Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08716 LG2 9651955 9655534 protein Dr1 homolog
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03021 Transcription machinery [BR:ko03021]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 9651999 5_prime_UTR_variant
A/G 9652021 5_prime_UTR_variant
C/T 9652168 upstream_gene_variant
A/T 9652171 upstream_gene_variant
G/A 9652172 upstream_gene_variant
G/A 9652226 splice_region_variant&intron_variant
T/C 9652362 upstream_gene_variant
C/T 9652367 upstream_gene_variant
T/C 9652550 upstream_gene_variant
A/G 9652552 upstream_gene_variant
G/T 9652892 upstream_gene_variant
T/A 9653194 upstream_gene_variant
G/A 9653477 upstream_gene_variant
A/G 9653557 upstream_gene_variant
T/A 9653609 upstream_gene_variant
T/A 9653615 upstream_gene_variant
T/A 9654626 upstream_gene_variant
A/T 9655100 missense_variant p.Asn139Tyr
A/T 9655238 3_prime_UTR_variant
G/A 9655339 3_prime_UTR_variant
T/A 9655443 3_prime_UTR_variant
A/T 9655452 3_prime_UTR_variant
T/A 9655461 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08716.1
MEPMDIVGKAKEDASLPKATMTKIIKEMLPPDVRVARDAQDLLIECCVEFINLVSSESNEVCNKEERRTIAPEHVLKALGVLGFGDYIEEVYAAYEQHKLETMQDSLKGAKWSNRAEMTEEEALAEQQRMFAEARARMNGGAITSKQPDADQSLES*


CDS Sequence:
>Vu_08716.1
ATGGAGCCTATGGACATAGTTGGAAAGGCCAAGGAAGACGCTTCGCTTCCTAAAGCAACAATGACGAAAATTATTAAGGAGATGTTGCCCCCGGACGTGCGTGTTGCCAGAGATGCGCAGGATTTGTTGATCGAATGTTGTGTCGAGTTTATAAACCTTGTCTCATCTGAGTCCAATGAAGTCTGTAACAAAGAGGAAAGAAGGACGATTGCACCAGAGCACGTGTTGAAGGCTTTAGGGGTTCTTGGATTTGGTGACTACATCGAGGAAGTTTATGCAGCATATGAACAACACAAGCTGGAGACAATGCAAGACTCTTTGAAAGGTGCCAAGTGGAGCAACAGGGCTGAGATGACAGAGGAAGAAGCATTGGCTGAGCAGCAAAGGATGTTTGCAGAGGCACGTGCTAGAATGAATGGAGGAGCCATTACTTCCAAGCAGCCTGACGCTGACCAAAGTTTAGAGAGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_08716::LG2:9649955-9651955(+)
GGTTAATATTTCACGCTTAAGACTAAATGTATCGTGAAAGTCGTCCAGCGAGACTTGTCTTGCCCATCCAGTATCAAGTCAATGAGTTCTTTAACTTTGATTTCGTTAGTGAGTAAATTCTCGCCCAATGATCACCAAGTCAATAGATCTTTGACTTTGACCTCGTCCAACGAGTATATGCTCTCACAATGAGTTTGCTTAATTATATAGAATATAATTATGTAGATTTATGTCACGCAAACCTCTTCAATTCAGTCTAACACTAACCACAGATACTAAAACAATCAACCATCATATTATGCAAAATTCAATAACTTAATTTACTTCAATTACAAGATCAATAATTCAACACATCAAAATTCCAATCACCTTATATTATTAAAGATAATTCAAATCCCTAATCTCAACTCAATAAGTTAATTTTTATCAATGTAACTAGTTTATCTTATTTGAAAGATGATCAAACGACTTTAAAAGTCCTAAAAGAGTTCCACAAACACATGAAACTCTATCCACTCCTACGAACAATAGAAATACAATTAAGATACACAGTTATGACAATAAATCAACAGAGACTCTTATAAAAAATTCATGCCTCACATGCAAGCCAGAATCGTTTTCATGCACAGAAAAAGAAAAATACACAAATAAAGGAAAAAAGTAAAAACTAACTTACTCTTTTATAGATAAAAGAAACTGATCAGATAGAGTTGAAGATTTCGTCTGAAAGATTATTCCGACAATCTTTAATCTTCAAAGAGATATTATAAAAAAAAGAAAAAAAGTTCTTATAAACAAACTTTAAAAAAATTATATAATTTTAAATAATGAAATTTATTATCTAACTTCAATCTTTAATTTAAGCTTTTAATATTAAAACAACTATGTCTCATATTTAAAACTTGTGATCAACATTTAAAACACAAATTTCAAGGTTCTTACATATATATATATATATAATAATAATTATATTAAATAAGTAATTAACAATATTTATCTTTCACATTAAGTAATATAATTAAAAGTAAAGATAAAAGGCTAGTTAGAAAATGTGGAAGGTTTAAACTTAATAAATATGGATAACTGTAAAGAAACACATAATTTATGTACAAAAGAAACATATCCCTGCTTCATATTTAAAAAAAAAAAAGTAACCAGGAAAAGCTAACCTTGTAGTAATGAACAGGACCAAACTCGGACGACGAAATTCAGCTCCATCAAACGTGTGTCTGAAAATTATATATTTTTTTAAAAATAGTTCTCTTAAAATTAAAACTTCAAATTCCGTTTAAATATTTTAAAACAAAAAATTATCGTAATTTTACTTATTTAATTTCAAAATATTTTATTTATAATCTTTGAAGTATATTTCATAACTATCTAATGAATACAATGAAAAGTTTTGACAATATAAATTTTATGTTCGATCTTCAATACTGTCATTAAAAAACAGAAAATTGAAATCACTTTAAAAACCAAAATTATAATATTTTTTAATATTATTAATTTAGTTATAGTATTTTTTAGTTGTTATGATATAATGGATAAAGAATAAAAGGTATATTTTGTTTGACGGACGTGATTGATACATTATTTTAAAGCTGACAATAAATAATTAGTAGGTGCTTGCATGACATATTATTTTTTAATCAACCCACAGAAATAAATTTTGAGATATATTTTTTAATTACTGATAAGAAACTTAGAAAAAAATATTTTTAAAATAAAAATTAAATGAGGACCTAATCCTAAAATAATTTTAAAGGACCAGGGAGAAAGAAAAAAAAAGTTTTAGAATTTTATAATTAGGGAAGAGAGAAAAATGAATTATTGAGGAGATGGAAACAAAAGAATGACGTGGGGAGGAAGTAAGATATTGGTTACGTGACAACAGAAAGTTTGTTGTGGGGTCCCGCAAGCAGTGGGGAACGCGCTGGGGGAGCGCGTGGGGGAGGTTGACGTCAACGTGCTTTTGGGTTGCCCTAACGCAAGGGAGGGCA


Gene Sequence:
>Vu_08716(+)
ATGACGGAAGAACTTGCTGTTTCTCTCTCTCTCTTGTTCTTATCCATCGCATTGAAAAGCAGCACCATCACCACACCACACCACACCTTGTTTTCATAAATATGGGACTCTCAGCCTCAGCCTCAGCCATGTCCACCATCTTCCCTTCTTCTATCAGTTGACTCTTCCACCTCTATTCATTAGGTGTGTTCTTCTTTCTTCGCTTCTATTTTTCTCAGATCTGCTTTTTCTGTTTCTCTTTTTCTTTCTCTCCTTTTGTTCACTCGTTTTCGATCTCAGGATGGAGCCTATGGACATAGTTGGAAAGGCCAAGGAAGACGCTTCGCTTCCTAAAGGTATCTCGCTAGATCTTTTTTCTTTCTCAGATTTGTTATTTTGGATGCTTAATTGTAAAGGAATGTATTTTTTTTTTCTAAATTCAGAGAAGTATTTTTATATAGTGTTTGAAAGATCATCTTTCTCGCAGCAACAATGACGAAAATTATTAAGGAGATGTTGCCCCCGGACGTGCGTGTTGCCAGAGATGCGCAGGATTTGTTGATCGAATGTTGTGTCGGTGAGGCTTGAAAAACGAAAACGCTTTTCGAATTTTGTTTAATTTATTGTTGAGTGAAATTTTGTTAGTTCCAGTGTTGTTTTTGAACTTTTTTTGTGTTCCGTTTTTTTTAGGTTTAGTGGTCTCTTGTGTAGTTTTATTTTCTGTGCTGAATGGTGTCTGTTTGTCACACTGTTCTGTTGTTTTTGTGTCAACTGTGGTTTTTTTTGGTAGATTAGGGTTAAATGGTGTTCGTTTTTTTAATTTCACCTTGGGTGTGTACGATTTGTTAGTGACACACTGGTCTTGGGTAGAAAGTAACAAAGGGGAGGGGAGAATTTACTAGATCGTGTTGTTTGACCTGTAAATGATGTGAAATGGAAAGATGGATTTTATGTTTGAGGGTAAATGCATTTTTATTTTTATGTCCAGACTTTTGCTAATTGCGGTTTTTGCTCGTGTATGGTATGTATGGGCAGCAATACATGTTGCGTTGGATTTAATTCTGTTTGGGGTTTCTAATCTTTTGTTCAAATTTTTCTCCTTACTGAATGTGATTTTGTATGTTGATCTGTATCATTATAGAGTTTATAAACCTTGTCTCATCTGAGTCCAATGAAGTCTGTAACAAAGAGGAAAGAAGGACGATTGCACCAGAGCACGTGTTGAAGGCTTTAGGGGTATTTTTCTAATGATTGATCTGTTGTTTTACTAAAGTTTTCATGCGGATGCTTTCCAATTTGTATTTCGTTATTTATTTGATATCTTCTTTGATGTGCTGTATTCTGTATTTTATTATCTTACATTTGTTTTTTGCATGAACAATTGAACATGTGCGTTTGTATGTGTGATTCTCAATTTACTTTGTGTTGTATTGTAGCTTGATACTCAAATGTTGCAAGTGACATTAGTCTGATGAGCTGATTCCTTGATTATACTCTGTCTGACTGTAATCAGAATATGGGCAATATAATTTATTTTCGTTGTGTATGGAATTCTGGATATGTCCGAACATGACTATACAATTTTATTTATTTGCTACATAAGTTTGCACTGTAGCACAAACAATTTTCTCTTGGATGGCGATACTATTAGCTGGTAATGGCATTGGATAAAGATTCTTCGTATTTTGGAATATGGTTCTAAAAGCAAAAGTTAGTAATAACAATGCCGTCTTTTTTATTCTTGTATTTTTATTTGATAGTCAAAATGAAACCCCTAGGAATTCACCTCTTTTCACATCCCCAGTGAGACTGGGCTACTGCTTTCCAAATCACGGAATGAATATCTCCAAGTGCTTTCTCTTTAGCCTGTCCTTTCTTGCTTATTATTTTTCCTGTCCATCCTAAATGTTGTCATGTGCTTCGTGCTTTCCAGACATTGAAATGTGTCAACTCATGTATACTCTTATTTTTAGAAGTAAAAATTGTTCATTCCCTTCTTTTTATGCAAACATTGTTGATAATTGATTGGAGCAATATGCATCTTTGTTATAAATATATATTTAGTATTTTATCTTTGTCGTATAAGATTTTGTTTAGAATCTTTTAAATAAAATGATTTCTTTTCAATGACCAAGTGTTCCAAACATAGTACGTATTATATTATTTCCTCTGTTGTTACTATATTAAATATTCTTGAAAATGTTATTATCAATACAAGTAATTTGTACGCTTTTAAGTGATTGGGTTGGTTATTGATTTCCACATGTTTTTGACAGGTTCTTGGATTTGGTGACTACATCGAGGAAGTTTATGCAGCATATGAACAACACAAGCTGGAGACAATGGTGATTGTTTAATGTTTAATGGGTTCATGGGCATGATATATTACCATTTGACATTAGAATTGTTTGTCTTCTATCTTTCCACAATTGTTTATCGGTGAACAATATTATAAACCATTTCTTAGCTTTTATTTGATGATCTTTGTACCACACTAGTGGAGTTGCCAGCCTGTCTTAATGTCGTCTGTCATAGGGGAGAAGACCAGGTTGACCATGGTTCTCTTGTTATCATACTGATTGCCTGGTAGTATGACCCATGCAAGTGTTGGAGATCATAATGGTCCTGATACCTAGGGTTTACTCCCCTTCTCCGCTATTCTGTTTATAGTCTGTTGTTCGGGAGCATGATCTGTTGTGTGGTTTTGCCCTAGTCTAGGCTCTTGTACGACTTGTAGAGGAACCCACTAAATTTTTTTGGCTGGTGAAATTGATTTATGAATCTCGAATTGTGTATATGGTTCATTCTATATGCTTGTGGGAAAGTATTATGTTATCGAGATTCATGATGCACGACTGATCCATCTTGGCTATTGGTTGATGAATGGCATGGCATTTTTGTTTTCATAGTATCGGTTCTGAATTTTTTGTATTAATGCTCATTGTGGTCACTATTGATCAATATGATTAGAAAAGCGAATTTTCCAACATCAAATACACTATTGTTTATAGATTGGCTTGAGCAAAGAAATATTTTCTGATTGGTTTTTTTAAAATTCCAGCAAGACTCTTTGAAAGGTGCCAAGTGGAGCAACAGGGCTGAGATGACAGAGGAAGAAGCATTGGCTGAGCAGCAAAGGATGTTTGCAGAGGCACGTGCTAGAATGAATGGAGGAGCCATTACTTCCAAGCAGCCTGACGCTGACCAAAGTTTAGAGAGCTAACTTAGGACCTTTATTTTCTTAAAGCATAGGCAAGCATCTCCCGACTCTGTCCTATGCGTTGATTAGCTCGATTTTGCACAAATACCCATTCACTAGTTTGATGGTCTACGTGAATGTGCTCGACATTTGTGTTCTTTTTAGTAATCCATATTTGTAAGTTAATGATGTAATTATTGGAGTTCGTCTAAACCTTCGTTTATTTAGAATTACATGTAAATTATTTCATTTACCTATTGTATCTCCTAAACTAGAAGCACTTGGCTTAATTTTGACAATAGTAGCTATATTAGATTGTAACAATCTATTATAATCTGTTATAGTTAATATGTGAAAGGCCATGAAGGTTTCCATAGAAATTAAGTTCGCTGACAACTTCAC