Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08460 LG2 6432212 6437736 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   extracellular region
Molecular Function   enables   protein tyrosine kinase activity, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, kinase activity, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, ATP binding, protein tyrosine kinase activity, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, protein tyrosine kinase activity, ATP binding, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 6432233 3_prime_UTR_variant
A/C 6432258 3_prime_UTR_variant
A/G 6432453 3_prime_UTR_variant
A/G 6432468 3_prime_UTR_variant
G/A 6432482 3_prime_UTR_variant
T/C 6432686 synonymous_variant p.Glu496Glu
A/G 6432689 synonymous_variant p.His495His
C/T 6432905 missense_variant p.Met423Ile
A/G 6433050 upstream_gene_variant
T/C 6433117 upstream_gene_variant
A/G 6433146 upstream_gene_variant
A/C 6433151 upstream_gene_variant
C/T 6433188 upstream_gene_variant
C/A 6433281 upstream_gene_variant
T/G 6433554 upstream_gene_variant
T/A 6433572 upstream_gene_variant
T/A 6433756 upstream_gene_variant
A/C 6433802 upstream_gene_variant
T/A 6434044 downstream_gene_variant
C/T 6434048 downstream_gene_variant
T/A 6434265 downstream_gene_variant
G/A 6434666 downstream_gene_variant
G/A 6435086 synonymous_variant p.Ser301Ser
A/G 6435338 synonymous_variant p.Ser217Ser
C/G 6435356 synonymous_variant p.Val211Val
G/A 6435477 downstream_gene_variant
G/T 6435493 downstream_gene_variant
T/C 6435706 missense_variant p.Asn161Ser
A/T 6436118 downstream_gene_variant
C/A 6436127 downstream_gene_variant
G/A 6436487 downstream_gene_variant
C/T,* 6436770 intron_variant
G/T 6436771 intron_variant
T/A 6436880 intron_variant
A/C 6437173 intron_variant
T/C 6437363 intron_variant
T/A 6437418 intron_variant
A/C 6437577 5_prime_UTR_variant
C/T 6437585 5_prime_UTR_variant
A/G 6437644 5_prime_UTR_variant
C/T 6437674 5_prime_UTR_variant
T/A 6437734 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08460.1
MEAKSMALQFLLLLLSLLAVAAHGLASNATLNETCGYFDGSLSRDTKVPCPIGWVMDPNKTKCFLHVGRPQSWNDSEICCSKYGGHLASLTSLQELQFAQSLCGESVNSCWIGGQRRNTTTGYQWMWSDNSPGNNSIFPLENVPPHCNGTGLSCHGNNTDNLCTVMTNNSNSLVSERCDNPHSSLCILDIDAACNRMHCHRDYYLIILIVVSALILSTTLAVVVWLLVYKRGKKRRRSRKISVPGASLPSWKVFTKEELRSITKNFSEGNRLVGDTKTGGTYSGVLSDGSRVAVKRLKRTSFQRKKEFYSEISRVARLRYPNLVAVMGCCYDHGDRYIVYEFVANGPLDKWLHHIPRGGRSLDWAMRMKIATTLAQGIAFLHDKVKPQVVHRDIRASNVLLDEEFGARLMGVGLSKIVPYEVMHERTVMAGGTYGYLAPEFVYRNEFTTKSDVYSFGVLLLEIVSGRRPTQAVDSVGWQSIFEWATPLVQVHRYHELLDPHITSSSSSIIPEASTIQKVVDLVYSCTQHVPSMRPRMSHVVHQLQQIAQPPAK*


CDS Sequence:
>Vu_08460.1
ATGGAAGCTAAGTCCATGGCACTGCAATTTCTTCTCCTTCTGCTCTCTCTACTCGCTGTTGCTGCTCATGGACTCGCTTCCAATGCTACACTGAACGAGACTTGTGGATACTTCGATGGTTCTCTCAGTAGAGATACAAAAGTACCTTGCCCTATTGGTTGGGTTATGGACCCTAACAAGACCAAATGCTTTCTTCATGTTGGGAGGCCTCAATCTTGGAATGACTCAGAAATCTGTTGTAGTAAGTATGGTGGACATTTAGCTTCATTGACATCACTTCAGGAGCTACAATTTGCTCAGAGCCTGTGTGGTGAATCTGTGAATAGTTGCTGGATTGGTGGACAAAGACGCAACACTACAACTGGTTATCAGTGGATGTGGTCTGACAATTCACCAGGGAATAACTCCATATTTCCATTGGAAAATGTTCCTCCCCATTGTAATGGAACTGGACTATCCTGTCATGGAAACAATACAGATAATCTGTGCACAGTAATGACTAATAATTCAAACTCTCTCGTGAGTGAGAGATGCGATAATCCTCACTCTTCTCTGTGTATACTTGATATAGATGCAGCGTGTAACCGGATGCACTGCCATAGGGATTATTACCTTATCATCCTCATAGTAGTGAGTGCATTGATACTCTCTACAACATTAGCAGTGGTAGTTTGGCTTCTTGTATATAAGCGGGGAAAGAAAAGAAGGCGGTCTAGAAAAATATCTGTTCCAGGAGCTTCTCTTCCATCATGGAAAGTCTTCACCAAAGAGGAGTTAAGGTCAATTACGAAGAATTTCAGTGAAGGTAATCGTCTTGTTGGTGATACCAAGACTGGTGGTACATACAGTGGGGTTTTATCAGATGGTTCAAGGGTTGCAGTTAAGAGATTAAAGAGGACAAGCTTTCAGAGGAAAAAGGAGTTTTATTCTGAAATTAGCAGGGTTGCTAGGCTTCGATATCCCAATCTGGTTGCTGTGATGGGATGCTGCTATGATCATGGTGATCGCTACATTGTTTATGAGTTTGTAGCTAATGGTCCCTTAGATAAATGGCTGCATCACATACCTAGGGGAGGTCGCAGCTTAGATTGGGCTATGAGGATGAAAATTGCTACAACGCTTGCTCAAGGAATTGCGTTTCTGCATGACAAGGTTAAGCCACAAGTGGTGCATCGAGATATACGTGCAAGCAATGTACTCCTGGATGAGGAGTTTGGAGCACGCCTGATGGGTGTTGGTCTGTCCAAGATTGTGCCGTACGAAGTAATGCATGAGAGAACTGTCATGGCAGGTGGAACTTACGGATATCTTGCTCCAGAGTTTGTGTATAGAAACGAGTTTACAACAAAGAGTGACGTATATAGTTTTGGCGTCCTACTACTTGAAATAGTAAGTGGACGTAGACCTACACAGGCAGTTGATTCTGTTGGTTGGCAGAGTATCTTTGAGTGGGCAACACCTCTTGTGCAAGTTCATCGCTACCATGAACTCTTGGATCCTCATATAACTTCATCCTCTTCTAGCATTATCCCTGAGGCTAGTACCATCCAAAAGGTGGTTGACCTTGTTTATTCCTGCACGCAGCATGTTCCTTCTATGCGCCCTAGAATGTCTCATGTTGTTCACCAGCTGCAACAAATTGCCCAACCACCTGCAAAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_08460::LG2:6437736-6439736(-)
GAGACCCAATCCGAAAAATCCTTCGAACCGTAAAACGCCCAAATCGAACTCCAAGCCAGAACTCCACGCTGCAAAGCCTTCAGTCTCTCTGTCACCACCTTGCTGCGCCACAACCGTTGTTGGGTAAACCTCATCTCCAAGAAAGGCTAAATTTTCTTGATAACAGAATTGCAAAATCTCTCTTAGATTAGCTTCACTAACACAAGACCCCATTTTGTTGTCTCTTCAAGGTAATATGGAACAAGGGTACCACCAAGTATAGCAATTGTTGCTGAGTAGAGAGGGTATTGGATACCCATTTGGATCATCAAGCAGGAATGGGGCTTTGGTGGCAAGGTGAAGCAGAAAGCTTACATATTGTGGAATTAGGTTATCAGAAACATTATTTTTTTATTTTTTTAATATACATTCCCGAATAAAATACTTACCTTGTCACTGTGCGAGCTCATCAAAAAGTTAATCCGGTTAAGTTAAGTTAATCCGGTTAAGTTAATTTAATAGTAGGAACTAAATTAATTCAATTTTTTAATATTAAAAATTTAATTAATAAAATTTAAAAGATGAAGATATAACTAAGATAACCCATAAAAATAGAGACTTCCGAATGGTTTAAGCTTATCTGAATTATAAGTAATAGAATGCATGATTAAGTTATATGGGCGGGTTACAGGGAACTTGATTGGTTGGTGTCCGTATGAGATGTAAACTTATTGGTATGATTGATGTCCTATTCGATTAAAGTATATGCTTATACCCACTGAACTTTATTATATTGTAAAACTAATTATATTTTCTTAAAGTAAAATTTAAAATGCTATAAATAATTAATCACACAGGATGTTTTAATTTTATAAAATAAAAAAATTTAAGTTTAAATTCGTTATATAATAAACTAAAAGAAGTGGCATGTTATGTTGGAAATATAGGTTGAGAATGGGTTTCAGCTTGTGTTTGGACTTGCTGAAAATTGACTACACTAAAATGGGCCTAGCATATTGGGCTTTTGCGACGTGAAAAAGACTGACCTGTGCCTTTTGAACAGGGGTGTTACTCCCTCCACCCCCACACGTCTCTTCCTCCACCTCCCCAATTTTCTAAAATGCCAATTATATCCTTCTAAAATGACAATTATATCCTCAAAAGTTAAAATTTTTTATTTTTATTATTTTAATATTTTAATTTATTTAAAACTTCTGATTTACTTCCCTCTGCACCTCTTCCTCTCTTCCATTTTCGTTTACCTTTCTCTCTTCCGTTAAGCTTCTTCTCCACCTATAACAAATTCATATTTTAACAAATTCATATTTTAACAAAATTATTACGTTTAAAAACTAACCATATATAACATTTAAAATTATAAATTTAAATATAAATTACTGTAAATAAAATAAACAAATAAAATAAAAACGAAACGTAAGATGTCGACATCCCTTTTGCCTTAAACGGATGTCGACATCCGTTTTGCCTTCAACGGATGTTGACATCCGTTGAAGGATGTCATCCGTCCAGAGGCAGTGTTCCTTTTACGTTTCGTTTTTATTTTACTACGTTTTGCGGCTCATGCAAGGATTATAGGCTTGGATATTAAAAGGATTATTGGAAGTATGGGAAGGATTTAGGGTTTAGGATTATTGGAAGGATTATGACTACGTACCTGGAGAGGAACCACGACAAGGACACTACACCATAAACGCACTGCACCACGTACTGCACCGAGAACAAGAAGAAGATTGTTTGATAATTCTTTTCACGATCACCAAGCTTTGTAGAAAAATATTTTACTCATACAAGAAACTACGTAGGTTATCAGTGAAATATGTTATAAATGAATAAAATTAAAAAACAACAATTTTAAAAATAAAATTTTACTGAGGGGCAAAATAGTAAAGGAAAGGTGGAGGAAGGGGCAAAATAGTAAAGGGGAGGTGGAGGAAGAGATGTGTGGGGGTGGAGGGAGCAACACCCTTTGAACAGATCTGACACCTCTTCGTTCAGAGTGG


Gene Sequence:
>Vu_08460(-)
TGACTGTCTTTAATTGCATTTACACCTACCCACCAAAACGCTGAAATGAACGAACCAGAATTGGAACGCCTTCCCCTCTTTCCTTTACTTCTTACACTTCAAGGGCAAAGAAATGAACAGCTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTGTTACTCTGGCACGCTCTCGGTATGTGATGTTCCCGTTTCTTCATTAGTGGAATCCAGGTTTTGAGGTTACTGTGATGGAAGCTAAGTCCATGGCACTGCAATTTCTTCTCCTTCTGCTCTCTCTACTCGCTGTTGCTGCTCATGGACTCGCTTCCAATGCTGTGAGTGTGTTACTACATGTTTGGTCAATCTCAAGAAATAATAGTAATAGTAACTGAAGTTTTCCTTTTATAGTTCTTTCTTGAGAAATGTTTTATGTTGTGAACCGATTTGTGGAAGCTTTGTCTTGCTTGCAGACACTGAACGAGACTTGTGGATACTTCGATGGTTCTCTCAGTAGAGATACAAAAGGTACGAGTTCTTCTATTGCTTACATAACGATGGTAGTTGCTATTTTAGAAATTATTATTATTATTGTCGTTGCTATAATTATTGTTATTATTATTGTACTCTCTCTGATCCAAAAGCATTGATGCTTGAGATTTTCCCCAATGATTATGAAGAGTCATTGAATACCTCCGACTCTGGAGGAATATCACTAAATTATCTCAGTTTCACTGGTAATATTTTCTGTTATATTTAGTGGATATCCTAGGAGACAAGGTCAGCACTGAAAATAAATTATGCTTTCTTGACCTTGAAAAGTCAGAGGTGTTAAACAAATACATGTTGCAATTTTGTTCACTTAGTTACTAGCTGAATAGTAGTTTACAAGAATAATTTGCTGTTAGCACCCAAGTAAAACTAACAAGCTAACTAATACACAGGCAAATTACAACTAATTATAACTAATTGGAAGGTTTTCTCTCATCAGTGAGTTTGCGTCTAGATGCATCTCATCATGCTCATCAATTTTATAAAACTCGTGGATCATTGATAGGAAGGGGGTAACATGATCATAACTTAGGGATGGTAACTTGGATTGTAATATCCTCTTAAAAATGCACAATTATATTTAGATGTTGGTGATGCAGCGTCAGTGCTGCTCGCTGACAGCTATGAATAGAAACGAGCGATGGTTTCTATGTGCATTTTGGGAACCTTAAGCACAAATGGGATGTACATCTAATTTTTGAATTGGGTTACAATAGACAACCTGAATAGTCCACTCACACACAGACACACACACATATTTCCCAAGTTGGGTAACAAAATTCCAAGACCATCCAACATTCAAGATTAACATGGGCAATGATCTGCTGTTTCTGCAAGCAAACTTGTGAGCATTTAATGATCGGCAGATTCTCTGCTCTGCCATGTGAATTTGGTCAATAGTGCCCCCAAAGTTGCAGGATTGTGCAAGTTTACTGATTTGGACAACATCGATGCTCACATCCTATTATCTACATGAATGGTATAAGAATTGTTGTGCACAATTCGTAATACTTAATATTCATGATTTGATATATTCTATATAAATTCTAATACATTACATCTGATGATGCTTATAGTCACATTTGGATAGTGAATTTTGTTATTTGTTTGGATAGACTTTGAATAGTAATGCTTGAGTTTTCAATTATTATATTATTTCCTCTCCTTCTGCAGTACCTTGCCCTATTGGTTGGGTTATGGACCCTAACAAGACCAAATGCTTTCTTCATGTTGGGAGGCCTCAATCTTGGAATGACTCAGAAATCTGTTGTAGTAAGTATGGTGGACATTTAGCTTCATTGACATCACTTCAGGAGCTACAATTTGCTCAGAGCCTGTGTGGTGAATCTGTGAATAGTTGCTGGATTGGTGGACAAAGACGCAACACTACAACTGGTTATCAGTGGATGTGGTCTGACAATTCACCAGGGAATAACTCCATATTTCCATTGGAAAATGTTCCTCCCCATTGTAATGGAACTGGACTATCCTGTCATGGAAACAATACAGATAATCTGTGCACAGTAATGACTAATAATTCAAACTCTCTCGTGAGTGAGAGATGCGATAATCCTCACTCTTCTCTGTGTATACTTGATATAGGTATGTTCTCGTTGTATATCACTACCAATTCTCATTTTGCATTCATTAGAGATTCAGTATTTATATTTTCAAATCTATTTTATTCCCTCACCCAAAAAGTCTCTTGCTATTAAAAAATATGTTCAATAGGTGCATCGTTCAATGAATTTTTAAATCATCATTTCTGACTGAACCGTTTACCCATTTTCTTTTATAATAGATGCAGCGTGTAACCGGATGCACTGCCATAGGGATTATTACCTTATCATCCTCATAGTAGTGAGTGCATTGATACTCTCTACAACATTAGCAGTGGTAGTTTGGCTTCTTGTATATAAGCGGGGAAAGAAAAGAAGGCGGTCTAGAAAAATATCTGTTCCAGGAGCTTCTCTTCCATCATGGAAAGTCTTCACCAAAGAGGAGTTAAGGTCAATTACGAAGAATTTCAGTGAAGGTAATCGTCTTGTTGGTGATACCAAGACTGGTGGTACATACAGTGGGGTTTTATCAGATGGTTCAAGGGTTGCAGTTAAGAGATTAAAGAGGACAAGCTTTCAGAGGAAAAAGGAGTTTTATTCTGAAATTAGCAGGGTTGCTAGGCTTCGATATCCCAATCTGGTTGCTGTGATGGGATGCTGCTATGATCATGGTGATCGCTACATTGTTTATGAGTTTGTAGCTAATGGTCCCTTAGATAAATGGCTGCATCACATACCTAGGGGAGGTCGCAGCTTAGATTGGGCTATGAGGATGAAAATTGCTACAACGCTTGCTCAAGGAATTGCGTATGTTCAAAATATACTTTTTATTTTGCTAACTTCATTTTATCTACAATTTTTCACACTCCTTGTTCATGTGCATATTTCACTCAAATTAACAAAAAATTTCTTATGATACAAATTGTTTTGCTATGAATGTGGGCATTTAGGTTATTCTGTTGTATTTGTGTGCATTCTTTGTAATATGCACTGCATTATGACTTTTAAGATTCCAAATTTCATAAGGGAACATTTAATTTAATACTTGTTGTGTCTGGTGCATGGACAAATTGAAATGAAATTGATTTTTCTTTCCAGTCTGTTTTCTTTGATGTTCCACCCTTTTAATTGGAACCAGAGTGTTTCATTTTTAAACTGTCCTTTTCAATTCTTTCTTTACAATGTAGCAACAATAGAATAGAACTCGGGATATGTTTGTTCCATCTAGTATGTCTAAATGTCACTGGTCTCATTGATTATCAAATTGAGTGAAGAACTTTCATGTTCTGGATTTCCCTGTCTCTAAAGTCCTACAGCCATCCTGTTCTTGAATGTTATTTTTGCATGAGAGCAATATTCTTTTCATTCTAAAGATAGGGATCGCCATTTGACCAAGTAAATATTACAAAGGATGGTGGAGTTGAATGAATTAAAATATGCTCTGCTGGTGTACTTGGCTCAAAACTTCGCGTGGATGGTGGTCAATTGAGTGAAGAACTTTCATGTTCTGGATTTCCCTGTCTCTAAAGTCCTACAGCCATCCTGTTCTTGAATGTTATTTTTGCATGAGAGCAATATTCTTTTCATTCTAAAGATAGGGATCGCCATTTGGCCAAGTAAATATTACAAAGGATGGTGGAGTTGAATGAATTAAAATATGCTCTGCTGGTGTACTTGGCTCAAAACTTCACGTGGACGGTGGAGTTTCAGAGTAAATGTACCAGGATCCCACAATGCTATTTGACACTAGATGATCATAGAGGGAGATAGAGATATAGAGCTAATTATCGTAGCCCATTGTTGTTTGTGTTGGATCCACTAATCTTGCATTGCATCTGTCTTATATTATGTCCTCATTTCACTAGTTATCATTAGAGGATCCTGATCCATCTAGAAAAGAGGAAATAATTAATGTGTTTTTTTAATTGCCGGTTAGGTTTCAGTTTTCGTTTGCGTTATGGGCTATCTACAGTTTCCTTGTCCAGCACTAGACTGTATCAATTGAGATTTTTGAAGATGTTTTAAATATTATCTTCTTTTCTAATGTTTATTTATTATATTATATAAAAAATTACATTTCCTGAGCCATGTAAGATCATTTATGAAAGATTTCACTCCTTTAGCATCAATCTTCAAGGACTTTTTCCTGGTTAGTTATATAACGTTGCTTCATTTCATTGTTGCTGTCCTATATTGGTCCAGTGTAGTGGATTATGTTTACCTTCATTATGCAAACTCTTCAATGCCTTGTGTGCTTTATAGGAGGATATAACAAAAGAAACCCGATGGCTTTTTAGTCTCTAAATATGCTATGTTAGTTAGCTTGTAAAATCATGCCAAGGGTAAGTAGGCCGTTATCTACCTATCAAGAAGAAAGAGAGGAGGAAATAATTTGAAACCCATGTCCGGGGAACCATATGAATGTTTGTTGAGTTTTTTCATAACGGTAATTATAATTCCATTCACTCTACGAAACTATTCCTCTTGAGTTTGTTCCAAACTTGATTTTCCGATTAAAAGTAAATAAATAAATAAATTAAATATTCCATACTCTGCAGTATTTTGAACTTAAATGATAGATTGATTAATGTATAATTGCGGCCCACCTCTCTATTTCAACAGGTTTCTGCATGACAAGGTTAAGCCACAAGTGGTGCATCGAGATATACGTGCAAGCAATGTACTCCTGGATGAGGAGTTTGGAGCACGCCTGATGGGTGTTGGTCTGTCCAAGATTGTGCCGTACGAAGTAATGCATGAGAGAACTGTCATGGCAGGTGGAACTTACGGATATCTTGCTCCAGAGTTTGTGTATAGAAACGAGTTTACAACAAAGAGTGACGTATATAGTTTTGGCGTCCTACTACTTGAAATAGTAAGTGGACGTAGACCTACACAGGCAGTTGATTCTGTTGGTTGGCAGAGTATCTTTGAGTGGGCAACACCTCTTGTGCAAGTTCATCGCTACCATGAACTCTTGGATCCTCATATAACTTCATCCTCTTCTAGCATTATCCCTGAGGCTAGTACCATCCAAAAGGTGGTTGACCTTGTTTATTCCTGCACGCAGCATGTTCCTTCTATGCGCCCTAGAATGTCTCATGTTGTTCACCAGCTGCAACAAATTGCCCAACCACCTGCAAAGTAAAAGCTAATCTTGACCTCAAATTTCTGTATCTATAACTTACAAGTGGAGGCTTTTTGTGTTAATACATGTAACAGATATTTATGTACTTTAACTTCCCCTTCTTTGGGATCGAAATTAGCTTTTTGTTAAATCAAGTGGGAACTAGGGTTAGAAGAGGCAAATTGTGCGAAACAATATTTGAATTTTTATACACGCAGGTGTAATTGTACTATTAATTGAACTGTACTATTGAAGAATTGTTTGAGCATAGAAGTGATTCTTCAACAAGTGATTCTTTTTATAAAGAATTTATTTTAGTAC