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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08902 LG2 12227495 12234256 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 12228689 intron_variant
G/A 12228837 intron_variant
A/T 12230225 intron_variant
T/A 12231009 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08902.1
MGCVSSKQAVSVTPAIDHSGAFRSNAAVLGESERKEKKRSKKRTESGGASQSEVGESGRTSSNCESLSFRLGNLHKYVQGEHVAAGWPAWLSAVAGEAIHGWVPLCADAFEKLEKIGQGTYSSVFRARELETGKIVALKKVRFDNFEPESVRFMAREILILRRLDHPNIIKLEGLITSRLSCSIYLVFEYMEHDITGLLSSPDIKFTEPQIKCYMKQLLAGLEHCHLRGVMHRDIKGSNLLVNNEGVLKVADFGLANYVSSGHRQPLTSRVVTLWYRPPELLLGSTDYGPAVDLWSVGCCVCGATCREAYTSGENGGSILLFQNTDVEQLHKIFKLCGSPPDEYWKKTKLPHATLFKPQQPYDSCLRQSFKDLPAASVHLLQTLLSVEPYKRGSATSALSSEYFKTKPYACDPSTLPIYPPSKEIDAKHREESRKKISGRVRGTETRKPSRKPHGVSKLAPAEDFASQTQTSQKVNGRSFRNPEEEKIKIGGKTQKSSSGKAEDASHTKNASQGDIPLSGPLQVSTSSGFAWAKSRKDDASFRSHCRNISRGHIFNPSEPSTLNLRNNLDTTNQENKEFCGGGVNSRGHQLLEISKLSMQNPWSKFDRPDSFDASDEYHSQELSMAIYHREDSASKRNNLSFQDQGERVEFSGPLLSQMHTVDELLERHERHIRRTVRRSWFQRGMTGILRQAHCKVEKKQFVALVLSLFSRTFVLRLEIIERILNVHDSEVNHILAIKEFTALSLNKIVDMAFLVNLCALDCSPTTEKPILIPQAHSFDQSDLYSDTV*


CDS Sequence:
>Vu_08902.1
ATGGGGTGTGTGAGCTCGAAGCAGGCGGTCTCCGTGACGCCGGCGATTGACCACTCGGGCGCGTTTCGGAGCAATGCTGCGGTTCTGGGCGAGTCGGAGCGCAAGGAGAAGAAGAGGAGCAAGAAGAGGACCGAGTCGGGGGGAGCGAGTCAGAGCGAGGTCGGTGAGTCGGGGAGAACGAGTTCCAATTGTGAATCGTTGAGCTTCAGGTTGGGGAACCTTCACAAGTACGTGCAGGGAGAACACGTGGCCGCCGGCTGGCCAGCGTGGCTCAGCGCCGTCGCCGGCGAAGCCATTCACGGCTGGGTCCCCCTCTGCGCCGATGCCTTCGAAAAACTTGAGAAGATAGGGCAGGGAACGTATAGCAGTGTGTTTCGGGCGAGGGAGCTTGAGACGGGGAAGATAGTGGCATTGAAGAAGGTGCGGTTCGACAATTTCGAACCGGAGAGTGTGCGGTTCATGGCGCGTGAGATATTGATTCTGCGACGCCTTGATCATCCCAATATAATAAAGCTTGAGGGCTTGATTACTTCGAGGCTGTCCTGTAGCATTTACCTCGTCTTTGAGTACATGGAGCATGACATCACAGGGCTCTTGTCTTCCCCTGATATCAAATTCACTGAACCACAGATTAAGTGCTACATGAAGCAGTTGTTGGCTGGTCTTGAGCACTGTCACTTGCGGGGAGTCATGCATAGGGATATTAAGGGGTCGAATCTTTTGGTAAATAATGAAGGGGTTTTGAAGGTAGCGGATTTTGGGTTGGCGAATTATGTCAGTTCTGGGCACAGGCAACCTCTGACTAGTCGTGTTGTTACCTTGTGGTACCGGCCGCCAGAGCTTTTGCTTGGTTCGACGGACTATGGTCCGGCCGTGGATCTCTGGAGTGTTGGTTGCTGTGTTTGCGGAGCTACTTGTCGGGAAGCCTATACTTCAGGGGAGAACGGAGGTTCCATTTTGCTTTTTCAGAATACAGATGTTGAACAATTGCACAAAATTTTTAAGCTCTGTGGCTCACCACCTGATGAATACTGGAAAAAGACTAAACTTCCTCATGCAACGTTATTTAAGCCACAACAACCATATGATAGTTGCCTTCGACAATCCTTTAAAGATTTGCCAGCGGCCAGTGTACATCTGCTACAAACTCTTCTTTCTGTAGAACCATACAAACGTGGGAGTGCTACATCTGCTCTTTCATCGGAGTATTTCAAAACAAAACCTTATGCGTGTGACCCATCGACCTTGCCGATATACCCACCTAGCAAGGAAATCGATGCAAAACACAGGGAAGAGTCAAGGAAAAAGATTAGTGGACGAGTTCGTGGAACTGAAACAAGAAAACCATCCAGAAAGCCACACGGAGTCAGTAAACTAGCCCCAGCAGAGGATTTCGCAAGTCAAACTCAGACTTCCCAGAAGGTCAATGGTAGATCTTTCCGCAACCCTGAAGAAGAGAAGATTAAAATAGGTGGCAAAACACAGAAGTCATCTAGTGGTAAAGCTGAAGATGCTTCCCATACGAAGAATGCTTCTCAAGGAGATATTCCCCTTTCCGGGCCGTTACAGGTTTCAACATCAAGTGGATTTGCATGGGCAAAAAGCAGAAAAGATGACGCTTCATTTCGATCCCATTGTCGAAATATTTCAAGAGGACATATTTTCAATCCATCAGAACCTTCTACATTAAATTTAAGGAATAATTTGGACACCACAAACCAGGAAAATAAAGAGTTTTGTGGGGGAGGCGTCAATTCTAGGGGCCATCAGCTGCTTGAAATTTCTAAGCTTTCAATGCAGAACCCGTGGAGTAAGTTTGATCGCCCAGATTCATTTGATGCTTCGGATGAGTACCATTCACAAGAACTGTCTATGGCCATATATCACCGAGAAGATTCAGCATCCAAGAGAAATAACCTGAGTTTTCAAGATCAAGGAGAAAGGGTTGAATTTTCTGGGCCCCTACTATCTCAAATGCACACTGTTGATGAGCTCTTGGAAAGGCATGAGCGTCACATCCGGCGAACTGTCCGGAGATCATGGTTTCAGAGAGGTATGACGGGCATATTAAGACAAGCTCACTGCAAAGTCGAAAAGAAGCAATTCGTTGCATTAGTGTTATCTCTTTTCTCCCGGACTTTTGTGCTTAGGCTTGAAATCATTGAAAGAATATTAAACGTACACGACTCTGAAGTTAATCATATATTAGCCATTAAGGAATTTACTGCCCTATCTCTCAATAAGATTGTTGACATGGCATTTCTTGTTAACTTGTGCGCTCTGGATTGCAGTCCTACTACTGAGAAGCCTATTCTCATTCCCCAAGCACACTCCTTTGATCAATCAGACTTATACAGTGACACTGTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_08902::LG2:12234256-12236256(-)
CAAGTTATTAAGTAACATGCACCGTCATTATGTACGCGAATAATAATAATAATATAATAATATATTAATAAAAACGTTAAAAGTTTGTACAACAGGCCACATATTATTTTGTATTAGTTTTAAAATAAATATAACTTTGAATTTTCTATAACTACCATAATATTTCTATAATAAAATTTCATTATTAAAAATAAATGCACCCCCTCCACCAAACACGCAACAAATAAAAGAGATGATTTAGGTGTTGAACTTTAACACCATTCATTGCTCTGGTTTGTGTGAGGAATGGAAGTGGCAATGGCAACAGTTAGAGATTTAATTTGTGATAATCAAATGGGAATGAGATGAATTGGACTGATTTCCTCTGTGACATGATGGACCCAAACTATTCATTCAGTGCGCTTTAATCTTCCAACCCTAATCACCACCCATCACACCCACTTTTGAATTTTCTAAGTCCCACATCCGAAAGCTCCCAGAGTTTTACAAATTAGATTTGTTTATGAATTCAATTCCAAGTTGGAGAAGGGTGAATGTGAACACGGTGGAAGTTAGACCAATATATTCTGCATTTCCAGAGTGGCATCACACGATGAAGAATTTGGTACCATAGAGATGCTTGGCCCACTCTTGTTGGTGTTGTTATTATTGTTTTACCTTTCAAGATGAACTCAGTAATGGGTGGGCCATAAGACTGATGAAAGTAAAGAGGAATTGTCAGAGGTGAGAAGGAACCGTAGGAGAGGTTGAAGAAAAGAAGATCTAGAAATGTAAAGTCTACACCTCATCCATGGATCTTTTTTTTCCCTTTTCCTTTCTTTCTCATCTTTTCCCATAAATAAAATCAAATTACCTATTTAACCATTCTTTCATATTAACAAAAATCAAGTGGATGTTTCTGAATCTTTCTCTTTCACATCCCCACCATGGCGTGAAGTGGTAAAACCTCTAAATTTAAAATTAAGAAAACCAAAATTAAGAATTAGGAGACAAATCAAGTATCCTTCAAGTCAACACCAACCAACCAGTGTGAAAAGCAAAACAGAATATTAATTAAATAATTAATCAATAATCATTTGTAAACGAATCAGTGAGTTACACGAACACGTACTTCACACGCGCTTCACAAAATCCAAAGCAATAGAAGAAGAAGATGCCCACAACACATCACAACTACTGCAAGCCAAGCCTCTGCCATGCATGGATTCCCCTTCCCTTGGCCATTTGGGAACAACCCAACGAACACAACACGAAAACAAAACACGAATGCAAACAAATGTAGAGAATATAAGGTCTTCCAAACACCATTTTTTACACTCACTGTTTTCCCATTATAGGTCCCTCCGTTGATCTAGGCTTTCTCATTTCATATTTTTCTTTTCATTTCTACAAAATTATGGTAAATAATTTTACTGAAAATGTTCATTGACCAATTTTATATGATGTTAAATAATTAAAGATAAATGAAACAGTTTTATCCAAAAAAAATTATTATTTCTGGTGATTAAAATAATTTTTTAAAGTAAAACTAAATTTTTACCTTTGTAATCAACACAATAAAATAGTTCATGAAATATAAATGCGTATCCAAATAATATTTACCTGTGATCTAGTAAGATTGCCTACCTATTGTTGGTTAACTTTATCCAATTTTTCTCCATTTTTTTAATGCATATTGAAGCCTCTGCTTATAGGTAGCAGTGGATCCACTTTGTAGTGTTTCTATTTATTTATTTTAAAAAAATTTAAAATTTATAGTCCTCCTTCCTCATTAAATCTCTTTTCCCTCAGTCTCCCGTAATTGCCGCGGCAGTCAGACTGAGGAACACAAAGCGACACTCGCTTTCTGCGTTTCTCTAATTGCATCGCTTTGCTCAGCTTCGCTTCGTGTCGCTTTACTTTCTTGCTTTGTTTCTTCGTTTCTTCGCACCAGTATAAAAGACGCGTAGCGTAGACTGCGTGTGGCAATTTGAATTGGGTTCAGGATCCGACCCGGATCC


Gene Sequence:
>Vu_08902(-)
ATGGGGTGTGTGAGCTCGAAGCAGGCGGTCTCCGTGACGCCGGCGATTGACCACTCGGGCGCGTTTCGGAGCAATGCTGCGGTTCTGGGCGAGTCGGAGCGCAAGGAGAAGAAGAGGAGCAAGAAGAGGACCGAGTCGGGGGGAGCGAGTCAGAGCGAGGTCGGTGAGTCGGGGAGAACGAGTTCCAATTGTGAATCGTTGAGCTTCAGGTTGGGGAACCTTCACAAGTACGTGCAGGGAGAACACGTGGCCGCCGGCTGGCCAGCGTGGCTCAGCGCCGTCGCCGGCGAAGCCATTCACGGCTGGGTCCCCCTCTGCGCCGATGCCTTCGAAAAACTTGAGAAGGTGAACCGTCACCAAATAAACAAAAGTTAAACTAACTTTATTGTTAATTAATATTACTATTATTATTATTATTATTCTAATAATAAGTATTATTATTATTAAGATGATGATGATGATGAAGTAATTGATTGGAGGTTGTTGATTTTGACAGATAGGGCAGGGAACGTATAGCAGTGTGTTTCGGGCGAGGGAGCTTGAGACGGGGAAGATAGTGGCATTGAAGAAGGTGCGGTTCGACAATTTCGAACCGGAGAGTGTGCGGTTCATGGCGCGTGAGATATTGATTCTGCGACGCCTTGATCATCCCAATATAATAAAGCTTGAGGGCTTGATTACTTCGAGGCTGTCCTGTAGCATTTACCTCGTCTTTGAGTACATGGAGCATGACATCACAGGGCTCTTGTCTTCCCCTGATATCAAATTCACTGAACCACAGGTAATAAACCAATCATATTTTCAAAGAAACAGAGAAGCAGGTTTCTTTTGTGCGTCTCGTTTCTATCTCATATCCACCTGTGAATACGGGCAAAAGAATATATATGTATACATTTATATAAGCAGGGGTAATTATGATTATGACTTTATCAATTAGTTTTTCGGTTAAGTCAAAATCTAAAATTCTTAGATTGCAGCAGAGTTTATTTTGGCAACTGTTGTTAAATTTATAGGTCGTTGTCAGATCATTCGTAGTTGTGATGTTCACTTTTACAAATTTTACTGTTCAAGCCGTTTAATCTTTGAAATGAGGATGTACGATGGAGATTCTATATTGATTAGAGATATAAATAGAAGACAACTTTTACCCCATGAACTAGTTTCAACAGTTGAGTAATATTAATTTAGAATAGAATGAAACTTTAATTTTAACTAAAGTACCAAAAGTAACTAGGATACTTTATCCAAGTTTTTTTTAGTAATAGTAATACAAGTAATTAATGTATTGTTGCGGGGGTGTGATATGATTTATGATTCTATTGTTGAATGGGTGAAATGATTTTATTGTGTGAGCAGATTAAGTGCTACATGAAGCAGTTGTTGGCTGGTCTTGAGCACTGTCACTTGCGGGGAGTCATGCATAGGGATATTAAGGGGTCGAATCTTTTGGTAAATAATGAAGGGGTTTTGAAGGTAGCGGATTTTGGGTTGGCGAATTATGTCAGTTCTGGGCACAGGCAACCTCTGACTAGTCGTGTTGTTACCTTGTGGTACCGGCCGCCAGAGCTTTTGCTTGGTTCGACGGACTATGGTCCGGCCGTGGATCTCTGGAGTGTTGGTTGCTGTGTTTGCGGAGCTACTTGTCGGGAAGCCTATACTTCAGGGGAGAACGGAGGTATTAGCCTTACCACAATGCATGAGTTGCCCTGTTATGGTGCATGTTAATGTAGTGAAGTTGTTACATTTTTGTGAGAAAAAAATGGCTAATCTATTGATATGAGTCAATGGTAAATCTTAAATATCTTTGATTTGATAATGTACATGAATGAAGAAATTCGATAATGCCTCAACACATAAGGAAGCAACTGATATGGAAATGTTGCTGTAACTTTTGATATCATCTTTCTTCCTATGATGAAGGTTCCATTTTGCTTTTTCAGAATACAGATGTTTTTATTTTCCAACATGCCTTCATGTTTACATGGAAGAAGCTTTTATAATTCCATATTTTTGCCGTCAAATATTTAACAGAGCTGAAGTTTAGTTCCCATACCTATTGCAAGAGGTTGCACTGCAATTCGTCAATAGTTTCATTTAGAATTTGCTATCATTGCGTGCTCAGTAGTAGGGTTTCCATCATTCTATATTTCAAAAGGTAAAGTGGAGAATATACTCAAACTAAAGAATATGTATGATACCTATTGGCATTAATCTTCAGAAAAGGAAGTAATTCAATCTGACAATCCTCCTTAATGTTAGACCGGATGCTAATCAGTTTTGTGGTTAATAAATGAATCAGCTGGAAATGAAAATTCTGACACTGTTTGATTCGTTATTTTGGAACTCTTCTAAATTCATTTTTGTTATGTATGCAGGTTGAACAATTGCACAAAATTTTTAAGCTCTGTGGCTCACCACCTGATGAATACTGGAAAAAGACTAAACTTCCTCATGCAACGTTATTTAAGCCACAACAACCATATGATAGTTGCCTTCGACAATCCTTTAAAGATTTGCCAGCGGCCAGTGTACATCTGCTACAAACTCTTCTTTCTGTAGAACCATACAAACGTGGGAGTGCTACATCTGCTCTTTCATCGGAGGTAGGTTAATTTTGTATTTGTTGGAAATTCCTGAAATACATTGTGGTTAATTGGAAATACTCAGCATATTTGTTTAGGCAAGCTTTTTCCTATTTTATATCCTTTTACCTTAGACAATAGTTTGTTTGCATTTTTTAAGGTGTTTATTTAATCAAATAGACAAATTTATGCTTTTCTTGAGTTTGTTTCATTTGTTTATTGTAAAAATAAACAGTTGTCTGCTTATTTTAACAAGCACATTCTATCTTCATATTAAGTCTTTGATTATTTTAAAAATCACTTATTTAAAAAAATATCACTTATTTAAAAATCACTAATTTAAAAATCACCTATTTAAAGTGCAAACAGACCCAATTACAAAATATCATTTTTTTTTTTCGTTTTGCTTCTTATTTTCAAATATTTGTAGGAAACCCTGAACACAAGGATTTTGTTTACATTCTTTCCTGTAAAAATCTTTGAAATCAAGAAACATGGTGAAAATAATCCGACATTCTTCTGAATTAGTTATGAAAACAAAAAATAAAAATAGATTTTGTTTTTTAAACCAAACAGACCTTGATTTATGTATAGCATTAGTTATGCATAGTATTAATCTTTCTTGCATTATCTGTTGATTTCTCTTGCCAACTTTTTTGGTGGATATCCATCATGTGAATCAATTCGTTTTTATGACATTAGTCTTAGATACAAAGCCATTCATCATTTATTTGCAAAATATATGATTATGTGAGTCATTGAAATATGATAAGCGCTCTTTCTAAAACTCTGTTCTGATACAACGACCTTACCACTTTCAGTATTTCAAAACAAAACCTTATGCGTGTGACCCATCGACCTTGCCGATATACCCACCTAGCAAGGAAATCGATGCAAAACACAGGGAAGAGTCAAGGTGAGGCTGATATTCATTGCACATTTTATGCAGAGTTATTCGAAAGTAATGCTTTAGTTGTTACATATTCAACTGATGTCTCAGGATTACCTCTTATTTGGCTGGTGAAAATAAGAGAATGCCTGCATATGCATTTTACCTGGTTTTAACCAATCTGCGAGAGAACGTTTGTTTTAGTTTGAAAACTTCACCAGGGTCTAGTTTTGGCCTCAGGGAGAGATTAGGAATGGTGTTTATTAATACTCTACTAATCATTTGAATGCACATACTTGTGCAGTTAATTTACACTGTGCTATCAAGGAACGAAGTAAACAACGTAGTGTTTTTGTTGTAAGAATAACAGGAACTCATGGAGGACTAATGCCTGTTCCTACTTCCAAATGAGAGGGAATAATCCTTACTGTTTTATAGCCTCCTTCTTCTCTTCAACCTCTAGATTTTTCCATGGACTATTTTATTGGGATATGTTTTTGAGGAGAACCTAGGCACCAGAGTAACGGAGCTAGACAAATATTTGTTGTGATGTCCACACTTAATGATTTATGAAAATACAAAAAAAAATTAAAACGTAACAATGTTCAAGAAGTTCAATTTGTCAACATTAAGCATTCACAAAAGAAATAAATAAAAAATTGAAGTCAATAAAATTCCGGGTAGCCAATAGATTTTTCTTTAGGTTGCCAACTATGTTTATCTTAATTAGGCTCAAATGTTTTGTATAAGCGTGATAATTTAGTCCTACCCTCAAAAATAGTCTCTCTGCATGGCCGGGGCAAAACTATTACTTCTAACATCCCCAGACCCCACTAGCTAGGAGCCTAATGCTATGTTTCCTTTTTTATATATATCTTTAAAGGATTTGAAACAGAAAAATTCAGTGAATCAACAGTGTTTGGCAAATTAAATCGAACAAAACTATTCTTCACAAATTCCATTTTCACTAGCATTATTTGTATATTGTTCTTGATTTTTTTCATGAAATTATAATGGACTTTTAGGAAAAAGATTAGTGGACGAGTTCGTGGAACTGAAACAAGAAAACCATCCAGAAAGCCACACGGAGTCAGTAAACTAGCCCCAGCAGAGGTCTGTCTTTACTTTCAATTCTGCATCTTAGCATTTCTTCTTATGAGGATGCACATTGATTTACATTAATGGGCTAATTATTGTAAACTAATTCTCACTTATTGCACTTGCAGGATTTCGCAAGTCAAACTCAGACTTCCCAGAAGGTCAATGGTAGATCTTTCCGCAACCCTGAAGAAGAGAAGATTAAAATAGGTGGCAAAACACAGAAGTCATCTAGTGGTAAAGCTGAAGATGCTTCCCATACGAAGAATGCTTCTCAAGGAGATATTCCCCTTTCCGGGCCGTTACAGGTTTCAACATCAAGTGGATTTGCATGGGCAAAAAGCAGAAAAGATGACGCTTCATTTCGATCCCATTGTCGAAATATTTCAAGAGGACATATTTTCAATCCATCAGAACCTTCTACATTAAAT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