Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08401 LG2 5661292 5666205 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase kinase 2-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 5661309 3_prime_UTR_variant
G/A 5661565 3_prime_UTR_variant
T/A 5661865 downstream_gene_variant
A/T 5661890 downstream_gene_variant
T/A 5661964 downstream_gene_variant
G/C 5661971 downstream_gene_variant
C/T 5662098 downstream_gene_variant
T/G 5662232 downstream_gene_variant
C/T 5662236 downstream_gene_variant
G/A 5662623 downstream_gene_variant
G/A 5662658 downstream_gene_variant
G/A 5662660 downstream_gene_variant
G/A 5662662 downstream_gene_variant
G/A 5662668 downstream_gene_variant
G/A 5662685 downstream_gene_variant
G/A 5662689 downstream_gene_variant
T/G 5662918 missense_variant p.Ser256Arg
C/A 5662919 missense_variant p.Trp255Cys
G/A 5663689 downstream_gene_variant
G/A 5663693 downstream_gene_variant
C/G 5664274 downstream_gene_variant
A/G 5664359 downstream_gene_variant
A/T 5664442 downstream_gene_variant
G/A 5664518 downstream_gene_variant
T/C 5664527 downstream_gene_variant
T/*,A 5664548 downstream_gene_variant
A/G 5664630 downstream_gene_variant
G/A 5664669 downstream_gene_variant
A/G 5664811 missense_variant p.Leu67Ser
A/G 5664919 downstream_gene_variant
C/A 5665652 downstream_gene_variant
C/G 5665656 downstream_gene_variant
T/C 5665755 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08401.1
MKKGSLSSGLKLTVPASDWGSFTKFLSESENETFKAGDLLVDKEGVRVVSEKEVEAPPPITPLDNQLNLADIDTIKVIGKGNGGIVQLVQHKWTNQFFALKEIHMNIEEPIHRQIALELKINQSAQCPYVVVCYQSFYHNGVISIILEYMDGGSLEDLLNKVKKIPESYLAAICKQVLKGLMYLHHEKYIIHRDLKPSNLLINHRGEVKITDFGVSIVMENTSGQANTFIGTHSYMSPERITTDQSGYDYKSDIWSLGLILLKCATGQFPYTPPDQLEGWENIFQLIEVIVEKPSPTAPPEDFSPEFCSFISACLQKNPRDRPSARDLINHPFIKLYEEDLNVDLSTYFYNAGSTLATI*


CDS Sequence:
>Vu_08401.1
ATGAAGAAAGGGAGCTTAAGCTCCGGTCTCAAACTCACTGTTCCTGCATCTGATTGGGGTTCATTTACCAAGTTTTTGTCTGAGTCTGAAAATGAAACGTTCAAGGCAGGGGACTTGCTTGTCGACAAGGAAGGTGTTCGAGTTGTTTCTGAGAAGGAAGTGGAAGCTCCACCACCAATCACGCCACTAGACAACCAGTTGAATCTGGCAGATATTGATACAATCAAAGTGATTGGAAAAGGAAATGGAGGGATAGTGCAATTGGTGCAACACAAATGGACTAATCAATTTTTTGCATTGAAGGAAATTCATATGAATATTGAGGAGCCTATTCACAGGCAGATAGCACTTGAGCTAAAAATTAATCAATCAGCACAATGTCCTTATGTTGTTGTCTGCTACCAGTCATTCTACCATAATGGTGTCATATCAATCATATTAGAGTACATGGACGGAGGGTCCTTAGAAGATCTTCTGAACAAAGTTAAAAAAATTCCAGAGTCATATCTTGCTGCCATCTGCAAGCAGGTGCTGAAGGGTTTAATGTATCTTCACCATGAAAAATACATTATCCATAGGGACTTAAAACCTTCTAATCTGCTAATAAATCATAGAGGGGAGGTAAAGATTACTGACTTTGGTGTAAGCATAGTCATGGAAAATACATCTGGTCAAGCAAATACTTTCATTGGCACACACAGCTATATGTCTCCAGAGAGAATCACTACTGACCAGAGTGGCTACGACTACAAAAGTGACATATGGAGCTTGGGACTGATTTTGCTCAAGTGTGCCACGGGGCAGTTTCCATATACACCACCAGATCAACTTGAAGGATGGGAAAATATTTTCCAGCTTATTGAAGTCATTGTTGAAAAACCTTCCCCCACTGCTCCACCAGAAGATTTTTCTCCAGAATTTTGCTCATTTATCTCAGCATGTTTGCAGAAAAATCCAAGAGATAGACCGTCTGCTCGTGACCTTATAAACCATCCTTTTATCAAATTGTATGAGGAGGACTTGAATGTGGATCTTTCAACTTATTTCTACAACGCAGGATCTACACTTGCAACCATATAG


Promoter Sequence:
>Vu_08401::LG2:5666205-5668205(-)
TGATAATGAAACTCTTACACCAATAATGAGAACAAGCTCTTATAGTGTATATCAATTCTTAGACTTTTGTTTGTAAGAAAGAACATTATTTTTGTTCATTGATATATAAAAGAGTGTTTGTATCTTGTTAGGAAATATTCCTTTCTAGTGAGTAAAATACGTTATTATTTATATTACAATATTTGTTTCAAAATGTTTTAGTTATGGATTGTTAAATCCAATTAAAAGTGGTTACGTCTAAAAGTGGATCAAACAATACTTGGTTTTGGATTTTGACAACCCATTTTACAAAATGCAGAGAAAAAGAAAAGGGTGACTATGTTATTAGTTTTTTCCCCTTTCTAGATTGAGGACATGAAGATAAGAGAAAGCATGAACATTAATAATGATTATTCATATTCGAATAACCCATTTGTAATTAACTGAATCCAAAATTATTTATATCCAAATAATCCAACAAATTAAATAGTCAAACTAAATATTAAAATATTAAATTTGAATTATATTAGATTAGCAATGTTGACCGGAGCTTGACTACTAGTTTAACTCTAATGTTCAATTTAAAAAACACATACACATAACATAATTCTACAAGAAAATGTTCCATTTCTAATTTAGAACTTGTTAAATGTCTAACTTTCTTGTTAATCATTCAATTTTGATGGTTATTTAATTAATTTCCTTAAATTTTGAAATGTTGATATATCTCAAATTGTTAATTTGTGAATAAAGTAGGAAAAAAAATTTTAGATGTTAAAATACTAAGTTTTAGTATATAGATCCTAACTATTTTGATGATGATACTCCAACGAAAATTTAGTAAGGAACATGGAGTTAAGAGTAATTTAACACTTTTAAAAGTTTACTCGTTAAATTTAATCAATCAACAAAAAATGGACAAAAAAATAACGAATTTTGTTTGAATGAAATTGGTTAAGTGAATTAAATTTCGTGAGTGAAATTGAAGTTGTAAAATTTAGGTGTCATTAGAGAAAATTATCTAAGCTAATTCAATTTGCTCGTTGAATCTTGAGAAAAATCTTAAAAATGAAGAATTCACTTTTGAAATTCATCAAAAGTAATTAGTTCAGCGAAAAGTGTGTACGATGATTTTGGAATTAAAAGCTATAAATAAGTTTTAATAAAGAAAAAATTTAAATACCTACTTCGTTCTCATGAGGTGAATTTCTGTTTATTCATATACTTTTCATAATATAAAGATTTAATTTCTTCATTTTGAAAACTGTGTACTAAACATAAATTTATCTTTTAACCTAGAAACGAAATAAACATTTAAACCCAAAGAAAAAACATCATGGAACTGAGGGGAGAAAAATATAAAAAAAAAAACTATATTAAAATAATTGAAAAAGTTTGAAAATGAACCATCCCCTTTTGTCTCTAATGATCTTCATGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAACACGGAGAATTAAATTAAATTACGCAAGCTATAATTTTTAAAATAAAATAAAATTTTATAAGTAATGATGACGTTAGTTTCCATCACTCAAAGATAATTAATTGCATCATCAAGACCCATTTATTTTATTTCATGAAGATAGTAATCTGGATGTGCGTGTCAGTGGAGTGGGAAAAATCTGTAACATGAAAACCTTGATTATATATGTGTTCATAGTTTTCCACGAATTATTAAATAAAAAATTGGTCTTTTAATAGAATTTGCAACTGCACGTGAGAACACTCCCATAAAGAAAAAGGGACAGTGAAAAAGGAGAAAGACTATTAATACGAGACGCGCGTACAATGTCTGAAATGTCAACACAAGTCTTCGTCTTCAAACTTCAAAGCTCATTTCTTTAATTTTTTATTATGATCCTTCTTCTTACCAACCTATTGCAACTTCAACTTTAACATCACAATCTTCAAAATACACTATAAATCTTTCACTTTCAACTCAGTTACTT


Gene Sequence:
>Vu_08401(-)
GCACATAATATATACTTTAATCACTTACTTTCCCTCATATTTTTTCATCGTATTCATACATAATCTTACTATATCTACGTATAAAGAAGGTTTTTTTTTTCTCGGAGCTGGGGGACTCAACTGGGAGCTCATAATCATGAAGAAAGGGAGCTTAAGCTCCGGTCTCAAACTCACTGTTCCTGCATCTGATTGGGGTTCATTTACCAAGTTTTTGTGAGCCTCTCTTTTGATTCAATGTGTTTGTTTTGTGTATGGTTTTGGCTGATTCGAATTGTGGCTATTTTGGTGTGGTAGGTCTGAGTCTGAAAATGAAACGTTCAAGGCAGGGGACTTGCTTGTCGACAAGGAAGGTGTTCGAGTTGTTTCTGAGAAGGAAGTGGAAGCTGTAACATTTTTCTCTTTAACGTTCTATGTTTTGCACTTTATTAGTTCCCTCTTTGAAAAATGTGTATGTTCAATTGGGTTGGTAAGTTGTTTCTCTTTTAGATTTGATCTTTTGATACTTATGAAATGCTTCCTCTGACAAGAAGGGGTTCCTGAACTTGTGTTGTTCGACAAAATGCGGCACTTTTTGTTTAGAAGAAGAAAGAGACTTTGCTTAAGATGGATTATCTGGTTTTTCTCCCTTATAATAAGATATTGTTTAAAAAAAAATTGGATTTGGAACATAGTGAGAAGGGGGTTGAATTTAATTTTTCTCTGACATTCGTTTTGTCTATAAGCAAACGGAACACAGGCTGCAAGCTGATGAAATTAAAGATTTTGTTCTGGAGACATTGTTCAATTTATGAAATGCTGAATCCATTTAGTTCATAATTTCATTTATTTTCTATCTAAAACAAAATTTGTTTTTGTTGTTTTCTAGACTTAAGAAATTTGTCTTGGTTTCTACCAGAATGTTGTGTGAACTTCTAGAGTCAACAGAATGTGCCAAAGCGTCATCCTTACTCTGCTTTTTTTTTTTAGTTTGTGTTTTTAACTCGTCAGTCATGGTGTAAACTGCTGAGCTTTTTGGGAAATTTGCAGGTTTCTAGAAAAACACTTTTGCATAAACTTATTTTTACATGTAAGGGAGAGATATAGTTAGAGAGAGAAGTCTGAAATTAGATGATTCATATGGTAGTTAGAAATAGAGAAATAATGAATTATAAAAGGGTAAAGAGTAATCTATCTCGCTTTTACCCTATGCAATGTTATGATCTCAATTTCTCTGCATTACTTTGGTCCTTGATACAAGAGGTTTGAATTTTGGAGTTCCTGTTTAGTAGTATTTTGTTTGGTCAATATACTTTTGAAAACAGGTTACATCAGAACTGAATTCTGATGATTTTGATTTTTAGTTTAATATCTGTGCTGTTTTCAGCCACCACCAATCACGCCACTAGACAACCAGTTGAATCTGGCAGATATTGATACAATCAAAGTGATTGGAAAAGGAAATGGAGGGATAGTGCAATTGGTGCAACACAAATGGACTAATCAATTTTTTGCATTGAAGGTATACTGCATACATACATTGTTTTGAGCTAGCATCTTCTGTTTCTTTTATCATTGTTTTTGTACAGTCATGTCAACTCAAGTCATAATTTCAAAGGTAAAATCATTTTCATTCTCCATTAAATCCATTTCATGGAGAATTTAGATTTTGTGATATTAAATTTTTTTTCTCCATGAAATTAGTGAGAGTCAAGGGAACATAAGGTTTCAGGAAGTTTTGATCTTAAAAAGGGTTTAACAAATTGGTTTCCTAAGGTGTAAGTTCATTCATTCAACTAGTTAGTTTTGTTGCAGTTGCTTTTTTTTTTTCATTATATCTAAAATACCATATCGTTCATTCAACATTAGATCTGTTGATGTCACTGAACATAAATCATTGAGATGTGGATAACTTAATCAGTTAAAGGGGACAAATTCAGGTAATGATCAGAAGAGTACAGTCATAATTTTACAGGATATTAAATGTATTAATTCCATTAATTTAATATCCGTATTTTGGTGTTACTTGAATAAGAGACTGTTTCTATGTTTTGTAAAGGGAAAGTTATAATGAAAAGTTGAAAAATAGTTGTATAATGATCCTAAATTTACAATAGAAAAGATAAAGGAAAGGTTTGTTTTGATTTTCAATCTTTTATATTGAATATTCTAGTATTCTTGTGCATGAAGATAATTAATTTGATAGATGTGGTTGGTCTCTCTCATTGATTTTTGACCACATTTTCCATAGAGTTCTCTTATCTCTTCCTTCTTTGAGTTAGACTTGAGAAAGAAGGGACCATGAAGAAAAAAAAAATATTTTTCATCCCTATACTTCATCTTAATTTTTTACACACTCTATTTTATATAGCTTCATTCTATTTGAGTTTTCTCTCCATAGTTTCGTGCTGGTTAGTTTTTGGTCCAATTTCTTACTAGACATGATTTTTTCAGCCCTCCAGCCTACACAAATCTACCCCATGGAAGTTTGGGTCAAAGTGTGGGTAGGTCCACACACAGTCAACATACGTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCATTAGTGTATACAATTGCTTGTGTTTTGAATATGACTAAATATTTATGTTCATTATTGGTTTTATAGCATATTAAATGTGTTCTTGATTTAGGAAATTCATATGAATATTGAGGAGCCTATTCACAGGCAGATAGCACTTGAGCTAAAAATTAATCAATCAGCACAATGTCCTTATGTTGTTGTCTGCTACCAGTCATTCTACCATAATGGTGTCATATCAATCATATTAGAGTACATGGACGGAGGGTCCTTAGAAGATCTTCTGAACAAAGTTAAAAAAATTCCAGAGTCATATCTTGCTGCCATCTGCAAGCAGGTAAGAAATAAGACATTGCACTTCATCCTTGCACCATCTGATTTTTTCTCTTTTCATTCCTAACTAGACTATATGCTCCTTTCTTTGTTTTATCACTACAATGTAGGTGCTGAAGGGTTTAATGTATCTTCACCATGAAAAATACATTATCCATAGGGACTTAAAACCTTCTAATCTGCTAATAAATCATAGAGGGGAGGTAAAGATTACTGACTTTGGTGTAAGCATAGTCATGGAAAATACATCTGGTCAAGCAAATACTTTCATTGGCACACACAGCTATATGTCTGTGAGTAACACAAGCAAGTGTATCTATCATTTTTCCTCTTGGCAATTACATTTGCCACCATTTCATGGAATACAACTTGTCCATCGTGCTCATTTTGCAGCCAGAGAGAATCACTACTGACCAGAGTGGCTACGACTACAAAAGTGACATATGGAGCTTGGGACTGATTTTGCTCAAGTGTGCCACGGGGCAGTTTCCATATACACCACCAGATCAACTTGAAGGATGGGAAAATATTTTCCAGCTTATTGAAGTCATTGTTGAAAAACCTTCCCCCACTGCTCCACCAGAAGATTTTTCTCCAGAATTTTGCTCATTTATCTCAGCATGGTATACATTAACTATGTTTCAGTAACCAAATCATATAGCCTCAACCAACTTTTCTCACTAGAAGACAATTAAAACAAAAACACTCTCATCCTTAAATTAGTTGCGATACTAAGAGCCTACAATTCAAAAGCAGAATGAGTATGTAGCCAAAACATGTAGTCTGTCTAATGGTATGAGGCCTTATGTTCATATTTTGTAATATAGTATATCTAAATGTGTCTGAAGCCCTTTATATTTTTTAAGATATCTTATATAATTTCATTGAACAAATCCTCCTGTGTTTAAACATATCTTAGAGATGGACCTCCAATCACCATATAATCAGCTATTTTGAAATAAATTTTGTAACTGTGCGTTTTATGAGGCTTCTGATCATCCTTTTGTCTTTGTGTTTAGTTTGCAGAAAAATCCAAGAGATAGACCGTCTGCTCGTGACCTTATAGTATGCATAATCTCAACTATATGAGTAACCCATGTAAAACATATCAAATACTCGTTCTTACTGTGGATATCTCTGATTTAAATTTCAGAACCATCCTTTTATCAAATTGTATGAGGAGGACTTGAATGTGGATCTTTCAACTTATTTCTACAACGCAGGATCTACACTTGCAACCATATAGAACATGGTATGTTTCCGTCCTGGACTTTATTCAAAGGTAATAGAGTTTGTGCTATGTATCACTTCACTAGGTATTCTTGAATGCAAATTACCTCAAACAGAATGTGTTGATCTGTCACTGTAGTTATTTCTATATGGAGGGAGCAAAGCAAGCCAATGTTTTAAATTGCATGCGGTTGAAATTTTGTAACTCTAAATATTGTAAAAAATTAAGGGGTAAATACAGCTGATGCAGTCACTTAATGTTGCAGTCAAAATTGCAATCGCAGACTGCTTTTTAAAACCTTGGTAACTGCTATAGGTACTCATGCTTCGACACTCAGATTATCTGATTGATTTCTAATTTTTTATTGAAATGATCATTTGTTTTTAAAGTTTGTATTGTGCTACTTAATGGATTGGAATACTCTTCTAAAGCCAATGTCATACATTTGCAGATATTATTACCTAAACTGCAAGTAAACGTGGAATGTGCTGGTTTGCTTCCAAGTTTCCAAGTCTCCATAGTAAATATATGAGGCCCTTTCACATAAACACACAGTTCTGAGCAGTGAACGTTATGGCATTCTCTGTGAACTTGGCAAATGGCAAGTTCTACTGTCACTTTATATGTAATTGCAATTTATATTCCTTTACTTGGTGGAGGATCCCCAGTTGCCATGACCAGAATTTGCAGAATGGAGCCAGCGAAACCAGCTTCTATGATTATGTCAAGGCATATTACTGTGTTGCCAAGATAGAGTCAAATGTTTTATAGCACAAACTCTTCAGAGAAATTTATACACTCATTTGAAAATAACCAATAATATATTCAGTAGTGGTTGGGATG