Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08661 LG2 8907719 8910671 PREDICTED: AP2-like ethylene-responsive transcription factor At1g16060
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 8908062 intron_variant
C/T 8908080 intron_variant
G/A 8908541 upstream_gene_variant
A/T 8908622 upstream_gene_variant
A/T 8908641 upstream_gene_variant
T/C 8908653 upstream_gene_variant
T/C 8908865 splice_region_variant&intron_variant
T/A 8908947 synonymous_variant p.Ser140Ser
G/A 8909214 upstream_gene_variant
C/A 8909215 upstream_gene_variant
A/T,* 8909281 upstream_gene_variant
T/C 8909307 upstream_gene_variant
A/G 8909387 upstream_gene_variant
T/C 8909495 upstream_gene_variant
G/A 8909519 upstream_gene_variant
C/A 8909747 upstream_gene_variant
G/T 8910209 missense_variant p.Gly321Val
T/C 8910347 3_prime_UTR_variant
T/A 8910559 3_prime_UTR_variant
A/G 8910567 3_prime_UTR_variant
C/T 8910568 3_prime_UTR_variant
T/A 8910578 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08661.1
MGKQQRQKINATTKDKNLNSTNTVTTKVKRTRRSVPRDSPPQRSSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQNKKGRQGAYDDEEAAAHAYDLAALKYWGQDTILNFPLSTYQNELKEMEGQSREEYIGSLRRKSSGFSRGVSKYRGVARHHHNGRWEARIGRVFGNKYLYLGTYATQEEAATAYDMAAIEYRGLNAVTNFDLSRYIKWLKPNNNDNTANSNVLDANPNSETNFTPNSNQQQGFNFFQSQESTVTQPRSSGATSALGLLLQSSKFKEMMEMTSAADLSTAASESELVPCTFPDDIQTYFECEDSNRYGEGDDNMFGELNGFVPHMFHCDDFES*


CDS Sequence:
>Vu_08661.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08661::LG2:8905719-8907719(+)
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Gene Sequence:
>Vu_08661(+)
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