Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_08288	LG2	4339316	4354214	PREDICTED: cadmium/zinc-transporting ATPase HMA3-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword
Pathway		B 09191 Unclassified: metabolism		C 99980 Enzymes with EC numbers

SNP	Position	Effect	Amino acid change
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View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08288.1

MKYIRSNSLKRLFSFGKRGFGEENNVGLVAPSCEEHPLRPSWKCFSFEELFDATNGFSSGTLKGFNLQLQLSYGYIFITDIMQETSKALMSGTVSPWLWPCDIVRTMFIGIWLGEEDENLPPLDWRTRYKIALGTARGLHYLHKGCKRRIIHRDIKASNVLLTADFEPKISDFGLARWLPSQWTHHSIAPIEGTFGHLAPEYYMHGVVDEKTDVFAFGVFLLEILSGRKPVDGSHQSVHSWAKPILNKGEIEKVVDPRLGGAYDVTQFNRVAFAASLCIRASATCRPTMSEVVEVMEKWEIDKEKWEMAEEKEQEKMAENIKRSSFEVLGMCCATEAALVERIVKPLHGVKHVTVIVPTRTVTVVHDVLFISDSQIADALNAARLEASLRLQGETDNEKKWPDLTTMVCGLFLALSFLKYIYHPLEWLALVSVVIGFPKVLLRAIASIKALTLNINILVLLAVCSTAALQDFWEAGIIIFLFSIAQWLETRATHKAKVAMSSLTSMAPQKAVIAETGERVDVNDVKINTILAVKSGDAIPLDGIVVEGKCEVDEKMLTGESLPVIKEFDSVVLAGTINVNGYISVKTTVLAKDTVVARMSKLVEEASSRKSRTQRFIDNFAKYYIPAVVLISASIAVVPAALEVPDIKPWFHLAIVVLLSACPCALILSTPVAIFCALTKAATSGLLLKGGDYIETLSGIKTVAFDKTGTITRGEFTVADFSVIDDISIETLLYWVSSIESKSSHPMAAALVEYGMSNSVKPIPENVENFENFAGEGVFGTIDGKNIYIGNRRIGARADSERVDCQLQFQSHEISTPKRYCGPTLVGVFSLVDTCRSGALEAIEELKLLGVRSVMLTGDSTQAALYVQSQLNHALDIVHAELLPAEKAVIIENLKKDGLTAMIGDGINDAPALATADIGISMGISGSALANETGNAILMSNDIQKIPEAIRLARKTTRKLIENVIISVGFKSAILALAIAGYPIVWLAVLTDVGTCLLVILNSMLILQEKPKHERKSASSKYGTFSEDLTMTLLDNESNNIKNQGLLTGEKCGKDCCKDDTYHVETTSKNESSGLLKLSKRNQSGNSVSIEVHIVKPCNGCCLRKVKTFDDSACRTNNGSGCCQEQSKTEQCVTGSDAREDASIASLESYCLKDKSEDIQDLSETEGIPKCCNKTCCNDSFKNMASLSQPEIIIE*

CDS Sequence:
>Vu_08288.1

Promoter Sequence:
>Vu_08288::LG2:4337316-4339316(+)

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Gene Sequence:

>Vu_08288(+)

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