Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08230 LG2 3801407 3805397 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 3801838 upstream_gene_variant
T/C 3801890 upstream_gene_variant
C/A 3802021 upstream_gene_variant
T/A 3802433 upstream_gene_variant
C/T 3802572 synonymous_variant p.Arg942Arg
A/T 3802688 missense_variant p.Phe904Ile
T/C 3802706 missense_variant p.Thr898Ala
A/T 3802707 synonymous_variant p.Leu897Leu
T/C 3802779 synonymous_variant p.Lys873Lys
C/T 3802798 missense_variant p.Gly867Asp
C/A 3802810 missense_variant p.Arg863Ile
G/A 3803228 missense_variant p.Leu724Phe
G/C 3803310 synonymous_variant p.Gly696Gly
T/G 3803532 synonymous_variant p.Pro622Pro
T/A 3803537 missense_variant p.Ile621Phe
C/G 3803656 missense_variant p.Ser581Thr
G/A 3803705 missense_variant p.Leu565Phe
C/A 3803735 missense_variant p.Val555Leu
C/A 3804227 missense_variant p.Gly391Trp
A/C 3804336 synonymous_variant p.Leu354Leu
C/T 3804521 missense_variant p.Gly293Ser
T/A 3804582 synonymous_variant p.Thr272Thr
G/A 3804624 synonymous_variant p.Thr258Thr
T/G 3804639 synonymous_variant p.Ala253Ala
T/A 3804948 missense_variant p.Gln150His
G/C 3805059 synonymous_variant p.Leu113Leu
C/A 3805063 missense_variant p.Arg112Leu
A/G 3805168 missense_variant p.Val77Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08230.1
MRISTLGIVLLCFYSALLCRGNESTMRVLLEVKSSFTQDPENVLSDWSENNTDYCSWRGVSCGSKKLNALDDDDDSVRVVGLNLSDSSLGGSISPSLGRLQNLLHLDLSSNRLEGPIPSALSNLTSLESLLLHSNQLTGHIPTELDSLMQLRVLRIGNNQLNGPIPETLGYMPSLEYLGLASCRLSGQIPAQLGRLSELQYLTLQENELTGSIPYEVGYCWSLEVFSAAGNRLNGSVPSELSLLRKLQILNLANNSLTGSIPSQLGQLSQLTYLNLMGNELEGRIPPSLAQLGKLQNLDLSNNTLTGEIPKELGNMGQLQYLVLSGNKLHGTIPRTICSNATSLENLLMSDCGLHGEIPAELGQCQSLKQLDLSGNDLNGSIPIEVYGLMGLTDLLLHNNTLDGSISPFIGNLTNMQILALFHNNLRGNLPREIGRLGKLEIMYLYDNQLSGKIPFEIGNCSSLEMVDFFGNHFSGEIPFTIGRLKELNFLHLRQNELVGVIPPTLGNCHKLTVLDLADNRLSGGIPATFGFLRELKLFMLYNNSLEGSLPHQLVNVANLTRVNLSNNRLNGSLVPLCSSSSFLSFDVTDNEFDGEIPFVLGNSPSLDRLRLGNNKFSGEIPRTLGKITALSLLDVSGNSLTGGIPDELSLCNNLTHVDLNNNLLTGHIPPWLGSLSQLGEVKLSFNQFSGSIPLGLLKQPNLIVLSLNNNSLNGSLPGDIGDLVSLNTLRLDHNNFSGPIPQEIGKLSNLYELQLSRNAFSGEIPIEIGSLKNIQSILDLSYNNLSGHIPSSLSMLSKLEVLNLSHNALTGEVPSAVGELTSLQKLDISYNNLQGALDKQFSRWPRESFEGNLHLCGASLERCKSGDGSGNKRSVFSSTSVVIVSTLSALAAIALLTLVVIVFFKTKQEFFRRGSEVSFVFSSSSRAHKRSLIPLNVPAKRDFRWHDIMEYAYSLKGTEKTDVYSMGVVFMELVTGKVPTDAAFGAEMDMVRWVKMQLEKEGIAVEAVIDPQLKPLLPCEEFAALQVLEIAIHCTKTAPQERPTSRQVCNHLLHVSNNKIVDFEKKNLDRNW*


CDS Sequence:
>Vu_08230.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08230::LG2:3805397-3807397(-)
ACCAAAATCAGGTTTCCAAGAATCAAAAGGTTTAAGCAACAGTGAAAATGGCTCAAAGAAGTATGAATGCAATGAACTAAGCTAGAATTAGAATGCTTAGTATGACCAAACTCAGAATAGACCAAACAAATAATATTAGCCCGGTGAATAGCTGGAATTAAAAACTGAACAGTGAGATGCTATTAATTGTGAGCAACCAAGCTATGGAAATTGCATTTCATTGCTTGTAATGGTCTGCTACACTTTTAGCAACCTTCAACAACATCAACCAAGTTTGTATAAAGCACCAGAATCAAAAGAAATCAACTGGAAAACAGATTCATGATTTAAAACAGAATTGAAATTCTGCAGCAGAGTTCAACACAGATTTGAAATCAAAATGGATTTATAGTGCTTTAGCTTGTATCACCAAGGCTAGAACAAATTCTCATTGCCTTTATTGGCTGATATATGGCTTTAAGGATGATAACTCAAAATAAGAGTTTGAAAGATTTATGAAGAGAGACAAGAAAGTTCTTTAATGAATGTGCTAGATACGATTATAATTGTTATCATGTGTTCACATCCATTTGAATCTGTGTTAATGTACAAATTTACAACTACCAATGCAAACCTTTTCTGTCAATTCAACAAAATAATTAATACACAGTCAAAGAATCTAACAACATATACTCATTTAAAAGAAAACATTTTAGAAATCAATATATTATCAAAGTTGAATAAAGACTTAATTAAAATTTTCGAAATTTATGATAAACTTAAAGTTTAATTAAACTTAAAATATACTATTACTAGTTTATTAAGTAATGCTACAGTTACAACAGTAACCTTGTTGGTGGACAAATCGGAAAAAAAAAGACAAGACCAGTTAGATCAGCCAAGAGGGTTCAGTGCATGCAGAGTGTGACGAATCAATCAAAAAGACGAAAGCTCTACAAAACCGTGTCTTGGTTTGGTACATCAACCCATTTTAAGCTTCCCAAGAAGAACAACAACAATATAACATCAACAATAACAATTTCCATGCATAAAATACACAACTTTTCTTCAATTTACTGCAATATTTTTACTTTCTGTTTTATTTGTTGGTGATGCGCGTTACTTGAAGAACTGCACAACACAAATGTTAACCATTGATTGAACCCCTTACGTGGCTTACGTATAATATGACAAACACTTTGTGGGGACTCCATTGACTTAGTAGAACAGACAAACTACAGATGCAGACACAAAATGATTTTGAAGGGAAATTTACCTGTTCACTTTCTTTCAATGGGGTTTTCTTCTTCTTCAAACCTTGTAAAATCCAACAAATGATATTTCCCTGTTTGTTCACCCAACCACTCTATATTTTCACAACTCTAACCTCAAATCTTCATGACTTCACCTTTTTTTTTTCTTTTTCTGTTGTATCACATCACAAATTCTTAATGAGATATTTACTATTGGATCATTTGTTACCACCTTTTCTTTTGATACTATTTCCAATGCGCTCTTTTAACCCTCAGTTTGACCTTCTCAGCTTTGAGCTCTTTCACATTTAATGAATAAGCGTTATTGCCATAAATGGTAATTGGTCACTGTTGCAGGTGACTGACACAGTTGCATGCTCATTTATAGTCATTCATGGATGATACGCATGCTTTATCAACATAGTCTCAGCTGCTACCAACTCATCTATATATCTCCAATGCATGTCATGCAGACGCATCATAATCAAACCTCTCAGTTTTCTTACACGTATACACACTTCAAGAGAACATGTGAAAGCATGCACCATTACCATGAAGCTTGGGACTTCTATCTTCTGCCAATAATACATGCTCACAATCCAAGAACAACCACTACCGCTTTCCAACCCACAACTACACCATTAAATTTCACTTGTCTTCATGTGTCTTTCTGTTAATAAGAGCAACTATTTGAGCTAAAGAACAACCCACCACCGCTTCCCTCACTAACTCCTTCACTTGTTCAATCCCAAAATGAGAGAAGCATCA


Gene Sequence:
>Vu_08230(-)
ATGAGGATTTCAACCCTTGGCATTGTGCTCTTGTGTTTTTATTCTGCACTCCTTTGCCGTGGAAATGAGAGCACCATGAGAGTGCTTTTGGAGGTGAAATCATCGTTCACTCAAGACCCAGAAAATGTTTTAAGTGATTGGTCAGAGAACAACACCGATTACTGTAGCTGGAGAGGAGTGTCATGTGGATCAAAGAAGCTCAATGCTTTGGATGATGACGACGACTCGGTGCGAGTGGTGGGACTCAACCTTTCCGATTCGTCACTCGGTGGGTCCATTTCACCTTCACTCGGTCGTTTGCAAAACCTACTCCACCTTGATCTCTCTTCTAACCGCCTCGAGGGTCCTATTCCATCTGCCCTCTCCAACTTAACTTCGTTGGAATCTCTCCTTCTCCACTCTAACCAACTCACCGGTCATATCCCCACCGAGTTAGACTCGCTAATGCAACTCCGAGTATTGCGAATCGGTAACAACCAACTCAATGGCCCGATTCCCGAGACACTTGGGTATATGCCCAGCCTTGAGTACCTTGGTTTGGCCTCATGCAGACTCAGCGGTCAGATCCCGGCCCAGCTAGGTCGACTCAGTGAGTTGCAATATTTGACTCTGCAGGAAAACGAGTTGACTGGGTCGATTCCGTACGAAGTGGGGTACTGCTGGAGCCTTGAAGTCTTCAGCGCCGCTGGGAACAGACTCAATGGCTCGGTTCCGAGTGAACTGAGTCTACTAAGGAAACTTCAAATTCTGAACCTCGCAAACAACAGCTTAACCGGGTCAATTCCGAGTCAACTCGGGCAGCTGAGTCAGCTTACATATCTGAATTTAATGGGTAACGAACTCGAGGGTCGTATTCCACCGTCTCTGGCTCAATTGGGTAAACTTCAAAATCTTGACTTGTCAAATAATACGCTCACTGGGGAAATTCCAAAGGAGTTAGGGAACATGGGTCAGTTACAATATTTGGTTCTCTCTGGGAACAAACTCCATGGAACCATTCCAAGAACCATATGTTCCAATGCAACAAGTTTGGAGAACTTGCTGATGTCAGATTGTGGACTTCATGGTGAGATACCAGCTGAGTTGGGTCAGTGCCAATCCCTGAAACAACTTGATTTATCAGGCAATGATCTCAATGGGTCAATACCTATTGAGGTTTATGGGTTGATGGGGCTAACTGATCTCTTGCTTCACAACAACACTTTGGATGGTTCAATCTCTCCCTTCATAGGAAACCTCACTAACATGCAGATTCTTGCATTGTTTCATAACAACTTGCGGGGTAATCTGCCGAGAGAGATTGGGAGGCTTGGGAAATTGGAGATAATGTATCTTTATGATAATCAGTTATCAGGGAAGATTCCTTTCGAGATTGGTAACTGTTCAAGCTTGGAAATGGTTGATTTTTTTGGAAACCATTTCAGTGGTGAAATTCCCTTCACTATAGGGAGGCTGAAAGAGTTGAACTTTTTGCACCTTAGGCAGAATGAGCTTGTGGGTGTGATTCCCCCCACACTTGGGAACTGTCATAAACTGACTGTGCTGGATTTGGCAGATAATCGGCTCTCAGGTGGCATTCCTGCAACATTCGGATTCCTCAGAGAGTTGAAGCTGTTCATGCTCTACAACAATTCTCTTGAAGGTAGTCTTCCTCACCAACTTGTAAATGTAGCAAACCTGACCAGAGTGAATCTTTCAAATAACAGACTGAATGGTAGTTTGGTTCCATTATGTAGCTCTAGTTCCTTTCTTTCTTTTGATGTCACAGATAATGAATTTGACGGTGAAATACCCTTTGTCCTGGGAAATTCACCTTCCCTTGACAGGCTGAGATTAGGTAACAACAAGTTTTCTGGTGAAATTCCAAGGACATTGGGAAAAATCACCGCATTGTCATTGTTAGACGTCTCAGGAAATTCACTCACAGGTGGAATACCAGACGAGCTTTCTTTGTGTAATAACCTGACACACGTTGATTTAAACAACAATCTTCTAACTGGACACATACCACCATGGCTTGGAAGTTTGTCTCAATTGGGAGAGGTTAAGCTCTCCTTCAATCAATTTTCTGGGTCTATTCCACTAGGCCTACTCAAACAGCCCAATTTGATTGTTCTTTCCTTGAATAACAATTCTCTCAATGGAAGTCTCCCAGGTGATATTGGTGATCTTGTATCTCTTAACACCCTCAGGCTGGACCATAATAACTTCTCTGGACCAATCCCTCAAGAAATAGGAAAATTGAGCAATCTTTATGAGCTGCAGCTATCTAGGAATGCCTTTAGTGGGGAAATACCAATTGAGATTGGAAGTCTCAAAAATATCCAAAGCATTTTGGACTTAAGTTACAATAATCTCTCTGGTCATATCCCATCTTCACTTAGCATGCTGTCAAAATTGGAAGTACTTAATCTTTCTCACAATGCACTCACTGGAGAAGTGCCTTCAGCAGTTGGTGAATTGACTAGCCTGCAGAAGCTTGACATCTCTTACAATAACCTTCAAGGAGCATTGGATAAGCAATTCTCCCGCTGGCCTCGAGAGTCATTTGAAGGGAACCTTCATCTTTGTGGAGCCTCTCTTGAAAGATGCAAAAGTGGTGATGGTTCCGGCAATAAACGATCAGTCTTCAGCAGCACATCAGTGGTTATTGTCTCTACACTTTCAGCTTTAGCTGCAATTGCTTTACTTACACTTGTAGTGATCGTCTTCTTTAAAACCAAGCAAGAATTTTTCAGGAGAGGCAGTGAAGTGAGTTTTGTTTTCTCCTCTTCATCACGAGCACATAAACGATCGTTGATCCCTCTAAACGTGCCTGCAAAGAGGGATTTCAGGTGGCACGATATCATGGGTTCCACAAACAATCTAAGCGACGAGTTCGTAGTTGGTTGTGGAGGTTCCGGGACAGTGTACAGAGTCGAATTGCCCTCTGGAGAGATCGTGGCTGTGAAGAAGATTTCAGGAAAAGATGATTATCTGTTGAACAAAAGCTTTATAAGAGAAATCAAAACTTTGGGGAGGGTCAAACATAGGCATCTGGTAAAACTGATGGGTTGTTGTAGCAACAGAATCAAAGGAACAGGTTGGAACCTATTGATATATGAGTATATGGAGAATGGGAGTGTTTGGGATTGGTTACATGGGGTGCCTCTCAAAGCAAAGAGGATCCTTGATTGGGACACAAGGTTCAAAATTGCAATGGGATTAGCTCACGGAGTGGAGTACCTCCATCATGATTGTGTGCCAAAGATCATTCACAGGGACATCAAATCCAGCAACATATTACTAGATTCCGACATGGAGGCACACCTGGGAGACTTTGGACTAGCAAAATCACTTGTTGAGAATCCAGAATCTACTGCAGAATCTAATTCTTGCTTTGCTGGATCTTATGGATACATAGCCCCAGGTAATAGTTGATCACACCATTGACTTGAATTGTTCTTTATCTCATTCTTTTACGAAACATAGATACGATTAGAACTGAAGTTTTGTCTTTTTAATGCAAACTTTTAATACCCTGATGAAACTTTAATTTAATCTAATCAGAATCTCGTTCCAGAAACATCTAAGTATCTTGTCCAATTGTTAACCATTGATTGACATTTCTATATTTTTAGAGTATGCATACTCACTGAAGGGCACAGAGAAAACTGATGTGTACAGCATGGGAGTGGTGTTTATGGAACTTGTTACTGGAAAAGTGCCAACAGATGCAGCTTTCGGAGCAGAGATGGACATGGTGAGATGGGTGAAGATGCAGCTTGAGAAGGAAGGCATTGCGGTTGAAGCAGTGATAGATCCTCAGCTGAAACCCCTTTTGCCTTGTGAAGAGTTTGCTGCATTGCAGGTGCTCGAGATAGCCATACACTGCACAAAAACTGCACCACAAGAGAGGCCAACATCAAGGCAAGTATGCAATCATCTCCTTCACGTATCCAACAACAAAATTGTGGATTTTGAGAAGAAAAATCTGGATCGTAACTGGTGA