Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08142 LG2 3117687 3121583 PREDICTED: two-component response regulator ARR2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 3117690 3_prime_UTR_variant
T/C 3117710 3_prime_UTR_variant
T/A 3117798 3_prime_UTR_variant
G/A 3118006 3_prime_UTR_variant
A/G 3118048 3_prime_UTR_variant
G/T 3118057 3_prime_UTR_variant
A/G 3118101 3_prime_UTR_variant
A/G 3118121 3_prime_UTR_variant
A/G 3118334 synonymous_variant p.Ser635Ser
G/C 3118439 synonymous_variant p.Leu600Leu
T/C 3118695 missense_variant p.Asp515Gly
G/T 3118712 synonymous_variant p.Ser509Ser
A/G 3118714 missense_variant p.Ser509Pro
C/T 3118733 missense_variant p.Met502Ile
C/T 3118752 missense_variant p.Ser496Asn
T/A 3118809 missense_variant p.Gln477Leu
G/A 3118973 synonymous_variant p.Ala422Ala
G/A 3119062 stop_gained p.Arg393*
A/G 3119177 synonymous_variant p.His354His
A/G 3119197 missense_variant p.Phe348Leu
A/T 3119517 downstream_gene_variant
T/C 3119520 downstream_gene_variant
A/G 3119571 downstream_gene_variant
C/T 3119584 downstream_gene_variant
C/T 3119585 downstream_gene_variant
G/T 3119653 missense_variant p.Thr247Asn
T/G 3119705 splice_region_variant&intron_variant
A/G 3119714 downstream_gene_variant
G/T 3119806 downstream_gene_variant
T/A 3119835 downstream_gene_variant
A/G 3119977 downstream_gene_variant
G/A 3120060 downstream_gene_variant
T/A 3120061 downstream_gene_variant
A/G 3120071 downstream_gene_variant
A/T 3120144 downstream_gene_variant
T/C 3120260 synonymous_variant p.Pro208Pro
A/T 3120596 downstream_gene_variant
C/T 3120627 downstream_gene_variant
C/A 3120961 downstream_gene_variant
G/A 3121052 downstream_gene_variant
G/A 3121060 downstream_gene_variant
A/G 3121082 downstream_gene_variant
C/T 3121089 downstream_gene_variant
C/G 3121103 downstream_gene_variant
G/A 3121104 downstream_gene_variant
G/A 3121209 downstream_gene_variant
G/T 3121278 synonymous_variant p.Leu52Leu
A/G 3121314 synonymous_variant p.Cys40Cys
C/T 3121367 missense_variant p.Asp23Asn
C/T 3121469 5_prime_UTR_variant
A/T 3121531 5_prime_UTR_variant
G/A 3121582 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08142.1
MNLGSGKGSTSSSPLKTGDVVSDQFPAGLRVMVVDDDPTCLRILERMLRACLYEVTKCKRAEVALSLLRENKNGFDIVLSDVHMPDMDGFKLLEHIGLEMDLPVIMMSADDGKSVVMKGVTHGACDYLIKPVRIEALKNIWQHVIRKRKNGLKDAEQSGSVEEGDRLLKGCDDGDYSSSVNEGKGSKKRRDEEEEGDERDDSSTLKKPRVVWSVELHQQFMAAVNQLGIDKAVPKKILELMNVPGLTRENVASHLQKYRLYLRRLSGVSQQQGNLTNSFISSQEATFGATSINGIDLQTLSVAGQLPAQSLAKLQAVALGRTTSKAGVSMPLSDQKNLFSFESPRLRFAEGSLHHLSNSKPMNLLHGIPTNMEPKQLVTLHQSTQTLGNLNMRVSTPAAQNNPLLMQMAQSQPRGQILSENADSHATRFPSSLVQPIVPNSISNGVLGNRITGSSNITSAYNTVPQNSSLLSFPINQTNEMPVGNFPLRSTPGITSIPTKAMFHEEGTSGITGPDGFVSSYDMFNELHHQKSHDWDLTSTGITYDSSQHANPLQGNIDVSPSVLVHQGFPCLQQSVQTRDSTSIGKPLFSTGEAIHQSNLQNVSQQHLNNLVDSSVRVKAETFPDPSSQINNLFSDQYGQEDLVTAFLKQQEGVGPSDHDLDFDGYSLDNIPV*


CDS Sequence:
>Vu_08142.1
ATGAATCTCGGCAGCGGCAAGGGATCAACTTCCAGTTCTCCTCTGAAAACCGGGGATGTTGTCTCCGACCAGTTTCCGGCGGGTCTCAGGGTGATGGTGGTGGATGATGATCCCACTTGTCTTAGGATACTTGAGAGGATGCTGCGTGCTTGTCTCTATGAAGTGACGAAATGCAAGCGGGCTGAGGTTGCATTGTCGCTTCTGAGAGAGAACAAAAACGGGTTTGACATTGTTTTGAGCGATGTGCATATGCCAGACATGGATGGATTCAAGCTTCTGGAGCATATTGGGTTGGAGATGGACCTTCCGGTTATTATGATGTCTGCTGATGATGGAAAAAGCGTTGTGATGAAAGGGGTGACACACGGTGCCTGTGATTATCTGATTAAACCTGTGAGAATTGAGGCTTTGAAGAACATATGGCAGCATGTGATTCGGAAGAGAAAGAATGGGTTGAAAGATGCAGAGCAATCGGGTAGTGTGGAGGAAGGAGATCGGCTTCTAAAAGGGTGTGACGATGGAGATTATTCATCTTCAGTGAATGAAGGCAAAGGCTCAAAGAAGAGGAGGGATGAGGAGGAAGAAGGAGATGAGAGGGATGATTCCTCCACGTTGAAGAAGCCACGAGTTGTTTGGTCTGTTGAGCTTCATCAGCAGTTTATGGCTGCTGTGAATCAACTTGGAATTGATAAGGCAGTTCCTAAGAAGATTCTGGAGTTGATGAATGTTCCTGGGCTCACTAGAGAAAATGTTGCCAGCCACCTCCAGAAATACCGTTTGTATCTTCGAAGACTGAGTGGAGTTTCACAGCAGCAGGGCAACTTGACCAACTCCTTCATCAGCTCACAAGAAGCAACATTTGGGGCAACCTCAATCAATGGAATTGATCTTCAAACTCTTTCAGTTGCCGGTCAGCTTCCAGCTCAAAGTCTAGCTAAGCTTCAAGCCGTAGCACTTGGCAGGACAACTTCTAAAGCTGGTGTGTCTATGCCTCTATCTGATCAAAAGAACCTTTTCAGTTTTGAGAGCCCAAGATTAAGATTTGCAGAAGGGTCACTGCATCATTTAAGCAACAGTAAACCAATGAACCTGCTTCATGGCATTCCTACCAACATGGAGCCGAAACAGCTTGTCACTCTGCACCAATCTACCCAAACCCTTGGTAACTTGAACATGCGAGTCAGTACTCCTGCTGCACAGAACAACCCCTTGTTGATGCAGATGGCTCAGTCTCAACCAAGAGGTCAGATTCTAAGTGAAAATGCCGATTCTCATGCAACCAGGTTTCCATCATCTTTGGTTCAGCCTATAGTACCAAATAGTATTTCTAATGGTGTTTTGGGAAATAGAATTACTGGCTCCAGCAACATAACTAGTGCTTATAATACAGTTCCACAAAACTCTTCATTGTTGAGTTTTCCCATCAACCAAACCAATGAAATGCCTGTCGGTAATTTTCCTCTTAGAAGCACTCCAGGTATAACTAGTATCCCGACTAAAGCCATGTTTCATGAAGAAGGTACCTCCGGCATTACAGGACCTGATGGATTTGTTTCAAGTTATGATATGTTTAATGAACTCCACCATCAGAAGTCCCATGATTGGGACTTAACAAGCACGGGCATAACATATGATTCTTCTCAGCATGCAAATCCTTTACAAGGTAACATTGATGTCTCACCATCAGTTTTAGTCCATCAGGGTTTTCCCTGCTTGCAACAGTCTGTGCAAACTAGAGATTCCACTTCAATTGGAAAACCTCTGTTCTCCACTGGGGAAGCCATACATCAGAGTAATCTCCAAAATGTTAGTCAACAACACCTCAATAACCTTGTTGACAGTTCAGTAAGGGTTAAGGCTGAAACATTTCCTGATCCAAGCTCCCAGATTAATAACCTCTTCTCTGATCAGTACGGTCAGGAGGATCTTGTCACTGCATTTCTGAAACAGCAAGAAGGTGTAGGACCATCTGATCACGATTTAGACTTTGATGGATATTCCTTAGACAACATTCCGGTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_08142::LG2:3121583-3123583(-)
AGTGAATAGAATTTTGTTACCAAATTAAGTTAAAAAATATTTCAGTTCCTTTTGAATTAACATGTGTTTGTTTTAAATATTGTTAGAGATAAATAAAAGAGAGAAGTGGAATGTTTTTCAGTTTTCTTGATGAAAAAATGAAAAAAAATAATGTTAAATAACTTAATTTAAAGTTATATTTTCGTTTATAAATATAACACTTTTCTCTAAGAAAAACATACAAAAAAATATTTTGTTATATTTTCTCTTATTCTTGTAATGTAAAAGTTAAAAAATAATAAAATACTCATTTTATATATTAATTAGTTTATTTTTTATATTCTACCTCTTGTATAAGCACCTTTCTCAGTACATTTTAAATGTTACCTTGACCAAAAACTTAGAAAATAAATAATTTACCTCGAGGAAAAACTTAGGAACTAAAAATTGAGGAACCGAAACATATTTCTAAACTTATGATTTGTAATTTAGGGATGACAATAAGCTCTGTATATACACATAAAAACTATTTATAACTAAGTAAATTACCTCTTTAGTGGGTAAGACCAAAAAAGATAAAATAATAGAAATTAATTATAAACTCCAACTCATACACACTTGTATATTGAAACAGTTTGTTTGTCAATGTGTGCAAATAAACACATATAAATAATTGTAATTATAATAATAAATATTTTTTAAACTATAGTAATACATTTAAAAGAAAATGTGAGAACTTATATACATGTGTATAGGTATAATAATTGTATTTTCAACGGATTGTCTTTCGGTAACCTTCTAAATTTTTCATTCCAAAATAGATTTAGATAACTTTTTGAAGAAATTTGTAATAATAAAAATGGATTTATATCATACTTTAAAATATTCACTATAAATTGAAATCATAACCTGATTACCGTAAATTTAAAATATAATAAATGTTTATTCTGAAAAAAATACTAGGTATGATAAAAAATGTAACTAAACATTATTTTGCCAATTAAAACAATTGTGCAAATTAAAAAAAAAAAACAAATATCAAACATTCAAACCGATTAAGAAAATAATTCAAAAAAATAAAAATACAGTGAAAATATGAAAAAAATACATTGTATTATACAAAAATTAAAATATAGATTAAATATGTTTTTATTCATTTAATTTTAAATAAAAATTTAAATTATTTTTTTGTCAAAATTTGATTCAATATAGTTTTTAACTTAAAAACTATATAAATTTAAGTTGTTAAATTTATTTAACATTTAAAATACATTTTATAATAATGTTTAAATTATTTACATTATCATATTATTTTTTATATTATTTGAGAAATTTTAAATAAATTTAATAAAATTTGATTGAAAAATTAAAATTCACACAATTTTAAATATAAAAAAATAAATTAGTCCAAAGTTTGTTTAAAAAAAATAATTCTATTTTTTATTTAAAATTAAGAAAAAATATATATTTAACTCTAAAATATTAGATAATGAAAGCCGGTGCATTAACTAAAATATCTAATCATTAATATGGAATAATGAATTTGAACATTCATGAATTACTTAATTCATAGCTTCTAAAATCCAGGCAGACTAAAAAACAATTTTCACTTTCTTTTAGATATTAGTTAATTCAGCTTTAAATCAGAGAAAAAGAAGAGCAGAGTTTACAACTACTCCTTTAGAAATGTTGTGATTTTCTGACAGAGTTGGAAGTGGTTTTGAGATCCGAGGTGGAGGGTTAGTTAATCCAATTCAACCAATGAGCTGGATCCACTCTTTCAGGAGTAACCTTAAAATATGATAATATTAATATTGTACAATGTCAAAATAATTACAGACACCAACATTTTAATAATATTATTATTATTTTGACAACATTATTTTATGGAAAGTAATAAAATATGCCAGAAACTGAGCATCCGTTTGAAACAGAGCAAAAAAAACTCTTTCAGAATCAGAGCCTCAATCATTTCCATTATTTATACGCTATATTATCTGCAAGCCAAAAGAAATTCCATT


Gene Sequence:
>Vu_08142(-)
ACCCTTTTCTCTGTTTCTTGGCCTGAACTCTTGTAACAACTCACTCTTGTGTTATTATATTTAACACTCTCATGATGATGCCACTTTCAACCATGTGAAGCTGTTTCAGTCTCAGTTTCTTGTTGTCAACTGTTTTGGATCTTCTCAAACATGAATCTCGGCAGCGGCAAGGGATCAACTTCCAGTTCTCCTCTGAAAACCGGGGATGTTGTCTCCGACCAGTTTCCGGCGGGTCTCAGGGTGATGGTGGTGGATGATGATCCCACTTGTCTTAGGATACTTGAGAGGATGCTGCGTGCTTGTCTCTATGAAGGTGCTTATTCGCTTTCTTTCTTTCTTTTGGGTACAGAAAAGAAATGCAATTTGCTTCTTTTCTTTTTTTTTTAATGTTTATGTGGTCGTGGATAGTACTTGTACTTGTCAATCACCTCCAACTGTGTCTTGTTATGGAGTTTTTGCTCCAAACATGTTGTTTGATACGGTAGTTACAGTAAGTTTGGATTCTTGCTGCAATCTTTCTTTTCAAGTTGACGCTATTTTTTTTTGTATGGTTAAATAGCATGGCATGAAGTGATTGATGGTGTTTGTTTTCATCTTGTGCTGACAGATTTATTTGTTAATTGTTTTTTTCAAACCTTTGGAATTGGTTCTAAAGTAAAGTTGGAGTCGTGATGAGTATACTTGTGCTGTGCCTCTTTTTTCACTTTCCTTTTTCTGCATTTTGAGTTGTGAAATTTGAGATTTTGCGATTTGATTCGGTTTGGTTGTTGGGTTCAGTGACGAAATGCAAGCGGGCTGAGGTTGCATTGTCGCTTCTGAGAGAGAACAAAAACGGGTTTGACATTGTTTTGAGCGATGTGCATATGCCAGACATGGATGGATTCAAGCTTCTGGAGCATATTGGGTTGGAGATGGACCTTCCGGTTATTAGTAAGCATCGTTTTGATTGGTTTATGGCTATTGAGAGACACTGCATTGATATGCAGTTACAAACTTTGTGTGAATGATTTTTACAGTGATGTCTGCTGATGATGGAAAAAGCGTTGTGATGAAAGGGGTGACACACGGTGCCTGTGATTATCTGATTAAACCTGTGAGAATTGAGGCTTTGAAGAACATATGGCAGCATGTGATTCGGAAGAGAAAGAATGGGTTGAAAGATGCAGAGCAATCGGGTAGTGTGGAGGAAGGAGATCGGCTTCTAAAAGGGTGTGACGATGGAGATTATTCATCTTCAGTGAATGAAGGCAAAGGCTCAAAGAAGAGGAGGGATGAGGAGGAAGAAGGAGATGAGAGGGATGATTCCTCCACGTTGAAGAAGCCACGAGTTGTTTGGTCTGTTGAGCTTCATCAGCAGTTTATGGCTGCTGTGAATCAACTTGGAATTGATAGTATGTGTTCCTCAATCACCTCCTTGCAAAAAAATGTTCTGTTGCTTTTCCATGCTGTCTTATCTGACACAGCAAACAATGCCTCCCACTACTTTTGATCTTTGGATTCTTTATGTCTAATTTCGAACTGGACAAGAATCTTGAAAGCATCAAATCCACACATTTACTACTTGCATCTTCCATGTCAGATTGCAATATTTTGGGATGACCCCTTCTAGCCTTTCATGACTGTCACAAATACCCAAATCAGTTTCCAACTATATATCATGTTTTAACCATATTCAATATGGTTAAAACATTACAGTTCCTAGAGTGGCCTTAGCTTTGGAAAATTGTTTTTATCTCTAAACTAGTTTCATTTTCACCCACAACTAATTCCTGAATATCTAATATACCAATAGATCCGGTGATATCTTCTTGCCTGGTTCGTTAGAGTTTTATTTAAATATAAATGCCTCATCTGATGTTTTAAATTTGTTGTTCATGTACAGAGGCAGTTCCTAAGAAGATTCTGGAGTTGATGAATGTTCCTGGGCTCACTAGAGAAAATGTTGCCAGCCACCTCCAGGTTTGATACTGTTATTATGCTTCATATAACATACTTTGGGGGAAATTCAGGAATTGATGTTAGCCATAGTTTAAACTTTTTGTCGTGCTCATTTTTACGGTATCAGTTTTGATTTGAAGGAGTTTTCTCTTTTTCTACCTGCTTTTTGGTACAGAAATACCGTTTGTATCTTCGAAGACTGAGTGGAGTTTCACAGCAGCAGGGCAACTTGACCAACTCCTTCATCAGCTCACAAGAAGCAACATTTGGGGCAACCTCAATCAATGGAATTGATCTTCAAACTCTTTCAGTTGCCGGTCAGCTTCCAGCTCAAAGTCTAGCTAAGCTTCAAGCCGTAGCACTTGGCAGGACAACTTCTAAAGCTGGTGTGTCTATGCCTCTATCTGATCAAAAGAACCTTTTCAGTTTTGAGAGCCCAAGATTAAGATTTGCAGAAGGGTCACTGCATCATTTAAGCAACAGTAAACCAATGAACCTGCTTCATGGCATTCCTACCAACATGGAGCCGAAACAGCTTGTCACTCTGCACCAATCTACCCAAACCCTTGGTAACTTGAACATGCGAGTCAGTACTCCTGCTGCACAGAACAACCCCTTGTTGATGCAGATGGCTCAGTCTCAACCAAGAGGTCAGATTCTAAGTGAAAATGCCGATTCTCATGCAACCAGGTTTCCATCATCTTTGGTTCAGCCTATAGTACCAAATAGTATTTCTAATGGTGTTTTGGGAAATAGAATTACTGGCTCCAGCAACATAACTAGTGCTTATAATACAGTTCCACAAAACTCTTCATTGTTGAGTTTTCCCATCAACCAAACCAATGAAATGCCTGTCGGTAATTTTCCTCTTAGAAGCACTCCAGGTATAACTAGTATCCCGACTAAAGCCATGTTTCATGAAGAAGGTACCTCCGGCATTACAGGACCTGATGGATTTGTTTCAAGTTATGATATGTTTAATGAACTCCACCATCAGAAGTCCCATGATTGGGACTTAACAAGCACGGGCATAACATATGATTCTTCTCAGCATGCAAATCCTTTACAAGGTAACATTGATGTCTCACCATCAGTTTTAGTCCATCAGGGTTTTCCCTGCTTGCAACAGTCTGTGCAAACTAGAGATTCCACTTCAATTGGAAAACCTCTGTTCTCCACTGGGGAAGCCATACATCAGAGTAATCTCCAAAATGTTAGTCAACAACACCTCAATAACCTTGTTGACAGTTCAGTAAGGGTTAAGGCTGAAACATTTCCTGATCCAAGCTCCCAGATTAATAACCTCTTCTCTGATCAGTACGGTCAGGAGGATCTTGTCACTGCATTTCTGAAACAGGTTGGTCCTTTCCTTCCTTCCTTTTCTGTACACATATCCTTTCACATAGTTTTCCTTTATAAACTAATCATTTTCTTGTGTTTTTCTGGCAGCAAGAAGGTGTAGGACCATCTGATCACGATTTAGACTTTGATGGATATTCCTTAGACAACATTCCGGTTTAGAACTGATCCTGTCAGATCTCTTTTTAATTGCAGACGCCAATGTAAATAGTTGGCGTTCCATTTGAACCAAATCATCTTGCAATCAGTTAGTTTGTTCCTTAGTTTAAATTTGTCAACACATAGAATTCAGTTGATGTAAAAAATTCAGGCATCAGGGAGTAGTATGCTATTATGATTTAGTCTGGATGCTCAAAATCAGTTAAGTGATCTATCAAGATGAATAATAACAAACATTAAATGCATGTATGCAGAAGGCATATTTGCAAGTTTTGGCTGCTTTTGATTGCAAAGATCCTAGCAAGCTTCTACTGTTGAAGTGTACATGGAGACATTGATTTAGGGCAGAACTGCAGAAGCAAGGTTTTGATACTACTGCAGACTTGTAGGAGCATTTTTAACTTTAATAACACCCTCATGAAATGTTTTTTCCTCTGATCT