Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08685 LG2 9238731 9240707 PREDICTED: dof zinc finger protein DOF5.4-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 9238977 3_prime_UTR_variant
C/A 9238982 3_prime_UTR_variant
C/A 9238986 3_prime_UTR_variant
C/T 9239057 3_prime_UTR_variant
C/T 9239058 3_prime_UTR_variant
C/G 9239070 3_prime_UTR_variant
A/G 9239197 3_prime_UTR_variant
C/T 9239202 3_prime_UTR_variant
G/A 9239259 3_prime_UTR_variant
G/C 9239468 3_prime_UTR_variant
A/G 9239511 3_prime_UTR_variant
C/T 9239651 missense_variant p.Gly277Glu
C/T 9239667 missense_variant p.Gly272Ser
C/A 9239929 synonymous_variant p.Gly184Gly
C/T 9239982 missense_variant p.Ala167Thr
C/T 9240023 missense_variant p.Ser153Asn
C/A 9240527 5_prime_UTR_variant
A/G 9240552 5_prime_UTR_variant
G/A 9240553 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08685.1
MQDIHSICGGDRRLRQHHQHHHQPLKCPRCDSLNTKFCYYNNYNLSQPRHFCKNCRRYWTKGGVLRNVPVGGGCRKSKRSNKPKTTANNTNDSSNNNNNNPSPSSQIAPATASTTPSAAEPERNSNSHSSSESSTLTVTEAMSAPTSKTLSSSALFLDNVRESKLFANANNPSLEGGGVFSEIGSFSSLIASNNEALGFGFGNCSNNNGNSNSNILDATTFRFGVTHPQGNNNDQVQVAGGREQQQNHEEFGTASFLDLTAPLEFSSSAQKGGHHGGFGSLDWQAGADQGLFDLPNTVDQPYWSHSHWSDQDNPSLFHLP*


CDS Sequence:
>Vu_08685.1
ATGCAGGATATACATTCCATCTGCGGCGGTGACCGCAGGCTCAGACAGCACCACCAGCACCACCACCAGCCGCTAAAGTGTCCACGCTGTGACTCACTCAACACCAAGTTCTGCTACTACAACAACTACAACCTCTCCCAGCCACGCCATTTCTGCAAGAACTGCCGCCGCTACTGGACCAAAGGCGGCGTCCTTCGCAATGTCCCCGTCGGCGGTGGTTGCCGCAAGTCCAAACGCTCCAACAAACCCAAAACTACCGCCAACAACACCAACGATAGCAGCAATAACAACAACAACAATCCTTCCCCTTCCTCGCAGATCGCTCCGGCAACCGCGTCCACGACGCCGTCGGCTGCGGAGCCGGAGCGCAACTCGAACTCCCACTCCAGCAGCGAAAGCTCCACCCTAACCGTCACGGAGGCGATGTCGGCGCCGACATCGAAAACTTTGTCTAGCAGCGCTTTGTTCCTGGACAACGTCCGCGAGTCGAAGCTGTTCGCTAACGCTAATAACCCATCTTTGGAGGGCGGTGGCGTTTTCTCTGAGATAGGGAGCTTCAGCAGCCTCATTGCTTCAAATAACGAAGCATTGGGGTTTGGGTTTGGGAATTGCAGTAATAACAACGGCAACAGCAACAGCAACATCCTCGATGCGACGACGTTTCGGTTCGGCGTTACTCATCCGCAGGGGAATAATAATGATCAGGTGCAAGTGGCGGGCGGTAGAGAGCAACAGCAGAATCATGAGGAGTTCGGTACGGCGTCGTTTCTCGATCTGACGGCGCCGCTGGAGTTTTCTTCGTCGGCGCAGAAGGGTGGTCATCATGGAGGGTTTGGGTCGTTGGATTGGCAAGCCGGTGCGGATCAAGGTTTGTTTGATCTCCCTAACACCGTTGATCAACCGTACTGGAGCCACAGTCATTGGTCCGATCAAGATAATCCCTCTCTCTTTCACCTTCCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_08685::LG2:9240707-9242707(-)
GCCCTAACATAAAGGAACTTGAAAAGGATGAGCTTGATCTTGAAGGAGGATGGTCTAGATGGACGATTTGGGTGGACGGCCTAGGTGGACGACAGGATGATGTCGGATCCTACTGTACGATACACATTGGTAGATGGCCTGGGTGAACGGTCTGGGTGGACGACCTGGTGGGTGACCAGGATAGTCGGTTTAGGTGGACGACCTGATGAACGACGGTGTGATGCCAAATCTTACTGTACGGTACACATGGATGGACAGTCTGATGGACGGTCAGAGAAGTCGACCTTAGTGGACGAGAGAGTGATGCCAGATCCTATTGTACAGTAGAATAAACAATTGTTTGTAATTATTTAGAAGATTTTTTTAAAGAATTATAAGTGCATTATCTTTCTTTAAGTGTGATTGTATGTTTCACATGTGAAATATGATTATAATTTAGGTAATTTTAAGATAGGAGAATAATCACTCTAAAGTTGAGTTAATTGATATTTGATGTTGAATCAGTTTATTTTAATCATTCTAAAAATCTTGCATGAAATATTTTTATCGCTACCAATACTACTAACGGACCTTGTTTATTTACGTGAGAATCTTAATTCTTGAATAAAGTGTTTTGAGATATTTTCTTTGAATATGTTATTAAACAACCTCCTTTATTTACAAATGACCTTAAAGCTTGTTTTAACAATTTTTTCAAAAAGAAAAAGATCTTAGAATCTTTAGTTAAAACCAAACTTTTTGATGAAGGTGCATTTATTAATAGATCGTCTATGTATTATTGAGAAAATTATTCTTCAAAAAAGTTAGCATAAAAATCTTTATTAAGTCAGTTGAGAAAAGAGTATTGAATGTTATTGTTAATCACATTTTTTTACCTTTTTAGATAATTGAAAATATGCATGTTGTAAAAGTTTTATTCATTTGGAATATAGAAAAAAATATACAAACTCAATATGATATTATACAAATAACATATAATTGGCCTTGATAAAAGTTTTGTAGTGTTAATATGTAAGAATGTCAAAGAGATATTAGATGTTTTGGAAATGATTTATAAGGCAACAAAAGGTGTTGAGGTAGTTAGGAAAGAACACCTCATACAATAGTATGAAATATTTAGGATGTTTCAGAGAGTAAACAACAATGATGGGCAAAGATGATCTTGTTATGTAGAAAGAAAATTGACAGAAAAAGGATAAACATCAGGATTTTGTAGTCCTTGAACAATAATTAACAACCTAAGGTATTAAAATACATCACTTTCGTTAACATGACAACTTTGTTTAGAAAGTCAAGAAAACATAAAATTAAGTTGAAAAAGACTAAAAAAATAAATATAGAAATTTTGAAAAGAAGAGAAAGAACTCAGTACTTAAGAATACATAATGTAATAGATTTTACAAATCACTAAAATATAAATCTTATCTTTTTTGGTCAGTAAATTTCCAAGATTAAAAAAAAAACTATTTTCAATATAAGAAAGTATCAATATCTCTTAATAAATATCAAAACACAAGTTGAAGAAGAAAAAGAGAGAAAAACATAAAAAAAAAAAGAAAAAACAGTGCGCACCTTCTACTACTAATAAAGAAACGAACTTGTAGCTAATTGAAGATGTAAAGTAATTTATAAGTTTTGAGTTGATTAATACGAAATATTGAATTGAACAATTTAAATTGATTTAAAATATCTTCAAATTGTTTCAATCTCAACCTCTATTATACTTAAATATAGTTTATTTATTTATTCTTCAAATAATTTTATATACTATTTGATACCATTTAAATTAAGATTAAATTATTAAATTAATATATGAACAATCCCAAAATTTGATAATATTAATATAAATATTTGAGTGAAGGTTTGTTTTAAGATTTTTGTTATAGGAGGGACATATTAGTATTTTGGCATGGTGTGTGGTGGGCCAGCTGTGGGCAAGGTCGTTTCGGTCAATTGCCCTGAAAAATATTAGAAAAATGGAAGATAGCGATACGAGACGA


Gene Sequence:
>Vu_08685(-)
GCAGTGCAGTGGTCTGCAGGGATATTTGTCAGTCCCAAAGACTCTTTCTTTCGCTTCTTCTCCTTCACACTATTCCCCATACCTTCTTCAACAAACTGACACTTCTCCCAAAACATAGTACACTCTCAGACACACCAGAGAAACAAACTCTTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTCCACACACCGCAAACAACTATCCTTCCAAATTTTCACCTTCCATTTCTGGCCGGAAATGCAGGATATACATTCCATCTGCGGCGGTGACCGCAGGCTCAGACAGCACCACCAGCACCACCACCAGCCGCTAAAGTGTCCACGCTGTGACTCACTCAACACCAAGTTCTGCTACTACAACAACTACAACCTCTCCCAGCCACGCCATTTCTGCAAGAACTGCCGCCGCTACTGGACCAAAGGCGGCGTCCTTCGCAATGTCCCCGTCGGCGGTGGTTGCCGCAAGTCCAAACGCTCCAACAAACCCAAAACTACCGCCAACAACACCAACGATAGCAGCAATAACAACAACAACAATCCTTCCCCTTCCTCGCAGATCGCTCCGGCAACCGCGTCCACGACGCCGTCGGCTGCGGAGCCGGAGCGCAACTCGAACTCCCACTCCAGCAGCGAAAGCTCCACCCTAACCGTCACGGAGGCGATGTCGGCGCCGACATCGAAAACTTTGTCTAGCAGCGCTTTGTTCCTGGACAACGTCCGCGAGTCGAAGCTGTTCGCTAACGCTAATAACCCATCTTTGGAGGGCGGTGGCGTTTTCTCTGAGATAGGGAGCTTCAGCAGCCTCATTGCTTCAAATAACGAAGCATTGGGGTTTGGGTTTGGGAATTGCAGTAATAACAACGGCAACAGCAACAGCAACATCCTCGATGCGACGACGTTTCGGTTCGGCGTTACTCATCCGCAGGGGAATAATAATGATCAGGTGCAAGTGGCGGGCGGTAGAGAGCAACAGCAGAATCATGAGGAGTTCGGTACGGCGTCGTTTCTCGATCTGACGGCGCCGCTGGAGTTTTCTTCGTCGGCGCAGAAGGGTGGTCATCATGGAGGGTTTGGGTCGTTGGATTGGCAAGCCGGTGCGGATCAAGGTTTGTTTGATCTCCCTAACACCGTTGATCAACCGTACTGGAGCCACAGTCATTGGTCCGATCAAGATAATCCCTCTCTCTTTCACCTTCCTTGAGAGCACTGAAGAAATTTCTTTTTGTTTTTTGTATCTTGAGAAGAAAAAGCAAAGAAAGAAAAAAAAACTGTGGAAGGAAGTTAGAATTAATTAATTAGCATATGTAAATTTTTGTTTTAGTTGTTTTTGGAGGGTGATTATGAGAGTCATCATGTGCATGTGCAACTAACAAAGACGATGTTAGTTTCTTTTATTGTGGATTTTTATTTATGGTTTTGATGTATGATGTATGAACATGGGATGATGGATAGATAAACACAGGAATGGTGTTTAAATATATAATTGGAGATTGTAAAGTTGTTATGGCGTGTTTGGGATGGTATTTCATCCGCACTATTAATGGCTATGAATTTGAAAAGGACGCATAACACTTTGTGTATAATGTGCCACGTCACGATGCATGTTGATAATGACGATAATCATGGCCTGATTTAAGGCCACGGAGGTGTTTGCTACAGCGGAATGATGAAGAGAAGAAGGGATGGGATGGTAGAGAGAGGTCACATCGGGGATGATGACTCCACGTGGCGGGACTGATGAGTGAGTGCGAGATGTAGGGATGCCATGGCTGACAAGACATGATGAATGTGATGGATGAGTGTGCCACTCATAATCAAGATTAAAAAGATCACAAGAACGGTGGTGAAGAACAATGGGTGTGGCCAATGCTGTTGGTGCAGGTGATAGTGCCCCGGGTAAGCAAATATTTGTACCTTTACCTGAACAGAATATGTTACAACTTCTGAATACTATTATCCTCCAGACAAAGATTTCTGATTTTCATCTC