Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08801 LG2 10655407 10658529 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 32
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 10655628 missense_variant p.Ala44Gly
T/A 10655662 missense_variant p.Ser55Arg
T/A 10655712 intron_variant
T/A 10655761 intron_variant
G/A 10655814 missense_variant p.Asp66Asn
G/A 10655837 synonymous_variant p.Leu73Leu
T/C 10655934 intron_variant
C/A 10656055 intron_variant
T/A 10656131 intron_variant
C/A 10656214 intron_variant
A/G 10656269 intron_variant
A/T 10656595 stop_lost&splice_region_variant p.Ter110Cysext*?
A/T 10656637 synonymous_variant p.Gly124Gly
C/A 10657895 intron_variant
T/A 10657947 intron_variant
T/A 10658171 intron_variant
A/T 10658190 missense_variant&splice_region_variant p.Glu220Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08801.1
MEKEEPMQQPLTDSSLTTHSSTSTASDEEQLHSETLSLHSSAHMQRSSTASKLGQVESKSPYKGILDVVYEPLLLLLVLMSAEDIAQHSDEETIVKETVEAPQKQTKSTSDRPSPKAVKVQKMDKGTPSGDTTLSSVSVSRTSASDGYNWRKYGQKQVKSPTGSRSYYRLNKGDLTCLDSAIKPGKKPKFVVHAAEDMGISSDGYRWRKYGQKLVKGNPHFRNYYRCTSAGCPVRKHIETAVDNAKTVIITYKGVHDHDMPVAKKRQGPPRASLVAAAAPASMKNLHFKKGGLVQNQETSSAQCSEDTEDEALDLGGEKAIESARTLLSIGFEI*


CDS Sequence:
>Vu_08801.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08801::LG2:10653407-10655407(+)
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Gene Sequence:
>Vu_08801(+)
ATGGAAAAGGAAGAACCGATGCAGCAACCGCTCACAGACTCGTCGCTAACCACCCATTCATCAACTTCCACTGCTTCCGATGAAGAGCAACTCCACTCAGAAACCCTATCTCTGCATTCTTCTGCTCGTAAGTTGCGTTTCAATAACACTTTTTTCTTCTCTGTTATATTGTATTGATAGTAGTAAATACTGAATAATGGTGTGTTCATGCGGCAGATATGCAAAGAAGCTCTACCGCAAGTAAGCTTGGTCAAGTTGAGAGTAAGGTTAGAGCATCTGTGTTAAATTATTAATTTTAAAAAAATTAAAACATTGAGATTGTGAATTTCAAAGGTGTGATTTTTATTTTTATTTTTTTAATTTTGAAATGTTCTGCTTGGTCTCAGTCACCTTATAAAGGGATTCTGGACGTGGTTTATGAGCCGTTGTTGTTGCTTCTTGTTCTTATGAGTGCTGAAGATATAGGTTTAGAATGACTATGGCTATGGCTTCCCAGCTTTATTAAGTGCTTTTTAAATTAGTGTTTGTGTATAAGATATTTCTAGAATCCAAGACGAAATGAGGTTTAGTATTATTGAAATAAGCTTAAATGTATCATAAGCTATGTTGTAATCTCTTCCGAATGAGTGTTCATGTCATTAGATAACCCCAATTAAGCTATGATTAAGCTCTTTAAACACACCCTCAGTGTATTTTTCTGTCACTGTTTGAAAGTTTCGTGACTTCTTGGCCTTTAAAGGTATTTGTGAGGCTTAGAAACCTGAGGTTACATGAAGCTTATAAAAGAAAACAAGAAGCAAATAGTCTCGAATTATAGAATTATTCCTTGACAGTAACAATTAATTTGACCAAAACTGCCATGAATCCAGCTGCAAAATCCAGTTTTTGATGTTTGGTATTAGATCTTCCATGAATAAATGGATCGGAGTTTGATACTTTGATTCATGCTCTCCCTTCTCTGCTTCCCATTTATTGATTTCTCAGCACTGAAATGCACCATTTTATGTACAGCAGTCAGCACAGCATTCTGATGAGGAAACTATTGTAAAGGAGACAGTAGAGGCACCTCAAAAACAGACAAAATCAACTTCAGATGTCTGTTTGTTCAACTTCATCGTCTAAACTATCACCAACTTCTGTATCAATGTATTTATCATCTGCCCCTAGTTCAACTGTACCACAACAGAGACCATCTCCCAAAGCTGTAAAAGTGCAAAAAATGGACAAAGGAACTCCTTCTGGTGATACAACCTTGTCTTCAGTTTCTGTTTCAAGGACATCTGCATCTGATGGATACAACTGGCGGAAGTATGGTCAGAAGCAAGTGAAGAGTCCTACAGGTTCTCGAAGTTATTACAGGTGTACCCATTCAAATTGTTGTGCAAAGAAGATTAAATTTTGTGACCATTCAGGATATGTGATAGAGATTGTTTACAAAAGTCAACATAGTCATGATCCCCCACACATAGTTGATTCTACTAAGGAAAGTAAATTCCTGCCTTACAGTGAACCTAAAATAAAATGCAGTATTCCAAAGCAGTCTAGCAGAGTTCAAATTGATTCTGATCCATCTTCTCCAAGAAAACCTTTATATGAATCACCTTGCAGTGCCAATAAAAATCAAGAAAACTCATCCCATGATGAGAATGACAAAGTTTTGTTGAAAAAAGAGCATGTTAATGACCCTGAGCCAAAAAGAAGGCAAGTTGCATATGAATTAATTTTTTTCATAGGAAATTTTTGAGGAATTTACTCTTTTTCTTGTACATGTGGCTGGATGTAATGTCTAATGCTCTTGTCCTTAATATGATAACTAGACTGAACAAAGGTGATTTAACATGCTTGGATTCAGCAATAAAACCTGGAAAGAAACCAAAGTTTGTTGTACATGCAGCAGAGGATATGGGGATATCAAGTGATGGATACCGATGGCGCAAATATGGACAAAAATTGGTGAAGGGAAACCCACATTTCAGGTTCATGGTTATATCTTGCTTTCTTTTTGTATTTAAATAATACCCCTACTCGTAGTTCTGTTCTTCTATGGAAGTCGTAGCTGCAGTGTGGAATTTTATAAATAAATTTCCTGTTTGATTTGTTGGGTCAAATCAATTGAAGATATTGGTTTCACAAAAAATCTCTCGTGCTTATGTTCATAGATGCCATTGTTTTGGTTAATCAATAAATGGAATGCTAAGAAGTGTTTGAGTGTTTTGTTTTAAATCAAGGGTTGCATGTCTCCTTTTAATATTCCAAGATATAGCTAGTCTGATATGCTTGGTATGCACAGGTCCATTAAAATTGTACTTTTTTTTTATAATTGTATTTTATATTTATTTAAAAATAAAAACAAGTTTTAAAACATATATATTAAAATTGAAGATGATTAATTATATTTTTAATTGAACACATGTTACCCTAAAATATTATTATCTGATCTTTCTTCAAGTAATAATAGTGATACTATATGTATACAATAATTAAAAATCAATTGTAATAGATATAAACTTATAATTAATTAAATTTTAGTATTCATTCTCTTTTACTTCAAATACTGTGTTTACATGTTGAATTTAATTTTTGTGACATAAAGGATTACATAAGTGTGACATAAGTTCAATCAGGATTTACATCACTTTTAACCCAAAAAATTTGTCTTTTTTCTTGTACAGTGTTAACTTAAAAACACTTAAAAACCCACTGTGAGATGTTAACTTCCCTTTTGTTTTATTTAATACGACTGTTGAAATCTTACTTCTGTGCTTATCAATGTGAATTTCCAGAAACTACTACAGATGCACTTCTGCTGGATGTCCTGTTCGAAAGCACATTGAGACTGCTGTGGATAACGCAAAAACTGTGATTATAACATACAAGGGAGTGCATGATCATGACATGCCTGTGGCCAAGAAACGACAGGGTCCACCAAGGGCTTCCCTTGTGGCTGCTGCAGCTCCTGCTTCAATGAAAAATTTGCACTTCAAAAAAGGTGGTTTGGTACAAAACCAGGAAACTTCTTCTGCTCAATGCTCAGAGGACACAGAAGATGAAGCATTGGACCTTGGTGGTGAGAAAGCAATCGAATCAGCTCGAACTCTTTTAAGTATTGGCTTTGAAATTTAA