATAGTGGCAAATGGATTGTCTAATTAAACAAGGCCACTGAACACATTATGCTATGAAAGACAACCTTATCATGCTCACATAGCTTTTACAAGAGCTAGGTGGAGTAGAAACTGCTGATTATAACCCAGAAAAGGTCCATTATGAAATGGGTAGCTATATAATCACTAACTGAACTTGGTCCAAGGGAAATGAAAGCAGCTGAAGACTTTGAGGAAGTACCAATTTCTTTCGAAGTGTAAAAATAGAGAGTGACAAGGACAATGTCAACGACATCTCTTGCATTTGTACGAAGTTGTACCAGGTACATATACCGATTCTAAAGGTATGTGTGGGTAATTGTACACAGACATACATCCTCCAATATGTAAAGACATAATAAAGGCTGCAAATTGTTTTCAAAGAACATGAAAGTGTTTTTAACAATTTTTTATAATAAACTATGTGTTTTATTGATTCTTATATTTGAAATACATCAATCACAAGTCACGTGGTAAAAAAATTATAAAAAAAAAAGTTGTTAAAGAAATATTTTTCCGTAAATAAATCATAAACATATTTATACTAATTGAATATTTGAACAATTTCATATAGATATGACACTTGTGAGCACTATAACTAACCTAATACACTTGTTGGATTAGAATTAGACACCAATAAGGTTTTGGCATCGTTATTGAAGACTTGTATCAATACATTCAGTAGTTAAATATGTTTAGATTTGCTTGTAAATCTATTAATATATCTAACAACCTTAAATTTTGTTTTTAGTTACTCTTCATTGCTCACCTTCTCGTGAATTGTTACTTGCATGCAAAACAAAAGACATGTGAAAGATTACTCTTTAATCCTAAAATAGAAAAGAAAATAAGAAAAAACAAAAACCGAACAAGAAAATAGAAACAAGGAAATCTAGAAACTATTCTAATATCCTAATATGAAAATTAAAATAAAATGAAGTGAAAAATGTGGAAAAAAAATTAAAACATACATGAAAATTAAAATAAAAAATAAAGCCTAGAAACTAATATCCTAATATTGTAAAATTGATAAAATAGGTTATCCATGTTAATCTATCATAGTCAATGAATTCGGAATCAAACATTTGGATATCCATAAAATATTGTAAAAACATGATAAATTGAAATTAGCAGTCCATAAATTAAAATATTATAAGTTTTACTATCATTACATATATAAAAATTTTGAATATTCAATAAAACGAAAATATTTAATAAAATTCAACTAAAAATGTTCAAAATTTTAAAGACTTGAGATTCAATTAAATTTTAAATAAAATAATTAAGCTCATTTAACATTTCAAGAACAACTTATTCATATATTACATAATTAGCTTAATAAATATATTTAAATAGTCAAAATATTTAAGAGGTTATAAACATTAAAAAATTACAAGGTGACTGTAAAAATTAAAATATTTAAGAATGAAAGAACAAAACAAAAATTTAAACCTTGCAAAATGAATATGAAAATTAATCATTTCACAGAAAGTAAAGCTAAATACTTTTAAAAGGATGTTAGGATCTCCCACATGGCGTTGCCCGTTGCACTGGCCCTAAACAGTAATTAGGCAATGTAAACGTGCGAAATGCACAGGATCAAGTAAAATGATTAAGGTTAATTGCACAAGGGCATCATCGTAAAGCACCATCGTCGTTATCCCTGTCTTGCTCCATGTGCCTCGTATAAACCCACGATTCCCTCCTCTGCCAGGA


Gene Sequence:
>Vu_08926(+)
AACCCCAACAGAACCAATCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCACCTTCCTACCTCCTTTCCCCTTCCACTCTCTTCCAATATCACTTTTTCTTGTTTTTCAATTCCCCATCTTTTGAGAGTCTCAGTGATGGGTGTATGCTGTCGCTGTTCCCACACCTCACACATCACCGCCATCATCATCACCAGCTTCTTCCGCCACAAGCCTTAGATTTTTACAGTTTTACTTCATCCACGTATTTCAACACCGTTGACCACACCCCATGGTCTTCCTCTGAGGATCCAAAATGGTGGGTGGGACTGTCTTTTCCGCTGCTTCAAGTTTAACCACTTTGCTTCCCAACCAATCACCTCCTTCCGCCTCTCAGCCTCTCGATTCCATTTTCCACTCTTCTTCTTCTGCTTCTTCTTCCCCTTTTCTCGGTACCTTCCTTTTCTCTCTTCTCAATTACAATAAAGGCTTGTAACACAGGCAGCCCTAGCTTATACATTAATTTAGGCGATAAAAATAAACTCTTTTACAATCTGAACAAAAATTCATGAATAAAAACTACAACTTGCACTTGCCCAAGTTGTGATTGGGTTAACCAAGCATCCTACAATAATTTACAAACATGGGTGGATGGAATAGGACTCTTAGTAGTCTAAATTGTCACTTTTTATACGTGGGTAATGGTCTTTTTGTGGTGGTGTTGTTTGTTCAGGTTCAAGATCTATAGTGAGCTTTGGAGGTGTTCAAGGGGGGAAAGGGTGCAACGAGTCGTTCTTCCTGCCTTACGATGATAATGGGGATGAGGACACGGACGAGTACTTTCATCAGCCTGAGAAAAAACGCAGGCTGTCCGTTGACCAAGTGCAGTTTCTTGAGAAGAGCTTTGATGAGGAGAATAAGCTCGAACCCGAGAGGAAGATTCGGCTAGCTAAAGAACTCGGGTTGCAGCCGCGGCAGGTGGCGATTTGGTTTCAGAACCGCCGGGCGCGGTGGAAGACGAAGCAGATGGAGAAGGATTATGATTCCCTGCACGCATGCTATAATGATCTCAAGGCCAGCTATGATGATCTTCTCAGGGAAAAGGATAAGCTCCAAGCTGAGGTGAGTTCAGTTGATGCCACTTGCTGAATTCTAGAATGCCAAAGTCGATGTATAATTTAGCTCTTGAAAGTAGTAACGTAATTGAAGTTGATTCCACTTGTTGAATTACAGAATGGCAAGCTTTTGGTTAGCATACAATTTTGCTCTTGAAAGTAGTAACTTGTGTTAAATTGTTGATTTGATAAAGTGTGTCTTCCCGTTGGCAATCTGTTAGTAAGTTTGCTCGGAAATTGTTTAAACCAGCATTACAGTGTCTTGGTTAGAATCTCATAGCTGGGTCATTGACTCATTGTCTCAAATGCAGAGATTTACCATATCAAGTTGTCAATTTATAAATAATTGTGTCCGTCTAAAAGGATTCATTTACCACTTTGGATGTTAACTTACGCACCATTTTATGATTCATGAAAATGTTTGTGATTGTGGTCTTTCAAAATAGGTAGCAAAGCTCAGTGAGAAGGTGCTCGAAAGAGAAAAACTGGAGGAGGGGAACTTTTACAGGGCTGAAACCAAGGGATTTCAGGAGCCGCTGCAGAAGTCTATGATTGATTCAGCTTCAGAGGGTGCAGGGTCCAAAGTTGACATTAGTTCAGCAAAGAGTGACATGTTTGATTCATCAGAAAGCCCACGTTACACTGATGGAGTACACTCTACTCTCCTTGAGACCGGTGACTCTTCTTATGTGTTTGAAGCTGATCAGTCTGATGTGTCACAGGATGAAGGAGATAACCTGAGCAATACCCTTTTGCCTCATTACATGTTTCCCAAACTTGAAGATGTTGGTTACACGGACCAGCCTCATAATTCATGTCATTTTGGATTTCCCGAGGAAGAAGATCAAGCCATCTGGTCTTGGTCTTACTGAATTTTCTGTTGTAGTAATACACAACATGCATCTACCGTGGACTCTCACAGGTTCTTCTGTCAATAAATGAGATAATGTGGTAGACATGGGGGAGTGAGTGAATAATAAGCCAAAGAAAAATGGCAGTCTGCTGGTCCACAACCGTGGTTTCTTGCCAGTTCTTTTTTACTTTGCAATGTAACTTTTGGATCAAATGTAATTAATTGAATAATGTCTTCTTGTTGAGGATGTATCTCTGAGTTTCATTTGAGGGATGAATAATAATTAACAGAGTTTATGTTTTC