Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08632 LG2 8542626 8547923 PREDICTED: homeobox protein knotted-1-like LET12 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 8542784 3_prime_UTR_variant
C/A 8543140 intron_variant
T/G 8543143 intron_variant
A/T 8543147 intron_variant
A/T 8543154 intron_variant
G/T 8543173 intron_variant
A/T 8543182 intron_variant
T/A 8543970 missense_variant p.Glu265Val
G/A 8544058 splice_region_variant&intron_variant
T/A 8544803 intron_variant
C/T 8544912 intron_variant
T/A 8545315 intron_variant
G/C 8545320 intron_variant
G/T 8546191 intron_variant
C/G 8546511 intron_variant
T/C 8546761 intron_variant
T/C 8546905 intron_variant
A/G 8546943 intron_variant
C/T 8546999 intron_variant
A/T 8547147 intron_variant
G/T 8547333 missense_variant p.Pro100Gln
T/C 8547521 synonymous_variant p.Gly37Gly
C/T 8547682 5_prime_UTR_variant
T/A 8547832 5_prime_UTR_variant
G/A 8547839 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08632.1
MAFHDHMAHEITFQPFTEDQQMGQGRDMQRLLPLSAGAPTWLNGNNAATLRQQNFLHLQPESATAQPNDDVRGGIDRNRTESNSEPDDLAEYKADILGHPLYDQLLSAHVSCLRIATPVDQLPRIDAQLQQSQRVVDKYSGLGNGVVDDKELDQFMTHYVILLCAFKEQLQQHVRVHAMEAVMACWELEQSLQTLTGVSPGEGTGATMSDDEEDQAESNANLYEGSMDGADSLSFGPLVPTETERSLMERVRQELKHELKQGYKEKIVDIREEILRKRRAGKLPGDTTSLLKAWWQSHSKWPYPTEEDKARLVQETGLQLKQINNWFINQRKRNWHTNPSSSSGSKSKRKSSGAGETSNQSFM*


CDS Sequence:
>Vu_08632.1
ATGGCTTTTCACGACCATATGGCGCACGAAATCACGTTTCAGCCCTTCACCGAGGACCAGCAGATGGGTCAGGGCAGAGACATGCAGCGGCTGCTGCCGCTCTCCGCCGGAGCACCGACATGGCTCAACGGCAACAACGCGGCCACGCTTCGGCAGCAGAATTTCCTCCACCTGCAACCGGAGTCGGCAACGGCGCAGCCTAACGACGACGTTCGTGGGGGCATAGATCGGAACCGGACGGAGAGCAACTCGGAACCGGACGATTTGGCGGAATACAAAGCGGACATTCTGGGACACCCGCTTTACGATCAACTCCTATCGGCTCACGTCTCGTGTCTGAGGATCGCCACGCCCGTTGACCAGCTTCCACGGATCGACGCGCAGCTTCAGCAGTCGCAGCGCGTCGTTGACAAGTACTCTGGCCTTGGAAACGGCGTCGTCGATGACAAAGAGCTTGATCAATTCATGACGCATTATGTTATACTGCTCTGTGCTTTCAAAGAACAACTGCAACAACATGTCCGTGTTCATGCCATGGAAGCTGTTATGGCTTGTTGGGAGCTTGAGCAATCTCTACAAACCTTGACTGGTGTATCTCCCGGAGAAGGAACGGGTGCAACGATGTCAGACGATGAAGAAGACCAGGCTGAGAGTAATGCCAACTTATACGAAGGAAGCATGGATGGTGCTGATAGTCTCAGCTTTGGACCTCTTGTTCCCACCGAAACTGAAAGATCTTTGATGGAACGTGTCAGGCAGGAGTTGAAGCATGAGCTGAAACAGGGTTACAAGGAGAAGATTGTCGACATAAGAGAAGAAATTCTACGAAAGAGAAGAGCGGGGAAGCTCCCAGGTGACACCACTTCGCTTTTAAAAGCATGGTGGCAGTCACATTCGAAATGGCCATATCCAACAGAAGAAGACAAGGCAAGGTTGGTGCAGGAAACAGGCTTGCAACTAAAGCAGATAAACAACTGGTTCATAAATCAAAGGAAAAGGAATTGGCATACTAATCCTTCGTCTTCTAGTGGCTCCAAAAGCAAACGCAAGAGTAGTGGTGCAGGTGAAACAAGTAACCAGAGCTTCATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_08632::LG2:8547923-8549923(-)
AATTGTAAAACAGGGAGTCATAGCAAAGATGAATAATACTTCCCATAAAATGTTTTTAGGGATGAAACAAATTTAAAATCAAAACATTAATATTGAATGTTGGAAAAGAGTGTTGGTGACATTTAAAACTCATTTTCACCTATAGTTTTGAAATTACTGTTTCTTAAAACATAATAAATGTGACATTTTCAATAACAATCTGAATAGGCATTATATAAATACAATATGATAATGATTGTATATAGAACTATAATTATTATCACAAACACATCCCATTTAAATTTATATGTTATTACATAAACATGTGTCATCATAAATACAAATCCTAGATTCGATATTAATGCATTCAACAAATAATCATCAATACAATCAAGATATATTTAAAAACTATACAAAGTACAACATGATAATGTAAACTAAACTTCAAAAACTATCAAAACAAAAATGATAGAGAAGAGCAACAAGTACGAGAAAGGAACTAGTGGTAACAACACAATCAATAAAACTTTTGAAAAACAATAACACAAACAATAATAAAAATAATAAAGACAATAACTAGTGACACAATTTTAATGAAGACCCATAATAGGATAATGTGAGTTATGGTGATAGAAGTGAAATATGACCCACAAGAAAGAAGGAAGGAGAAGAAAAAATAAAGAAATAAAAAAAACGTAAGTAAAAAATATTTAATTTAATTATATTTTAGATAATATAAAATTCAATGATATAGTTCCTTAATGAATATATATAACAATGAACTAATAATAACCACTATCATATAGTTGACAAAATAACGGTTAAATTGTGTTTGCCATATCATATATATACAACTTCTATTAAAAAATAATAATTATTATATATTTAATATTAATTAAAAAAATACTATTTATCAGTTTTTTTTTATAACAATCCTTTTATAACTATTGTTGTGTGATATTACTAAATAATATTTTTGCAATAGTGATTAAAAAAATTAAAATCACAAAATGTCAACAAATACTTATTCCATACTCTTAATTTAGAGTTTAAAGCTAATTTATATATATCATGTTTTTTATAAAAAAAATCACGATGTTCAAGCTAATATAAAATATTATATTTGAAGTGTTAGTTATATTGAAGTTTTATCGTAATAATATTTCTATAAAATGTTGATTGATATACTCTGTTAAGTGAAAAGGAACAAAATTGTAATTTTCAACAGCACTAAAATATCTAAATTTTGTCTGTTTATACAGGAAAGAGAGAACATTCAAATGAATATAGTAAAAAGAGATATTTTCCTTCCACTCTAGAAAGAAAGAACAAAAAAATGCTTGTAGAATACACAAACGTAAAAAGGTCCTGATCTATATTACCTATCAGCTCTTACATAGATATTTTAATTATTGCATTTTTCACATATTTTTCTTGCTAAATTATTTGAAAGCATCTTTATTTTTTATGTTCTATTGTGTTTATCTGTAATATAGTTTTTGTAATACAGTGCATAGAAGACTACAGACGAAGAAGGTGAGTGAAAAAGTAAGTTGAGTTCCCAATAATCTGTCGTATAAAGGGTTCTCTGCTGTGGTTTCCTGTACCTATAATTCTTAGATTACTTACTATTTTCCAATCTCGCGCCAATCCCTACGATGAACCTACCATCATCACCTATTTTCTACCCTATTCTGTGTCTATTTATTTATTTATTTATTTATTATTATTATTATTATCACTGTTTGGTGCAGTTAGGATTTAGGACTGCTTCATGGCTTCTCAAAAGTCCGCATCTTTGGATTATAATAATTTCCCATCAAACAGTAAAACCGATATTTTGTCCCTATTTTTAAACATATCTTTGCCTATCACAAACACGTCGGCACACTACTGTGTCCTCTCTCCCAACCATTTCCTAACACCAAACATTACTTAAAACTACAAATAGGATTATTCTATTACCATAATCAAACAAAATTAACATAATTATAATTATAATTATTCCGGAGTTATTAGCT


Gene Sequence:
>Vu_08632(-)
GCCTCCAACATCATTCATCAAACCTTGTCTTATTACTCCAAAATCTCCAATAAGGTGGTACCACAAATTGCTCCACGTTATCACCAATCCCACCCTCCATCCTCTCCCTCGGTCTTCGTGTCAACACTTCCAAAAGTCTTCCCCTTCACCAAATCCCTTCTCCTTCTTCTTCTAACTACTCCCTCTTATGCTCCAACTTCCGTTTTCAGTGTCATGAAATCCAATTAAATGTGCTGCCAGAGGGAGATGCACTCAAAGAGAACACAAGATTAATCAATTGGGTATCTAAATAATGGCTTTTCACGACCATATGGCGCACGAAATCACGTTTCAGCCCTTCACCGAGGACCAGCAGATGGGTCAGGGCAGAGACATGCAGCGGCTGCTGCCGCTCTCCGCCGGAGCACCGACATGGCTCAACGGCAACAACGCGGCCACGCTTCGGCAGCAGAATTTCCTCCACCTGCAACCGGAGTCGGCAACGGCGCAGCCTAACGACGACGTTCGTGGGGGCATAGATCGGAACCGGACGGAGAGCAACTCGGAACCGGACGATTTGGCGGAATACAAAGCGGACATTCTGGGACACCCGCTTTACGATCAACTCCTATCGGCTCACGTCTCGTGTCTGAGGATCGCCACGCCCGTTGACCAGCTTCCACGGATCGACGCGCAGCTTCAGCAGTCGCAGCGCGTCGTTGACAAGTACTCTGGCCTTGGAAACGGCGTCGTCGATGACAAAGAGCTTGATCAATTCATGGTTAATTTGCTTCCTTTCTCTCTCTCAACCTATCATTATTTGCTTGGTTACTATAGCTTCATCATATTCAACTATCAACCCTACTCTATGATTAAGGTTGTTGTTTTCTGTTCCGGTACGCTAATCCACTTCCCAATGACTTTGATGATTTGATACAAGACCGTGTTTGTTTTCTTTCGGTTGTTGTTTCTTTCTTTTCCAAACTGAGCTGCTTTTCGGTTGTGTGAATTTGTGATGCTTTGGCTAATGTCATTCAGCAAGCATTCTATACAACTTTAATAATTATATTATTTTTTAATGGTTTAATGTAATAAATTAAGTAATATCTTCTTCCATGAGGGTACTATTTTAATCTTCAACTTGAGTGCATTAATCATCCTGTGCTTATTTTAGTTCTTTTTTATCTTTTTATTTATCGTATAACATTTTTTTATTGTTCATGAAGTTTGTCTTTGACTACAATCCTTTGTGTTTTATTTTTACTGTTCATTCGGCTAAGCTTAGAGGACCTTCCTGTCCTGATTTTCCGGAATTTGTTGTCTGCAGTTTGAAAAAAAATAAAAGAAAGGGTAATGTATGTCTGTTACGGTAAAACAGTGACCCGATTGTAGGTGCAGAATTCACGAAATGGACAAAAAGAAAACAAGAGAGAGAGAGAGGGGAGAGAAAAAGTAACATTTCTTCTACACATTGGACGGTTGTACTAGTAGTGAGAGTAAATGAATCTGATTTGTTTTGGTGTAATGTAATAAAAGAGATTAAAGGGTGCATGGTCGTGTTCCCTTGAATTCAAGGTGTGGTTTTTATCTTCTAGAATCTTAATCTTCCCTCTTCTTAGTTCAACATGTGTTACACTTGTTAATTCTTTTATGGCCGAATACTTAATGTGGTGGTTACAAATTCTTAAATTCTAGTAGCATAGGTTGTCACATAACAACTGGAAGAAGAAGCTCTCACCAAGTTTTGTCGACCCTTTCCCTCTCGTATACGTTATCTGTTTGCCAACTGCAAAATAATGAAGTCATGGGACCTAATTCGTTATTATAGTTGTCTTCCAGTGAATTTCACTTGGCCTATCTATTTATTATTCACGCACTACTTCATTCATTTTCAGCCTTCAATATTCAAACTTCATAATCACTTCACACAAGACAAGCCCAGATCATCAACAATTTCAGTACTAAAATCTTTTCAATATTTAATTAATGCCTATGCATTGACCGATACATATTCATTATGTACCTTATTAGTACTGTAACCAGTTCTTTACAAAAAAAAAACAGAAAAAAAAATTGAATTTTTGAATTAACATATTCCATTTCCCTTCTTCTAAATGTTTTGTTTGGAATATTTTTAATTAGTTCCCATGATTGAGTTCAGTTTTCAGGAAGTAGTCTTGTGCTTGTTTTAAGCTTCTTTACAAGTTTTGGTCTTGTTTTTGTTGTAGACGCATTATGTTATACTGCTCTGTGCTTTCAAAGAACAACTGCAACAACATGTCCGTGTTCATGCCATGGAAGCTGTTATGGCTTGTTGGGAGCTTGAGCAATCTCTACAAACCTTGACTGGTACGTTTCAACTATCATACAAATCTTTGTTTGAATCCTTCGTGTTAGTTTTTGTGCTTTTTAAATTGTTATACCCTCTTTGTTTGTAAAAAGGTATAGGAAAGAGAAACAATAAAAGTATAATTTACAGGCTTATTTTTAGCAATTAGTTTTCTCAAAAGGGGAAGGGAGGTCTATTTCACTAAGACAAAAACATGATGTTATTCCTTGTATAAAAGTTGAGTGAATGAATTAAATCCAGAAAAGGAAGAAAGAAGTTTTTTATAAATAAAAGTCTGTCATCATGTTTAGTAAAGTATAAGTGTTGAAATAATAAAATAAATGAACATTCTTAAGCTTTTAAGAATGTCTTTAAACTGGATATGAATAATTGAAAACTAGTTAAAACAATGGTTCAAGATTTAGCAATTTAGTAATACTTTTTAATTTTACAATGATGTAATGGGCATAACGAGTAAAAACATATTTGTTTGAATATATTTCTAGGTCCAACTTATGTTTAATATTTTCTGAAACATTATTATTTATATTACGTACTGCGACACCCAATATTAGACAAATTTTTTAAGGCAATATTAAACAAAATTATTAAATGAACAACATGGCATTGTGGGAAATGAGATGTCAACCTAAAACATAAACAATATTCATCAGAAGATCTCATCCTTAACAATATGTAACGTGTCTTTCGCCATACTGAGGTTGTTGATTCTTTTTTAGGAAATGAACTCAAGTGCTTCAAAAGGAATCAAATTGCGAGTCCAGAACAACGTTGGCTTTGGATTTTTAGTTAAAAAAGAAAACTTTTCCAACTTTCCATTTTGAACCACTTAACTCCATTTTTTATACCAGTTTTTTGGGCTCGGTTTTCTACAATAACTATACCACTCTCGTGTCTGATTCCCTGTGGAACTGCTCTGACCATTAGTCCAGTCCCATCTTTTTAGCAACCAGGTTTTTAGAGTAACAATGCTGCATGCCGAAAATATTACATTATTTCTACGTTTTATTTGCTTGATTAGAAAAAAAATATGTTAAAATGTTAAATAATGTGATCCATTAAAAAAAATAATAAATTTTTCACTATTTCTTATCCTTTTATGGTTTTAAGTTTCTAAACCAGACACATTAAGACTTAAAAGCGTAATTAATTACAAGGGTTTTCCTGCATGCTAGCGTGTTGATGGAGAGGACCAAGCATGCATGGCATGAATCTGGTGGGATGCTATCAAAATTTATGATTTCTGATTTCGTCTTTTTGCAAACTTATAGAAAGAAAAGTATGGAAACCATATATAGATGGAAGATTTAAAATGAAGGTATGTACGGTGCATGAACAGGTGTATCTCCCGGAGAAGGAACGGGTGCAACGATGTCAGACGATGAAGAAGACCAGGCTGAGAGTAATGCCAACTTATACGAAGGAAGCATGGATGGTGCTGATAGTCTCAGCTTTGGACCTCTTGTTCCCACCGAAACTGAAAGATCTTTGATGGAACGTGTCAGGCAGGAGTTGAAGCATGAGCTGAAACAGGTACTATGATTCATGATTCCATGATTTTACCATACCAGACATTATTATCATTGTTTTTCATAACTTGTTGGTCTGGACCAGGGTTACAAGGAGAAGATTGTCGACATAAGAGAAGAAATTCTACGAAAGAGAAGAGCGGGGAAGCTCCCAGGTGACACCACTTCGCTTTTAAAAGCATGGTGGCAGTCACATTCGAAATGGCCATATCCAACAGTAAGTCACCAATGATTGCTTGCACTCAAGAATGTGTATTTGAAAAAGCATGTAGAGAATTATATTACTCCATTGGTGTCAAGTCATATATATGTGGACCATCTTCGTTTTGAACTTTGTTATTTATAGTTTTTTGTGCCAATGACGATGAGGAGATAAGATAACTAGGTTGAGTGGAAGAGGATAAGATTATTATTGTAATTAACTATAAGGATTAATGTTTGTTGATCGATGATTGCTGACTTGTTTCAGGAAGAAGACAAGGCAAGGTTGGTGCAGGAAACAGGCTTGCAACTAAAGCAGATAAACAACTGGTTCATAAATCAAAGGAAAAGGAATTGGCATACTAATCCTTCGTCTTCTAGTGGCTCCAAAAGCAAACGCAAGAGGTCAGTTTGTAGTTTATTAGCCTCTTTTGTATCCACCACCGCATCATGCATATTATAATTGAAATTATTTATCTTGTTCTTTGATAACACACAAGAATAGACTCTACCCCACAAATTACAATTGATTATTTCTCATACAACAATGCTACTTTTGACATTAATTTTTTTTTTACTTCTATTTGATCTTATAAAAAATTGTCAAATAGTAATAACCGTTGTTTTAAATAACCTTTTTCTAATGAAACTTTGGCAAACATATCCCAACCTTTTGAGCCGGTTGTAAGACCTATCTTGAAACACAGCAGTTTATAATCTGATGGGTTTAGGATTGTTTCTTCATTTTACTTTTTCATAGGAAGTTTCATTAGAAAAAAGTAATGTAAACATAGATTTGGAAGCTTAATGTTATTTTTGTTTGGGCAGTAGTGGTGCAGGTGAAACAAGTAACCAGAGCTTCATGTGAATGGACGTTTGGCTATTCTTCATTATATGCAACAACAGACGGGAGCTTACAGGGAAAAAGATGAAACTGAAAT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