Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08709 LG2 9533051 9535219 PREDICTED: transcription factor TCP5
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 9533303 intron_variant
T/A 9533568 intron_variant
A/G 9533784 5_prime_UTR_variant
G/A 9533822 missense_variant p.Ala12Thr
C/T 9533907 missense_variant p.Pro40Leu
G/T 9533921 missense_variant p.Val45Leu
C/T 9533935 synonymous_variant p.Phe49Phe
T/A 9534205 synonymous_variant p.Ser139Ser
T/A 9534373 missense_variant p.Asp195Glu
A/T 9534661 synonymous_variant p.Ser291Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08709.1
MLMASSREGQQAKQEGGAINIDKFSKASSSTRQWSAFRNPRIVRVSRSFGGKDRHSKVCTIRGLRDRRIRLSVPTAIQLYDLQDKLGLNQPSKVIDWLLEATKLDIDKLPPLQFPQGFGQFHHPQTLLPFHDSSSSQLSLGPFGESSSSFVRDGGVQNSMAKSRYWDSIDSISRLKGKEGEKGKWVKTNEEENQDDDVVGSYSNLHASTQRLFPMGSGTTTTHSLLPGLLNNTMPYNPYNAEPSGLSLSQFGGHGLFSSQQVDPGPSSANGVQFPSSLALPSSASQFFLGSSSATPPMFTTYAPYLTPSLDNDPRQFNHIQFLNSASQILPHPLIPSLHSLNPHVRPFPATPFSSKLLESDSIRSQHDKDSSS*


CDS Sequence:
>Vu_08709.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08709::LG2:9531051-9533051(+)
TAATAAATAAATACACGCAAAGAGGATTTTAAAACATGTTTTAAAGAAGGGCCACAAAACAATAACAAATTATTTATCCAAACATATGTCTTGACAATATGTCAAAGTCAATAATCATTTTGTTTCCGTAAAAGAAAAAAATGAATTTCAAATTATCCATAATTTTAAGAAGGACAAAATTTAATTAGTTAAACTGTGCTTTGCCTTTTATAATTGAAATTAGGGTTGTGTAATTATATATTGATTCTTTGTATATGTCTTATAATTTTTTATGAAGTGTGTGTAAATAAATAGCTAGGTACGGCTCCGATGAAGAAATGAAAATTGACAATGAATGCATATTGTTGGTAGGTTTATGGTTTGAATTCGTTTGGGTTATATATGAAGCTTAAAAACTATATAAAGTAGGTTCAGCTTTTACCAAATAAAACTGCAGTTGCAGTGTCCTGAGATGAACCTTTCAATTATTTTGGGGGAAATCCCAATTTATTCTAGATATTGCTTGGTTTTGAAGGAAAATCTGCAGGCTCTCACCGTCACACACACACACACTGCGGGACACAGCACAGCTTTTTCAAGGTTTCTTGTCATTAAAAGCACACTGTTTATAATTACCAACTAACACTGTTACAAATTCAGTTGAGTTATTAGGAAATCTGTAAGAAAATTAATTCGTTATTTCTTTTACTTCTTTTGCGTAAAGACTTGGCTAGGGTTCCCTCAATTCTTGAGAAACTAATATGGTACAAGCCTATTTTTACTCGTTTACTGTTGATCCAGACCACATTTGAAGTGTTAAATGTTAAGTTCACTCGTTCAGAGGCTGCAATAATTGTCCGTTAGGGTTTTTCTTGTTTGGCAGGCTACAAAGTACTCTCAATATTTAAAGACCTACTCAAGACAACAGCACAATTAGGAAACGATGAAGCCTATATGGGTGTGCCAAATTATTCAAGTTAGCAAGTCAAATTCGGGCTCTAAAATTCTTGATGCTTTATAGCACACTTTTGCTCAACTATAGCATATATGTATCCACATCTTATTGGGGAAGCACATGCCTCTTAATGAAGTGATAAACTCGTGCAATTAGGTTGCTAAACCAAATTTAGATATTTATGTTACAGAATAATGAAAGTCAGATCTTTCAACTTGTGCCGTGCAAATCTCACTGCCATCTGCCTGTGGTCCCTCTTTCTATGAGTTGAGTGGATGCTTTTTAAGACCTAAGTTGGTCCCTCATCTACAGCGCAGCTACCTATGATCTATAATCTAATCCAACTGATCACACTCAAATACCATACACCACATCTTTTGAAACTGATTATGACTCTAGTTGAATTTCTTCCACTCTTGTTTCTCTTACTTTTCTCTTAAGTTCCTGCAAATCTTATTAGTTTATCATCTTAATTAAGAATATTTTGGTATACGAATATATCTAAGATAAATAGGGATTTCATTCTTATAAATATTCTTAGTTTCACTTGAAAGTTCTTTCTTTTAATACTATTGGAAATGCATTATTTCTTTAGATAATGCTATGTGGAATTCTCTTGTTTCCTTTACAACAGTGCGAATTTGTTGATAAAGATACATGTGGTTGAACATAAAAGTGTAAAACCTGCTTTCTTCGTCTTGTTCTTCTTCTTGTTCTTTTAGTTTTATCTTGTAAATAAAATATCTTTATAAATGGATTTGAAGGTCATATTTTTCTCTGTATTTTCTTCCTTTCGTTCTTCCTTTTTGCCGGCAGTGTTTAGTCCGATATTGAAGTTGCATTAGTGTGCTTTCCAACACTGAATTGAATAATTATAGTGATAACAGTTAATGATTAAGCCAGTGATTGTTCAGTAGGAGGTATGAGCAGATCGAGGAAATTAACACTGCCAGTTTGCTTACGCGTCATTTCCAAAGGATGCCACGTGATCAATGATCATTTACTCTTTACATTTAAATGCTAAAAGTTGAATGCTATAAGACTCACAAGTTCACTACTCAGTTCA


Gene Sequence:
>Vu_08709(+)
ATGAAATTCTTAATCGTAGAGTGAATTTTGGCCTTTGAGATAATAGGTTGAAATCCAAGGTTGGGGTCATCTGCTCAAATAATTAACGTTTAGGTGCTCATTTCGGAAAGACTTCAATTTTAGGGTATTTCTATATCCTTTCTCTTTCATTTCTTCTCTTTCTAGGTTATGGTGGAAGGCATAGAACAGAATAACCACATAGCCTCCACACTTTTTCTCTCGTGTAAGTTGGTTCTTGCCATTTTGTGCTTCTCATTCTTCTATTTTCACTCAAATCCTATTTTACATATCTACACTTTTCAACTTCCACGGCTATTATTTTTGCTCCAAATTCGGTTTCACAAGCTACCAATTGAGTAAATAGAGTCGTCCTCGCTTCAATTTTCAGGAAAAACATGACTTCAACAGCAGTGTAGTCAAATGGAAAAACTGACTCCAGTTTGCAGAACTTTAATTTTTTTTGGAGATTACAGCTTCCAGAACCTCTTTTTGCTCTCTAACTATGTTATTCTGTGTCTTTCTCTTACTAACTACCGAAAATGAGAATATTTTCTTAGTCAAGAATGCAACAACTTTTGAATAATCTTGTAGTCAGTTTTACCACCGAAACTGTGTAATTAATAATATCAGAAAAGGGTTTCTCTTTCCAATACCAATGCATAAATTATTTTTTTTTTGTCAGGTGGGAGTTGCAGTGCGCCATATATATACTGAAGAGAAAGATGAACTGAGTAGACGATGCTGATGGCGAGTTCAAGAGAAGGTCAACAAGCGAAGCAAGAAGGTGGCGCCATTAATATTGACAAGTTTTCCAAGGCATCCTCCAGTACAAGACAATGGTCAGCGTTTAGAAATCCAAGAATTGTGAGAGTGTCACGTTCTTTCGGAGGAAAAGATAGGCACAGCAAGGTTTGCACCATAAGAGGGTTGAGGGACAGAAGGATTAGGCTCTCGGTGCCCACAGCAATTCAGCTATATGATCTTCAAGACAAGCTTGGGCTCAACCAACCCAGCAAAGTGATAGATTGGCTGCTTGAAGCAACTAAACTCGACATTGACAAGCTCCCTCCACTTCAATTCCCTCAGGGTTTTGGTCAATTTCATCATCCACAAACCCTACTCCCCTTTCATGATTCAAGTTCCTCTCAGCTTTCTCTCGGACCCTTCGGTGAATCTAGCTCCTCATTTGTAAGGGATGGTGGGGTTCAAAACTCCATGGCAAAGTCAAGGTATTGGGACAGTATAGATTCAATATCAAGATTGAAAGGCAAGGAAGGTGAAAAGGGCAAGTGGGTCAAAACAAACGAGGAAGAAAATCAAGATGATGATGTTGTTGGAAGCTACAGCAACTTGCATGCATCTACTCAGAGGCTTTTTCCTATGGGTAGTGGTACCACCACTACTCACTCACTTTTACCTGGTTTGTTAAACAATACCATGCCATATAACCCCTACAACGCTGAGCCTTCTGGTTTGTCGTTATCCCAATTTGGAGGCCATGGCTTGTTTTCTTCCCAGCAGGTAGATCCCGGTCCAAGCAGCGCAAATGGTGTTCAATTCCCATCTTCTTTGGCATTACCTTCATCTGCTTCTCAATTTTTCCTTGGTTCATCTTCTGCTACACCACCAATGTTCACTACCTATGCTCCATATCTTACACCCTCACTTGACAATGATCCTAGACAGTTCAACCACATTCAGTTCTTGAACTCAGCTTCTCAAATCTTGCCTCATCCTCTCATTCCATCTCTTCACTCCTTGAATCCACATGTCAGACCCTTCCCAGCAACACCCTTCAGTTCAAAGCTTTTGGAGTCAGATAGCATCCGCAGCCAACATGATAAGGATAGCTCTTCTTGAGTCTCCTCACCATTGTTCTTTCCCAGGTGTCAGATTGTTGCCTCTAATAAGCAGGCAGCAACGGATGTGAGCAGATCCTTCATAGAAATCACTCAAGAATCTAACTCACATTATATTTTATACACTTGAACCAAGGTGAGTACATGCACGTTTGTAGGTATGGCAATGCTAGCTATGCATATGGGATGAATATTTTGTATTTGAATCTTTCTTATTTCAGTTATAGGTACCTTGTTGAGAAACCATTCTGGGTACACGTTACAATAAGTACCGAACTAAATGAAGGAGTTCTCTTTCTTTCTTCTATGC