Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08457 LG2 6372704 6380581 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 6373093 3_prime_UTR_variant
A/G 6373199 3_prime_UTR_variant
C/A 6373886 missense_variant p.Gly1001Val
A/T 6373898 missense_variant&splice_region_variant p.Val997Asp
T/A 6375459 synonymous_variant p.Pro593Pro
T/A 6375486 missense_variant p.Gln584His
T/A 6375487 missense_variant p.Gln584Leu
G/A 6375505 missense_variant p.Thr578Ile
G/C 6375929 missense_variant p.Pro437Ala
G/A 6376150 downstream_gene_variant
C/T 6376184 downstream_gene_variant
G/T 6376629 missense_variant p.Pro365His
C/A 6376716 missense_variant p.Gly336Val
A/T 6376718 splice_region_variant&synonymous_variant p.Val335Val
C/A 6376720 missense_variant&splice_region_variant p.Val335Phe
T/A 6377175 intron_variant
A/T 6377436 intron_variant
C/T 6377514 synonymous_variant p.Thr193Thr
T/C 6377754 intron_variant
C/A 6377868 missense_variant p.Asp170Tyr
T/A 6377870 missense_variant p.Lys169Ile
G/T 6378394 intron_variant
G/C 6378514 intron_variant
A/G 6378908 synonymous_variant p.Ala61Ala
A/C 6379906 5_prime_UTR_variant
G/A 6380184 5_prime_UTR_variant
C/A 6380296 intron_variant
G/C 6380404 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08457.1
MKAPPNGYLPNSSEGERKTINSELWHACAGPLVSLPPVGSLVVYFPQGHSEQVAASMQKEADFVPSYPNLPSKLICMLHNVALHADPETDEVYAQMTLQPVTKYDKEAILASDMGLKQNQQPTEFFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKIFPLLDFSMQPPAQEIVAKDLHDSTWTFRHIYRGQPKRHLLTTGWSVFVSTKRLFAGDSVLFIRDEKQQLLLGIKRANRQQPALSSSVISSDSMHIGILAAAAHAASNNSPFTIFYNPRASPSEFVIPLAKYNKALFNQASLGMRFRMMFETEESGVRRHMGTITGISDLDPVRWKHSQWRNLQVGWDESTAGERPSRVSLWDIEPVVTPFYICPPPFFRPKFPKQPGMPDDDSDIENAFKRAMPWLGDDLGMKDASSSIFPGLSLVQWMSMQQNNQFSAAQSGFMPPSMLSSNALHGNIPTDDPSKLLNFQAPVLSAPNLQFNKPNLPNQVNQLQQPQTSWPPQHQQQQKVQSLMPTTLNPLQQQQQRQQQLPVLQNLSQPQQQQPQMPQQRPQQPQQQQSCQQTIMNNEAVSSNQIQNQCVQQPVTYSQLQQQQLLSGNIPPQQSFQSPNKNALLMTSLPQDSQFQQIDQQASLLQRQQQQTQLQSSPLQLLQQSMSQRTPQQPQMTQMSQQNSSEQQPQLQLLQKLQQQQQQQQQQQQKQQQLLSTSSPLLQSHLLQQQNTHQQNQQLPQLPLSQCHQPQQLGNNAFSMEKLFNGNNYSSSALMQTQQFPMNQSQNTQKSLTNTRAPSTLTDGDAPSCSTSPSTNNCQISPSNLIKRNQQLPTTLGGPSVVEPTNHLIQELHRKSEMQIKHELPCVRGPDQLKCKGTIADQMEASSGTSYSIDPNNIHQNFPLPSFCMDGDVQSHPRNNLPFTSNLDGLTPDTLLSRGYDSQKDLQNLLSNYGGAPRDIETELSTAAISSQPFGVPDMPFKPGCSSDIAINDPGVLNNGLWASQTQRMRTYTKVQKCGSVGRCIDVTRYKGYDELRHDLARMFGIEGQLEDPQRTEWKLVYVDHENDILLVGDDPWEEFVSCVQSIKILSSAEVQQMSLDGDLGHVPVPNQACSGTDNGNAWRGQYDDNSAASFNR*


CDS Sequence:
>Vu_08457.1
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>Vu_08457::LG2:6380581-6382581(-)
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Gene Sequence:
>Vu_08457(-)
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