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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08855 LG2 11520476 11520815 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 11520489 missense_variant p.Lys5Arg
T/C 11520618 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08855.1
MSGRKKSRTSKFRESKINDLLLMLKAVLPQQNQTSDSRVSVSMMQIIKETCSHISMLQKEVKELGERVAELVNSAYTSDLD*


CDS Sequence:
>Vu_08855.1
ATGTCTGGCAGAAAAAAGTCCAGAACTTCAAAATTCAGAGAAAGTAAGATTAATGATCTGTTGTTGATGCTAAAAGCAGTGTTGCCACAACAAAACCAAACAAGCGACTCAAGGGTATCAGTGAGCATGATGCAGATCATAAAGGAAACTTGCTCTCACATCAGTATGCTTCAGAAAGAGGTAAAAGAGCTTGGTGAAAGGGTAGCAGAGTTAGTGAATTCTGCATATACCAGTGATCTTGACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_08855::LG2:11518476-11520476(+)
CGAGATTATTAGCTGCGATTATGGTACTGATTTCAAAACTTAGTAAATTACATTTAAGTCCTTTTTAAAGAAATAAATAGAATGATGTGTAAAATAATTACAAACTGCAACCAAATGAATAAAACACAGAGTGTTGAAACATGTTTTAAAAAAGGGCATACAAACAATTCGGTTGAATTAAAACGATTAGTTAGATTTTTTTTCCTTTATTTCTCTTTAATAAACCTTCATAATTGGAGGTCGTTTCTTAACATAATCAATACAGAGTGTGTGTCAAAATATAATTAAGATATGGTTAATGTATTGTATGAACTGATGGATCAACGTAATAGTGAGCGATCAATCAATTTTCCAAAATTTTTAAAACAACATAGATCAATTGGTTATTATTAACATCAATGATTTATTGATATCTTATATATTAAGAAAACTTCAAGATATAGTAAGATAAAACATGCTTATTTGACATTGGGTTGTGATTTGGATCAGTTCTAAACAAAAGTTTATTTCAAAACTTATAAATACAGAGACATGATAAAGAAGTAGGTGATTATATTTATTGGGTATTTAAAATTGTACCTGCTACCCGACCCGTTACCCGCTTGGGTATCTATTTAAAAAATATTTTCGGATATTTTAAAATCCGCGAGTACCCACGGATACCAACAAAAAAAAAATATATTTAATACATTTTTAAAATAAATTTAATTAAAATTACAAAAAATATATATATAATATAATATAAATTAAAATTTAATTATAATTAAATTTAACCTAATAAAATATAATTATATTTTATTTTTAATTAAATTTAATTAAAAAATATATAAAAATTATTTTATTTTAATTTTTTGCGGGTAACGAGTACGCGCGGGGCGGGTAGTATACTATCCGTATTCGACCCGTTTAGAAGCGGGTATTAAAATATTCACTACCCGTTACCTGCAGATACTCGTGTCCGCAGGTAAAATTGCTATCCCTACTTGAGCAAGAGAGTGCATTTAACATAGGCCCACTCGTTCAGATTTGGACATTTAGACTTTAATGAAAAAGATTTGATAAGACATTAGAGAAGATAGACAATCTTCATTAAAAGAAGTAACAAAGTGTGAAAATATAGTTGTCGACTTACATATTGAAATAGTTAATATAAGTTAATGATCATTATTGTTTAATAACTTAGTAATATTACTATATTGTGTGTACAATAGTATGGGTTCTGACAACATTAATGTTTCATGATCCATTATCCTCTTATGAACTTGGAGACGTGATTCGCTCAATCAATACAATAATTGAGACTAATTATCATCATCAATAATTCAACCAAACCTTCTAATTATATTATTAATCAACATTAACTCAAGTAATGTTGACTATCAAGTTCTCAGACCCGACTATAGATAGTAGAGTTAGGTGACTCAAAAAAATTGTTACTAATTTTTGACAGTATTTATTAAAAATGACTAAAATCGAAATTGAATTAAAGGTTAGAATGTTTTTACAGTGTAGATCGGCTCTGATTTTGATGGCCTAACCTACAAAAGTTCCATGACCGAGGAGAACATTACATATTACGGCTGGTTGTGATTGAAACCAACGGACAAAAGGAATATTGTGCAGGCAAAGACTGACAGCGAATGCAATGTTTTGCCAACCTTAATTTCCCACAAAAACAAACAAGATACCGTTAGATTTGCATTCCACTCCCAAAATTCTTGAGGCTGTCTTTAAGGATACGTGTACATCAGATAAGTTCATGAGTATCATCATGGTGTAGTAAACTGTAAGGATTATGTTTGGCAATGAGTCTCTCAACCCTCAAAACCACTGTAATTGTGGGCCATGTAGATCTAATTCTCACTGTTTACAGTGTCAACAGAGTATATTATTAGTATAAAAGAACAGTTTTCGCCCTTCCTCCATTCAAGCATTTTTCAGTTTCTTGGTGGCAACTCACATCAAAGTGAGCACAATTGCAAAACTGCAAACTTTCAGCA


Gene Sequence:
>Vu_08855(+)
ATGTCTGGCAGAAAAAAGTCCAGAACTTCAAAATTCAGAGAAAGTAAGATTAATGATCTGTTGTTGATGCTAAAAGCAGTGTTGCCACAACAAAACCAAACAAGCGACTCAAGGGTATGACATAGCTCACTATGGAAGTTAATGTTAATCCCAAAGGATGAAAATTTCTTCATTCTCTCAATAAAAGCTTATCTATGTTTCGTTGCAGGTATCAGTGAGCATGATGCAGATCATAAAGGAAACTTGCTCTCACATCAGTATGCTTCAGAAAGAGGTAAAAGAGCTTGGTGAAAGGGTAGCAGAGTTAGTGAATTCTGCATATACCAGTGATCTTGACTAG

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