Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08519 LG2 7140027 7150442 PREDICTED: squamosa promoter-binding-like protein 12
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 7140167 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 7140224 5_prime_UTR_variant
C/A 7140233 5_prime_UTR_variant
G/A 7140245 5_prime_UTR_variant
G/A 7140374 5_prime_UTR_variant
C/G 7140401 5_prime_UTR_variant
T/G 7140402 5_prime_UTR_variant
A/G 7140410 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 7140467 5_prime_UTR_variant
G/T 7140481 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 7140496 start_lost p.Met1?
T/C 7140509 missense_variant p.Leu5Ser
A/G 7140513 synonymous_variant p.Glu6Glu
G/A 7140582 synonymous_variant p.Glu29Glu
T/C 7140710 missense_variant p.Val72Ala
G/A 7146812 upstream_gene_variant
G/T 7146894 upstream_gene_variant
A/T 7146961 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08519.1
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CDS Sequence:
>Vu_08519.1
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>Vu_08519::LG2:7138027-7140027(+)
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Gene Sequence:
>Vu_08519(+)
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