Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_08269	LG2	4148151	4148528	PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF098-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
T/C	4148391	synonymous_variant	p.Leu81Leu
G/A	4148415	missense_variant	p.Asp89Asn
A/T	4148424	missense_variant	p.Ser92Cys

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08269.1

MEKERSKEEEVKYRGVRKRPWGKFGAEIRDPTKPTGRQWLGTFDTAEEAARAYDRAAIGLRGALAILNFPDEYYSHLPFLLSSNSSTVDSGSSFARKEVIEFEYLDDKVLEDLLEIEEKRRNNKD*

CDS Sequence:
>Vu_08269.1

ATGGAGAAAGAGAGATCAAAAGAGGAAGAAGTGAAGTACCGTGGTGTGAGAAAGAGACCGTGGGGTAAGTTTGGAGCAGAGATCAGAGATCCGACAAAACCTACGGGAAGACAATGGTTGGGAACGTTTGACACTGCAGAAGAAGCAGCAAGAGCTTATGATCGTGCAGCCATTGGTTTGAGGGGTGCTCTTGCCATCCTTAATTTCCCCGATGAGTATTACTCTCATCTTCCTTTTCTATTGTCGTCAAATTCTTCTACTGTTGACAGTGGAAGTTCTTTTGCCCGAAAGGAAGTTATTGAGTTCGAGTATCTGGATGACAAGGTCTTGGAGGATCTTCTTGAGATTGAAGAGAAGAGAAGGAATAACAAAGATTAA

Promoter Sequence:
>Vu_08269::LG2:4146151-4148151(+)

CGGTAAAGATAATAACCACATTACCTTGTTAACACAGAAATCTAAAAATAGGATTTTTTTAAAAAAAAAATTTATATACAAAACAGATTGAATAATTTAGTTTACTGATCCACATAGACTTATATCACATAATCCACCGTCCACACGACTGAATAGACTTACCTATATAATCTGCAAAAGTATTTGTTAACATATTTTAATTTATAACTTACGTAAAACTCTTTTATTTATTTTGTTTTTCAACACTCACCTAAATCCCTAAGTCAATTCTTTTATCTATATTTAACATTGATTAATTGTTATAATTTTTTAGTAACTTAAACAATAATTTATTTTATATTTTCTTTTCATAAAAGATTTAACTTTCACATATTTATTTTTTTTAATCTTAATATTATGCTTATTTAGTATATTTTAATTTTATTTTCAATGATAGATTTTTGGAACATAACAATAATATAAAACATTAAAATTAAAATATTATATTATTATTATAATATTTAGGTTTAATTATTTTCGAAGTTTCTAATTTTGTTAAAAGAAGTGTCAAGTTTTCAGTTATTTTTCTTCTTAATTAGGTCCTTATTTTTGAAAAATTAAAGTTATTATGTTTTTGTCATTAATTTTTTGAAAATAAAGATTCAATTGAGGAAAAAAAAACTAAGAACTTTGAGACTTCTCAATAAAATTAGAAAATTTGAAAATGATTAAACCTAATATTTATATAAAGTTATTTTTATATGGATGACTGGAAACTCACGGACCAATCACTATGCATGACAAGCTAATACTAACCTGCAATTCATGTGAGGCGGACAAATCCCATCAAATTTTCTGTAGATCAAATATGGAGCAGCTTAAACTCAGAAAAAACTAACCTACATTATTATCCCATAATTAACAAGTTATGAAAGTAATCTAACAAGGAATACAAATGAGTCTCATTAGATAGTTGAAATATTTAAATGATGCATGCATTAAATGGAATGAAAGTAAACTAATTTTGATATAAATAAATACCGTAAACAAGATAAACTAAATTTGTTAAACTTAATCTAAATCATTTACGTGTAATAATTTATATTTTAAAGGATTACGAGTTTTTTTTCTCAAAAAAAAAAAATCAAATTGAATCGTTGATCAATTCAGGTCAGATTATCTACACCGGATCCATTTGAATAACATTAATGACAAATGACATATTAACGCAACAAGTCTAACATGATGTACAATATAACTATTAAAAAATTGATCTACAGCAATTTTGAATCAGTTTGGTTACGGTATTCTTAATTGCAGTCAATCAGTTAATGTAATAAAAAAAGATACGACAACAGAATGAAGTGAACTGTATTAAAAAAATCTATTATTTAAATATAGAAATATTTTCTGATGGTACAAATAAAACGAAAATAATTACTCCAGCTTTATCTTTTAAATTAAAAAAGCAAGAAATTAAAATAAAATGAATATGTATGACTTACGTAAAGTGGTCATAATACATACTTCACATTTATTCAACACTGTATTATTGGATATGGGATCCTTATTCAATTTTTGCTGTTTTTAACTTTATTCTGCTTATTGAAATCGGTAAATAGAAAATGTTATCTTGTGTTTTGGTTCAAACCTCTTAAGATGTGTCAACATCGTAGGGTTACTGTAGTTAAAATAATTCATAATAATTGCGACCCAGTAGCCACCTCAGCCATGAGCTACTAGAAAAAAAGGCCATGGATGCAAAAGTGACGATCTTTGAACATCATGGAACCTGTCCAAATATACTCATCGTAGTACCAGTTCTTTCCAAAATATTATAAACCAAGTCAAAGAAGAGTCCAACTTTTACACTTGCACAAGAAAGCTCGAATCAAGTCAATAACAAGAAACAAAAACTAATAGTTACAACAAAGGCTGCTTTTATATGCATATATATATAAGGAGTTGAAAGAAAGAATAAAAATACTGAAGAAAGAAGGAAGTTGTTTAAGCAAAAGATA

Gene Sequence:

>Vu_08269(+)