Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08496 LG2 6832720 6837658 PREDICTED: WRKY transcription factor 6-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 6832904 missense_variant p.Thr27Ile
C/T 6832926 synonymous_variant p.Asn34Asn
A/G 6833138 intron_variant
G/A 6833162 missense_variant p.Gly39Ser
C/T 6833247 intron_variant
T/C 6833261 intron_variant
A/G 6833290 intron_variant
C/T 6833291 intron_variant
C/A 6833377 missense_variant p.Thr74Asn
A/G 6833384 synonymous_variant p.Leu76Leu
C/A 6833453 synonymous_variant p.Leu99Leu
T/C 6833697 intron_variant
G/C 6833702 intron_variant
T/A 6833993 intron_variant
G/T 6834198 missense_variant p.Gly141Cys
A/C,* 6834441 intron_variant
T/A,* 6834443 intron_variant
A/T 6834453 intron_variant
T/C 6834488 intron_variant
T/A 6834648 intron_variant
C/A 6834846 intron_variant
C/A 6834854 intron_variant
G/A 6834899 intron_variant
C/T 6835005 intron_variant
A/G,* 6835046 intron_variant
A/G 6835114 intron_variant
C/A 6835234 intron_variant
T/C 6835353 intron_variant
A/T 6835354 intron_variant
T/A 6835357 intron_variant
A/C 6835360 intron_variant
A/G 6835401 downstream_gene_variant
T/A 6835552 downstream_gene_variant
A/G 6835557 downstream_gene_variant
T/C 6835575 downstream_gene_variant
T/A 6835626 downstream_gene_variant
A/C 6836150 downstream_gene_variant
T/A 6836353 downstream_gene_variant
T/C 6836359 downstream_gene_variant
A/T 6836388 downstream_gene_variant
T/G 6836433 downstream_gene_variant
C/A 6836445 downstream_gene_variant
G/A 6836702 downstream_gene_variant
G/T 6836749 downstream_gene_variant
C/A 6836846 missense_variant p.Pro265Thr
G/A 6836851 synonymous_variant p.Leu266Leu
C/A 6836862 missense_variant p.Ser270Tyr
T/A 6836863 synonymous_variant p.Ser270Ser
C/A 6837090 missense_variant p.Thr346Asn
T/C 6837112 synonymous_variant p.Pro353Pro
C/T 6837117 missense_variant p.Pro355Leu
A/T 6837118 synonymous_variant p.Pro355Pro
T/A 6837184 synonymous_variant p.Pro377Pro
T/C,G 6837217 missense_variant p.Ser388Arg
T/C 6837289 synonymous_variant p.Ser412Ser
A/G 6837293 missense_variant p.Lys414Glu
A/G 6837416 3_prime_UTR_variant
A/G 6837418 3_prime_UTR_variant
C/A 6837472 3_prime_UTR_variant
A/T 6837473 3_prime_UTR_variant
A/G 6837476 3_prime_UTR_variant
T/A 6837486 3_prime_UTR_variant
G/T 6837489 3_prime_UTR_variant
T/G 6837491 3_prime_UTR_variant
A/G 6837565 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08496.1
MEEKSSLKNLLKDEERPYDCNTTGNGTDEPFLHNTMGSGVLSLNLNNSGQPLNQMGMLRIKLEEAKKENEILKTMLTKVNEHCTVLQNRILFEMQQHQLSSSVINKNNNHESQGKIQDVEKPMLHTRQFLNIGDCSSLSEGYTEKVEKKTLDRSLACEKKNIVEGEMNTKIALHEAKCIEDQASEVTCRRAKVSIRARSDFSLMGDGCQWRKYGQKTAKGNPCPRAYYRCSMGTACPVRKQVQRCFKDETVLITTYEGSHNHPLPLAARSLASSTSAALNMFLSGSLTSSVGTTTLPNSPLFSSSLSSVSPTAVATFSHSATCPTVTLDLTQPNNNNNYLQFQRATTSHPFFPLPLHDHPHQGLPLLCSKVPTFLSPDKNLALVDVVSQAITKDPSLKAALFSAISSLTGDSQKNSNNHTPHSKTSSGYDPCSKMPAIPPHQPCSTELI*


CDS Sequence:
>Vu_08496.1
ATGGAAGAAAAATCTTCGTTAAAAAATTTGCTGAAAGATGAAGAAAGGCCTTACGATTGTAATACAACAGGAAACGGAACCGATGAACCCTTCCTTCATAACACTATGGGATCCGGTGTTCTCTCCTTGAACCTGAATAACTCTGGACAGCCCTTGAACCAAATGGGCATGCTGAGAATCAAGCTTGAAGAAGCTAAGAAAGAGAATGAAATCCTAAAGACCATGCTAACCAAGGTTAATGAACACTGCACTGTTCTTCAGAATCGAATACTTTTTGAGATGCAGCAACATCAACTCTCTTCATCAGTTATCAATAAAAACAATAATCATGAGTCGCAGGGAAAAATACAAGATGTGGAGAAACCAATGCTACACACTCGGCAGTTTTTGAATATTGGTGACTGTTCTTCACTTTCAGAGGGTTATACAGAAAAGGTTGAAAAGAAAACATTAGACAGAAGCCTGGCATGTGAGAAAAAGAATATTGTTGAAGGTGAAATGAACACAAAAATAGCATTGCATGAAGCAAAATGCATAGAAGATCAAGCATCTGAGGTTACTTGCAGAAGAGCTAAAGTATCCATAAGAGCACGATCAGATTTTTCTTTGATGGGAGATGGATGCCAATGGAGAAAGTACGGACAAAAGACTGCCAAAGGCAACCCTTGTCCCCGAGCCTACTACCGTTGCAGCATGGGAACTGCATGTCCAGTTCGTAAGCAGGTGCAGAGGTGTTTTAAGGATGAGACTGTTCTCATCACAACCTATGAAGGAAGCCATAACCACCCACTCCCACTGGCAGCAAGATCTTTGGCAAGCTCAACATCAGCAGCATTGAACATGTTCCTATCTGGCTCACTCACGAGTTCTGTTGGCACCACCACTCTACCAAACTCACCCCTCTTCTCTTCATCGCTGTCTTCTGTTTCCCCAACTGCAGTAGCCACTTTCTCCCATAGTGCAACATGTCCCACAGTAACACTGGACTTGACTCAGCCCAACAACAACAACAACTATCTCCAGTTCCAAAGGGCCACCACTTCACACCCTTTCTTCCCTCTCCCACTGCATGACCACCCTCATCAAGGGTTGCCCTTATTGTGTTCCAAAGTTCCAACCTTTTTAAGCCCTGACAAAAACCTTGCATTGGTGGATGTTGTCAGTCAGGCCATAACCAAAGACCCTTCTCTCAAGGCAGCTCTTTTTTCAGCCATTTCTTCACTCACCGGAGATTCTCAGAAGAACAGCAATAACCACACCCCACACAGTAAGACTAGCAGTGGTTATGACCCTTGTTCTAAGATGCCTGCAATACCACCTCATCAGCCTTGCTCTACTGAGTTGATATAG


Promoter Sequence:
>Vu_08496::LG2:6830720-6832720(+)
ATGTGTCCTTTTCACTGGAAGCCTGTCAGGAGCCGCTCCTTGTCTGTGCCCCATGCACTTCGTGCCTCTTGCACCGGCGATCACTCCCGGTCCTCGTCAATACCCAGTGTCACAGAGTGAACTATAGTATTTTTTATTTATTTATTTAAACTTCTTTGTAAACTTTTAAAACAGAAAATAAGAAAAAAAGTAACCTTTTAAAAAAAGTATATATTTTCCTAATTTGTACATGCTTTAATTAATAAAAAATATTTTATATTTTTTACAAATGTTTATTAAAAAAATTGGGTAAATAAATACTAAAATACTTAAGTAGTACAGCTCATGATACCCACCTTTTAAATTAGATAGGGCCCGTCTGCGCGCAGATTGGACATTTGTTCACCGATGTTGAAATCTTTATGAATGAACAACACAATTCAAAAGCAATAGTTGAGAAGAAAAGACAAACTTACAACTTGTATTCCAAACTGCAAAAGTGATAATAAATGAATATACAATTCACGGAAAGAAAATACAAAATAAAAACAAAGAGTTACAGAAATAAAAATCTCAATATGCTATTTAATGGCTTTATTGTTTAGAATATGACTCATTAGAGTGATCTTTTAAGAAAAAACTAATAGTCTCTATAATTAATAACAAAAATTAATCATTAATATTTCAACATACACACAGTCTACACACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATGGTTGATTTTGTTTTACAATAACTAGTAGAAATACCAGTATTGTGTTGTTAATTTTGTATGTCCACATATTTTGGTAATAAAAAATTACTAACACAGTTACAAAGAAATAATTATCATGATAAGAACAGTATTATAGATAAAAAATTCTACAAAAATATATCTAATAAAAAATTATAAGAATTTATCATTTTTTATTAATTTCCATCAATATTATATAGGTTTAAAAGTATTTCAATTCTCTTAAAATTTATTTCTATCATAAATTTTTATATATTTTTATCTTCAAACTTTAAAAATGAATATAATTTTTAAATTCAATTATATTTTAAAAAATTTACGTGTTAAACATAAATCAGGTTAGCATTTAAATTCTTTACCTGATTTAATACATTCTCATTTTAATGTTTACTGGTTTTAATGTTTATGTTATGGGTGTAAACAACTAAATCTTAACATGAAACGCATTTAATATTAAAAAAATTAACGTAATTGATTAAAAAAAACATGTTTATTCATTTTTAAAATTTAAAGACAAAAATATATTAAAATTTTAAAAAATAACAACTTCTAATTTCGTATCAAAGTTTAAGAATTAAAAATATATTTAATTCTTATTTGTCTCAAATTATATCTTTTTATTTACAAGATCTTATTTTTTAGAAAATTGTTTGTATATCACTCCATCGACCATTTATTGATTAAGTTGAATTTATGATAATTAAAACTACTTTATTTTTAACTCGTTCGAAATGAGTGTTCAGTTTAGAACAATTGAATACGTTAATTTGGTACTCTAAATGGTTCCTTAATTAGTTAGCAAGTCCCTTATCACAATTGTCTTGACACTAGGGTTTCCAATTCAACCTGTCTTGGAGCCTCTATCACGGATAAAATAATAAAAAATATTTTTTCTTATATTTTTCTTCTCTCAAATAAGATTATTAATGGAAAGTTTCACATTAAAGATGTACTTTTAAAATAAAATACTCACAATATTATTTATTATCTTGAAGAAGACTGTATCTTATCTCCAACCTCAATGAGGTCATTTTCATATTCGGTGTAGAAAAGTATATTTCCTTTCTCCATCCTTTACTTGATGTTATTTTTATACTTTATAATTTAATTAAAGTAATTAAATATTTTGGATGGAAAAACAAGGTATTAGAAAAATAGACTTAGCAAGGACTCTGCAGAAATTTCGTCCATAAACGCTGTAGACTACACCCACTATATAGTTA


Gene Sequence:
>Vu_08496(+)
AAGCCTCAAAAGTTTGGTAAAGAGATTAAAGTCTCTGGGAAAATCACTTATATATATGGATATCTGATATCACCATCTCTCAGTAGTGGTAACCATCAGAGAAACATGGAAGAAAAATCTTCGTTAAAAAATTTGCTGAAAGATGAAGAAAGGCCTTACGATTGTAATACAACAGGAAACGGAACCGATGAACCCTTCCTTCATAACACTGTAAGTTTTCTTACTGCTTAATTTCTATCAGATTTGTAAACTCTGGTTGTGATCAGATGCTTTCAAAACCTTAAAATATTACAAAAAAATATGATCCATGAGACCATTATTGAGGTTGACCTTGGTCTCGATCTCCTAGCTTAATTCCATTTTTTACATTTTAGCAGAATTTTTAACAAGATGACATGATTTTGAGCGATTATGAAAAAAAAAAATTATGCAGATGGGATCCGGTGTTCTCTCCTTGAACCTGAATAACTCTGGACAGCCCTTGAACCAAGTGAGTGATATTAATTTCTGGGGTACCCCATAAAGCTCAGAAATCTGTTATTTTCTAAGCATAAATTTTCATTGTCCCTTACTGAACATGCATGATTAATTATTCTTAGATGGGCATGCTGAGAATCAAGCTTGAAGAAGCTAAGAAAGAGAATGAAATCCTAAAGACCATGCTAACCAAGGTTAATGAACACTGCACTGTTCTTCAGAATCGAATACTTTTTGAGATGCAGCAACATCAACTCTCTTCATCAGTTATCAATAAAAACAATAATCATGAGTCGCAGGTAATGATAAGCTTCTTTTATAAGCATGTGGTTAACCTTCCTTTTGTAATTACTTTGATTCAAAATTTTAGATTAATTGCCAAAAAATTAAGCAATTAATGTAGTTAGTTTTACTTGGTCAACAACTCAGCGTATATATTCAGTGCCAGCAATAATGTCAGGCCCAGAAGGTCTCTATCTTCTAGCTAGCTATACCGGGAATTCAAGACAAACAGATAAACAACAACTATATATGACCAAAACAAAAGAAAAAAACATTATTTTGTTGTTCTTGTAACTTTCATGACGTATATGCATTTGACAGAAAAATATATAAGTGTAGAAAGAGTAAAATGATTGAGGGAAAAACTGTAATAAAACCAGGAAGTTCATAGGAAATTAAATAATTAATATTTTGAATTGGAGACTCACATAGATGCCATTTCATTGAGATCATTAAATGTTGTCAAAATTTTGACATATGCAATTGCAATGTGATCAGAAAAATTTATAAACATTGTAATTGAGTTGTAGTTTCTGACTTTTATCAATAAATGTTGATGAGTGCTAATGATTTTTGCGTTATAATCATGTCCTATGATTTTGAAGAAGATAACTAAAAAAGTTGTATATCTTTTGAAGGGAAAAATACAAGATGTGGAGAAACCAATGCTACACACTCGGCAGTTTTTGAATATTGGTGACTGTTCTTCACTTTCAGAGGGTTATACAGAAAAGGTTGAAAAGAAAACATTAGACAGAAGCCTGGCATGTGAGAAAAAGAATATTGTTGAAGGTGAAATGAACACAAAAATAGCATTGCATGAAGCAAAATGCATAGAAGATCAAGCATCTGAGGTTACTTGCAGAAGAGCTAAAGTATCCATAAGAGCACGATCAGATTTTTCTTTGGTAAGAATTTGTATCTCATTTGGTAACTATTGTGTTATTATGGCTTTCTATAGGACTTGAAATTTTATATAGAAAAAATATCCCACACGCAACAACACCAATTTTTGAAGTGATGAAGTTTTTTTTTCTTTTAAAAAAAATAGATAGAAAACTGAAGGGGTGCAAATCGTTTTTTTATTATTCTTTATAAATTATAATATCTGTTACTTTTACATAGAAATTGTTGACTGATTATAGCAAGAAAAAAGAATAAGATTTGTCTCATAATAATACCTGGCCGGCTGACACCTGTGTAAAAATCCAGCAATGCCATTGGATTATATATGCTTTTAATTAACTGAAGGAAAAACTTAATTACTTTCCTTTATCAGTGTGTTTAAACCTCATTTTTCAATTAAAAAGATAAACACTTCTTAATAAGATTGTTTTTTCGTATTAAACCTCCTTTTTTCAACTCAACATTAATTCTTGTCATTGTAAATGCAAATAAAAAAAAATACTCTACCTTGACTGCAATTTAATTTTACATTAGATCAATAGCAGTCATTTTATAGTTAATTATAATTTCATCTTCAACAAACTTATAATATTAAATTTTATTGGAAATCATAGTTATCTCAAACAAAAAAAATCCTAATGTGTGTGGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATATGTTGAATGATAAGTAGATTAACTACCCATGCATGCAGTGTTTACAAATTGTGTCATAGACAGTGAAATATTTCTTCATTTTCTTGAAGCCTCTCCTTCAATGTGAAAAAAAATAAAATAACGTGTGTTTTTGTATTATAAAAAGCTTATCACATGTGCGAGGGGGGTGTAATTAAGTAAAACAAACGCGTGAAATTATCATGCCTCTCGGAAAACTTATTTAAAAAATATTAATTTAGACAAAAAGAAATTACATTAATATAGCATGATAGTTTTGACAAAATATAGTATTAAATATTTGATTAAAAGTTCAATAATTGGACGGTGTTATAGAAAGACATTTGTCAAAAAGAAGGTAACCTTACTACACCTTTGTACCTTAAAAGAATTAATGTCTGACTTTGAGATATAAAGAGTATTTAATAGGTAAACTCTTTTTTTTACTAAATTTGTTATTTTATATTGATAATATTTTAAGTTTAAGTTTAACTTAATTATGTTGGTTTATAAAATCTAATTTATATGTATTTTAGAATTAGATATGTCAAAATGAATTATTCATAAGTTAATTTTGACTAATTACAAATTTCCGTATAATTGGATTGGAAAATAATACAATTCTTTTTAATATGAATTAAATTAAATCCGGTTTACTAAAATATGAGTAAGCAAGTTCAAATAAAGCTTATGCAAATTCACCATTAACAATTTGTTATTTTTTTATTATAATAATTGTTTACCATTATTAAAGATATAATCGACACTTGGGTTTCCTTTAATATTAGAATATAGTATTTTAATGATTTAAATATTTAATTTACTTGTTTGCTTATTGATATTTTGATTTTCGTATATTATAATATCAGCTTATTTGTCTAATTATAAGTATTCTCATTTTGAATTAATGGATATCAACAATATATGGGTTGAGAGTTTAAGTGAGATATTTTCTAAATAATAAGATTAGTTAACAATGAGTTTTTTTATTTTTTATTTAAAGGTTTTATGTAATCTATTCAATATACTCTACTAATATTTGATATTGTGTTGGAACTTTGTATATGAGTTAACTCAAATGTTCTGTTTTTTTAACGTTAAAAGAATGGTCTAATCATAAGTAATTATAAATGAATATTTTTGATTCTATTACAATAAATATAATATAAGTAACAGGTTAGAAAAATAAATTATGTTTAAGTAAATTAACTTATCTAACCTATTAATATCAGGTGGATAAATTCCAAAAAAAACTAATATATGAAAAAGTGAGTTAGGGTGAGTTGATTGAAGAGCTAAGTGTGAGTTTGGTCGAGTCCATTTGGACATTTGTAATGAATTTAATGTGGATTTGAGTATAACTTTTGATGTTGTAATGCATTCAGATGGGAGATGGATGCCAATGGAGAAAGTACGGACAAAAGACTGCCAAAGGCAACCCTTGTCCCCGAGCCTACTACCGTTGCAGCATGGGAACTGCATGTCCAGTTCGTAAGCAGGTTTCTGTCCCAAAATCTTAAAAAAACCTTAAATTATCACAAAAACAATGTTCAAGGAAAACCGACAAAAGTTTTAAGAAAATCTAGTTGTCACATTTAGCAGTTTAATTACTTACAGGATATGGTGGTATTACATTTGCAACAGGTGCAGAGGTGTTTTAAGGATGAGACTGTTCTCATCACAACCTATGAAGGAAGCCATAACCACCCACTCCCACTGGCAGCAAGATCTTTGGCAAGCTCAACATCAGCAGCATTGAACATGTTCCTATCTGGCTCACTCACGAGTTCTGTTGGCACCACCACTCTACCAAACTCACCCCTCTTCTCTTCATCGCTGTCTTCTGTTTCCCCAACTGCAGTAGCCACTTTCTCCCATAGTGCAACATGTCCCACAGTAACACTGGACTTGACTCAGCCCAACAACAACAACAACTATCTCCAGTTCCAAAGGGCCACCACTTCACACCCTTTCTTCCCTCTCCCACTGCATGACCACCCTCATCAAGGGTTGCCCTTATTGTGTTCCAAAGTTCCAACCTTTTTAAGCCCTGACAAAAACCTTGCATTGGTGGATGTTGTCAGTCAGGCCATAACCAAAGACCCTTCTCTCAAGGCAGCTCTTTTTTCAGCCATTTCTTCACTCACCGGAGATTCTCAGAAGAACAGCAATAACCACACCCCACACAGTAAGACTAGCAGTGGTTATGACCCTTGTTCTAAGATGCCTGCAATACCACCTCATCAGCCTTGCTCTACTGAGTTGATATAGAGTTCTATGGATATATAGTTCTCAAAATAATAAATCAAATAGAAAAAATCTGGCTTCTTTTCCTGCAGCAAGACATGATATGTGTGTTTGTGTGTGAGAGAGAGAGGTAAGTTTTATGAGAAATCTAGGTCACACCAACATTGGCTTTCCTTAGTCTTTATACTTTGTAAAATAAATTAATGAACATATTGAAGTTTTGGCTTTTGGTCTTGTAATTAACTATATATAGTGTTATAAAAAAAAGGTTGTAATTTC