Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08861 LG2 11591073 11592464 PREDICTED: transcription factor bHLH47-like isoform X1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 11591127 synonymous_variant p.Thr209Thr
C/G 11591174 missense_variant p.Ala194Pro
T/G 11591330 missense_variant p.Met142Leu
C/T 11591348 missense_variant p.Val136Ile
A/T 11591367 synonymous_variant p.Gly129Gly
C/T 11591564 downstream_gene_variant
G/T 11591596 downstream_gene_variant
C/T 11591612 downstream_gene_variant
T/C 11591613 downstream_gene_variant
C/A 11591626 downstream_gene_variant
G/A 11591634 downstream_gene_variant
T/A 11591654 downstream_gene_variant
G/A 11591658 downstream_gene_variant
G/A 11591670 downstream_gene_variant
T/A 11591680 downstream_gene_variant
T/C 11591682 downstream_gene_variant
A/G 11591715 downstream_gene_variant
C/G 11591742 downstream_gene_variant
C/A 11591746 downstream_gene_variant
C/A 11591785 downstream_gene_variant
T/A 11591831 missense_variant p.Ile98Phe
A/C 11591834 missense_variant p.Cys97Gly
T/G 11591838 synonymous_variant p.Gly95Gly
A/G 11591899 missense_variant p.Ile75Thr
C/A 11591990 downstream_gene_variant
A/G 11592010 downstream_gene_variant
T/C 11592079 downstream_gene_variant
A/C,G 11592080 downstream_gene_variant
T/A 11592225 stop_gained p.Lys46*
G/C 11592274 missense_variant p.Asn29Lys
C/A 11592283 synonymous_variant p.Val26Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08861.1
MMGSEISSTVVEKLNNSQDLSRKRSCANKQKQEKIPKRIRKAEREKEKREQLNELFLGLADTLDLKEQNNGKASILRESIRLLKDLFSQIESLKKDSVSLLSETHYVTREKNEMLEENCVLKSQIEKLAGEIEARVVQCGHNMMNPFPEPEKITEFSGENLQLSNTEAAVQQGHAVLVVPISTNHGPHNVVEQIAKPKSTITKPHPRYPTQMDSWPLQLLAEQPTSN*


CDS Sequence:
>Vu_08861.1
ATGATGGGGTCTGAGATTTCATCCACTGTTGTTGAAAAGCTCAACAATTCACAAGATTTATCAAGAAAGAGGTCTTGTGCTAATAAACAGAAACAAGAAAAAATCCCTAAGAGGATTCGCAAGGCTGAAAGAGAGAAAGAGAAGCGTGAACAGTTGAATGAACTCTTTCTTGGTCTTGCTGATACACTCGATCTTAAAGAACAGAACAATGGAAAAGCTTCTATATTGAGGGAATCCATCAGATTGCTGAAAGACTTGTTCAGTCAGATCGAGTCCTTAAAAAAGGACAGTGTATCTCTGTTGTCAGAGACTCACTATGTGACTAGGGAGAAAAATGAGATGTTGGAGGAGAATTGTGTTCTGAAAAGTCAAATTGAGAAACTTGCAGGTGAAATAGAAGCAAGAGTAGTCCAATGTGGACATAACATGATGAATCCATTTCCAGAACCAGAAAAGATTACAGAGTTTTCAGGGGAGAATCTGCAATTGTCCAATACAGAAGCAGCAGTGCAGCAAGGACATGCAGTTTTGGTTGTCCCCATAAGTACTAATCATGGTCCTCATAATGTTGTTGAGCAGATTGCAAAACCCAAATCAACTATTACTAAACCACATCCCAGGTATCCTACTCAAATGGATTCATGGCCACTGCAGTTGCTTGCAGAGCAACCAACTTCAAATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_08861::LG2:11592464-11594464(-)
CAACTTATTAGAGATATATATCCTATCATATCCAATAGTCTTATCATATCCAATAGTCTTATGTTGCTTAAAAGTCGAAACTTGATACAGTTTAAATATTACTTCCTCTTTCCATCTCCAAGACATCTTTTAAGAATAAAATTATAACTAAATTTCAATCTCCAAAATGACCATATACTAATAAAATATAATGATTAATCCTAATAGAAAAACTTAAAATAAGAATAAATTATATTAATTTTAGTTATAAAAAACATTTTATTAAGAAACAACATAATTCTTTAGATAACATATTATATATATATATAATTGGATGTGTGAATTAATATATTACTTCTTACTCATATAATTATTTCAAAACTTTTTATTATAAAATTAAATTTACATATCAATATTTGACCAATGCTTTGCTGCACTGTTTCCAATAATAGTTACATTTTGGAATTTCTTTTCTTCAATCTTATACTATCGAATGATTTCCATGACATTTCAAACATTTCCCTGGATATAACATATTTAAACTAATCATTTAAATTCACTTTAGAAAATTTTGTTAAATATTTTATTGAAGAATAATGTATAGTTTGGATCAGATTATAGAAACTAAAATTTTGAAAAAGAAAAAAGGATAGAAAATAAATTGTTTGACTAAAAAAAGTAAAAAGAATAAAATATAAAATGTGTTTTTTAATTATTAGTTCTTTATTTTAATATTATTATTTTATTACAAATAAGAAATATAAAAATTAATCCAAATGAATTATGTAAAGTTGATATCTGTAAATATTAATAAAATAGTTATAATCTAATCAATTATGTATTATGAACTTTTTTGTACAAACACTTTTATATTTTTGGGAAAAATTTAATGTATATATTATTATTTTTTGAATTTTTATTTTATTTCATTTTTATTATTTATGTTAATCATTCATGTATTAAAATATGTAATAATTGTTTTAATAGTTACAATAGTTTGCATAATCAATTTCATATGGATATCAAAGTTATTTTATAATTCTTTTATCAACAATATCGTCAACCTTTTTAAGTATAGTACAATTTTAATGAAATTGAGAATTTATATTTTTTTAACATTTTTTTCAACAAAATCATGGTATTTCTTTTTAATATTTACTTTTCGCTATGGAAGAAAACATATGCACTAAGACAACTTTAATACTCATTAATAGAAGTGATTTTTTTTCAGAAATATAAAATAAATATTTGACTTACAAGCTCACTCCACTTTTTGTGTATTAAGAACTGTGTTTTTTTTCACATGCAAACTCAACATTAACACTTTAATTTTAAAGTGGTTTTTAACATCAGAACATTTCAAATATTAAATACAAAGAGGCACAATTTTTAATTTATTAAAGTATACTTTAATGTTTCGTATGTAATAACTTTTATTTTCATTATATTTCTATTAATTAAACTCATTTCTCATGCTATATTTAAAAAATAAAAAATTTACATAAATTATAAAAACACATATGATGATGACGTAGCTAACTTCAACGTGAAAACGTGTTATGTATACAGTAGACACGCGCTGCAGGAACGTGTCACTGTGGACGACACACGATTTTGAGTTAAATTTCAAAATAATTATTAATTACTCATTATTCATGAGTAAGACTTAACTGAATAATTACATTAATTACTAATTTAAAATTCATGTAAATTGTTCCAAACAAGTATGTTTTACTTAAAATAAATACTAGAACCCCACATTATGCTATAATATAGTAATAATTAAAATTAGAAAAAGATGTTATGCAGGAGTTTGAATGGTGGTGGGAGCATACGAGCGTGCGGTAACCACGTGCCTGGTGCGAACTGTTACCTCTCGCCACACTCACACTCTTACAATAATAATGTCTAACTCTTTCCACAAACCTCAGAAGCGTGTCATTTGTAGCAAAGTCGTGCTGGTGAAACATTCACTCTTCAGAAACAATTGCAGGTAATGAAAAAGTTGCTTTGAGATTTCT


Gene Sequence:
>Vu_08861(-)
ATGATGGGGTCTGAGATTTCATCCACTGTTGTTGAAAAGCTCAACAATTCACAAGATTTATCAAGAAAGAGGTTAGAGGTTCTATTCACACACACATGGCTCTTCAAAAGTTTTATTCAGTGCTTAATAGCTTTAGTATCTGGATTCAGTTTGGAAATGCTTAATGTGGTGCAGGTCTTGTGCTAATAAACAGAAACAAGAAAAAATCCCTAAGAGGATTCGCAAGGCTGAAAGAGAGAAAGAGAAGCGTGAACAGTTGAATGAACTCTTTCTTGGTCTTGCTGATACACTCGGTAACTTAATCTTATGTCACCACTATTTCAAATTTTAGTACTTTAATCTTATATCAGATTCTCAAACTTCTGTTATAGTCAATTTGAACTTTATTAGTAATCTGTTTGTTCCATGCAGTATTTTTATGTTTGATTTCTTAGATAAGGTCATCTTTGAGACTTTGCATGGTCTAATAGTAGTGCTGCTTTGTTTCTTTTTCTTTTGGGGTTGTGTTTTTCTCTGGGAAGAGGTAACAGATCTTAAAGAACAGAACAATGGAAAAGCTTCTATATTGAGGGAATCCATCAGATTGCTGAAAGACTTGTTCAGTCAGATCGAGTCCTTAAAAAAGGACAGTGTATCTCTGTTGTCAGAGACTCACTATGTAAGCCCTTCACAAGCTATTGCTTCACTTTTTACCCAATGGTAATTACTTGCATGTGTAGATCGATATAGCTATCTAAAACCATGTTTTTTCTTTAATTATCAATCAAAACATGTTTAGAAAAAAAAAACAATTTCAAAGATTTCATCTATATTTAGGATAAAGTTTGTATCTTTAGTGGTATGTTTGACACAGTAATTGAAATTTTGTCAAAGGTTAATGTATGTTTTTGAATGGATATAGTCTCAGACTAAACCTTAAGAAATTAATAGACCACCATGTTCATTGACAAAAGAAATCTGTAATTCATGATTTCAATCAATTTTTCATCTTGAATATGATTATATGGTATTATCTTAATTGGGCAGGTGACTAGGGAGAAAAATGAGATGTTGGAGGAGAATTGTGTTCTGAAAAGTCAAATTGAGAAACTTGCAGGTGAAATAGAAGCAAGAGTAGTCCAATGTGGACATAACATGATGAATCCATTTCCAGAACCAGAAAAGATTACAGAGTTTTCAGGGGAGAATCTGCAATTGTCCAATACAGAAGCAGCAGTGCAGCAAGGACATGCAGTTTTGGTTGTCCCCATAAGTACTAATCATGGTCCTCATAATGTTGTTGAGCAGATTGCAAAACCCAAATCAACTATTACTAAACCACATCCCAGGTATCCTACTCAAATGGATTCATGGCCACTGCAGTTGCTTGCAGAGCAACCAACTTCAAATTAA