Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08603 LG2 8168655 8171611 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 8168694 synonymous_variant p.Gly394Gly
T/C 8168888 upstream_gene_variant
G/A 8168943 upstream_gene_variant
A/G 8169048 synonymous_variant p.Arg346Arg
A/T 8169212 missense_variant p.Leu327Gln
T/C 8169226 synonymous_variant p.Gly322Gly
T/A 8169429 missense_variant p.Glu297Val
C/T 8169430 missense_variant p.Glu297Lys
C/A 8169541 upstream_gene_variant
C/A 8169546 upstream_gene_variant
A/T 8169589 upstream_gene_variant
A/T 8169592 upstream_gene_variant
T/C 8169812 synonymous_variant p.Lys234Lys
T/C 8169864 upstream_gene_variant
G/T 8169889 upstream_gene_variant
T/C 8169983 missense_variant p.Lys209Arg
A/G 8170069 upstream_gene_variant
G/T 8170071 upstream_gene_variant
A/T 8170294 upstream_gene_variant
T/C 8170375 upstream_gene_variant
T/C 8170380 upstream_gene_variant
C/T 8170463 upstream_gene_variant
T/A 8170773 missense_variant p.His122Leu
C/T 8170781 splice_acceptor_variant&intron_variant
A/T 8170854 splice_region_variant&intron_variant
T/C 8170858 splice_region_variant&intron_variant
T/A 8171078 splice_region_variant&intron_variant
A/C 8171080 splice_region_variant&intron_variant
C/T 8171116 upstream_gene_variant
C/G 8171321 upstream_gene_variant
G/T 8171504 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08603.1
MKLIRHPNVIRMYEVMASKTKIYIVLEFVTGGELFDKIARSGRLKEDEARKYFQQLICAVDYCHSRGVFHRDLKPENLLLDANGVLKVSDFGLSALPQQVREDGLLHTTCGTPNYVAPEVIHNKGYDGAKADLWSCGVILFVLMAGYLPFEETNLTALYKKIYKAEFTSPPWFSSSAKKLINRILDPNPATRITFAEVVENNWFKKGYKPPVFEQPAVSLDDVNSIFSESLDSKNLVVERREEEGHVAPVTMNAFELISKSQGLNLSSLFEKQMGLVKRETRFTSKCSADEIISEIEKAAGPLGFDVKKNNCKLKIQGEKTGRKGHLSVATEILEVAPSLYMVELRKSQGDTLEFHKFYKNLATGLKDIVWKAEPIDGGKDGGKDGGKDEGKDGGKDGSFSINLDI*


CDS Sequence:
>Vu_08603.1
ATGAAACTTATTAGACATCCAAATGTCATACGTATGTATGAGGTAATGGCTAGCAAAACAAAGATATACATTGTATTGGAATTTGTTACTGGTGGAGAGCTGTTTGATAAAATTGCACGCAGCGGGAGGTTGAAAGAAGATGAAGCAAGAAAATATTTTCAACAGCTTATATGTGCTGTGGATTACTGCCATAGTAGAGGTGTTTTTCATAGAGACTTAAAGCCTGAGAATTTGTTGCTGGATGCTAATGGAGTGCTTAAAGTATCAGATTTTGGATTGAGTGCATTGCCTCAACAAGTTCGGGAAGATGGGCTACTTCACACAACATGCGGTACGCCAAATTATGTTGCCCCAGAGGTGATTCACAACAAAGGTTATGATGGTGCAAAGGCAGATCTGTGGTCATGTGGTGTTATTCTCTTTGTTTTAATGGCAGGCTATTTGCCCTTTGAAGAAACCAATCTAACGGCTTTATATAAAAAGATTTACAAGGCTGAGTTCACGTCTCCTCCATGGTTCTCTTCAAGTGCAAAGAAACTAATCAACAGAATACTTGATCCAAATCCTGCCACTAGGATTACATTTGCTGAGGTCGTTGAGAATAATTGGTTCAAGAAGGGATATAAGCCTCCCGTATTTGAACAGCCTGCTGTTAGTCTTGATGATGTAAATTCTATTTTCAGCGAATCTTTGGATTCGAAAAATCTTGTAGTTGAGAGGCGTGAAGAGGAGGGGCATGTGGCACCAGTGACAATGAATGCCTTTGAGCTTATATCTAAATCTCAAGGTCTCAACCTTAGTAGTCTGTTTGAGAAGCAAATGGGACTTGTTAAAAGGGAAACACGATTCACTTCCAAATGTTCAGCAGATGAAATAATTTCAGAAATTGAGAAAGCTGCAGGACCCCTGGGTTTTGATGTTAAGAAGAACAACTGTAAGTTAAAGATTCAAGGGGAAAAGACTGGACGGAAAGGTCATCTGTCTGTAGCCACTGAGATCTTAGAGGTAGCCCCTTCGCTATACATGGTTGAGCTGCGTAAGTCTCAAGGAGATACTCTGGAATTTCACAAGTTCTACAAAAATCTTGCTACTGGACTGAAAGACATTGTTTGGAAAGCTGAGCCTATCGATGGAGGAAAGGATGGAGGAAAGGACGGAGGAAAAGATGAAGGAAAGGATGGAGGAAAGGATGGTTCGTTTTCTATCAATCTTGATATTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_08603::LG2:8171611-8173611(-)
GCATAGAAGACTCTACCGAAGGGAAGTTTCAAAACATCTTAGTTTTCAATTTTTTTAGATGATTGCTTATACTCCAACCGAAAATGATGAAATTCAATTTGAACAAATAATTGGATGGGTGGATAAATAAAATTGTAGAAAATGAATAATTATAATTAAGTTTTAGTGGGTTAGAATATTTTTGAGGATTTATTCAATTTGAGTTTATGATTTAATATTTATAAATTTATAAATGTATTTTAAATTTTATTTTTCTGTAATATATTTTATTAAAATTTAATACTAAATTATATAATATTATAGTTTATTATTATAATTATTATAATTAAAATTACACATGTTATTTTTTGATTAAATATTCATTATATTTATTTAAAATAACAAATACTTTTTCTTAAAAAAAAATTAGTTTAATATGAATTCATCGAATAATCCATTCAAATTAACTCATAACCTAAACTACTTAGAATTTATATTTTCAAAATTCAATAAATTAAATAATCAAATAAAAGTTTTAAAATATTAAATTTGAGTTATATTTTGATATAACCCGAATTTATATAATTCTTTTTAGATTATTATATAATGTTTTAATTTAACTTTTTAATACAAACCTTTATAGCATTCATATTTTATTGAATTATAATATCTGGTTTTGAAGTTCTTAAAATACAAATTCTTATTTAAAATCGAATTTTAAATTTTATACTATATTTACCTACACTAATAAGAAAATTTTGTAATATTCATATATCAAAGTTTTCAACGGGGTTAAACATTTTCTTAATCATTATTATTATGGATGACTTTATTTGACATAATATGAGGTCATTTATGGGTTTCAGTTAGGTTATTTGTTTTTCCAGACTCTTGAAAATTGCAAAAGGGTGGCGTGTGGTTTGTTGTCCTTTGTTGGTTTGTCACACTGTTAGACCTTTTAGAATGCGGAAGTCAAAACAGCATTTATTAAAGTGAATTTTGTCGTCTTCGTAGAGGGTTAGAGTTTTTAAGTTTTGGGTTGACTCTGCTGTCCTTGAGGTGTATGGAGAAAGCCAGAACAGAATGTGCAAATAAACTAGAAGTGAAACCTATTTATTTATTTTAGAAAAGTAGAATTGGTTTCTGTACAGTTAATTTGAATAATTAAATAAAATTAGCATGATTTAAAATTAATTAGACACGAACTATATACTTTGAAATGGTTTTATTGAAAAAATAAGCTAAACAGGATAGTATATTTTATCGAATTTGTTTACTTTTGTCTAAATCATGGAATTTTTGAAAGGAAAAAAACTATCCTATATTAACTACAAGGGCAGTGAAAAAGGGAAAACACTAGATAAATACTGAATTGATTATGAAAATAACTTAGTGGACCAAAGCGTAGTACTGTTTATTGTAGATCTGTGTTCTGGTTTTGATTTTTTGTGTGGGTATTATAGTTTTTTAAAATATGTTTTTATATTTTCATTTTGGTACAGTTAATTTTATCTTTATTTCTTTCTATCTTTTATTTTCAAATTTAACCTAAATAAAATTTACATTTTTTTAGAAAAAAACATATTATAATTTTAGATTTATTTTAAAATAATTAAATTTTTATTAACCTTTGTAATGCTTATATTTTTTTTTGAAGTTACATGTTTCTTATTTAGACCAGACATCTTATTTAAATTAGTTCTTCCAATAAGTAGTAATCAAATTTAATTTTTATTTATTTTCTTAAATTTATATTTTTATTTCTTAATTTAAACTACTAAATTTCTTCTTCTTTTTTAAATTTTTTATTGTGTAATATTTCTATAATATTATGTAACAAATATTGATTACTTTTGGAAAATAGATAAAGAGAGATAAAAAAATTATGAACAATAAAAAAAATATTAAAATATAAAAGTTAAGAATACAGTTTTTAGTGCTTTCTTTTAGTATAGTTACTCTTGTCTTCCTGACGTTTTCCACTGTTCACTGATATGCAGATAAAACGGGAAATATCGACA


Gene Sequence:
>Vu_08603(-)
ATGAAACTTATTAGACATCCAAATGTCATACGTATGTATGAGGTTAGAATACAGTAAATGATTTCCCAGTTACTTTACATTTTGTATCATTTTTTTTTTCATATTTTCCCTGTCTTTCAATCTTTCCAAACTTCATTATAAATGACTAATCCTTGCGTAGGTAATGGCTAGCAAAACAAAGATATACATTGTATTGGAATTTGTTACTGGTGGAGAGCTGTTTGATAAAATTGTAAGGCAGTTTCTATCTTTACCGTGAGCTTATGAAGGCCCGAGTCCTTGTATTATCTGGTCGGTCTTTATATAACTCTTCTACTGTGTTTTTGTTGCTATTAACTTGAGTCAGGCACGCAGCGGGAGGTTGAAAGAAGATGAAGCAAGAAAATATTTTCAACAGCTTATATGTGCTGTGGATTACTGCCATAGTAGAGGTGTTTTTCATAGAGACTTAAAGGTGTGTAACTCTTGCACCCTTCACATTTTTAGCAGATAAAAGAATATAAAATTAAATTGTTCCTTTGTTTTATCTGCTAAAGCCTGAGAATTTGTTGCTGGATGCTAATGGAGTGCTTAAAGTATCAGATTTTGGATTGAGTGCATTGCCTCAACAAGTTCGGGTGAGTACATTGAGTAATTTTTGAAAAAAGTGATAATATAATTACGTGTAATTGGAAACTGATTATCTTATTGATAATAGGAAGATGGGCTACTTCACACAACATGCGGTACGCCAAATTATGTTGCCCCAGAGGTAGATTGGCTTTTACCATTACATTTAATCTCATGAACTTTTATTTTTTCTTCTTTTATCACTACTTCCTTATCGTCTAGGTGATTCACAACAAAGGTTATGATGGTGCAAAGGCAGATCTGTGGTCATGTGGTGTTATTCTCTTTGTTTTAATGGCAGGCTATTTGCCCTTTGAAGAAACCAATCTAACGGCTTTATATAAAAAGGTGATTTTGATGACTCCATGTCCATTTCCTTCTGTTCACCTGACCGAACTCGATTCACATTATTCTGATCTTTCTCGAGGGCATAACAGTACAACTTAATTTTTCTCAAACATTTATTATCTTTAAAATCTTTGTGATTAGAATCTGTAAGAGTTGAAGCAGTTTACGAACTAATTACTAGAGGAATTCTTGCGAATGCATGTATGCTCATTACTGTATTTTTTTTCTTTGTTAAATGAGGTACCTTTTATGAATTAGATAATTAGCATGATTTATTTAATGTCGTGAAGCTGTCTAGAAAACTTATCATATTGACTTTTGTGAATCAAAAAGACAGTCCTTGTGTGCTTCTTTTTCGTTTATTTTGTTTTTCCTATTTCCCGCGACAGATTTACAAGGCTGAGTTCACGTCTCCTCCATGGTTCTCTTCAAGTGCAAAGAAACTAATCAACAGAATACTTGATCCAAATCCTGCCACTGTATGCCCTTTTGTTTTCTTTTCTTATTTACTTGTGATCTGTTACTAACCTGGTGTTAACAAATATTCTTATTTTTCCCGCCATCTTACCAAATATGTGAAAAACCTTTTATCTGTTTTTATTTTAATGATACGTAACAGAGGATTACATTTGCTGAGGTCGTTGAGAATAATTGGTTCAAGAAGGGATATAAGCCTCCCGTATTTGAACAGCCTGCTGTTAGTCTTGATGATGTAAATTCTATTTTCAGCGAATCTTTGGTAAGTCTTTGGTTCTGCTGGTTAGCCTGATTAATTTTTTTTTTCACCAAAACTTGGATTCTAACCTCAATCTCAATATTGACTGCGGTACACAGGATTCGAAAAATCTTGTAGTTGAGAGGCGTGAAGAGGAGGGGCATGTGGCACCAGTGACAATGAATGCCTTTGAGCTTATATCTAAATCTCAAGGTCTCAACCTTAGTAGTCTGTTTGAGAAGCAAATGGTATGTGTATCTTCATAACTAAATGATTTGTATACTTTTCCTTATTACAACTGTGCATCACAGAAACCTGTAGAAAAAAGAAAAAATAAATAAAAAGAATATTTTCTTTTATTTTTACTTTCCGTTTCACAGACCATCATGTTATGCTATGTTTATTATAATGGTTAAGGCTAGTTGTATTTTTTTTACAACCAGGGACTTGTTAAAAGGGAAACACGATTCACTTCCAAATGTTCAGCAGATGAAATAATTTCAGAAATTGAGAAAGCTGCAGGACCCCTGGGTTTTGATGTTAAGAAGAACAACTGTAAGGTAAAAAAAAATGCATACTGTATAACTTATATATTTAGTTAATAACTTGGTATACATCTAATTTTTACTTTCTAGCACTAATAACTTGATATACATATCTGATTGTTTATCTTATGGTGCACCTCAGTTAAAGATTCAAGGGGAAAAGACTGGACGGAAAGGTCATCTGTCTGTAGCCACTGAGGTATATGTTTTCAAAGTATTATTTCATGATATGGGTGGCGTTCATATTAGTTTATTTGTATTCAGGAATCGTGACTGTTTCTAATGCTTTAAGAGCCGCTTTTCAGATCTTAGAGGTAGCCCCTTCGCTATACATGGTTGAGCTGCGTAAGTCTCAAGGAGATACTCTGGAATTTCACAAGGTAAGTTTGATGCAAAAAATATGTATGTATTTGTTTATAGAAGTACAATTAAGACCTCTATATTATCAATACTTGTGATGAAAAAAGCAGCACTTTTCTCCATCTTTAGATTATTATTGTGGTTACAGATCATCGAGTAAAGCGACTCTTTTGTAAAACAAATTTTCATTTTCATTAGCTTTGCTTGGACTAACTTGTCTTTCTTTGAAGTTCTACAAAAATCTTGCTACTGGACTGAAAGACATTGTTTGGAAAGCTGAGCCTATCGATGGAGGAAAGGATGGAGGAAAGGACGGAGGAAAAGATGAAGGAAAGGATGGAGGAAAGGATGGTTCGTTTTCTATCAATCTTGATATTTGA